, 这是最好的.
2, 如果一定要进行two-stage, 即先计算校正值, 然后进行GS或者GWAS, 那么推荐使用品种的BLUE值, 而不是BLUP值....文献1:
这篇文章是冬小麦GS的文章.
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这里, 计算了小区遗传力, 残差除以每个基因型的调和平均数. 同时, 在模型中, 将品种作为固定因子, 计算了BLUE值.
?...这里, 使用了BLUE值, 而不是动物育种中的BLUP值.
估计了13个环境的遗传力, 计算了每一个环境的BLUE值....在小麦育种中, 重点选择的是基因型值, 而不是育种值, 因此, 相比较BLUP值, BLUE值更适合.(这句话有点费解)
?...那么, LSMeans, BLUE, BLUP值有什么区别呢?可以见我之前写的文章:GWAS分析中表型值是使用BLUE值还是BLUP值?