在Linux下一般我们使用wget命令下载文件，但是因为wget是单线程的，所以当使用它下载比较大的文件的时候会显得力不从心，因而使用axel下载还是很爽的～～～
王通老师在他的 "基因学苑" 公众号，发表过一篇《命令行的“迅雷”，提升百倍以上下载速率》的文章，给我们简单介绍了 axel 这个命令行下多线程下载的利器。本公众号也有幸转载过，但在实际使用中 axel 还是有几点不为人知小秘密，今天来聊一下。
Ubuntu 20.04发布了，带来了很多新特性，同样也依然带着很多不习惯的东西，所以装完系统后还要进行一系列的优化。
axel插件是基于yum下的一个多线程下载插件，通过打开多个HTTP/FTP连接来将一个文件进行分段下载，从而达到加速下载的目的。对于下载大文件，该工具特别有用。可用于CentOS、RHEL、Fedora等使用yum的Linux发行版。暂时找不到rpm包，只能编译安装。使用Axel可以在低速网络环境里提高数倍的下载速度。
以下笔记分享来自于2019-11月学徒，其实去年也分享过一个类似的下载神器：GEO和GitHub下载神器
Ubuntu 21.04快发布了，带来了很多新特性，同样也依然带着很多不习惯的东西，所以装完系统后还要进行一系列的优化。
vim /etc/ssh/sshd_config 去掉22的注释.添加新的端口 Port 4365 重启sshd服务 测试是否可以连接 测试无问题 注释掉22端口(安全性)
在学习Python的过程中，大家肯定会遇到pip安装失败的问题，要么是因为网速问题，要么是因为win系统上与vs绑定，必须要装vs等一些系列问题，而这些问题有个很关键的解决办法，那就是直接下载相应的whl包来安装。
一个非常简单的多线程下载工具，解决单线程下载速度慢的问题，首先是安装： apt-get install axel #debian/ubuntu安装方法 yum install axel #centos安装方法 使用方法，就几个参数，非常简单： axel -n 10 http://...... 另外还有一些参数，不太常用，请自行参考： -o /tmp #指定下载目录 -q #静默模式 -s #限制最大速度
mycli：mysql客户端，支持语法高亮和命令补全，效果类似ipython，可以替代mysql命令。
ports从网上下载软件包自动安装，那么从那里下载呢？首先，我们需要安装axel来取代默认的下载工具fetch，这样可以提高ports的安装速度： cd /usr/ports/ftp/axel make install 然后，我们需要一个源地址管理。跟ubuntu上的/etc/source．list文件一样，freebsd用的文件是/etc/make．conf，我们可以修改其文件，达到加速下载的目的。 #修改 /et/make．conf vi /etc/make.conf FETCH_CMD
axel -S ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1000genomes/ftp/release/20130502/ALL.chr11.phase3_shapeit2_mvncall_integrated_v5a.20130502.genotypes.vcf.gz
哈喽大家好呀,仅经过了一段时间大数据相关的博文又和大家见面了,笔者之前有写过一套Hadoop大数据相关的博客,为什么今天又要开坑呢?当然是有原因,随着不断的学习了解,慢慢意识到之前做法存在很多缺陷,最
wget ‐‐output-document=myname.iso http://example.com/file.iso
当然了，很多人会说可以多线程下载，其实并不然，多线程的前提也是网络好才行。比如我自己在mac设置 axel 多线程
来源 | 网络 ag： 比grep、ack更快的递归搜索文件内容。 tig： 字符模式下交互查看git项目，可以替代git命令。 mycli： mysql客户端，支持语法高亮和命令补全，效果类似ipython，可以替代mysql命令。 jq: json文件处理以及格式化显示，支持高亮，可以替换python -m json.tool。 shellcheck： shell脚本静态检查工具，能够识别语法错误以及不规范的写法。 如果您正在学习Spring Boot，推荐一个连载多年还在继续更新的免费教程：
常见的端口转发程序有socat、Brook、nginx、rinetd、iptables等，大部分已经在博客做过介绍，有兴趣的同学可参考我之前的文章。
❝本节来介绍如何使用「eggnog-mapper」软件来对基因做功能注释，，由于需要注释的基因有10万条，在线版单次只支持5000条序列因此我们使用本地版来进行注释❞ 软件安装 conda install -c bioconda eggnog-mapper 数据库下载 目前版本已经更新到5.0.2下载后解压缩即可 axel -an50 http://eggnog5.embl.de/download/emapperdb-5.0.2/eggnog.db.gz axel -an50 http://eggnog
Clash是一款用Go语言开发，可以在Linux/MacOS/Windows等多平台使用的代理工具。
下载 VcXsrv Windows X Server download | SourceForge.net 并安装
3、mycli：mysql客户端，支持语法高亮和命令补全，效果类似ipython，可以替代mysql命令。
Docker镜像由只读层组成，每个层都代表一个Dockerfile指令。这些层是堆叠的，每一层都是前一层变化的增量。示例Dockerfile:
在 Linux 操作系统下，我们经常使用 cat 命令去连接多个文件并打印到标准输出，合成几个文件为一个目标文件，追加几个文件到目标文件中。
故事的过程是这样的，朋友是搞科研的，需要在一个国外的学术网站下载一个药物的模型压缩包，大概有23g。关键他也不会用别的就wget下载....恩中间还断了....问我有什么方法没有断点续传，而是能不能更快速的下载？我记录wget是有断点续传的？问一下chatgpt不完了...wget -c
旧的下载地址：http://www.eso.org/public/archives/images/original/eso1242a.psb
安装axel sudo apt-get install axel 使用axel axel -n 100 -a http://archive.apache.org/dist/kafka/1.0.0/kafka_2.11-1.0.0.tgz
可以看到它是可以公开获取的，链接在：https://download.cncb.ac.cn/gsa-human/HRA000395/
花了好几天，终于看完了《Docker进阶与实战》，今天终于抽出时间来实践一把，这里把今天实战的过程记录一下。 安装Docker 因为我使用的MacOS系统，查阅文档找到在MacOS系统中最简易安装办法如下。 #使用Homebrew Cask安装virtualbox brew cask install virtualbox #使用Homebrew安装docker-machine brew install docker-machine #使用docker-machine创建名叫mydockerhost的dock
前面我们模拟混合了几种细菌的数据拼接，本次带来的是文献《Complete and validated genomes from a metagenome》中的数据，步骤就是下载数据，开始拼接。
3.mycli：mysql客户端，支持语法高亮和命令补全，效果类似ipython，可以替代mysql命令。
众所周知，我们在 Linux 下大多数时候是使用命令行来处理任务的。这样不但操作起来效率比较高，而且界面也比较炫酷。下面，我们就给大家推荐一些不但炫酷又好用的 Linux 命令行神器。
哈喽，大家好呀！这里是码农后端。今天来聊一聊Linux下的yum源及其配置相关的内容。简单来说，yum源就相当于一个管理软件的工具，可以想象成一个很大的仓库，里面存放着各种我们所需要的软件包及其依赖。
基因组拼接一直是整个基因组数据分析中最重要和最核心的工作，因为基因组包含了一个物种全部的遗传信息。得到的基因组越完整，包含的基因组信息也越多，对于后续对整个基因组的功能分析，变异检测都有非常大的帮助。由于基因组本身具有的高度重复序列，多倍体杂合位点，低复杂度区域以及测序错误等诸多条件的影响，基因组拼接一直是一项非常复杂且困难的工作。尤其是基因组重复序列的影响，一直是二代短读长测序最难解决的问题，尽管后来基于二代测序数据开发除了一些辅助拼接方案，例如大片段文库，Optical mapping光学图谱，三位基因组等辅助方案，都无法彻底解决基因组拼接难题。而利用 nanopore 长度长测序，将革命性地解决重复序列对于基因组拼接的影响。
基因家族：gene family，是指来源于同一个祖先，经过基因重复和突变而产生的一组具有序列结构与功能相似性的基因，它们编码相似的蛋白质产物。对于一个基因家族中的基因，能够编码蛋白都有同一个结构域。
所谓工欲善其事，必先利其器，好的软件或工具，能够在很大程度上提升你的工作效率。对于像我这样把 Linux 直接安装在物理机上当作日常操作系统来使用的人来说，能够找到并成功安装一些 Linux 版的日常软件以及效率软件，是一件多么令人兴奋的事情。这里经过我多年的收集积累，罗列出了一些实用的 Linux 软件，希望能够对大家有所参考价值，另外也作为自己的一份笔记，方便日后重装系统后来查阅安装。
mysql客户端，支持语法高亮和命令补全，效果类似ipython，可以替代mysql命令。
[root@hadoop1 opt]# yum -y install gcc make gcc-c++ openssl-devel flex byacc libpcap ncurses ncurses-devel libpcap-devel
导读：Windows 操作系统本身是不开源的，但是近日微软内核工程师 Axel Rietschin 发表了一篇博客，带大家一窥 Windows 10 内核的魅力。
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