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转录组数据—质量控制(数据质量评估,过滤低质量

数据质量评估软件Fastqc图片(rna) Mar402 20:38:07 ~/project/Human-16-Asthma-Trans/data/rawdata #-t 6 同时对这6个文件进行质控...fastqc.zipSRR1039510_2_fastqc.zip SRR1039511_2_fastqc.html SRR1039512_1.fastq.gzfastqc运行#方法一:直接运行 #缺点霸占控制台和时间...fastqc -t 6 -o ./ SRR*.fastq.gz#方法二:在命令前后加上nohop & 使用FastQC软件对单个fastq文件进行质量评估,结果输出到qc/文件夹下(nohop no hang...multiqc *.zip -o ./ #-o 整合到当前目录再将整合的网页版文件下载到本地 (pic Multi QC)图片·对于转录组数据中的%Dups只要不超过80%即可图片图片图片图片图片过滤低质量是否需要过率低质量主要看...--per base N content、sequence quality Histograms 、adapter content 图片图片单个样本过滤低质量运行(rna) Mar402 20:59:04

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【信管7.2】质量保证与质量控制

质量保证与质量控制 项目质量管理的两个核心过程就是实施质量保证和控制质量。...控制质量 质量控制是监督并记录质量活动执行结果,以便评估绩效,并推荐必要的变更过程。本过程的主要作用包括: 识别过程低效或产品质量低劣的原因,建议并采取相应措施消除这些原因。...控制质量的实施步骤主要是:选择控制对象;为控制对象确定标准或目标;制定实施计划,确定保证措施;按计划执行;对项目实施情况进行跟踪监测、检查,并将监测结果与计划或标准相比较;发现并分析偏差;根据偏差采取相应对策...对于控制质量来说,我们最关心的是它的工具与技术,而其中最为核心的就是下面要介绍的七种质量工具。同时,这七种质量工具又分为新老两大类。...当一个过程的控制点超出了图中的上下控制界限,就认为当前过程的质量出现了问题。

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质量控制点的设置_质量控制的五个要点

(1)质量控制点是指对工程的性能、安全、寿命、可靠性等有严重影响的关键部位或对下道工序有严重影响的关键工序。...(3)质量控制点的划分:根据个控制点对工程质量的影响程度,分为A、B、C三级。   ...1)A级控制点:影响装置、设备的安全运行,使用功能或运行后出现质量问题时必须停车才可处理或合同协议有特殊要求的质量控制点,必须由施工、监理和业主三方质检人员共同检查确认并签证。   ...2)B级控制点:影响下道工序质量质量控制点,由施工、监理双方质检人员共同检查并确认签证。   ...3)C级控制点:对工程质量影响较小或开车后出现问题可随时处理的次要质量控制点,由施工方质检人员自行检查确认。

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scRNA-seq—质量控制

评估QC指标并设置过滤条件以删除低质量的细胞 scRNA-seq质量控制流程 ?...对于原始计数数据的质量控制,包括: 目标 筛选数据,使其仅包含高质量的真实细胞,这样当我们对细胞进行聚类时,就更容易识别不同的细胞类群 识别任何不合格的样本,并尝试挽救数据或将其从分析中删除,此外,还要尝试了解样本失败的原因...挑战 从不太复杂的细胞中划定质量较差的细胞 选择合适的阈值进行过滤,以保持高质量的细胞,而不会去除与生物相关的细胞类型 建议 在执行QC之前,要求您对细胞类型的期望有一个很好的了解。...如果是这样,那么在评估我们的数据质量时,我们需要考虑到这种生物学因素。...过滤 总之,孤立地考虑这些质量控制指标中的任何一个都可能导致对细胞信号的误解。例如,线粒体计数相对较高的细胞可能参与呼吸过程,可能是您想要保留的细胞。同样,其他指标也可以有其他生物学解释。

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CAE+VBR如何提升用户体验?

内容自适应编码(CAE)产生的是动态码率(VBR)视频流,根据内容复杂性为视频分配所需的码率从而让“编码质量”与“码率/带宽/存储空间”达到最佳平衡,为用户提供最佳的体验质量。...视频播放的用户体验质量之辩 ABR 播放时若想实现出色的用户体验质量不仅取决于最佳编码质量,还取决于播放期间ABR流之间的切换次数较少。...图1:VBR和CBR流的码率 3.2 实验过程 实验1:基于峰值码率的VBR流 情形一: DashJS播放器的测试结果 注意: DashJS播放器的ABR策略被设置为默认动态策略。...图2:DashJS Player上的VBR与CBR流 DashJS使用1000kbps作为初始带宽,同时下载ABR4作为VBR和CBR流的第一个切片。在整个播放期间,两个流的切换次数保持不变。...图5:使用DashJS时Manifest中的峰值码率与平均码率 DashJS播放器考虑根据吞吐量和缓冲级别来选择合适码率显示。 若以上两种情况下的平滑呈现切换次数保持不变。

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表达矩阵处理—表达质量控制

表达质量控制(UMI) 7.1.1 简介 一旦基因的表达被定量了,就将其概括为表达矩阵,其中每行对应于基因(或转录物),并且每列对应于单个细胞。...在此阶段未能移除低质量细胞可能会增加技术noise,这可能会模糊下游分析中感兴趣的生物信号。...因此,为了执行QC,我们将寻找相对于数据集的其余部分异常的细胞,而不是与独立的质量标准进行比较。因此,在比较使用不同protocol收集的数据集之间的质量指标时应该小心。...= anno ) 去除在任何细胞中都不表达的基因: keep_feature 0) > 0 umi <- umi[keep_feature, ] 定义控制特征...这里,PCA图提供了按质量度量排序的单元格的2D表示。然后使用来自mvoutlier包的方法检测异常值。

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控制风险,是质量保障的核心工作

前几天转发了一篇关于变更和质量风险的文章,公众号后台有位同学留言问了这样一个问题:最大的难点是影响范围不好评估,这也是目前业界的共同痛点,有没有一种产出比较高的影响范围评估方法来控制变更带来的风险。...这篇文章,聊聊质量保障工作的一个潜在内核:控制风险。 风险都是来自哪里?...软件工程的本质,是聚焦软件质量控制软件研发交付过程中的风险,这就是质量保障工作的内核。理想状态下,如果一切都按照设计和预期来百分百完美执行,那风险只存在于理论中。...所谓控制风险,其实就是通过一系列手段来对执行人不可预估的偏差进行控制,缩小不可控的范围以及带来的影响,进而保障软件的质量。 为什么管理比执行的薪资高?...控制风险的常见方法 今年年初给某国企质量部门做内部培训时,我分享的主题是全链路质量保障体系建设,其实就是针对软件生命周期的全流程来开展质量保障工作,其中的内核就是控制风险。

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【学习】用SPSS绘制质量控制

控制图通过科学的区分正常波动和异常波动,对工序过程的质量波动性进行控制,并通过及时调整消除异常波动,使过程处于受控状态。不仅如此,通过比较工序改进以后的控制图,还可以确认此过程的质量改进效果。...因此,控制图在质量管理中有着广泛的应用。 ? 控制图由样本均值服从于正态分布演变而来。正态分布可用两个参数即均值μ和标准差σ来决定。...在质量数据管理中,经常要用到一些图形方法和工具,例如帕雷托图、直方图、散点图、控制图、序列图等,SPSS均可以有效地应用这些图形方法和工具来处理质量数据信息,这些功能集中在Graph菜单中。...步骤: 分析—质量控制控制图—个体/移动全距—个案为单元 过程度量:选择“测量值变量;标注子组:选择“编号” 自动生成以下两组控制图,可用于综合解读。 ? ?...质量控制图的使用规则 既然质量控制图是为了帮助我们及时发现指标的不正常状态,那么当我们看到上面的图以后,需要观察和分析是不是存在异常的点或异常的变化趋势,如何定义这些异常,需要有一套控制规则:即样本点出界或者样本点排列异常

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Python 单细胞分析教程(一):质量控制

以上原因,使得我们所获得的单细胞测序数据不是完美的,我们需要对数据进行质量控制,避免影响我们发现有意义的生物学结果。...但是不同的预处理方法可能会带来不同的效果,单细胞测序分析技术的快速发展使得我们有大量的工具可以对单细胞测序数据进行质量控制。在本小节中,我们将详细描述质量控制的最佳步骤。 1....过滤低质量的细胞 质量控制的第一步是过滤低质量的细胞。当细胞检测到的基因数量较少、计数深度较低且线粒体计数较高时,细胞膜可能会破裂,这表明细胞正在死亡。...由于这些细胞通常不是我们分析的主要目标,并且可能会扭曲我们的下游分析,因此我们在质量控制过程中将其去除。为了识别它们,我们定义了细胞质量控制(QC)阈值。...手动/自动过滤低质量读数细胞 在第二小节我们介绍了低质量读数的细胞的过滤思想,在本小节中,我们将演示手动与自动过滤低质量读书的细胞的步骤。

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铣削零件表面质量控制

数控编程、车铣复合、普车加工、Mastercam、行业前沿、机械视频,生产工艺、加工中心、模具、数控等前沿资讯在这里等你哦 1、切削深度参数对表面粗糙度影响及控制 在进行高速铣削加工时,通常是作为精加工流程...针对硬铝合金进行铣削作业过程中,在切削深度值逐步增大情况下,所加工工件的粗糙度同样有所增加,导致这一问题的主要原因为在切削深度逐步增加情况下,所形成切削力同样也会增加,由于切削力在一直发生着改变,从而使得工件加工的表面质量会受到相对较大的影响...2、径向进给量参数对表面粗糙度影响及控制 依照相关理论,在进行工件的加工过程中,所设定的径向进给量参数值越小情况下,则相应的立铣刀在工件表面位置所留下的残余高度值便会有所降低,此时便能够确保加工工件的表面粗糙度会进一步的减小...3、主轴结构转速参数与进给速率参数对表面粗糙度影响及控制 在进行铣削加工过程中,一般情况下铣刀和加工工件之间会存在一定的倾角,角度β值代表了铣刀轴线位置和进给方向之间形成的夹角值,若是所使用的铣刀对应轴线对于进给方向而言其为超前方倾斜情况下

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优思学院|零质量控制是什么概念?

今天,优思学院希望和大家讲述一个比较少人谈论,但又是一个很好的质量管理概念,这就是零质量控制(Zero Quality Control)。...那些追求过程优化并致力于持续过程改进的组织将零质量控制(Zero Quality Control)作为目标。...(SQC)的需求,而这些年来一直是质量控制的核心”。...跨越SQC 在他的书中,Shingo写道,他花了20年的时间认为统计质量控制(SPC)代表了质量控制的顶峰。它从简单地扔掉有缺陷的产品发展到试图阻止缺陷的发生。...Shingo写道,这个结果“完全使我摆脱了统计质量控制的魔咒。”这些思想最终导致了全面质量管理,在全球范围内得到了广泛推广。

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干货 | 携程酒店360度Java质量控制

所以,根据被测系统的重要性以及成本的考量,不同的公司对质量保障体系有着不同考量。 ?...常见的测试保障体系 携程酒店测试的质量保障体系在传统的质量体系中增加了一些 “保镖”,不同的是,其中一部分增加的“保镖”是机器人。这样既增加了被测系统的安全性,也适当的降低了成本。...无疑携程酒店的360度质量保障体系的核心就是自动化。也只要有这样,无论是持续集成,API测试以及监控预警,利用自动化都达到了质量和效率的双重保障。 ? 携程酒店360度质量保障体系 1....那么就面临着一个问题:如何量化这些测试用例的质量,如何衡量测试的完整度和有效性。...如何能在这些挑战面前保障软件的质量,如何能利用创新来提高效率和质量,这是摆在所有测试人面前的问题。

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振弦采集仪助力岩土工程质量控制

振弦采集仪助力岩土工程质量控制随着工程建设规模越来越大,建筑结构的安全性和稳定性越来越成为人们所关注的焦点。岩土工程在工程建设中占据着非常重要的地位,岩土工程质量控制更是至关重要。...而振弦采集仪作为一种先进的检测设备,正得到越来越广泛的应用,为岩土工程质量控制提供了有力的保障。...在工程建设中,岩土工程质量控制需要从多个方面考虑,其中结构物的稳定性和承载能力是最为重要的。...总结,振弦采集仪在岩土工程质量控制中具有非常重要的作用。它可以对结构物的稳定性、承载能力、地下水位等指标进行精确测量,为岩土工程的规划、设计、施工、验收等环节提供全方位的支持和保障。

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