文档建议反馈控制台
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
最新优惠活动
文章/答案/技术大牛
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

GWAS计算BLUE值2--LMM计算BLUE值

GWAS计算BLUE值2--LMM计算BLUE值 #2021.12.12 本节，介绍如何使用R语言的lme4包拟合混合线性模型，计算最佳线性无偏估计（blue） 1....使用lme4包进行blue值计算 这里，使用lme4包进行blue值计算，然后使用emmeans包进行预测均值（predict means）的计算，这样就可以将predict means作为表型值进行GWAS...「注意，lme4直接计算的固定因子（RIL）的效应值（BLUE值），不是我们最终的目的，因为它是效应值，有正有负，我们需要用预测均值将其变为与表型数据尺度一样的水平。」...，predicted.value这一列就是blue值，两者结果一致。...95%的同学，在计算GWAS分析表型值计算时，都是用上面的模型计算出blue值，然后直接进行计算，其实还有更好的模型。

1.1K30

Jenkins 之 Blue Ocean

Blue Ocean是什么 Blue Ocean 是 pipeline 的可视化UI。同时兼容经典的自由模式的 job。...Jenkins Pipeline 从头开始设计，但仍与自由式作业兼容，Blue Ocean 减少了经典模式下的混乱并为团队中的每个成员增加了清晰度。...Blue Ocean 的主要特点包括： 持续交付 (CD) 管道的复杂可视化，允许快速直观地了解管道的状态 管道编辑器- 通过引导用户通过直观和可视化的过程来创建管道，使管道的创建变得平易近人 个性化以适应团队每个成员基于角色的需求...Blue Ocean 显示了管道中需要注意的地方，促进异常处理并提高生产力 分支和拉取请求的本机集成，在与 Git 服务中的其他人协作编写代码时，可最大限度地提高开发人员的生产力 2....使用 Blue Ocean 创建流水线 -> Git 输入源码仓库URL，输入git服务器的用户名和密码；然后点击创建证书 然后点击创建流水线。

90910
您找到你想要的搜索结果了吗？
是的
没有找到

GWAS计算BLUE值3--LMM考虑残差异质计算BLUE值

GWAS计算BLUE值3--LMM考虑残差异质计算BLUE值 #2021.12.13 本节，介绍如何使用R语言的asreml包拟合混合线性模型，定义残差异质，计算最佳线性无偏估计（blue） 1....使用asreml计算BLUE值（定义残差同质） library(asreml) m1 = asreml(height ~ RIL, random = ~ location + location:RIL...使用asreml计算BLUE值（定义残差异质） m2 = asreml(height ~ RIL, random = ~ location + location:RIL + location:rep,residual...两个模型达到极显著，所以定义残差异质的模型是更好的。 所以，该数据，应该选择地点异质的模型作为计算BLUE值的模型。 6....计算最优模型的BLUE值 re2 = predict(m2,classify = "RIL")$pval %>% as.data.frame() head(re2) 7.

70420

持续交付-Blue Ocean 应用

Blue Ocean 特性： 流水线编辑器：用于创建贯穿始终的持续交付流水线，是一种直观并可视化的流水线编辑器。 流水线的可视化：对流水线的可视化表示，提高了全企业范围内持续交付过程的清晰度。...安装完成之后重启 Jenkins 进程，之后就可以在 Jenkins 页面上看到 Blue Ocean 的图标。单击 Blue Ocean 图标启动即可启动 Blue Ocean。...在 Blue Ocean 中创建 Pipeline 在 Blue Ocean 中单击 New Pipeline 创建新的流水线。...Blue Ocean 图形化编辑工作流 图片 编辑完后会生成 Jenkinsfile，并提交到你的代码库根目录，你可以选择提交到 master 分支或者提交到一个新创建的分支。...Blue Ocean 任务进度查询 图片 查看日志视图 单击任务中对应的工作节点，可以查询任务运行过程中的日志详情。

42000

Blue Ocean重新思考Jenkins用户体验

Blue Ocean 重新思考Jenkins的用户体验，从新开始设计Jenkins Pipeline, 但仍然与自由式作业兼容，Blue Ocean减少了混乱而且进一步明确了团队中每个成员 Blue Ocean...Pipeline 编辑器 - 引导用户通过直观的、可视化的过程来创建Pipeline，从而使Pipeline的创建变得平易近人。 个性化 以适应团队中每个成员不同角色的需求。...Blue Ocean 展示 Pipeline中需要关注的地方， 简化异常处理，提高生产力 本地集成分支和合并请求, 在与GitHub 和 Bitbucket中的其他人协作编码时实现最大程度的开发人员生产力...blue ocean入口，或直接在url中添加 /blue。 blue ocean 首页 ---- 创建流水线 选择项目的代码库信息，这里使用的gitlab，暂时选择Git。...接下来选择创建流水线 进入了流水线的编辑页面，对于新同学比较好理解，这其实就是在自定义流水线的过程。我们先来配置一下流水线将要运行的节点，这里默认使用的是master节点。

1.9K10

多年多年数据如何计算BLUE值

解答：可以使用多个表型值的平均值，作为品种的表型值，现在有更好的方法：BLUE值。 2. 为何使用BLUE值？ 一般，有两个选择，BLUE值或者BLUP值，在GWAS中大都使用的BLUE值。...BLUE和BLUP的区别： BLUE值是混合线性模型中固定因子的估计效应值 BLUP值是混合线性模型中随机因子的估计效应值 BLUE和BLUP的代表： BLUE值着重在于评估品种现在的表现 BLUP值着重在于预测品种将来的表现...BLUE和BLUP的方差变化 BLUE只是对表型值根据地点，年份进行矫正，得到的数据和原来数据尺度一样 BLUP值会对表型数据进行压缩 3....数据中的lsmeans即为品种的BLUE值，可以作为GWAS或者GS的表型值进行后续的计算。...结果中的predicted.value即为品种的BLUE值。

2.4K30

用Rust编写的Vivo Blue OS

有几个大字赫然的映入眼帘在老者的眼眸中，Blue OS。 并用不太流利的中式英文说出：卜路 哦爱四。这是啥玩意，该不会和CNMIOS是一个东西哇。...此时，少年停止了抖动，极力控制住自己，并用几乎癫狂的声音从它那个「公鸭嗓」中挤出一句话： ❝Blue OS是用Rust编写的「全球首款」操作系统的系统框架 ❞ 此时老者还不相信自己的眼睛，又把眼镜取下哦...不得不说，在操作系统面前，前有Harmony OS，后有CNMIOS,这又来了一个Blue OS 所以，我们今天就来介绍一下Blue OS。...│ └── manifest.json 项目配置文件，配置应用图标、页面路由等 └── jsconfig.json js 配置文件，用于语法校验 └── package.json...greeting }} .greeting { color: red; font-weight: bold; } 这就应证了上面说的Blue

26120

使用 Jenkins Blue Ocean 构建 Android 项目

Blue Ocean 是 Jenkins 推出的一套新的 UI，对比经典 UI 更具有现代化气息。2017 年 4 月 James Dumay 在博客上正式推出了 Blue Ocean 1.0。...兼容 Blue Ocean 的 Jenkins 版本只需要安装插件即可使用，对于已经在使用 Pipeline 构建的 Jenkins Job 基本可以无缝切换到新 UI。...在 Jenkins 插件管理中安装 Blue Ocean Plugin 与 Android Signing Plugin 插件。...Jenkinsfile 参考文档：Blue Ocean Pipeline Syntax Pipeline Steps Reference Pipeline 功能在之前的 Jenkins 版本中已经存在了...参数 使用 parameters 块来声明参数化，不过由于 Blue Ocean 与 Declarative Pipeline 都是新生事物，所以当前支持的参数类型有限，需要等待社区扩展或者以 Scripted

1.8K20

BZOJ 1568: Blue Mary开公司(超哥线段树)

若单词为Query，则后接一个整数T，表示Blue Mary询问第T天的最大收益。 ...若单词为Project，则后接两个实数S，P，表示该种设计方案第一天的收益S，以及以后每天比上一天多出的收益P。 提示：本题读写数据量可能相当巨大，请选手注意选择高效的文件读写方式。...超哥线段树是处理一次函数的一种线段树， 在超哥线段树中，每一个节点保存着一个一次函数所对应的编号， 那他是怎么保存的呢？ 借用一位大神的图片 ?...没错就是这样， 然后对于每一次插入操作， 我们去递归当前 值小的节点 的值 可能比 值大的节点 的 值 大的方向。。。。。。。...if(pd(now,tree[k],l)) tree[k]=now; return ; } int mid=(l+r)>>1; if(a[now].k>a[tree[k]].k)// 当前点的斜率比目标点的斜率大

82680

更换主题-七彩之家BLUE2.0以及后续的修改

更换主题-七彩之家BLUE2.0以及后续的修改 作者：matrix 被围观: 9,648 次 发布时间：2013-07-31 分类：Wordpress 兼容并蓄 零零星星 | 2 条评论 »...这是一个创建于 3319 天前的主题，其中的信息可能已经有所发展或是发生改变。...强大的小墙、强大的功能、更是辛苦了的自说Me话 图片有点不科学，打开的时候要注意啦 同学~ 无意中发现个好看的cms主题BLUE2.0之后就果断跟换，然后就一连串的修改调整。。。.../my-quicktags.js', array('quicktags') ); } 主题目录内添加my-quicktags.js文件： QTags.addButton...\jquery.js中添加控制语句： /*************************** Toggle伸缩 就少了”jQuery(document).ready(function(){“这句ready

28320

基于Docker平台的Jenkins安装与Blue Ocean使用入门（1）

该镜像包含当前的长期支持 (LTS) 的Jenkins版本 （可以投入使用） ，捆绑了所有Blue Ocean插件和功能。这意味着你不需要单独安装Blue Ocean插件。...3.点击 可用的 选项卡，然后在 过滤 文本框键入 blue ocean ，将过两次插件列表为名称/描述包含“blue”和“ocean”的插件名单。...注意：   无需选择此过滤列表中其他插件的复选框，因为 Blue Ocean 插件具有其他插件的依赖关系（构成Blue Ocean的插件套件），当您点击安装， 其他插件将被自动选择和安装。...访问 Blue Ocean   一旦Jenkins环境安装了Blue Ocean，登录到Jenkins经典UI 后，您可以通过点击左侧的 打开Blue Ocean 来访问Blue Ocean页面。...或者，您可以在您的Jenkins url后面追加 /blue 直接访问Blue Ocean (如 http://192.168.2.73:8080/blue)。

1.4K20

Windows Blue首个测试版将于7月发布

事实上，在Windows 8发布之后，微软仍然在通过更新的方式对其进行完善和优化。随着时间的推移，有关Windows Blue的传言也越来越多。...而目前受到公认的是，Blue将会是Microsoft全系列产品的一次统一升级，而不仅仅是Windows系列。...第一个Windows Blue测试版将在六月下旬面向所有开发人员发布。 谈到Windows Blue，Julie Larson-Green表示这次的更新将会非常的轻松。...即便如此，有关Windows Blue的技术细节我们仍然知之甚少。甚至于这次更新的名字都还没有一个官方的说法。...尽管微软仍然对Windows Blue采取保密态度，但是我们仍然能从首席财务官的博客上找到一些蛛丝马迹： Windows Blue将提供更加广泛的创新平台，支持更多尺寸的设备，更好的电源管理和性能，

24520

GWAS多环境表型数据用BLUE值还是BLUP值？

, 这是最好的. 2, 如果一定要进行two-stage, 即先计算校正值, 然后进行GS或者GWAS, 那么推荐使用品种的BLUE值, 而不是BLUP值....文献1: 这篇文章是冬小麦GS的文章. ? 这里, 计算了小区遗传力, 残差除以每个基因型的调和平均数. 同时, 在模型中, 将品种作为固定因子, 计算了BLUE值. ?...这里, 使用了BLUE值, 而不是动物育种中的BLUP值. 估计了13个环境的遗传力, 计算了每一个环境的BLUE值....在小麦育种中, 重点选择的是基因型值, 而不是育种值, 因此, 相比较BLUP值, BLUE值更适合.(这句话有点费解) ?...那么, LSMeans, BLUE, BLUP值有什么区别呢?可以见我之前写的文章:GWAS分析中表型值是使用BLUE值还是BLUP值？

1.6K20

B站最火数学视频3Blue1Brown是如何制作的

授权转发自 知乎网友 李狗嗨 原文地址：https://www.zhihu.com/question/57357012/answer/723888621 相信很多人都知道3Blue1Brown，这是一个由斯坦福大学的数学系学生...现在最新的版本是基于Python 3的，以前的基于Python 2.7的教程已经不再适用于当前代码。所以在安装过程中，遇到了不少新问题，在解决的过程中记录了这些新问题的解决方法。并形成此文。...这里的演示也是基于Windows 10 系统，在安装Anaconda的基础上完成的。...选择”环境变量”-“用户变量”中的”Path”-“编辑”-“新建”。 ? 然后把解压后的FFmpeg的bin文件夹的路径和dvisvgm的dvisvgm文件夹路径添加进去，并选择确定。...如果安装成功，感谢点赞支持，如果配置遇到什么问题，欢迎在评论区留言~ (注：本教程仅针对Windows 10 64位系统） 3Blue1Brown的B站主页： https://space.bilibili.com

3K20

GWAS计算BLUE值1--计算最小二乘均值（lsmeans）

GWAS计算BLUE值1--计算最小二乘均值（lsmeans） #2021.12.11 上一次，我计划写个系列，为何？...要用BLUE值作表型进行GWAS分析，GWAS分析多年多点或者一年多点的数据时，如何计算矫正后的均值（BLUE值），肝了一上午，写了四篇，从原理到计算方法到代码展示，后面四天的素材就有了，总结一些东西，...系数的结果是： 注意，这里的值是系数，不是最小二乘均值。...这里，如果我们要计算第一个品种RIL1的lsmeans（最小二乘均值），我们需要： 即我们需要整体均值 + 品种RIL1的回归系数 + 地点的效应平均值 + 地点内区组效应品均值 + 品种RIL1和地点互作的效应品均值...总结 一般，很少用一般线性模型去估算最小二乘均值，都是用混合线性模型，将品种作为固定因子，去估计BLUE值（最佳线性无偏估计）。

86620

Twitter Blue订阅引发冒牌危机

据Bleeping Computer 11月10日消息，Twitter在近期推出的“ Twitter Blue”蓝色认证功能已开始被网络不法分子以冒充的形式滥用，让这项每月需花费7.99美元的订阅服务的认证机制及安全性受到质疑...Twitter Blue订阅服务能够为用户账号提供优先推文、更少的广告、发布更长的媒体内容等特权，而最引人注目的特征，则是会在账号名称后面加上一个表示“已验证”的蓝色徽标。...在马斯克的例子中，虚假帐号直接从马斯克的真实帐号全盘复制个人资料，并通过了Twitter Blue认证。...【真（右）假（左）马斯克推特账号都带有蓝色认证】 到目前为止，区分是否经Twitter Blue订阅认证的账号的唯一方法是点击账号的蓝色认证徽标，查看弹窗中的认证说明信息，过去以知名人士或组织机构身份认证的账号会被描述为...11月初，马斯克在接管Twitter后正式推出Twitter Blue订阅服务，在此之前，马斯克就曾表示，要改进该平台的认证流程，但Twitter Blue所带来的这一混乱局面已经引发诸多不满。

33630
点击加载更多

扫码

添加站长 进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云

扫码加入开发者社群

相关资讯

热门标签

更多标签

活动推荐

    运营活动

    活动名称
    广告关闭

    腾讯云开发者

    扫码关注腾讯云开发者

    扫码关注腾讯云开发者

    领取腾讯云代金券

    热门产品

    热门推荐

    更多推荐

    Copyright © 2013 - 2024 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有

    深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 深公网安备号 44030502008569

    腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号 | 京公网安备号11010802020287

    领券