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Cell Brower

推荐一个单细胞数据交互式可视化软件:Cell Brower http://cells.ucsc.edu/ 这个软件可以查询一些已有的数据库,并且可以将自己的单细胞数据上传形成一个简单查询的网址: 这个是现在已有可以查询的单细胞表达的数据库 image.png 要是想将自己的单细胞数据形成查询网站的话,可以安装cell brower,但是目前只能在Mac和linux下面使用: 安装网址:https://cellbrowser.readthedocs.io

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【高分新文】Cancer Cell|肿瘤细胞系中临床相关蛋白的药物响应特征

Large-Scale Characterization of Drug Responses of Clinically Relevant Proteins in Cancer Cell Lines 在随后的分析中,使用了两个平台共有的46个“perturbation-cell-line”IDs(60个样本)和347个基因/蛋白。 对于具有多个浓度和/或时间点的perturbation-cell-line ID,采用所有条件下的中值作为代表性响应分数。对于每个平台,首先将连续响应转换为分类响应:上调、下调或中性。 然后,使用配对的Student’s t-test来评估真实和随机匹配之间的差异;(2)样本-样本关联:在本工作产生的RPPA数据集,一个perturbation-cell-line ID可能有复制样本。 Cancer Cell. 2020 Oct 26:S1535-6108(20)30539-0. doi: 10.1016/j.ccell.2020.10.008.

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    读《Single Cell Biomedicine》

    闲暇时,在书库里面搜索的时候看到了这本书:Single Cell Biomedicine,也是Xiangdong Wang 老师参编的。 不能手里拿着锤子就看什么都是钉子,也不能一看到Single Cell 就想到scRNA,scVDJ,scATAC,应该想到在微环境中活生生的,细胞间相互交流,细胞内各种调控的细胞生态。 本书是编著,所以是围绕Single Cell Biomedicine这个主题几位专家展开的讨论。开卷是有益的,看大牛们的讨论,形成自己的思考。单细胞打开了一个维度,巧的是,单细胞本身也是一个维度。

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    Swift 2.0 自定义cell和不同风格的cell

    昨天我们写了使用系统的cell怎样创建tableView,今天我们再细分一下,就是不同风格的cell,我们怎写代码。 先自己创建一个cell,继承于UItableviewcell 我们看看 cell 里面的代码怎么写的,我现在把 整个 cell 代码展示出来。 = 1) { // 系统的cell let cell:UITableViewCell = tableView.dequeueReusableCellWithIdentifier text="你真的很帅" return cell } else { // 自定义的cell 的工作,当然也只是简简单单的家了一张图片,思路整体上就是这个思路,给 cell 里面再添加其他控件的大家可以自己动手试试!

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    Cell | 分子胶水的兴起

    Schreiber教授在“Cell”上发表的文章”The Rise of Molecular Glues”。 那么,如何将这个看似无关紧要的功能与CsA对T细胞受体(T cell receptor,TCR)介导信号通路的抑制联系起来呢? 作者想知道是否还存在类似性质的化合物。 作者与其他研究者在1990年有了一个惊奇的发现:结构相关的FK506和雷帕霉素破坏两个截然不同的通路。FK506干扰TCR信号,而雷帕霉素干扰IL2受体信号。 Cell ( IF 38.637 ) .Pub Date : 2021-01-07 , Stuart L. Schreiber. DOI: 10.1016/j.cell.2020.12.020

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    python 创建类cell数组

    array at the end: >>> a array([[[[2, 2]], [[3, 3]]]]) >>> a.shape (1, 2, 1, 2) But to mimic a cell 例如: npose = 5 nsmile = 2 poseSmile_cell = np.empty((npose,nsmile),dtype=object) for i in range(5): for k in range(2): poseSmile_cell[i,k] = np.zeros((4,4)) print poseSmile_cell.shape 参考文献 : https://stackoverflow.com/questions/19797822/creating-matlab-cell-arrays-in-python

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    cell-blog 开发记录

    Cell Blog 开发记录,项目地址 搭建 php 环境 安装 wampserver 安装 composer 更换 aliyun 源 1 composer config -g repo.packagist mirrors.aliyun.com/composer/ 新建 laravel 项目 1 composer create-project --prefer-dist laravel/laravel cell-blog 1 2 3 4 5 6 7 8 APP_URL=http://cell.blog DB_CONNECTION=mysql DB_HOST=127.0.0.1 DB_PORT=3307 DB_DATABASE =cell_blog DB_USERNAME=root DB_PASSWORD=123456 下载 laravel-admin 1 2 cd cell-blog composer require encore

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    TensorFlow RNN Cell源码解析

    本文介绍下 RNN 及几种变种的结构和对应的 TensorFlow 源码实现,另外通过简单的实例来实现 TensorFlow RNN 相关类的调用。 cell. 在这样的情况下,我们所要预测的内容和相关信息之间的间隔很小,这种情况下 RNNs 就能够利用过去的信息, 很容易实现: ? LSTM Cell 的结构如下: ? LSTMs 最关键的地方在于 Cell 的状态 和 结构图上面的那条横穿的水平线。 Cell 状态的传输就像一条传送带,向量从整个 Cell 中穿过,只是做了少量的线性操作。这种结构能够很轻松地实现信息从整个 Cell 中穿过而不做改变。 ?

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    低功耗设计 | isolation cell

    在 multi-voltage design 中,常常用到isolation cell; 本文简单介绍什么是 iso cell, 如何使用 iso cell, 何时需要加 iso cell, iso cell的插入位置。 如何使用 iso cell ? 通常isolation cell和Level Shifter一起连用,AND和OR门都可以组成一个isolation cell; 1. 3)isolation_cell所占的面积问题。 如果isolation_cell独立,单个isolation_cell所占的面积可以稍微大一些。 下面是lib iso cellcell(Isolation_Cell) { is_isolation_cell : true; dont_touch : true; dont_use : true;

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    低功耗设计 | always on cell

    有些逻辑需要在关机期间保持活动状态,如Power Switch Cell、Retention Register Cells、Isolation Cells,他们就被称为Always-On Logic Cells Always-On Logic Cell 用在什么地方? 它与普通cell的区别在于,多了一个secondary power pin,这个second power pin必须连在always on stripe上。 它一般加在feedthrough net上比较多,也可以加SRPG cell的control端或者isolation cell的enable端 feedthrough net SRPG cell isolation cell UPF文件描述always on buffer,如下所示: define_always_on_cell -cells { VIAONPTBUFF} \ buffer cell

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    T cell infiltration in old neurogenic niches

    文章信息 今天分享一篇2019年7月份发表在nature上的文章:《Single-cell analysis reveals T cell infiltration in old neurogenic 于是作者找到一个表面marker——BST2,这个蛋白和INF-γ反应性相关,可以在INF-γ的作用下限值病毒囊泡的释放。 ? 上面的图证明了在年老小鼠aNSCs细胞群里有BST2高表达的一小亚群。 但是也发现这群细胞的cell cycle非常不活跃。 ? 既然看到了这群细胞的cell cycle有问题,那么当然需要去看以看原因了。于是作者又做了Edu细胞增殖检测。 这里分别做了NSCs+CK(细胞因子)、NSCs+T cell+CK、NSCs+CK+IFN-γ抗体以及NSCs+T cell+CK+抗体同型对照。 ?

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    think-cell chart 软件简介

    今天跟大家简单介绍下昨天文末提到的think-cell chart 。 该软件是德国的阿诺Schödl博士设计并研发的,阿诺博士曾就职于微软研究院和麦肯锡公司。 在PowerPoint中对think-cell chart 图表进行编辑效率要比编辑excel图表高很多。 它拥有自己完善的编辑功能区,而不是借助excel图表的编辑菜单。 think-cell chart 的图表类型: ? 不算形状,一共有15中图表(不算组合图表) 插入完图表之后,单击右键就会弹出它自己的图表编辑菜单功能选项。 ? 当然以上图表完全可以通过excel实现,但是代价很大(你需要对excel工具操作非常熟练,对配色和排版有相当了解,还要自己去做小图标、插入各种图标和线条,但是在think-cell chart来说都是小菜一碟

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    Cell V2详解

    Cell V2 第一次出现是在 Ocata 版本,但当时仅仅只支持单个 Cell,对多个 Cell 的支持是在 Pike 版本中实现的。 下图中的整个 Nova 服务由3部分组成,位于上层的 API Cell 和下层的 Cell01, Cell02。 Cell01 和 Cell02 之间是平级关系,且相互无感知,我们还可以在下层继续增加新的 Cell,如 Cell03。 在下文中,我们统一将下层的 Cell01, Cell02, Cell03 等称为 Cell,上层仍然称做 API Cell。 下面的代码只列出了与 Cell V2 相关的流程。

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    css display table-cell

    ="0"> </body> </html> 从以上代码的表现来看,为div添加了相关属性值之后 ,差不多完全具有了表格的相关特性,当然上面的演示并不能够完全说明表格所具有的相关特性,以上代码只是说明三个属性值的作用。 到这里可能会有朋友提出这样的疑问:在众多的实际应用中并没有完整的定义类似表格这样的层次关系,而是往往只有display:table-cell,这是因为,如果一个对象具有display:table-cell ,但是它并没有父元素或者祖父元素定义display:table-row和display:table-cell。 在兼容各个浏览器的位置高度div垂直居中效果中,middle对象中使用了display:table-cell,它的父对象parent中也显示声明了display:table-cell,否则会匿名创建两个具有此属性的对象

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    matlab结构体 rmfield,arrayfun,structfun,struct2cell,cell2struct

    * 将结构体转换为元胞数组 * C = struct2cell(S) * C = struct2cell(S) 将结构体转换为元胞数组。 将元胞数组转换为结构体数组 structArray = cell2struct(cellArray, fields, dim) structArray = cell2struct(cellArray, } {1x2 cell} {1x3 cell} {1x2 cell} {1x2 cell} {1x1 cell} {1x1 cell} {1x2 cell} {1x1 cell} {1x2 cell} {1x1 cell} {1x2 cell} {1x2 cell} {1x3 cell} {1x1 cell} 将元胞数组转换为与此维度相关的结构体数组 depts: depts = cell2struct(employees, rowHeadings, 1) depts = 3x1 struct array with

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    library | std cell delay 模型

    LDM: LDM: linear delay model, 最简单的cell delay 模型,计算公式: D = D0 + D1 * S + D2 * C 其中,D0, D1, D2 是常值,S NLDM: NLDM: Non-Linear Delay model, 在lib 中是几张index 为input transition 跟output load 的二维表,如果是多输入cell 每个输入到输出的 delay 跟其他输入的状态相关,在lib 中会用 "sdf_cond" 跟 "when" 来表示。 NLDM 是在仿真波形上采样三个点得到cell delay 跟output transition: slew_lower_threshold_pct_rise/fall, 通常是工作电压的30% 或20% fall, 通常是工作电压的70% 或80%, 用于计算output transition. input/output_threshold_pct_rise/fall, 通常是工作电压的50%, 用于计算cell

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    Cell函数的另类应用

    标签:Excel函数与公式,CELL函数,COUNTIF函数,SEQUENCE函数 需求 数据验证下拉列表必须包含具有货币数据类型列的列标题,如果数据类型改变,下拉列表也相应改变。 图1 解决方案 1.提取数据类型 CELL函数从数据的第一行提取数据类型。 图2 由于CELL函数似乎不能以数组公式形式工作,因此必须逐个单元格输入公式。 CELL函数和OFFSET函数都是易失性函数。 =OFFSET($C$6,0,0,$C$4,1) 图4 至此,问题解决。 注意,如果改变了数据表中的列的数据类型,则需要按F9键重新计算。 CELL函数官方介绍链接: https://support.microsoft.com/en-us/office/cell-function-51bd39a5-f338-4dbe-a33f-955d67c2b2cf

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    xib之cell高度计算--简单实现cell高度由控件数量自定义

    核心思想:约束设置(xib) ->继上次的多label计算cell高度之后,本次带来的是,多控件的cell高度动态计算 ? 实现成果1 ? 实现成果2 如图,我们发现,最终的cell的高度,是根据按钮数量而自适应决定的,而在实际开发中,我们也经常需要有这种需求; 简单做法: 1.镇楼图所示,竖直方向约束贯穿整个cell 2.添加展示View 手动计算内容高度 第四步:调用系统计算整个cell高度的方法 ? 系统自动计算cell高度的方法 最终实现需求~ 小tips:此项目与 多 label 的cell自动适应高度略有不同,多label的那个Cell,竖直方向上就当前的label所在的View,我们目前的这个 拓展:如果有多个控件在竖直方向上,如镇楼图所示,只要你设置竖直方向的约束,从top 到 bottm 贯穿整个 cell,一样可以实现cell自适应高度~ 简单Demo:Demo

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    Ios 该图显示其出现的相关问题定义UITableView dataSource must return a cell from tableView:cellForRowAtIndexPath:

    解决这个问题 在 加上个 标示符 Cell 自己定义 customCell .h 代码例如以下 ViewController.m 文件里 代码例如以下 执行结果 吕 图坚持直接在这里 不行 发布者

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    如何快速查找目标cell

    这其中涉及到一个重要问题:如何快速且高效地找到目标单元(cell)。什么是cell可以阅读这篇文章:一张图看懂cell, pin, net, port。 因此,对于设计者而言,了解原始RTL代码的层次结构有助于查找cell。 方法1:根据目标cell的名字特征查找 Cell的名字其实是包含层次的,类似于操作系统中文件的全名。 这些逻辑单元都有自己对应的cell,同样每个cell都有REF_NAME。不同的是,REF_NAME的名字是固定的。 方法3:根据其他属性查找 选中一个cell,在其property窗口中可以看到相关的属性。根据属性的特征可以筛选出目标cell。 方法4:根据cell与net或pin的关系查找 通过与cell相连的net可以找到cell,通过附属于cell的pin也可以找到cell。看一个典型案例。具体电路如下图所示。

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