大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 文章目录 一、在anconda prompt中创建新的conda环境。...二、查看虚拟环境是否成功建立 三、进入虚拟环境 四、安装第三方依赖包 五、查看当前环境已安装的包是否于requirements.txt相同 一、在anconda prompt中创建新的conda环境。...conda create -n E8519 python=3.6 选择“y” 二、查看虚拟环境是否成功建立 conda env list 三、进入虚拟环境 activate E8519 四、安装第三方依赖包...切换工作目录到requirements.txt所在目录，在用pip安装requirements.txt中的包。...cd E:\python #例如 pip install -r requirements.txt 五、查看当前环境已安装的包是否于requirements.txt相同 pip list 发布者：全栈程序员栈长
许多Python项目中都包含了requirements.txt文件，该文件记录了当前程序的所有依赖包及其精确版本号。...生成requirement.txt文件 pip freeze > requirements.txt 安装requirement.txt文件依赖 pip install -r requirements.txt...除了使用pip命令来生成及安装requirement.txt文件以外，也可以使用conda命令来安装。...conda install --yes --file requirements.txt 但是这里存在一个问题，如果requirements.txt中的包不可用，则会抛出“无包错误”。...| pip install 也可以这样子操作 导出到.yml文件 conda env export > freeze.yml 直接创建conda环境 conda env create -f
正常情况下，我们的R包都是依附于R语言环境，常见的情况是在个人电脑的Rstudio这样的界面软件安装的。...但是单细胞数据处理相关R包有一点点特殊， 它首先依赖的包特别多，其次很有可能是并不会在个人电脑里面安装，也就是说不一定有Rstudio这样的界面软件给你。...另外就是，大家在安装它的时候，它没办法很好的自动解决它自己的依赖问题，所以官网给了其系列依赖包的独立安装方式。...如果你需要安装包依赖了一个仍然是在GitHub的包，就只能说自己独立安装依赖了。...，其实有一个很简单的解决方案，就是使用conda，一句话安装它。
但是写教程的时候，发现自己没有conda，默认的Python版本也太低了，很多教程都没办法复现。...打开conda官方网站，查看版本和下载链接：https://repo.anaconda.com/miniconda/ 安装conda的方法代码如下： # 首先下载文件，20M/S的话需要几秒钟即可 cd...，记得是一路yes下去 bash Miniconda3-latest-MacOSX-x86_64.sh # 安装成功后需要更新系统环境变量文件 # source ~/.bashrc source ....这个最新版，默认安装的软件也是很新： ## Package Plan ## environment location: /Users/jmzeng/miniconda3 added / updated...第6阶段：软件安装及conda管理，让linux系统实用性放飞自我。
官网: https://www.anaconda.com/ conda的安装 下载安装包 -- bash 安装 -- 接受协议 -- 选择默认安装路径（回车） -- 重新激活环境 -- 调用帮助文档 #...conda 的帮助文档 conda --help 配置镜像 我们使用 conda 安装软件时，conda 会去 channel 中搜索软件，如果使用的服务器是在国内，channel 就选择国内的，推荐清华...# -i 是指清除掉构建好的index，清除掉之后才会从新的频道下载软件包 conda clean -i # 也可以把所有的缓存都清除掉 conda clean -a 创建小环境 # 创建名为rna...的软件环境来安装转录组学分析的生物信息学软件 conda create -y -n rna python=3.7 # 创建小环境成功，并成功安装python3版本 # 每建立一个小环境，安装一个python...安装软件的另一种方式:用yml文件安装 #导出当前环境: conda env export envname > env.yml #(跨平台均适用) conda list --explicit > env.txt
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 PyCharm版本：PyCharm 2020.2 1....打开PyCharm进入 File -> Settings… 2.找到 Plugins 并点击（挥着在搜索框输入 Plugins 并选择Plugins菜单） 3.在Marketplace的搜索框输入...可以看到 Chinese(Simplified) Language Pack EAP 安装包，点击Install 安装 5.等待安装完成，点击Restart IDE 重启IDE窗口 6.选择Restart...7.等待PyCharm重启后我们可以看到，整个菜单和界面已经全部中文化，至此就可以愉快的使用PyCharm了 发布者：全栈程序员栈长，转载请注明出处：https://javaforall.cn/
什么是conda？ conda是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统，用于安装多个版本的软件包及其依赖关系，并在它们之间轻松切换。...通过conda安装软件 1.省时省力省bug 2.方便管理和更新 3.安装时不用配置环境变量 01 安装anaconda/miniconda 首先进入anaconda的网址 https://www.anaconda.com...，软件会询问安装路径，如果是个人使用，默认安装路径就可；如果你是管理员，最好自己创建一个公共的文件夹。...02 添加环境变量 如果在安装conda的最后一步时，你选择了yes，那么它会自动给你环境变量，直接source一下即可使用。...install r -y # -y表示yes，安装过程中所有的提示统统帮你yes 3.卸载软件 conda remove r -y 4.查看conda已安装的软件 conda list 因为我用的
交流群有人询问一个包（oncoPredict）的安装问题，说是R版本问题，需要 大于4.1.0。 我下意识的认为他应该是有其它错误，但是看大家在群里讨论的热火朝天， 我就去试了试。...首先看了看最原始的安装方式： > install.packages("oncoPredict") Warning in install.packages : package ‘oncoPredict...’ is not available (for R version 4.0.2) 确实是失败了，然后去 官网查看：https://cran.r-project.org/web/packages/oncoPredict...Version: 0.2 Depends: R (≥ 4.1.0) 哪怕是下载源代码进行安装，也是绕不过去这个版本依赖 ： > install.packages('oncoPredict_0.2.tar.gz...install.packages : installation of package ‘oncoPredict’ had non-zero exit status 虽然这次仍然是报错了，但是这个很容易解决，仅仅是缺几个依赖包而已
BiocManager安装R包失败——Bioconductor version cannot be validated; no internet connection 目录 前言1. 报错内容2....安装R包模板3.1 镜像设置3.2 下载方式设置3.3 安装R包4. 永久保存镜像设置后记 前言 最近因为需要安装ChIPseeker这个R包，需要使用BiocManager进行安装。...过去使用BiocManager安装R包就是手到擒来，轻轻松松。但是最近好像知识更新的有点快了，装个R包居然遇到了很多困难。 这里简单记录下。 1....然后再安装R包即可。 3. 安装R包模板 这里顺便记录下相关的代码。...永久保存镜像设置 为了更方便的安装R包，不用每次都进行设置。
的python-GPU算法生态 ︱ RAPIDS 0.10 nvidia-rapids︱cuML机器学习加速库 nvidia-rapids︱cuGraph(NetworkX-like)关系图模型 -...--- 文章目录 1 cuDF背景与安装 1.1 背景 1.2 安装 2 一些demo 2.1 新建dataframe 2.2 pandas 与 cuDF切换 2.3 选中某行列 2.4 apply_rows...和apply_chunks 2.5 groupby ---- 1 cuDF背景与安装 1.1 背景 cuDF在过去一年中的发展速度非常之快。...此外，RAPIDS添加了cuStreamz元数据包，因此可以使用cuDF和Streamz库简化GPU加速流处理。...图5：单个NVIDIA Tesla V100（立即免费试用） GPU与双路Intel Xeon E5–2698 v4 CPU（20核）上的cuDF vs Pandas加速 1.2 安装 有conda可以直接安装
Copy these files from the ./Library/bin to ./DLLs/ : libcrypto-1_1-x64.* libss...
RAPIDS cuGraph库是一组图形分析，用于处理GPU数据帧中的数据 - 请参阅cuDF。...关联文章： nvidia-rapids︱cuDF与pandas一样的DataFrame库 NVIDIA的python-GPU算法生态 ︱ RAPIDS 0.10 nvidia-rapids︱cuML...机器学习加速库 nvidia-rapids︱cuGraph(NetworkX-like)关系图模型 ---- 文章目录 1 安装与背景 1.1 安装 1.2 背景 2 简单的demo 3 PageRank...---- 1 安装与背景 1.1 安装 Conda安装，https://github.com/rapidsai/cugraph： # CUDA 10.0 conda install -c nvidia...cuGraph是RAPIDS的图形分析库，针对cuGraph我们推出了一个由两个新原语支持的多GPU PageRank算法：这是一个COO到CSR的多GPU数据转换器，和一个计算顶点度的函数。
CondaANACONDA所有语言的包、依赖和环境管理器Anaconda Navigator为什么要使用Conda？...Conda主要是解决软件安装的问题1.1 下载Condawget 相当于Linux上的迅雷wget -c 断点续传 - - continue1.2 安装Miniconda3安装后需要重新加载查看conda...常用conda install （主命令+子命令）1.3 配置频道要配置好conda的频道才能用conda安装该频道的软件1.找到需要添加的频道2.复制链接地址3.添加conda频道的命令：conda...1.conda会改变原来设置好的环境2.不同的软件的依赖会互相冲突3.方便项目管理：基因组、转录组、Chip-seq……不要往base环境里安装任何软件包1.4.2 如何创建独立小环境conda create...1.4.4.2 哪些软件可以使用conda来安装？在安装之前确保小环境被激活conda可以一次安装多个软件，但是容易遇到报错1.4.4.3 如何指定安装的软件的版本？
在安装pytorch的时候因为源的问题折腾了非常久，在这记录以下。...During handling of the above exception, another exception occurred: 我大概就截图这么多吧，大概就这种类型的错误。...网上的办法 设置源： conda config --remove channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ conda.../anaconda/cloud/pytorch/ 执行安装命令 conda install pytorch-cpu==1.1.0 torchvision-cpu==0.3.0 cpuonly 注意：在执行的安装...pytorch的命令的最后，一定要将 -c pytorch 删除掉 大概就这样。
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。...Scrapy安装有问题的： 1.按照这个路径配置下anaconda的环境变量 2.然后进入pycharm里的工作目录 3.输入pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn.../simple scrapy 点击回车进行安装 4.安装完成后在cmd中输入scrapy, 若显示以下内容则证明安装成功： 版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献，该文观点仅代表作者本人...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容， 请发送邮件至 举报，一经查实，本站将立刻删除。
Matt Rocklin： ---- 我喜欢RAPIDS符合标准的Python API，这样就可以轻松地与现有的Python生态系统集成； ---- 我喜欢RAPIDS为许多其他Python软件包做出了贡献...此外，RAPIDS添加了cuStreamz元数据包，因此可以使用cuDF和Streamz库简化GPU加速流处理。...RAPIDS团队高兴地宣布，0.10版本随附一个完全基于XGBoost主分支的XGBoost conda软件包。这是一个快照版本，该版本包含即将发布的1.0.0 XGBoost版本中的许多功能。...为了简化下载，目前XGBoost的conda软件包（rapids-xgboost）已被包含在主要的Rapidsai conda通道中，如果你安装了RAPIDS conda元软件包，就会自动安装 conda...软件包（详细信息请参见入门页面）。
用官方源去安装、升级包，速度估计会抓狂，说不定还总是失败。 解决方法很简单，只需要把官方镜像替换为国内的镜像。网上搜的教程一般是清华或者中科大源。...不过，由于授权问题，中科大的 Anaconda 源已经停止服务。目前可以使用用清华或者北外的源。...，比如要用 R 语言的话增加 R 的镜像，要用 bioconda 则加上 bioconda的镜像： # R conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn.../anaconda/pkgs/free 检查是否成功 添加后，可以查看目前的conda软件源，检查是否添加成功： # 设置显示源的地址 conda config --set show_channel_urls...yes # 查看已添加的源 conda info 清楚缓存 添加成功后，可以运行 conda clean -i 清除索引缓存，保证用的是镜像站提供的索引。
下载完成后，运行安装程序并按照提示完成安装过程。 第二步：创建新项目并配置 Python 解释器 打开 PyCharm 并创建一个新项目。 在创建项目的向导中，选择合适的项目位置和项目名称。...第三步：配置 Conda 环境 在 Python Interpreter 页面，点击右上角的齿轮图标，然后选择 Add...。 选择 Conda Environment 选项卡。...点击 conda.exe 文件路径旁的文件夹图标。...浏览到你的 Anaconda 或 Miniconda 安装目录下的 Scripts 文件夹（通常位于 Anaconda3\Scripts 或 miniconda3\Scripts），选择 conda.exe...如果你已经有一个包含 PyTorch 的 Conda 环境，可以直接选择它；如果没有，则需要创建一个新的环境： 选择 Create New Environment。
pip: pip freeze conda: conda list
现在重要的是我们需要配置环境和实践一下，感受一下怎么用的！ 要安装 RAPIDS，请访问：https://rapids.ai/start.html，在这里你将看到如何安装 RAPIDS。...你可以通过 Conda 将其直接安装到你的机器上，或者简单地使用 Docker 容器。在安装时，您根据实际情况设置您的系统规格，如 CUDA 版本和您想要安装的库。...例如，我有 CUDA 11.3，想要安装所有的库，所以我的 install 命令是： 这一行命令完成运行，就可以开始用 GPU 加速数据科学啦！...conda create -n rapids-22.12 -c rapidsai -c conda-forge -c nvidia \ cudf=22.12 cuml=22.12 cugraph...】GPU数据科学加速包——RAPIDS
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