Manta 是 illumina 公司开发的一款用于检测结构变异 Structural Variant 和 Indel 的软件,Manta 检测 SV 和 Indel 分为两个主要步骤:(1)扫描基因组以找到SV相关区域,以及(2)分析,评分和输出在这些区域发现的SV。其输出的结果可以作为 strelka 的输入,以提高 strelka 对 indel 检测的准确性。 值得注意的事,该软件既可以用于 germline SV 的检测(家系样本),也可以用于 Somatic SV 的检测(肿瘤样本)
使用C语言编写嵌入式SQL以访问DB2的程序,DB2预编译器可以将SQL语法直接转换为DB2行时服务应用程序编程接口(API)调用。
EvoSuite是由Sheffield等大学联合开发的一种开源工具,用于自动生成测试用例集,生成的测试用例均符合Junit的标准,可直接在Junit中运行。得到了Google和Yourkit的支持。
https://www.scala-lang.org/download/2.11.12.html
首先声明,这不是一份指南,这是一份失败的操作流水记录。我得到的最终结果:编译成功,但是无法运行,放弃在 Mac 平台直接使用此工具,乖乖用 Linux 或者容器环境。
64位os下为啥要编译hadoop就不解释了,百度一下就能知道原因,下面是步骤: 前提:编译源码所在的机器,必须能上网,否则建议不要尝试了 一. 下载必要的组件 a) 下载hadoop源码 (当前最新的稳定版是2.6.0) 地址 http://mirrors.hust.edu.cn/apache/hadoop/common/stable/hadoop-2.6.0-src.tar.gz b) 下载apache-ant (centos自带的ant版本太低,编译过程中会报错) 地址: http://mirro
② 修改 spark-env.sh 文件,添加 JAVA_HOME 环境变量和集群对应的 master 节点
1.下载用于Ubuntu的Oracle JAVA JDK 选择正确的版本,记得做一次MD5效验。
提到了.mvn/wrapper/maven-wrapper.jar和当前jdk版本不兼容…
1.Macbook 安装了Eclipse,Eclipse装入插件maven & git , 可是在git中clone project 的时候,常常会报错:
在项目开发过程中,我们经常需要将一些公共方法提取出来,然后单独封装成一个第三方公共jar包,采用普通的方式打包后的jar,依赖的工程执行编译时,却提示找不到对应的依赖包,那么如何将工程打包为可执行jar包呢?
我们要写java代码,需要安装jdk,那我们要使用maven,也类似,需要在我们的机器中安装maven。
Docker 技术发展为微服务落地提供了更加便利的环境,使用 Docker 部署 Spring Boot 其实非常简单,这篇文章我们就来简单学习下。
删除临时函数 drop temporary function tolowercase
日常开发当中,业务人员经常会遇到一些重复性整理表格的事情,这时候,就可以通过一些方式进行自动化程序处理,提高工作(摸鱼)效率。
EvoSuite是由Sheffield等大学联合开发的一种开源工具,用于自动生成测试用例集,生成的测试用例均符合Junit的标准,可直接在Junit中运行。
这次代码拉取成功,但是构建仍然失败,原因包括maven没安装(mvn命令不识别)、目录路径未识别
有时候,由于项目的需要,我们会将源码编译后以工具包(class打成jar包)的形式对外提供,此时, 你的 jar 包不一定要是可执行的,只要能通过编译,能被别人以 import 的方式调用就行了。但还有的 情况是,我们的 jar 包是要可执行的,即能直接在 cmd 下直接运行。前者的打包很简单,在 eclipse 中, 直接选中要打包的 java 文件和其它资源、依赖文件, export → Java → JAR file 即可。需要注意的是, 这种方式导出的 jar 包是
Docker 技术发展为微服务落地提供了更加便利的环境,使用 Docker 部署 Spring Boot 其实非常简单,这篇文章我们就来简单学习下。 首先构建一个简单的 Spring Boot 项目,然后给项目添加 Docker 支持,最后对项目进行部署。 一个简单 Spring Boot 项目 在 pom.xml 中 ,使用 Spring Boot 2.0 相关依赖 <parent> <groupId>org.springframework.boot</groupId> <artifactId>sprin
https://img2020.cnblogs.com/blog/1871335/202006/1871335-20200604173550160-1696672787.png
(抱歉各位,之前发布的内容当中视频嵌入成“迁移 KTS”那一节的视频了,这次重新发布,更正视频内容,感谢大家的支持!)
现在我们的 Gradle 脚本都迁移到 KTS 了。接下来我们要考虑的问题是,能不能添加一些好用的扩展,方面后续脚本的编写?
原因:flink1.8版本之后已弃用该参数,ResourceManager将自动启动所需的尽可能多的容器,以满足作业请求的并行性。解决方法:去掉即可
3.3. UDF 开发实例 3.3.1. Step 1 创建 Maven 工程 <dependencies> <dependency> <groupId>org.apache.hive</groupId> <artifactId>hive-exec</artifactId>
你可以自由的使用任何一种 spring 框架技术定义 bean 和他们之间的依赖. 简单起见,我们通常通过@ComponentScan 寻找你的 beans,结合使用@Autowired构造器注入工作的很好.
新建完成之后,IDEA右下角会有一个弹框提示,选择开启,IDE会自动将填写的依赖下载同步到本地
java_home地址可以用echo $JAVA_HOME 输出 (前提是/etc/profile有export)
1. 不要使用最新的 Maven3.1.1,与Maven3.0.x存在兼容性问题,所以老是出现java.lang.NoClassDefFoundError: org/sonatype/aether/graph/DependencyFilter之类的错误。
yum -y install lzo-devel zlib-devel gcc autoconf automake libtool gcc-c++ openssl-devel ncurses-devel
Ubuntu/UbuntuKylin平台下源码编译Ambari 2.4 1、Ubuntu环境配置 1.1 网络配置 kylin@Ubuntu:~$ sudo vim /etc/network/interfaces \# interfaces(5) file used by ifup(8) and ifdown(8) auto ens32 iface ens32 inet static address 192.168.1.166 gateway 192.168.1.1 netmask 255.255.255.
注意下载linux版本JDK的时候不能直接通过wget这种直接链接下载,否则会解压不成功,应该打开原官网,点击同意许可后点击下载(这种方式下载很慢),比较好的方式是复制下载页的地址到迅雷,通过迅雷打开该下载页,同意许可后点击下载。
Maven下载地址http://maven.apache.org/download.cgi
Mvn是开发人员比较常用的一个项目管理工具,主要是对项目的创建,编译,打包操作,命令简单使用。接下来简单总结一下常用的命令。
这边篇文章主要是来讲解我们日常开发中碰到一些Maven包冲突的一个解决方案。如何去一步一步进行排查,然后找到思路解决某一个固定的痛点和问题。在我们日常的导入包当中,可能不经意间就会导入一些相同类名的包或者路径的包。因为不同的包,它可能依赖某一个版本的可能不是同一个版本,这样就会导致一个冲突产生。可能版本不一致也有一定的原因。
在这里使用yum来安装java的jdk,可以使用指令yum search java | grep jdk来查看yum下提供了哪些jdk版本。这里选择1.8版本,安装指令为:sudo yum install java-1.8.0-openjd
Scala下载地址:https://www.scala-lang.org/download/
jenkins部署本环节分为两部分,上篇主要介绍jenkins部署环节时的基础环境配置,下篇介绍如何利用jenkins把项目发布到远程服务器中。本环节的相关软件环境有maven、svn(git理论上也差不多)
点击保存,然后点击左侧的Build Now,出现Build success就成功了~
为了持续地进行信息的更新,以及对账本进行管理(写入交易,进行查询等),区块链网络引入了智能合约来实现对账本的访问和控制;智能合约在 Fabric 中称之为 链码,是区块链应用的业务逻辑。
既然是VM,那肯定也是一个虚拟机,那它跟JVM有关系吗?有一定关系,GraalVM 可以完全取代上面提到的那几种虚拟机,比如 HotSpot。把你之前运行在 HotSpot 上的代码直接平移到 GraalVM 上,不用做任何的改变,甚至都感知不到,项目可以完美的运行。但是 GraalVM 还有更广泛的用途,不仅支持 Java 语言,还支持其他语言。这些其他语言不仅包括嫡系的 JVM 系语言,例如 Kotlin、Scala,还包括例如 JavaScript、Nodejs、Ruby、Python 等,如图。
最近维护了一段时间的组件包,在向同事进行推广的时候,经常会听到身边会有类似的抱怨:
●maven-assembly-plugin和maven-shade-plugin的区别
写了个Java SDK(ava Library),想要让更多的猿媛使用,如何发布到中央仓库(Maven Central)呢?
Tech 导读 距离 JDK 8 发布已经过去了 9 年,那么这 9 年的时间,JDK 做了哪些升级?是否有新的重大特性值得尝试?能否解决一些现在令人苦恼的问题?带着这份疑问进行了 JDK 版本的调研与升级踩坑记录,希望本文能够帮到大家。
前面已经搭建好了本地基于springboot,redis,mybatis的项目,其中redis,mybatis都是在docker中运行的,但是整个项目还是在IDEA上运行的,不如折腾一下,让项目在docker上跑起来。
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