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R语言 ROC曲线

ROC曲线(受试者工作特征, Receiver Operating Characteristic) 可以简单、直观得观察分析方法的临床准确性,并可用肉眼作出判断。...ROC以真阳性率(灵敏度FPR)为纵坐标,假阳性率(1-特异度TPR)为横坐标绘制的曲线,可准确反映某分析方法特异性和敏感性的关系,是试验准确性的综合代表。...ROC曲线不固定分类界值,允许中间状态存在,利于使用者结合专业知识,权衡漏诊与误诊的影响,选择一更佳截断点作为诊断参考值。...提供不同试验之间在共同标尺下的直观的比较,ROC曲线越凸越近左上角表明其诊断价值越大,利于不同指标间的比较。曲线下面积可评价诊断准确性。...ROC曲线下的面积(area under ROC curve)值在1.0和0.5之间。 在AUC>0.5的情况下,AUC越接近于1,说明诊断效果越好。

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R语言绘制曲线

由于ggplot2中的geom_line()函数只能绘制折线图,需要用到ggalt提供的geom_xspline()函数绘制光滑的曲线图 geom_line 将所有点连接起来,是折线图但不平滑 geom_smooth.../stat_smooth一条平滑的线,但他是拟合曲线,不会遍历所有数据点 实现遍历所有点的光滑曲线需要用到插值原理 一个更好的选择是使用插值splines.这也是一个使用多项式的插值,但不是只使用一个(...如你所尝试的),它使用很多.它们被强制执行以使曲线连续的方式遍历所有数据点....element_text(size=10,face="plain",color="black") ) image.png 通过R自带的spline函数获得一系列插值点后用geom_line()绘制的曲线明显光滑了...axis.text = element_text(size=10,face="plain",color="black") ) image.png也可以直接用geom_xspline()函数 绘制填充面积的曲线

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R语言实现决策曲线分析

大家对ROC曲线都很熟悉,从方法的特异性和灵敏度出发反应一个方法的准确度。但是,在临床的应用中,往往仅通过以上标准得到的准确度是不可靠的。...故早在2006年纪念斯隆-凯特琳癌症中心AndrewVickers博士等人研究出另外一个新的评估方法,叫决策曲线分析法(Decision Curve Analysis,DCA)。...今天我们就来介绍下在R语言中如何实现决策曲线分析方法。 首先我们 还是找到一个DCA的包DecisionCurve。...2. summary.decision_curve 等同于summary列出评估模型的所有内容 3. plot_decision_curve 绘制以上生成的决策曲线 4. plot_clinical_impact...然后就是决策曲线的绘制: plot_decision_curve( list(baseline.model, full.model), curve.names = c("Baseline model",

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【R语言】散点图+直方图+密度曲线(二)

前面给大家介绍 ☞【R绘图】散点图+直方图(密度图) 今天小编给大家介绍第二种方法,绘制散点图,并且在散点图上添加直方图和密度曲线。我们还是使用☞【R绘图】散点图+直方图(密度图)里面使用的数据。...添加密度曲线 #在散点图上添加密度曲线 ggExtra::ggMarginal(p, type = "density", #指定添加类型 xparams=list...=list(fill = "green"), #指定颜色 yparams = list(fill="orange"), #指定颜色 ) 3.添加直方图+密度曲线...#在散点图上添加密度曲线+在散点图上添加histogram ggExtra::ggMarginal(p, type = "densigram", xparams...根据性别分组添加密度曲线 #根据性别分组添加密度曲线 ggExtra::ggMarginal(p, type = "density", xparams=list

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「R」使用R语言手撕ROC曲线

之前因工作需要绘制ROC曲线,所以对该曲线的计算细节进行了一番摸索。...刚开始我搜索ROC曲线一般跟机器学习相关联,导致我对它的概念有了曲解,理所当然地以为它只是一个用于机器学习的分类器评估标准,所以在绘制曲线前应当使用逻辑回归等模型对数据建模分析。...如上就是ROC曲线的动机。 在R里面,有ROCR与专门的机器学习包mlr(现在是mlr3了)可以进行建模和绘制ROC曲线,以及相关参量的计算。...实际上,不需要使用任何模型,也可以绘制ROC曲线,因为ROC曲线的绘制就是选择阈值与计算当前阈值下假阳性率与真阳性率变化的过程。...我们接下来使用R语言手撕AUC计算。 这里的核心是计算假阳性、真阳性率,所以首先要计算下方混淆矩阵中的各个参数。 ?

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C++】C 语言C++ 语言的关系 ( C 语言发展 | C 语言缺陷 | C 语言 + 面向对象 + 高级语言特性 | C++ 语言增加内容 | C 语言C++ 语言应用场景 )

一、C 语言发展 C 语言 被开发之前 并 没有经过 缜密 的 设计 , 而是在 使用过程中 逐渐完善的 ; C 语言发展经过如下阶段 : 初始阶段 : 1972年至1978年 , C语言 初步形成 ,...C99 , C11 , C17 等标准 , 以满足新的编程需求 ; 二、C 语言缺陷 C 语言有如下缺陷 : C 语言 没有经历过 缜密的 设计过程 , 都是根据需求逐渐完善的 , 出现了很多缺陷和漏洞...2、C 语言C++ 语言关系 C 语言C++ 语言 并 不是 竞争关系 ; C++ 语言 是 以 C 语言为基础 的 加强版本编程语言 , 可以看作是更好的 C 语言 , 在 C++ 语言...中 , 可以使用 C 语言语法 , 对 C 语言完全兼容 ; C++ 语言 包含 C 语言 , 在 C++ 代码中可以使用 C 语言的语法 , 但是在 C 语言中不能使用 C++ 的语法 ; 3、C++...语言应用场景 C 语言C++ 语言的应用场景 : C语言 应用场景 : 系统软件、操作系统、编译器等 底层系统级应用 ; C++ 语言 应用场景 : 大型应用程序、游戏 等更 高级的应用 ; 在不同的

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R语言绘制生存曲线估计|生存分析|如何R作生存曲线

p=6087 根据生存曲线的估计,可以推断出相比组之间存活时间的差异,因此生存曲线非常有用,几乎可以在每个生存分析中看到。...例 在我们将对象放入ggsurvplot()函数之后,我们可以创建简单的生存曲线估计。让我们来看看患有卵巢癌(卵巢浆液性囊腺癌)和患有乳腺癌(乳腺浸润癌)的患者之间存活时间的差异 。...conf.int = TRUE, # 曲线的置信区间....xlim = c(0,2000), # 横轴范围 break.time.by = 500, # 时间刻度....每个参数都在相应的注释中描述,但我想强调xlim控制X轴限制但不影响生存曲线的参数,这些参数考虑了所有可能的时间。 比较 基础包 ? 看起来很漂亮..... ?

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C语言C语言入门知识

一、主函数 C语言的主函数是main()函数,有且仅有一个。 例如: int main() { return 0; } 是一个标准的C语言主函数。...二、输入、输出函数 C语言中的输出函数为printf,输入函数为scanf,使用前需要引用头文件#include 。...(2)C语言中的常见单位(从小到大): bit(比特)<byte(字节)<KB<MB<GB<TB<PB<..... 1byte = 8bit 1KB = 1024byte 1MB = 1024KB...四、变量和常量 4.1 变量的使用 C语言中常量是不变的值,变量是可变的值 创建变量的使用: int age = 10; char ch = 'w'; float weight = 45.5f...4.3 常量 C语言中的常量分为字面常量,const修饰的常变量,#define 定义的标识符常量,枚举常量。 (1)字面常量:100,'w',3.14等。

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