cBioPortal数据库是探索肿瘤的基因组学特征，是从DNA水平进行的，是对机制的进一步研究。基因差异表达、生存分析和免疫浸润分析，上述分析严格意义上讲均属于表型。...今天，我们分享TCGA多组学分析的神器，肿瘤基因组学分析的神器——cBioPortal，不需要注册，登录即可免费使用： cBioPortal（https://www.cbioportal.org/） ?...cBioPortal网站目前存储DNA拷贝数数据（每个基因的假定，离散值，例如“深度缺失”或“扩增”，以及log2水平），mRNA和microRNA表达数据，非同义突变，蛋白质水平和磷蛋白水平（RPPA...首先登陆cBioPortal官方网站http://www.cbioportal.org/。 ? 以乳腺癌为例，分析E2F基因家族基因突变在乳腺癌发生中的作用。...以上几个功能是cbioportal的重要功能，当然还有很多小功能，如查询基因在肿瘤中突变类型的总结分析、点图展示、突变基因的enrichment分析和基因突变数据下载等等，分析结果可直接应用于发表paper
使用cBioPortal进行复杂的癌症基因组和临床profiles整合分析（Y大宽原创，转载需要说明） 主要来自于doi:10.1158/2159-8290.CD-12-0095（http://sci-hub.tw.../http://doi.org/10.1126/scisignal.2004088）和doi:10.1126/scisignal.2004088 摘要：cBioPortal提供了这样一种网络资源：探索...这里，我们提供一个可操作的guide来分析和可视化cBioPortal的特征（对癌症基因集的）。...cBioPortal是专门设计来降低对这些复杂数据的接近门槛，因此，促进基因组数据向新的生物学视野，治疗和临床特征的转变。...查看癌症研究summary data 除了执行特异gene queries，cBioPortal还提供access to 包含在portal中的每个癌症研究的总结。
cBioPortal整合了来自TCGA,CCLE以及几个独立的大型肿瘤研究项目的数据，构建了一个易于使用的网站，不需要有深厚的计算机功底，也可以通过该网站查询，分析，可视化肿瘤的相关结果。...针对该网站的使用，官方专门发布了对应的文章，链接如下 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4160307/ 该网站的网址如下 http://www.cbioportal.org...cBioPortal功能非常的强大，更多用法请参考官方的帮助文档。 ·end·
cBioPortal介绍 使用cBioPortal数据库可以先阅读关于该数据库的文章： The cBio cancer genomics portal: an open platform for exploring...Integrative analysis of complex cancer genomics and clinical profiles using the cBioPortal....cBioPortal是专门设计来降低对这些复杂数据的接近门槛，因此，促进基因组数据向新的生物学视野，治疗和临床特征的转变。...cBioPortal这个网站，促进多维度癌症基因集数据的探索，可以允许跨基因，样本和数据类型的可视化分析。...下面我们介绍该数据库的使用教程 主页面介绍 地址:http://www.cbioportal.org/ ?
cBioportal cBioPortal (http://www.cbioportal.org/）由Memorial Sloan Kettering Cancer Center (MSK)开发，是基于...由此可见，cBioPortal是经过专业杂志认可的数据分析工具，其可信度是相当高的。 下面直接带领大家来学习一下如何通过cBioPortal挖掘肿瘤数据。...我们按步进行： cBioPortal（http://www.cbioportal.org/）打开网址以后，有一点要跟大家提一下，cBioPortal作为一个国外的网站，其访问速度并不算快，有时甚至出现网页打不开的尴尬场面...在cBioPortal中共有32个癌种，240个study，基本覆盖所有常见和个别少见肿瘤。...这里就要说一说cBioPortal强大无比的分析功能了，几乎包含了多组学研究中能够实现的所有分析功能，如下图所示，包括OncoPrint（基因突变图谱）、Cancer Types Summary（泛癌种基因突变汇总
cBioPortal cBioPortalhttp://www.cbioportal.org/）由Memorial Sloan Kettering Cancer Center (MSK)开发，是基于...由此可见，cBioPortal是经过专业杂志认可的数据分析工具，其可信度是相当高的。 下面直接带领大家来学习一下如何通过cBioPortal挖掘肿瘤数据。...我们按步进行： cBioPortal（http://www.cbioportal.org/）打开网址以后，有一点要跟大家提一下，cBioPortal作为一个国外的网站，其访问速度并不算快，有时甚至出现网页打不开的尴尬场面...在cBioPortal中共有32个癌种，240个study，基本覆盖所有常见和个别少见肿瘤。...关于cBioPortal中的生存分析就讲到这里 文章详情：科研猫公众号
pycharm打不开问题总结 1:第一步：进入如下路径，找到cmd.exe，右键选择“以管理员身份运行”； 第二步：在打开的cmd窗口中，输入 netsh winsock reset，按回车键；第三步...打不开是因为你修改了pycharm路径上的某个文件夹名，导致一开始添加的激活成功教程插件路径改变，你只要在.vmoptions中修改为正确的插件路径即可恢复正常。
1、下载压缩包解压后得到jetbrains-agent.jar 2、启动IDEA，试用（Evaluate for free）进入IDE 3、
1. cd /Applications/PyCharm.app/Contents/MacOS
如果是无反应的话，可以尝试以下方案： 1.打开任务管理器（或者点击CTRL+Shift+ESC） 2.点击“文件” – “运行新任务” 3.请确保勾选[使...
Number Array 知名的肿瘤研究机构都有着自己的TCGA数据库探索工具，比如： Broad Institute FireBrowse portal, The Broad Institute cBioPortal...，主页在：https://www.cbioportal.org/ 这个网页工具可以很方便的查询感兴趣的目标基因在指定的癌症数据集里面，是否有突变，有表达量差异或者生存意义。...包含的数据集列表在：https://www.cbioportal.org/datasets，值得注意的是这里面可不仅仅是TCGA数据集哦，也并不是说每个数据集都有多组学哦，如果我们按照样品数量排序，很容易看到...： cBioPortal网站文献列表 只要是ngs数据文献 愿意遵守这个cBioPortal规则，就可以把其突变信息和表达量信息以及病人临床信息，按照固定的格式整理好，并且上传到cBioPortal...网站，就可以使用cBioPortal的网页工具去探索它。
在芒果学习的生信论文中，第28篇生信文章是cBioPortal数据库使用最多，也是用的最好的。...在生信研究中，甲基化用UALCAN数据库，基因突变可以用cBioPortal数据库。本文提供很好的示范。 ? 探索机制时，用UALCAN数据库分析启动子区域的甲基化变化情况。...补充数据中，作者用cBioPortal数据库对ACE2的基因组学进行深入分析，从突变，融合，扩增和删除等角度分析组学变化，图文并茂。 ? ?
这是我们分享多次的论文，其中涉及基因组学的生信分析，就是用cBioPortal数据库进行机制探究。比较简单，但是在进行基因组学探究时，这些分析有时就足够了。 ?...cBioPortal数据库是探索肿瘤的基因组学特征，是从DNA水平进行的，是对机制的进一步研究。基因差异表达、生存分析和免疫浸润分析，上述分析严格意义上讲均属于表型。...在完成差异分析、临床意义的问题之后，作者利用cBioportal数据库，进一步探讨可能的分子机制。
FL Studio 21版本发布了，为我们带来了多种新功能，大大提高处理效率，轻松应对各种复杂的编曲任务.fl studio 21打不开，FL工程文件也打不开怎么办？...那么这篇教程和大家讲解fl怎么导入工程文件和flstudio21工程文件打不开的解决方法。...图3 导入工程二、flstudio工程文件打不开1.导入工程将本地flstudio工程导入到水果编曲软件中，发现弹出一个警告窗口。...当然工程文件打不开还有另外一种情况，那就是工程已经被损坏，这种情况是没有解决办法恢复工程的。避免工程损坏的方法避免未保存工程或者未关闭水果软件强制关闭计算机。
在https://fastly.net.ipaddress.com/github.global.ssl.fastly.net找到：
不知道大家有没有遇到过Github老是打不开的问题。 即使开了所谓的代理或者host文件，还是打不开，甚至一点动静都没有。但是过了一段时间又可以访问了。
Github 作为全球最大的同性交友网站，开源社区，程序员社区，拥有非常多的资源，几乎没有你找不到资源，除非...你打不开！
Github作为全球最大的代码托管平台，是所有技术人使用最多的网站之一，但在今年年初在家到现在开学我使用时总存在着打不开或者打开慢的问题。
mac系统安装mysqlclient时，会报错OSError: mysql_config not found
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