Blast2go本地化教程网上也有不少，但是都是13年之前的，由于最近有这个需求，我也重新收集了下资料，然后整理了下： 主要参考： http://blog.shenwei.me/local-blast2go-installation...GO: 基因本体论注释数据库 这里我们就讲解如何本地化Blast2go完成蛋白序列到GO数据库的注释。...（名字随意），解压上述文件，并将所有文件都放到blast2go目录下，然后cd到blast2go目录下，进行后续操作，文件总共有这几个： b2gdb.sql b2gdb.sql~ gene2accession...:mysql-connector-java-5.0.8-bin.jar: ImportIdMapping /home/anlan/blast2go/idmapping.tb localhost b2gdb...blast2go blast4it 测试 理论上，上述的步骤都没报错的话，下面的测试肯定没问题的 下载官网的测试例子https://blast2go.com/data/blast2go/b2g4pipe_v2.5
以前的话，非模式生物要用blast2go跑电子注释，而blast2go又需要使用MySQL，没有root权限的话非常麻烦。
而blast2go虽然可以一步到位帮你完成功能注释，但它是收费的。这时，我们可以使用eggnog-mapper进行功能注释。
SeqExpress；SerbGO；SOURCE；Spotfire Gene Ontology Advantage Application；STEM；T-Profiler；THEA； 5.其它工具：APID；Blast2GO
Linux 文件系统 目录 说明 bin 存放二进制可执行文件 sbin 存放二进制可执行文件，只有 root 才能访问 boot 存放用于系统引导时使用的各种文件 dev 用于存放设备文件 etc...是超级管理员 localhost 表示主机名 ~ 表示当前目录（家目录），其中超级管理员家目录为 /root，普通用户家目录为 /home/chan $ 表示普通用户提示符，# 表示超级管理员提示符 Linux...test.tar.gz 文件搜索命令 locate：在后台数据库搜索文件 updatedb：更新后台数据库 whereis：搜索系统命令所在位置 which：搜索命令所在路径及别名 find：搜索文件或文件夹 用户和组 Linux
Linux文件操作 Linux中，一切皆文件(网络设备除外)。 硬件设备也“是”文件，通过文件来使用设备。 目录(文件夹)也是一种文件。...boot:这里存放的是启动Linux时使用的一些核心文件，包括一些连接文件和镜像文件。...deb:deb是Device(设备)的缩写，该目录下存放的是Linux的外部设备，在Linux中访问设备的方式和访问文件的方式是相同的。...系统会自动识别一些设备，例如U盘、光驱等，当识别后，Linux会把识别的设备挂载到这个目录下。...---- Linux文件的操作方式 文件描述符fd fd是一个大于等于0的整数。 每打开一个文件，就创建一个文件描述符，通过文件描述符来操作文件。
相信很多在linux平台工作的童鞋, 都很熟悉管道符 '|', 通过它, 我们能够很灵活的将几种不同的命令协同起来完成一件任务.就好像下面的命令: echo 123 | awk '{print $0+123...EAGAIN 如果所有管道写端对应的文件描述符被关闭，则read返回0 如果所有管道读端对应的文件描述符被关闭，则write操作会产生信号SIGPIPE 当要写入的数据量不大于PIPE_BUF时，linux...当要写入的数据量大于PIPE_BUF时，linux将不再保证写入的原子性。
一、Linux下的用户分类 在Linux下，有两种用户，一种是超级用户，一种是普通用户 超级用户：可以再linux系统下做任何事情，不受权限限制（制定规则，但不需要遵守规则） 普通用户：在linux...2、Linux中的所有用户都要有自己的密码，无论是root还是普通用户，并且root的密码和普通用户的密码尽量不要一样！！...二、Linux权限的概念 什么叫做权限呢？？通俗一点说就是一件事情是否允许你做！ ...后缀无意义但需要 Linux系统中，文件名后缀没有没有直接的意义。 ...所以Linux中的文件是否需要使用后缀，具体看用户的需求！！
---- O_SYNC 缓存同步 为了保证磁盘系统与缓冲区内容一致，Linux系统提供了sync,fsync,fdatasync三个函数。...---- Linux文件IO流程图 内核中会有一个线程，不断地将高速页缓冲区中的数据写入到物理磁盘中。
linux安装.net 下载.net https://dotnet.microsoft.com/download/thank-you/dotnet-sdk-2.1.4-linux-x64-binaries...下载安装包后执行命令： dotnet-sdk-2.1.302-linux-x64.tar.gz yum install libicu -y cd /root ln -s /data1/soft /data.../soft tar zxvf dotnet-sdk-2.1.302-linux-x64.tar.gz -C /data1/soft/dotnet/ echo 'export DONET_ROOT=$PATH
在 Linux 系统中，网络配置是非常重要的，它涉及到网络接口、IP 地址、子网掩码、网关、DNS 等多个方面。...本文将介绍如何在 Linux 系统中配置网络，包括设置静态 IP 地址、修改主机名、配置 DNS 服务器等内容。...查看网络接口在 Linux 系统中，可以使用 ifconfig 命令来查看当前系统的网络接口信息。...其它的内容这里先暂且不讲，这里先继续根据 在 windows 上搭建一台 Linux，这篇文章的内容来继续写，在这篇文章中，已经将系统搭建完成了，这篇文章主要就是调通网络。...这么一来，我们的网络就配置好了，然后我们可以在 Linux 系统中访问外部网络了。
为了解决内存紧缺的问题，Linux引入了虚拟内存的概念。为了解决快速存取，引入了缓存机制、交换机制等。...要深入了解Linux内存运行机制，需要知道下面提到的几个方面。 首先，Linux系统会不时地进行页面交换操作，以保持尽可能多的空闲物理内存。...其次，Linux进行页面交换是有条件的，不是所有页面在不用时都交换到虚拟内存中，Linux内核根据“最近最经常使用”算法，仅仅将一些不经常使用的页面文件交换到虚拟内存中。...Linux虽然可以在一段时间内自行恢复，但是恢复后的系统已经基本不可用了。...Linux下可以使用文件系统中的一个常规文件或者一个独立分区作为交换空间。同时Linux允许使用多个交换分区或者交换文件。
Linux ESC :wq 和:wq!的区别 Linux ESC:wq 和:wq!...的区别 发布者：IT人在线 ｜ 发表时间：2018-12-4 17:20:43 Linux ESC :wq esc(键退出)->:(符号输入)->wq(保存退出) wq(存盘并退出 write%quite
从今天开始陆续分享Linux的知识 因为服务器基本是Linux的 所以Linux不学明白 Shell命令不熟 会让你的办事效率大打折扣。 一。...Linux文件系统 Linux文件系统是从Unix结构严进过来的。总结一下Linux顶层虚拟目录及其文件内容。 ?
文件锁 前言 /proc是一个特殊的文件系统。 该目录下文件用来表示与启动、内核相关的特殊信息。 /proc/cpuinfo——CPU详细信息 ...
shell 对于Linux，有相同的作用，主要是对我们的指令进行解析，解析指令给Linux内核。反馈结果在通过内核运行出结果，通过shell解析给用户。...2.3 Linux中的用户 Linux下有两种用户：超级管理员（root）、普通用户。 超级管理员(root)：可以再linux系统下做任何事情，不受权限约束 普通用户：在linux下做有限的事情。...Linux具有组的概念，主要是在多人协作的时候，更好的进行权限管理！...而在Linux中不通过后缀区分文件类型！但并不是说Linux不用后缀。 那通过什么区分呢？即ls -l第一个属性列。 Linux文件类型： -：普通文件。...很简单一个道理，Linux系统不以文件后缀作为区分文件类型的依据，但并不代表gcc不需要，Linux系统 != gcc。
Linux系统调用 前言 操作系统——管理计算机硬件与软件资源的软件，是用户和系统交互的操作接口，为它上面运行的程序提供服务。...例如Linux。 Linux操作系统——基于Linux内核的操作系统。通常由Linux内核、shell(特殊的应用程序，提供运行其他程序的接口)、文件系统和应用程序组成。...Linux的运行空间: Linux的运行空间:内核空间+用户空间 ---- 内核空间——存放的是整个内核代码和所有内核模块，以及内核所维护的数据。 用户空间——用户程序的代码和数据。...Linux系统内核响应软件中断，从用户态切换到内核态，执行相应的系统调用。
二.man指令 众所周知，Linux的指令有很多，指令的选项也有很多，我们不可能全记住，但可以通过查看联机手册获取帮助，只需要用到 man指令，然后加上你要查的内容即可。...五.Linux 下一切皆文件 在Linux系统下，一切皆文件，文件就有读写功能，包括键盘啊，显示器啊什么的，这些都有读写功能。
一、Linux基本命令 i=1; while [ i -le 100 ]; do echo “hello world” i >> text.txt ; i = 首先我们介绍一下这个语句，这是一个循环语句...我们只需要记住几个组合就行 组合 作用 -czf 打包压缩 -tzf 预览 -xzf 解压 tar为打包后缀，gz为压缩后缀，tgz为打包压缩后缀，它可以直接进行多个文件打包压缩 20、bc指令 bc指令的作用就是召唤Linux
一.Linux中的用户 Linux中分为两种用户，分别为： 1.root 用户，也叫超级用户，它的权限非常高，不受其他权限的约束，也就是可以为所欲为； 2.普通用户：除了root用户外，都是普通用户...二.什么是权限 1.权限和人有关； Lniux中，这里的“人”指的是： a，所有者 b，所属组 c，其他 2.权限和事物的属性有关 Linux下一切皆文件，而文件具有可读...Linux中给出一个叫粘滞位的概念。 粘滞位 语法：chmod +t 文件 加了粘滞位的文件： 1、超级管理员删除 2、该文件的所有者删除 加上粘滞位后，原来的 x 会变成 t 。
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