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探针注释文件中没有基因名字怎么办?(二)

前面给大家介绍了,如果从GEO数据库下载的芯片数据,配套的☞探针注释文件中没有基因名字怎么办?...如果你点击这里的GB_ACC,例如(NR_046018)就能跳转到相应的NCBI网页 你就可以看到这个基因的名字叫DDX11L1,有人说那我就一个一个去点不就可以得到每一探针对应的基因名字了吗?...因为这里的探针有50000+个。了解小编的人都知道,小编一直奉行,“能有代码解决的问题,绝对不手动去做”。 接下来,小编就来用R解决这个问题。...下面是refGene.txt.gz这个文件的结构,里面包含了我们需要的两种ID号,分别在第2列和第13列 有了这个文件,接下来我们就可以R代码来做ID转换了,给我们的探针注释文件加上一列gene...=F,sep="\t",row.names=F) 得到的结果如下,最后一列就是我们R加上去的gene名字

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甲基化探针相对于基因来说太多了怎么

如果是表达量芯片,探针数量很明显是比标准的2万多个蛋白质编码基因多不少, 很容易理解嘛,因为每个基因长度那么给力,在上面设计多个探针很正常。...针对表达量芯片,我们会有一个很常规的操作,就是相当于基因来说的去冗余操作,如果一个基因对应多个探针我们会仅仅是保留表达量最大的探针作为那个基因的唯一表达量,这样之前的五六万个探针的表达量矩阵去冗余操作后就是两三万个基因的表达量矩阵啦...但是如果一个基因对应多个探针我们会仅仅是保留表达量最大的探针作为那个基因的唯一表达量,我们就会发现PPARα的基因表达量没有统计学显著的差异,因为这个基因有多个探针。...既然一个基因会设计十几个探针甚至几十个探针,如何量化这个基因的甲基化信号值就需要考虑生物学背景啦。...也就是说仅仅是考虑了 TSS1500-island 的21610个探针,可以看到, 这两万多个探针并不意味有两万多个基因,因为仍然是一个基因有好多个探针: 一个基因有好多个探针 ChAMP包中包括了两个测试集

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Asp.net 传送大文件

设置很大的maxRequestLength值并不能完全解决问题,因为ASP.NET会block直到把整个文件载入内存后,再加以处理。...如果文件很大的话,我们经常会见到Internet Explorer显示 "The page cannot be displayed - Cannot find server or DNS Error",好像是怎么也...wr.ReadEntityBody(bs2,n) >0)        {              .....         }   } Chris Hynes为我们提供了这样的一个方案(HttpModule...),该方案除了允许你上传大文件外,还能实时显示上传进度: ASP.NET Upload Magic Part 2 这里有他讲座的PPT文件: Uploading with ASP.NET (part...1) Uploading with ASP.NET (part 2) 本文由来源 21aspnet,由 javajgs_com 整理编辑,其版权均为 21aspnet 所有,文章内容系作者个人观点

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