Blast2go本地化教程网上也有不少，但是都是13年之前的，由于最近有这个需求，我也重新收集了下资料，然后整理了下： 主要参考： http://blog.shenwei.me/local-blast2go-installation...GO: 基因本体论注释数据库 这里我们就讲解如何本地化Blast2go完成蛋白序列到GO数据库的注释。...（名字随意），解压上述文件，并将所有文件都放到blast2go目录下，然后cd到blast2go目录下，进行后续操作，文件总共有这几个： b2gdb.sql b2gdb.sql~ gene2accession...:mysql-connector-java-5.0.8-bin.jar: ImportIdMapping /home/anlan/blast2go/idmapping.tb localhost b2gdb...blast2go blast4it 测试 理论上，上述的步骤都没报错的话，下面的测试肯定没问题的 下载官网的测试例子https://blast2go.com/data/blast2go/b2g4pipe_v2.5
以前的话，非模式生物要用blast2go跑电子注释，而blast2go又需要使用MySQL，没有root权限的话非常麻烦。
而blast2go虽然可以一步到位帮你完成功能注释，但它是收费的。这时，我们可以使用eggnog-mapper进行功能注释。
SeqExpress；SerbGO；SOURCE；Spotfire Gene Ontology Advantage Application；STEM；T-Profiler；THEA； 5.其它工具：APID；Blast2GO
定量：featureCounts 去除FPKM<0.1的LincRNAs LincRNA功能注释： Blast2GO 比对到拟南芥、水稻、高粱、苜蓿属、短柄草属 Pvalues<0.05 topGO
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