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【R语言】卡方检验Fisher精确检验,复现临床paper

今天小编就带大家来重现一下下面这篇paper的Table2 Table2里面主要展示的是各种临床特征在MEX3A高表达组低表达组里面是否存在显著差异,用的是卡方检验。...接下来我们就来用R代码做卡方检验,算出P值 先来对年龄做卡方检验 ################# #Age ################# table=matrix(c(51,66,66,189...(table) 这里算出来的卡方值p值跟Table2中是一致的 接下来我们来对组织病理分期来做卡方检验 ######################## #stage #############...大家自己体会 最后我们来看看生存状态的卡方检验 ################### #Vital status ################### table=matrix(c(55,62,75,181...(table) 计算出的卡方值p值都跟文中一样 剩下的临床特征的卡方检验,就留给大家自己练习吧!

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R语言线性趋势检验:Cochran Armitage 检验

Cochran Armitage检验是一种线性趋势检验,常用于自变量是有序分类变量,而因变量是二分类变量的资料,可以用来检验自变量因变量存不存在线性趋势。...注意Cochran-Mantel-Haenszel检验区分,CMH检验是研究两个分类变量之间关联性的一种检验方法。...关于CMH检验的内容可以参考之前的推文:R语言卡方检验方法总结 换句话说,在2 x 2表格数据的基础上,引入了第三个分类变量,称之为混杂变量。...现在我们想要了解某种药物剂量疗效之间的关系,药物剂量有50mg,100mg,200mg,300mg,500mg,5个水平,疗效分为有效/无效两个水平。...dimnames = list("Dose" = c("50", "100", "200", "300", "500"), "effect" =

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    C语言C语言数组指针

    ---- 友情提醒:本文可能是全csdn最详细的指针内容了,希望你能用心读下去 前言 接下来的讲解部分是指针的进阶,包含多种指针以及对应的数组,这部分章节对我们来说很重要,也是c语言中的重点模块儿,重要性不言而喻...,那么他们在内存中的空间位置肯定是不同的,而数组名代表首元素地址,两个不同的数组的首元素地址肯定也是不相同啊,那么自然str1肯定str2是不相同的啦 2.首先常量字符串要在内存中开辟空间存储它本身...(c/c++会把常量字符串储存到单独的一个内存区域中) 当这两个指针指向同一个常量字符串时,实际上就是指向同一块儿地址**(指针就是地址,地址就是指针)** 2.数组指针 2.1数组指针的定义 1.数组指针嘛...我们直接大白话给他翻译成通俗易懂的语言。怎么样就是回调函数呢?就比如你现在有一个可以实现两数之和功能的函数Add,你明明可以在main函数里面直接调用这个函数,给他传上两个整数的参数,让他返回的值。...,数组的元素个数(记住是元素个数,比如一个结构成员,一个浮点数,一个整型,都是一个元素)单个元素的字节大小(记住是字节大小,也就是1,2,3,4这些大小,是整数)

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    ISO9001是什么?ISO9000ISO9001有何关系?

    优思学院本文将探讨ISO 9000ISO 9001之间的关系,解释它们的区别以及为什么对企业非常重要。什么是ISO9000ISO9001?...ISO9000ISO9001的实施流程实施ISO 9000ISO 9001需要以下步骤:确定实施ISO 9001的目的范围。进行组织内部审核,确保企业符合ISO 9001的要求。...实施ISO9000ISO9001的挑战实施ISO 9000ISO 9001可能会面临以下挑战:初次实施的成本较高:实施ISO 9000ISO 9001需要投入大量的时间资源,包括制定程序文件、培训员工实施内部审核等...虽然实施ISO 9000ISO 9001可能会面临挑战,但这些挑战可以通过认真策划实施来克服。如果企业能够成功实施ISO 9000ISO 9001,将获得重要的商业优势收益。...2: ISO9000ISO9001适用于哪些企业?A2: ISO9000ISO9001适用于所有希望建立维护有效质量管理体系的企业。3: ISO9000ISO9001的实施需要多长时间?

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    t检验u检验_均匀性检验界值表

    t检验与F检验有什么区别 1.检验有单样本t检验,配对t检验两样本t检验。 单样本t检验:是用样本均数代表的未知总体均数已知总体均数进行比较,来观察此组样本与总体的差异性。...u检验t检验区别与联系 u检验t检验可用于样本均数与总体均数的比较以及两样本均数的比较。理论上要求样本来自正态分布总体。...公式(19.10) 公式(19.11) 公式(19.12) 式中sx1-x2,为两样本均数之差的标准误,s2c为合并估计方差(combined estimate variance)。...双侧检验与单侧检验的选择 需根据研究目的专业知识予以选择。单侧检验双侧检验中的t值计算过程相同,只是t界值不同,对同一资料作单侧检验更容易获得显著的结果。...t检验仅用在单因素两水平设计(包括配对设计成组设计)单组设计(给出一组数据一个标准值的资料)的定量资料的均值检验场合;而方差分析用在单因素k水平设计(k≥3)多因素设计的定量资料的均值检验场合。

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    C语言——C分支循环

    前言 C语⾔是结构化的程序设计语⾔,这⾥的结构指的是顺序结构、选择结构、循环结构,C语⾔是能够实现这三种结构的,其实我们如果仔细分析,我们⽇常所⻅的事情都可以拆分为这三种结构或者这三种结构的组合。...一、 if语句(分支) 1.1语法形式 if(判断表达式) 语句 表达式成⽴(为真),则语句执⾏,表达式不成⽴(为假),则语句不执行; 在C语言中,0为假,非0表示真,也就是表达式的结果如果是...二、关系操作符 C语言用于比较的表达式,称为“关系表达式”,里面使用的运算符就称为“关系运算符”,主要有下面6个。...(C中唯一一个三目操作符) exp1 ?...C语⾔中提供了 break continue 两个关键字。

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    R语言-功效分析(t检验

    R语言基础知识: 样本大小:指实验设计中每种条件/组中观测的数目 显著性水平:由I型错误的概率来定义,可以说发现效应不发生的概率。 功效:通过I减去II型错误的概率,可以看作是真实效应发生的概率。...效应:是指在备择研究假设下效应的量。效应值的表达式依赖于假设检验中统计方法。功效分析中研究设计的四个基本量。给定任意三个,你可以推算第四个,利用pwr包实现功效分析。 ? pwr包中的函数: ?...sig.level表示显著性水平(默认为0.05) power为功效水平 type指检验类型:双样本t检验(two.sample)、单样本t检验(one.sample...)或相依样本t检验(paired)。...默认为双样本t检验。 alternative指统计检验是双侧检验(two.sides)还是单侧检验(less或greater),默认为双侧检验

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    R语言中的卡方检验

    大家应该很熟悉卡方检验,卡方检验作为非参数检验的一种主要应用大样本数据(样本量>40)。今天我们详细介绍R语言中卡方检验的实现与应用。 1....我们看下理论基础 (1)检验某个连续变量的分布是否与某种理论分布相一致。...则理论频数为npi(n为样本总数) ③根据已有实际观测值fi,计算卡方统计量即 ④计算自由度,为分类变量数目减去一,与再显著性α=0.05下的临界值比较,若大于临界值,则认为偏差过大,拒绝原假设 (3)检验某两个分类变量是否相互独立...①提出原假设H0:两个分类变量之间无关 ②再假设无关的条件下,应用其独立同分布特点,计算出每个格子的理论概率值,比如吸烟并且没有呼吸道疾病的概率值,利用样本数据,分别求出吸烟的概率患呼吸道疾病的概率,...R语言中卡方检验的函数chisq.test() ?

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    聊聊C语言-程序编程语言

    那么小编接下来将要写一个系列的文章来带你进入C语言编程的奇妙世界。 什么是编程? 编程简单来说就是用计算机能够识别的语言来编写程序。...只要计算机能够听得懂的语言我们就可以叫它编程语言。 计算机懂的语言是什么呢? 就是010101这些二进制语言(也叫机器语言)。...高级语言与机器语言的联系是什么? 上面说的高级语言其实也并不能被计算机直接识别处理的,它们需要转化成机器语言。转化的方法有两种-编译和解释。...为什么选择C语言?...既然有那么多的高级语言我们为什么选择C语言编写程序呢,也许是小编对C语言有着独有的情怀吧,也许是因为我们上过大学的人基本上学的第一门编程语言都是C语言吧,也许它是至今为止用的最多的底层硬件打交道的语言

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    javac语言哪个简单_Java编程C语言哪个好学

    很多人都拿Javac相比较,那么今天小编就来先说说我的个人理解吧,学习Java很简单上手很容易,只需要会拼音就可以,简直而且没有门槛,而c语言学习成本高,要想学会需要投入较大的精力,才能有一个相对不错的回报...下面是Javac的市场占有率,可以看出,二者不分伯仲,第一第二换着来,这足以看出她们的市场价值,和在编程语言中的地位!...首先先说Java编程语言吧,Java是c语言的后辈,它是在c语言的基础上,抛弃了一些指针之类的东西,c完全不同的是Java是一门面向对象的语言,Java是跨平台的,Java是安全的,许多要求安全的企业对...、通信协议之类,在UnixLinux环境中也是不可或缺的,另外在嵌入式领域也大有作为,而且c语言效率极高。...其实每一门语言都有优势,不足,这也是各种语言层出不穷的原因所在,我相信随着时间的推移,优势会逐渐发挥,不足也会逐渐解决,所以两门语言都有巨大的存在价值,只要掌握,都能发挥巨大的作用。

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    R语言系列第五期:③R语言逻辑回归预测检验

    详情点击:R语言系列五:②R语言与逻辑回归建立 但是模型建立起来之后,是用来做什么的?...当观测数据只有两个不同的取值时,就没有方法利用残差图进行检验了。 我们利用menarche的例子。...这里推荐使用一个检验模型很好的工具ROC曲线,我们可以一步一步告诉你ROC曲线是如何画出来的: > glm.menarche<-glm(menarche~age,binomial) # 原始模型输入到glm.menarche...关于逻辑回归的建立,预测诊断我们都已经介绍完了,下面就是关于生存分析的部分了。敬请期待。 参考资料: 1.《R语言统计入门(第二版)》人民邮电出版社 Peter Dalgaard著 2....《R语言初学者指南》人民邮电出版社 Brian Dennis著 3.Vicky的小笔记本《blooming for you》by Vicky

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    C C++语言的标准

    C 语言的标准主要有以下几个: K&R C:这是第一个 C 语言标准,由 Kernighan Ritchie 于 1978 年编写。...ANSI C:也称为 C89,是由美国国家标准协会制定的标准,于 1989 年发布。 C99:是第二个 C 语言标准,由国际标准化组织 ISO 制定,于 1999 年发布。...C11:是第三个 C 语言标准,由 ISO 制定,于 2011 年发布。 C18:是最新的 C 语言标准,于 2018 年发布。...其中,K&R C 已经过时,不再使用,而 ANSI CC99、C11 C18 都是现代 C 语言标准,但在实际开发中,使用最广泛的是 ANSI C C99。...其中,C++98 是最初的 C++ 标准,但在实际开发中已经很少使用,而 C++11、C++14、C++17、C++20 C++23 都是现代 C++ 标准,不断引入新的特性语法糖,使得 C++

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    C语言中的&*

    C语言中的&* 1、C语言中为什么存在&* C语言中大名鼎鼎的“指针”,想必你肯定听说过吧。 没错,C语言中的&*就是为了指针而诞生的。...试想一下,如果没有&*的存在,你可能每天都在为计算寻找某个变量在哪里而发愁呢! 有了&*之后,就不需要你手动的去计算内存中的地址。 2、&*是什么?...3、&(取地址运算符)*(间接寻址运算符)的使用 int i; 是变量 int *pi;是指针 int i, *pi; char c,*pc; 例子: #include ...int main() { int i, *pi; char c,*pc; //初始化i为10 i = 10; //初始化c为‘a’字符 c = 'a'; //把pi指向i的地址...pi = &i; //把pc指向c的地址 pc = &c; printf("i=%d;c=%c\n",*pi,*pc); //做一些基本处理 *pi = *pi + 100; printf

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    C语言】编译链接

    一、翻译环境运行环境 在c语言的实现中,存在两个环境 翻译环境:在这个环境中源代码被转换成可执行的二进制指令 运行环境:实际执行代码 二、翻译环境 翻译由编译链接两个过程组成 编译又可以分为预处理...、编译、汇编三个过程 一个c语言的项目一般是由多个.c文件一起构建的,多个.c文件通过如下步骤生成可执行程序: ①多个.c文件单独经过编译器,编译处理生成对应的目标文件 ②多个目标文件链接库一起经过链接器处理生成最终的可执行程序...后续编译器会使用 经过预处理后的.i文件中不再包含宏定义,所有的宏定义已经被展开了,我们可以通过查看预处理后的.i文件来确认宏定义和头文件是否包含正确 2、编译 编译的过程就是将预处理后的文件进行语法词法的分析优化...,它的过程主要包括:地址空间的分配、符号决议、重定位等 重定位:当我们使用多个.c文件生成一个可执行程序的时候,由于编译的时候是每个文件单独编译的,当我们在一个文件中使用另一个文件定义的函数时,我们是需要明确地址的...在独立的环境中,需要手动操作,也可能是通过可执行代码置入只读内存完成 2、程序执行:程序执行便开始调用main函数 3、开始执行程序代码:开始执行程序代码时程序将使用一个运行时堆栈,存储函数的局部变量返回地址

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