最近好多同学想学习java，我在网上找了找终于找到这个指南。这一个非常不错的java学习指南。内容包含的比较全面，知识点也比较完整。
``` R pwd #显示当前路径 bio02@ecm-cefa:~$ pwd /home/bio02 mkdir #创建目录 bio02@ecm-cefa:~$ mkdir hello ls #显示列表 bio02@ecm-cefa:~$ ls biosoft hello project src tmp #除了四个已有目录，新增一个hello目录 rm #删文件 rmdir #删空目录 rm -r #删非空目录（删除统一展示了，如下，因为不会随意切换目录，导致删除要挨个进入目录删） bio02@ecm-cefa:~$ rm -r tmp bio02@ecm-cefa:~$ mkdir tmp bio02@ecm-cefa:~$ cd tmp bio02@ecm-cefa:~/tmp$ mkdir rm_test bio02@ecm-cefa:~/tmp$ cd rm_test bio02@ecm-cefa:~/tmp/rm_test$ mkdir huahua bio02@ecm-cefa:~/tmp/rm_test$ cd huahua bio02@ecm-cefa:~/tmp/rm_test/huahua$ touch doodle.txt bio02@ecm-cefa:~/tmp/rm_test/huahua$ rm doodle.txt bio02@ecm-cefa:~/tmp/rm_test/huahua$ cd bio02@ecm-cefa:~$ cd tmp bio02@ecm-cefa:~/tmp$ cd rm_test bio02@ecm-cefa:~/tmp/rm_test$ rmdir huahua bio02@ecm-cefa:~/tmp/rm_test$ cd bio02@ecm-cefa:~$ cd tmp bio02@ecm-cefa:~/tmp$ rmdir rm_test bio02@ecm-cefa:~/tmp$ cd #进入目录 bio02@ecm-cefa:~$ cd tmp vi #建脚本或文档 bio02@ecm-cefa:~/tmp/new$ vi hello_world.txt cat #查看文档并展示到屏幕 bio02@ecm-cefa:~/tmp/new$ cat hello_world.txt i today is a good day,i meet my boyfriend,he is older than me,he finished his work then meet me.we have a good time. head #输出前十行（然而我只发挥了一行） bio02@ecm-cefa:~/tmp/new$ head hello_world.txt i today is a good day,i meet my boyfriend,he is older than me,he finished his work then meet me.we have a good time. tail #输出后十行（如上括号所言） bio02@ecm-cefa:~/tmp/new$ tail hello_world.txt i today is a good day,i meet my boyfriend,he is older than me,he finished his work then meet me.we have a good time. head -n #数字 自定义输出几行 bio02@ecm-cefa:~/tmp/new$ head -n 2 hello_world.txt i today is a good day,i meet my boyfriend,he is older than me,he finished his work then meet me.we have a good time. cp #复制 bio02@ecm-cefa:~/tmp/new$ cp hello_world.txt hello_boy mv #移动 bio02@ecm-cefa:~/tmp/new$ mv hello_world.txt tmp bio02@ecm-cefa:~/tmp/new$ ```
使用方法非常简单， 就是 makeCluster 函数定义好需要并行计算的线程数量，然后之前的apply家族循环就区别在函数名字前面加上par的签字，比如 lapply就替换成为了 parLapply 函数。
Java作为一门后端语言，对于网络编程的支持是必不可少的，但是，作为一个经常CRUD的Java工程师，很多时候都不需要接触到网络编程，自然而然地对这个东西不那么重视了，毕竟，即使像是JVM虚拟机，Java多线程，在平时工作的时候还会用到一些，但是对于网络编程，除非你做的东西确实是需要自己写通讯服务代码的，比如网络游戏，以及偏向中间件方向的开发， 可能会接触到一些网络编程的实践，要不然在平时的开发工作中确实不多见。
在《WebRTC流媒体服务器-Janus的安装与布署》 一文中我已经向你介绍了如何布署Janus，今天我们来了解一下 Janus 的源码，看看Janus目录中都包括哪些文件，以及它们所起的作用是什么。
我下意识的认为他应该是有其它错误，但是看大家在群里讨论的热火朝天， 我就去试了试。首先看了看最原始的安装方式：
当HTTP资源或网页更改位置时，通常重要的是提供某些方法来提醒用户这些资源已移动。 HTTP协议为此提供了多个“重定向”状态代码，用于与客户端应用程序进行通信，而不会影响用户体验。
之前写过很多次关于Java学习指南、Java技术路线图的文章。但是总还是有小伙伴来问我，Java怎么学，项目怎么做，资源怎么找，真是让人头秃。
如果是想通过培训掌握生物信息学，那么可以参考：彻底入门生物信息学，可能需要12天！ 推文介绍的。
于是这次黄小斜决定来一波狠的，把所有这些内容都整理起来，做成一份非常硬核的Java学习指南+路线图，一篇文章搞定Java学习，360度无死角（可能）如果你们喜欢这类硬核的文章，以后我也会继续这么硬核下去的！不要忘了分享噢。
参考： Netty权威指南第一版 Java 网络IO编程总结（BIO、NIO、AIO均含完整实例代码）
《跟闪电侠学Netty》 并不是个人接触的第一本Netty书籍，但个人更推荐读者把它作为作为第一本Netty入门的书籍。
现在回过头来看，很多教程已然过时，当然并不是说的知识点过时，其实linux基本上几十年都没有怎么变动过基础知识的，哪怕你现在搜索到十几年前的linux教学视频，也不会觉得尴尬。主要是其中一些资源链接，一些小技巧都过时了，比如R语言安装包，需求切换适合的镜像，或者某些配套书籍课程的URL肯定也会成为死链啦，所以非常有必要系统性整理一下，最新生信分析人员如何系统入门R
要开始使用 Dash Bio，请使用 pip install dash_bio 安装，然后转到 Dash Bio 的文档: http://dash.plot.ly/dash-bio
技术更新日新月异，对于初入职场的同学来说，经常会困惑该往那个方向发展，这一点松哥是深有体会的。
1、字符设备驱动: 当我们的应用层读写(read()/write())字符设备驱动时,是按字节/字符来读写数据的,期间没有任何缓存区,因为数据量小,不能随机读取数据,例如:按键、LED、鼠标、键盘等 2、块设备: 块设备是i/o设备中的一类, 当我们的应用层对该设备读写时,是按扇区大小来读写数据的,若读写的数据小于扇区的大小,就会需要缓存区, 可以随机读写设备的任意位置处的数据，例如 普通文件(.txt,.c等),硬盘,U盘，SD卡。 3、块设备结构： 段(Segments)：由若干个块组成。是Linux内存管理机制中一个内存页或者内存页的一部分。 块 (Blocks)： 由Linux制定对内核或文件系统等数据处理的基本单位。通常由1个或多个扇区组成。（对Linux操作系统而言） 扇区(Sectors)：块设备的基本单位。通常在512字节到32768字节之间,默认512字节 应用程序进行文件的读写，通过文件系统将文件的读写转换为块设备驱动操作硬件。
HTML5 Canvas编程：http://blog.csdn.net/column/details/canvas-programming.html GTK编程基础学习：http://blog.csdn.net/column/details/sjin-gtk.html Git学习系列：http://blog.csdn.net/column/details/git-lover.html git学习笔记：http://blog.csdn.net/column/details/gitnote.html Git深入体验：http://blog.csdn.net/column/details/gitexperience.html Git菜鸟变大神：http://blog.csdn.net/column/details/lilongsheng-git.html GitHub 漫游指南：http://github.phodal.com/ 全栈增长工程师指南：http://growth.phodal.com/ 全栈增长工程师实战：http://growth-in-action.phodal.com/ Phodal’s Idea实战指南：http://ideabook.phodal.com/ JavaScript 闯关记：https://github.com/stone0090/javascript-lessons css知多少：http://www.cnblogs.com/wangfupeng1988/p/4325007.html Docker入门教程：http://dockone.io/article/111 HTTP cookies 详解：http://bubkoo.com/2014/04/21/http-cookies-explained/ HTTP 接口设计指北：https://github.com/bolasblack/http-api-guide http2讲解：https://bagder.gitbooks.io/http2-explained/content/zh/ innodb源码分析：http://blog.csdn.net/column/details/innodb-zerok.html JavaScript Promise迷你书（中文版）：http://liubin.org/promises-book/ JavaScript：http://blog.csdn.net/column/details/js-lyg.html JavaScript权威指南：http://blog.csdn.net/column/details/webcode.html JavaScript设计模式：http://blog.csdn.net/column/details/design-pattern-of-js.html JavaScript设计模式浅谈：http://blog.csdn.net/column/details/js-patterns.html LGCB：http://happypeter.github.io/LGCB/ linux基础与shell编程：http://blog.csdn.net/column/details/linux-world.html Linux内核读书笔记：http://blog.csdn.net/column/details/linuxnotes.html Linux入门及进阶：http://blog.csdn.net/column/details/dxmy-linux.html Nginx开发：http://blog.csdn.net/column/details/sknginx.html PHP程序员技术精粹：http://blog.csdn.net/column/details/phpjingcui.html PHP入门到精通：http://blog.csdn.net/column/details/phpspecialcolumn.html python3入门学习：http://blog.csdn.net/column/details/python-spider.html Python大法好：http://blog.csdn.net/column/details/python-master.html Python入门学习：http://blog.csdn.net/column/details/enjoypython.html Python学习笔记：http://blog.csdn.net/column/details/python-notes.html scala 从入门到入门+：https://segmentfault.com
2.看样子是 64 位的，然后去找miniconda for Linux 64的最新版本，顺利下载到了 biosoft 目录下
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
在Java中，提供了一些关于使用IO的API，可以供开发者来读写外部数据和文件，我们称这些API为Java IO。IO是Java中比较重要知识点，且比较难学习的知识点。并且随着Java的发展为提供更好的数据传输性能，目前有三种IO共存；分别是BIO、NIO和AIO。
今天是加入生信星球学习的第2天，昨天晚上开组会给我开崩溃了，真的设计不出实验方案啊啊啊，但不管怎么样，今天要元气满满地学好今天的内容
语言无关 MySQL 21分钟MySQL入门教程 MySQL索引背后的数据结构及算法原理 NoSQL Disque 使用教程 Neo4j .rb 中文資源 Neo4j 简体中文手册 v1.8 Redis 命令参考 Redis 设计与实现 The Little MongoDB Book The Little Redis Book 带有详细注释的 Redis 2.6 代码 带有详细注释的 Redis 3.0 代码 PostgreSQL PostgreSQL 8.2.3 中文文档 Postgre
前面一篇中已经介绍了基本IO的使用以及最简单的阻塞服务器的例子，本篇就来介绍下NIO的相关内容，前面的分享可以参考目录： 网络IO的基本知识与概念 普通IO以及BIO服务器 NIO的使用与服务器Hello world Netty入门与服务器Hello world Netty深入浅出 NIO，也叫做new-IO或者non-blocking-IO，就暂且理解为非阻塞IO吧。 为什么选择NIO 那么NIO相对于IO来说，有什么优势呢？总结来说： IO是面向流的，数据只能从一端读取到另一端，不能随意读写。NI
4，Linux不分各种磁盘，文件系统呈现树状，系统目录无法使用，主要可用的是home文件夹
找后缀.sh的点击并复制下载链接（一定要.sh而不是.exe，sh是脚本脚本的意思，我因为搞了个.exe一直错 笑哭）
网上关于BIO和块设备读写流程的文章何止千万，但是能够让你彻底读懂读明白的文章实在难找，可以说是越读越糊涂！
OpenSSL可以直接使用命令对文件件进行base64的编码与解码，利用OpenSSL提供的API同样可以做到这一点。
之后会出现more,是还有更多，让enter翻页的意思，持续按enter，第一个enter下来是空白行，不要担心继续往下按，直到出现
目的：安装64位最新版本（Miniconda3-py39_24.1.2-0-Linux-x86_64.sh）
Java工程师往往容易忽视的一块知识点，其实就是Java网络编程，为什么呢，因为如果我想写一个Java Web项目，我只要用SSM就可以轻松搞定，写好我们的controller、service和dao就可以了，也就是只需要关心业务逻辑，不需要关心前端请求的路由、甚至是后端的负载均衡和网络请求处理，因为这些东西很多时候都被Nginx和Tomcat给吃掉了，Nginx帮我们做好了负载均衡，Tomcat则帮我们完成TCP连接的建立，HTTP请求的处理，把所有复杂的技术细节都给屏蔽了。
按照学习要求练习了几个基本命令：pwd、mkdir、ls、rm、cd、vi、cat、cp、mv。
第一章 入门 本章中，我们将给你关于什么是 MINA、什么是 NIO、我什么我们在 NIO 之上开发了一个框架以及你会在其中找到什么等等的第一认识。我们也将会给你演示如何在一台 MINA 的服务器上运行一个很简单的例子。 NIO 概述 NIO API 是由 Java 1.4 引入的，从此被广泛用于各种应用。NIO API 封装了 IO 非阻塞操作。 首先，最好了解一下 MINA 是基于 NIO 1 写的。Java 7 设计了一个新版本 NIO-2，(因为我们基于 NIO 1) 我们并没有从
上文介绍了网络编程的基础知识，并基于 Java 编写了 BIO 的网络编程。我们知道 BIO 模型是存在巨大问题的，比如 C10K 问题，其本质就是因其阻塞原因，导致如果想要承受更多的请求就必须有足够多的线程，但是足够多的线程会带来内存占用问题、CPU上下文切换带来的性能问题，从而造成服务端崩溃的现象。怎么解决这一问题呢？优化呗，所以后面就有了NIO、AIO、IO多路复用。本文将对这几个模型详细说明并基于 Java 编写 NIO。
传统的机械硬盘一般为3.5英寸硬盘，并由多个圆形蝶片组成，每个蝶片拥有独立的机械臂和磁头，每个堞片的圆形平面被划分了不同的同心圆，每一个同心圆称为一个磁道，位于最外面的道的周长最长称为外道，最里面的道称为内道，通常硬盘厂商会将圆形蝶片最靠里面的一些内道(速度较慢，影响性能)封装起来不用；道又被划分成不同的块单元称为扇区，每个道的周长不同，现代硬盘不同长度的道划分出来的扇区数也是不相同的，而磁头不工作的时候一般位于内道，如果追求响应时间，则数据可存储在硬盘的内道，如果追求大的吞吐量，则数据应存储在硬盘的外道；
在计算机的世界里，我们可以将业务进行抽象简化为两种场景——计算密集型和IO密集型。这两种场景下的表现，决定这一个计算机系统的能力。数据库作为一个典型的基础软件，它的所有业务逻辑同样可以抽象为这两种场景的混合。因此，一个数据库系统性能的强悍与否，往往跟操作系统和硬件提供的计算能力、IO能力紧密相关。
Conda是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统，主要用于Python程序，但也可以用于其他编程语言。它能够跨平台运行，支持多种操作系统，如Linux、OS X和Windows。Conda主要用于安装和管理软件包及其依赖关系，可以在不同环境中轻松切换，使得软件包的安装和管理更加方便。
从官网下载openssl源码和 libcurl源码。OpenSSL顺利交叉编译通过。
Block Layer层在整个I/O中负责承上启下，上接文件系统，下接块驱动。 我不想直接讨论代码，希望从一个架构的演变来初探一下Block Layer层。
按照ldd的说法，linux的设备驱动包括了char，block，net三种设备。char设备是比较简单的，只要分配了major、minor号，就可以进行读写处理了。相对而言，block和net要稍微复杂些。net设备姑且按下不谈，我们在以后的博文中会有涉及。今天，我们可以看看一个简单的block是怎么设计的。
研究IO也很久了，一直无法串联bio和块设备驱动，只知道bio经过IO调度算法传递到块设备驱动，怎么过去的，IO调度算法在哪里发挥作用，一直没有完全搞明白，查看了很多资料，终于对块设备驱动有所理解，也打通了bio到块设备。
Bio-Linux是功能齐全的、强大的、可定制的、易于维护的生物分析工作站。Bio-Linux基于Ubuntu提供500多个生物分析程序，由一个图形化的菜单进行管理，能方便地访问到其生物分析文档系统及对测试程序有用的样本数据。用于处理新型序列数据类型的Bio-Linux软件包可额外安装。
学习路线图往往是学习一样技术的入门指南。网上搜到的Java学习路线图也是一抓一大把。
原文转载：http://blog.csdn.net/21aspnet/article/details/6694485
进入网址：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
redis.conf中的appendfysnc是对redis性能有重要影响的参数之一。可取三种值：always、everysec和no。
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