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提高单细胞分析准确度的工具之一:Self-assembling manifolds

但这里小编要说的是另一个软件Self-assembling manifolds(SAM),其可以独自完成一个完整的单细胞分析的流程。...软件的开发者在文章《Self-assembling manifolds in single-cell RNA sequencing data》中说(下图),SAM在多项评估中得分最高,其次为SAM的top...一是SAM被封装进scanpy中,可通过scanpy调用,二是独立使用安装使用SAM,这里写的是第二种,参考github地址:https://github.com/atarashansky/self-assembling-manifold...SAM #pip安装 pip install sam-algorithm #或者github上安装最新版 git clone https://github.com/atarashansky/self-assembling-manifold.git...cd self-assembling-manifold python setup.py install #其他安装 pip install matplotlib conda install -c conda-forge

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