配置好了之后，我就可以肆无忌惮地安装perl包到/data/10.xuxiong/software/perl5目录。...cpanm Unicode::UTF8simple cpanm utf8 Encode RedisDB cpanm Statistics::Descriptive; cpanm Statistics::...Distributions; cpanm Bit::Vector; 安装好了之后，这些包就可以正常使用了。...假如我要从源码安装perl包，则可这样子实现： wget http://search.cpan.org/CPAN/authors/id/O/OV/OVID/Test-Most-0.34.tar.gz;...cpanm Test-Most-0.34.tar.gz;
装Perl模块有两种方法 自动安装 (使用CPAN模块自动完成下载、编译、安装的全过程) 手工安装 (去CPAN网站下载所需要的模块，手工编译、安装) 使用CPAN模块自动安装 安装前需要先联上网，有无...然后你直接运行cpanm Module::Name，就跟root用户一样的可以下载模块啦！ 或者用下面的方式在shell里面安装模块，其中ext是模块的安装目录，可以修改！...1 || cpanm -v --notest -l ext File::Basename;perl -MFile::Copy -e 1 > /dev/null 2>&1 || cpanm -v --notest...>&1 || cpanm -v --notest -l ext YAML;perl -MXML::Simple -e 1 > /dev/null 2>&1 || cpanm -v --notest -l...2>&1 || cpanm -v --notest -l ext Devel::Size;perl -MSort::Key::Radix -e 1 > /dev/null 2>&1 || cpanm
推荐使用cpanm在线安装或升级Mojo::Webqq模块, 如果使用docker方式请参见Docker镜像安装及使用方法 安装perl 安装之前请先确认下你的系统是否已经安装了Perl，因为除了windows...cpanm包管理工具（如果系统已经安装了cpanm可以忽略此步骤） 方法a： 通过cpan安装cpanm $ cpan -i App::cpanminus 方法b： 直接在线安装cpanm $ curl...|perl - App::cpanminus 使用cpanm在线安装 Mojo::Webqq 模块（如果系统已经安装了该模块，执行此步骤会对模块进行升级） $ cpanm Mojo::Webqq 如果安装过程中一直提示下载失败...安装失败可能有帮助的解决方法如果你运气不佳，通过cpanm没有一次性安装成功，这里提供了一些可能有用的信息在安装 Mojo::Webqq 的过程中，cpan或者cpanm会帮助我们自动安装很多其他的依赖模块...用户，通常采用的是编译安装的方式，系统缺少编译安装必要的环境，则会导致编译失败 对于 Windows 用户，由于不具备良好的编译安装环境，推荐采用一些已经打包比较全面的Perl运行环境 例如比较流行的
//github.com/sjdy521/Mojo-Webqq/blob/master/API.md) zabbix version：3.2 OS version：CentOS 7 1.依赖环境安装...1.1 安装cpanm包管理工具（如果系统已经安装了cpanm可以忽略此步骤） a) 方法a：通过cpan安装cpanm cpan -i App::cpanminus b) 方法b：直接在线安装cpanm...(我是通过这个方法安装成功的,第一个方法比较慢,貌似也不成功.) curl -kL http://cpanmin.us | perl - App::cpanminus 1.2 使用cpanm在线安装Mojo...::Webqq模块 cpanm Mojo::Webqq 1.3 使用cpanm安装邮件依赖模块 cpanm Mojo::SMTP::Client MIME::Lite （注意：由于国内墙和网络质量的问题...，很有可能有些依赖包安装不成功，可以多试几次，或者把没有成功的包单独cpanm装一次，实在没有办法的可以使用集成环境的包: https://github.com/sjdy521/Mojo-ActivePerl
也可以安装在本地，在本地可以绘制基于基因组的更复杂的图。 Circos由Perl写成，安装相对简单，只要Perl的包都装好了就可以了。...Circos安装 从http://circos.ca/software/download/circos/下载Circos安装包，并解压，把安装包内的bin目录加载到环境变量。...Perl包 配置CPANM (CPANM是一个文件，下载下来，增加可执行属性，放到环境变量中即可使用) # 若无根用户权限，也可放入自己家目录下在环境变量内的目录中就可以 wget https://raw.githubusercontent.com.../miyagawa/cpanminus/master/cpanm -O /sbin/cpanm chmod +x /sbin/cpanm 获得依赖的Perl包，circos -module ok...:Polyline没安装上，查看错误信息是No package 'gdlib' found # 根用户 yum install gd-devel 然后再用cpanm安装GD和GD::Polyline。
也可以安装在本地，在本地可以绘制基于基因组的更复杂的图。 Circos由Perl写成，安装相对简单，只要Perl的包都装好了就可以了。...Circos安装 从http://circos.ca/software/download/circos/下载Circos安装包，并解压，把安装包内的bin目录加载到环境变量。...pwd`/circos-0.69/bin ~/bin #make sure ~/bin is in $PATH or export PATH=$PATH:`pwd`/circos-0.69/bin 安装依赖的...Perl包 获得依赖的Perl包，circos -module 配置CPANM wget -O- http://cpanmin.us | perl - -l ~/perl5 App::cpanminus...echo 'export MANPATH=$HOME/perl5/man:$MANPATH' >> ~/.bash_profile Install needed modules by typing cpanm
为了其它相关软件的顺利运行，我们根据教程来设置默认的安装目录及变量环境：Ensembl's VEP ， If you don't have VEP installed, then follow this...--AUTO af --SPECIES mus_musculus --ASSEMBLY GRCm38 --DESTDIR $VEP_PATH --CACHEDIR $VEP_DATA ## 这中间会安装...-v --notest -l ~/perl5 Archive::Extract; cpanm -v --notest -l ~/perl5 Archive::Zip; cpanm -v --notest...-l ~/perl5 HTML::Entities; cpanm -v --notest -l ~/perl5 LWP::Simple; cpanm -v --notest -l ~/perl5...当然，你可能会喜欢snpEFF： 安装snpEFF工具并对VCF文件进行注释【直播】我的基因组85
Perlbrew是Perl5的安装和版本切换工具，您可以安装，删除，并在之间切换Perl版本。 Perlbrew在您的主目录中安装Perl，您安装的每个Perl版本都独立于其他版本。...installed 验证cpanminus模块现在是否存在： perlbrew list-modules 你应该在输出中看到App::cpanimus： App::cpanminus Perl 您现在可以使用命令行cpanm...cpanm Email::Simple 安装完成后，再次查看模块列表： perlbrew list-modules 您将看到以下输出结果： App::cpanminus Email::Date::Format...cpanm程序自动为您安装了依赖项。 结论 在本教程中，您安装了Perlbrew并使用它在您的主目录中安装Perl。...您还学习了如何使用Perlbrew来安装和管理多个版本的Perl，以及如何使用该cpanm实用程序从CPAN存储库安装其他模块。
说明：Lstu是一个使用Perl编写的轻量级短网址程序，还提供api、二维码生成、统计面板、网址导入和导出等功能，界面挺简洁的，用起来还行，这里就发个手动和Docker安装。...截图 手动安装 Github地址：https://github.com/ldidry/lstu 教程只适用于Debian、Ubuntu系统，建议使用Debian 9。...#安装依赖 apt update apt install build-essential libssl-dev zlib1g-dev libpng-dev memcached sqlite git -y...#安装cpanm curl -L http://cpanmin.us | perl - App::cpanminus #安装carton cpanm Carton #拉取源码 git clone https...Docker安装 1、安装Docker #CentOS 6 rpm -iUvh http://dl.fedoraproject.org/pub/epel/6/x86_64/epel-release-6-
64 yum install -y pcre.x86_64 yum install -y pcre2.x86_64 yum install -y ImageMagick* --skip-broken 安装...python模块 yum install -y python3-* --skip-broken 安装perl模块 yum install -y perl-* --skip-broken perl这一块的安装包找不到...，可以用conda来安装，还有cpanm来安装 (base) xiehs 09:45:56 ~ $ cpanm XML::Parser --> Working on XML::Parser Fetching
Pipeline安装有点复杂，但是安装完成后，使用就炒鸡方便了！！！...安装OrthoMCL Pipeline 直接去github下载zip安装包，或者直接使用git命令下载 git clone https://github.com/apetkau/orthomcl-pipeline.git...安装perl依赖包 使用cpan或者cpanm安装依赖包 $ cpanm BioPerl DBD::mysql DBI Parallel::ForkManager YAML::Tiny Set::Scalar...blast，MCL及OrthoMCL 安装好2.2.26版本的BLAST (blastall, formatdb, 不是blast+, 更旧的版本可能不会正确运行) 下载编译安装MCL (http://...出现上面的信息说明安装成功了！！！ 运行 $ .
软件及数据库下载及安装方法是： cd ~/biosoft # https://github.com/LANL-Bioinformatics/GOTTCHA mkdir GOTTCHA && cd GOTTCHA...看起来这个软件使用很简单，但事实上，我被虐了两个多小时，它里面的代码下载YAML的代码似乎有问题 perl -MYAML::XS -e 1 > /dev/null 2>&1 || cpanm -v --...notest -l ext YAML::XS; perl -MYAML -e 1 > /dev/null 2>&1 || cpanm -v --notest -l ext YAML; 导致它自己的脚本总是找不到
环境准备 Analizo的安装依赖于perl以及其他相关组件，编译和安装的命令如下。...File::ShareDir::Install sudo cpanm FindBin::libs sudo cpanm App::Cmd::Setup sudo cpanm Class::Inspector...sudo cpanm Env::Path sudo cpanm Class::Accessor::Fast sudo cpanm Graph sudo cpanm Graph::Writer::Dot...sudo cpanm YAML::XS sudo cpanm Statistics::Descriptive sudo cpanm File::HomeDir sudo cpanm CHI sudo.../libevent/build > libevent_matrics.yaml 整理结果 环境准备 我们使用pandas解析上面产生的yaml文件，所以需要安装一些python包。
在CentOS环境下，需要预先安装以下软件： yum (http://yum.baseurl.org/) Vmatch version 2.3.0 (http://www.vmatch.de/download.html...) Vmatch下载安装如下所示： wget -chttp://www.vmatch.de/distributions/vmatch-2.3.0-Linux_x86_64-64bit.tar.gz 需要将...： unzipCRISPRCasFinder.zip 依次安装上述的依赖软件以及依赖包，可以运行perl CRISPRCasFinder.pl -v查看缺少哪些perl模块，然后使用cpanm进行安装，...例如：cpanm JSON::Parse。...安装完成后即可使用主程序CRISPRCasFinder.pl。
注意：本实验都是重新安装的MySQL，可直接启动同步。...提示：若yum安装出现以下报错，建议在所有节点改用编译安装，操作见附1-附2： ?.../bin/bash 3 wget http://xrl.us/cpanm --no-check-certificate 4 mv cpanm /usr/bin 5 chmod 755 /usr.../bin/cpanm 6 cat > /root/list << EOF 7 install Algorithm::Diff 8 install Class::Singleton 9 install...，强烈建议使用yum安装，但yum安装必须使得MySQL版本为mysql-community-server-5.6.37（或以上）！
安装 对于本次安装，我的环境是 Linux Mint 桌面，版本是 18.3 Cinnamon 64 位，在其他大多数 Debian 派生系统上安装非常类似。...在大多数发行版中，对于基于 RPM 的系统也有类似的安装程序。...最简单的安装使用了 VirtualBox 作为虚拟化提供者，所以我需要安装它： sudo apt-get install virtualbox vagrant 安装程序将会获取依赖项 —— 主要是 Ruby...的一些东西，安装它们。...libtemplate-plugin-gravatar-perl \ libtext-csv-perl \ libstring-tokenizer-perl \ cpanminus cpanm
3）安装MMM（所有机器上都要执行） .......先安装MMM所需要的Perl模块........../bin/bash wget http://xrl.us/cpanm --no-check-certificate mv cpanm /usr/bin chmod 755 /usr/bin/cpanm...Proc::Daemon install Thread::Queue install Time::HiRes EOF for package in `cat /root/list` do cpanm...（注意：yum安装的和源码安装的路径有所区别）： /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/MMM MMM使用的主要perl模块 /usr/...执行上面的"perl -MCPAN -e shell"命令后，出现下面的安装命令 ...... cpan[1]> install MIME::Entity //依次输入这些安装命令 cpan
安装Expect 可以使用下面方法安装 cpanm cpanm Expect CPAN shell perl -MCPAN -e shell install Expect 或直接在cpan中进行安装 cpan
自动安装： 使用perl自带的cpan工具安装：% cpan Perl::Critic 使用cpanp（CPAN Plus）：% cpanp -i Perl::Tidy 使用cpanm（CPAN...Minus）：% cpanm DBI WWW::Mechanize 零配置，轻量级的CPAN客户端 手动安装： Makefile.PL： 下载perl模块包：% wget （该URL...，如果管理员想增加额外的安装目录，只需要重新编译并安装Perl即可。...安装 该模块还不是核心模块，需要用 cpan 下载：% cpan local::lib 查看提供的环境变量：% perl -Mlocal::lib： 使用其安装模块： 对于 cpan ：...% cpan -I Set::Crossproduct 对于 cpanm ：% cpanm --local-lib HTML::Parser 在脚本中自动将安装的路径加载到 @INC 中： use
zsh安装 如果你用 Mac，就可以直接看下一节，Mac默认已经安装； 如果你用 Redhat Linux，执行：sudo yum install zsh； 如果你用 Ubuntu Linux，执行...安装 官网推荐安装方式： Via curl: $ sh -c "$(curl -fsSL https://raw.github.com/robbyrussell/oh-my-zsh/master/tools...per-directory-history rake screen symfony2 torrent xcode bgnotify chruby cpanm
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