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xarray系列 | 基于xarraydask并行写多个netCDF文件

创建的多进程cluster 不同的机器参数设置上述信息会存在差异 然后加载数据集: ds = xr.tutorial.open_dataset('rasm', chunks={'time': 12})...然后,对上述数据集执行相关计算操作: result = np.sqrt(np.sin(ds) ** 2 + np.cos(ds) ** 2) 计算过程使用了 dask,可以执行如下语句查看计算图: result.Tair.data.visualize...读取存储的数据: new_ds = xr.open_mfdataset(paths, combine='by_coords') 然后上述计算的结果进行对比: try: xr.testing.assert_identical...之前也介绍过另一种文件格式 Zarr真的能替代NetCDF4HDF5吗,在文件并行写增量写方面非常友好,尤其是涉及到大文件时。...后话:虽然本文使用了dask,但是涉及到dask的内容比较少。最近在处理数据时用到了dask,后面有时间可能会更一些dask相关的推文,比如数据并行处理。

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【Python 数据科学】Dask.array:并行计算的利器

Dask提供了两种主要的数据结构:Dask.arrayDask.dataframe。在本文中,我们将重点介绍Dask.array,它是Dask中用于处理多维数组数据的部分。...可以使用dask-schedulerdask-worker命令来启动调度器工作节点: dask-scheduler dask-worker 其中scheduler_address...数组可视化与比较 9.1 使用Matplotlib进行数组可视化Dask.array中,我们可以使用Matplotlib或其他可视化工具来将数组数据以图表形式展示出来。...然而,在小规模数据集或简单计算任务的情况下,NumpyPandas可能更适合。NumpyPandas在功能性能上更加全面,因为它们是专门针对数组表格数据的库。 10....在未来,Dask.array将继续发展,为科学计算工程领域带来更多的便利效率。我们期待Dask.array在大数据处理、机器学习科学研究等领域的更广泛应用。 感谢阅读。

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对比Vaex, Dask, PySpark, Modin Julia

我们将看一下Dask,Vaex,PySpark,Modin(全部使用python)Julia。...这些工具可以分为三类: 并行/云计算— Dask,PySparkModin 高效内存利用— Vaex 不同的编程语言— Julia 数据集 对于每种工具,我们将使用Kaggle欺诈检测数据集比较基本操作的速度...主要操作包括加载,合并,排序聚合数据 Dask-并行化数据框架 Dask的主要目的是并行化任何类型的python计算-数据处理,并行消息处理或机器学习。扩展计算的方法是使用计算机集群的功能。...Dask处理数据框的模块方式通常称为DataFrame。...让我们来比较一下pandasjulia中数据加载、合并、聚合排序的效果。 ? Julia性能 要衡量Julia的速度并不是那么简单。

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并行计算框架Polars、Dask数据处理性能对比

Polars Dask 3、大数据集 我们使用一个8gb的数据集,这样大的数据集可能一次性加载不到内存中,需要框架的处理。...Polars Dask 总结 从结果中可以看出,PolarsDask都可以使用惰性求值。...所以读取转换非常快,执行它们的时间几乎不随数据集大小而变化; 可以看到这两个库都非常擅长处理中等规模的数据集。...由于polarDask都是使用惰性运行的,所以下面展示了完整ETL的结果(平均运行5次)。 Polars在小型数据中型数据集的测试中都取得了胜利。...但是,Dask在大型数据集上的平均时间性能为26秒。 这可能Dask的并行计算优化有关,因为官方的文档说“Dask任务的运行速度比Spark ETL查询快三倍,并且使用更少的CPU资源”。

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数据科学学习手札150)基于dask对geopandas进行并行加速

2 dask-geopandas的使用   很多朋友应该听说过dask,它是Python生态里非常知名的高性能计算框架,可以针对大型数组、数据框及机器学习模型进行并行计算调度优化,而dask-geopandas...就是由geopandas团队研发的,基于dask对GeoDataFrame进行并行计算优化的框架,本质上是对daskgeopandas的封装整合。...()将其转换为dask-geopandas中可以直接操作的数据框对象,其中参数npartitions用于将原始数据集划分为n个数据块,理论上分区越多并行运算速度越快,但受限于机器的CPU瓶颈,通常建议设置...的计算比较中,dask-geopandas取得了约3倍的计算性能提升,且这种提升幅度会随着数据集规模的增加而愈发明显,因为dask可以很好的处理内存紧张时的计算优化:   当然,这并不代表我们可以在任何场景下用...dask-geopandas代替geopandas,在常规的中小型数据集上dask-geopandas反而要慢一些,因为徒增了额外的分块调度消耗。

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如何可视化理解MongoDB数据

可用的MongoDB数据可视化工具 无论你选择何种类型的数据,有时需要可视化所有数据。在搜索MongoDB数据可视化工具时,我注意到很难找到具有开箱即用功能的工具。...因此,今天我将给大家介绍一个我使用的工具,这些工具用于可视化我的数据。 · 第一个是Compass,它是一个本机MongoDB数据库管理GUI应用程序,是MongoDB Atlas订阅的一部分。...我发现它适用于MongoDB数据及其集合模式的可视化,编辑,添加删除数据。此外,我使用了Schema可视化工具在我的数据集中定义模式。...这就是它的界面: image.png · 我认为它是Compass最强大的部分之一,因为它使我能够与数据实时交互,快速执行简单复杂的查询来过滤数据,查看数据的特定部分,使用生成的直方图分析数据类型字段值的分布...· 我选择的第二个数据可视化工具是Flexmonster Pivot Table。它是Web报告和数据分析的组件。

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Spark vs Dask Python生态下的计算引擎

本文基于Gurpreet Singh大佬在 Spark+AI SUMMIT 2020 的公开课编写 0x00 对于 Python 环境下开发的数据科学团队,Dask 为分布式分析指出了非常明确的道路,但是事实上大家都选择了...Spark vs Dask 首先先上DaskSpark的架构设计图~ [设计架构] 生态 Dask 对于 Python 生态中的 Numpy、Pandas、Scikit-learn等有很好的兼容性,并且在...但是因为 Dask 需要支持分布式,所以有很多 api 不完全 pandas 中的一致。并且在涉及到排序、洗牌等操作时,在 pandas 中很慢,在 dask 中也会很慢。...) Debug dask分布式模式不支持常用的python debug工具 pySpark的error信息是jvm、python混在一起报出来的 可视化 将大数据集抽样成小数据集,再用pandas展示...使用开源的D3、Seaborn、DataShader等(Dask)框架 使用 databircks 可视化特性 选择 Spark 的原因 你更喜欢 Scala 或使用 SQL 你是基于或者更偏向

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什么是Python中的Dask,它如何帮助你进行数据分析?

这个工具包括两个重要的部分;动态任务调度数据收集。前面的部分与Luigi、芹菜和气流非常相似,但它是专门为交互式计算工作负载优化的。...后一部分包括数据帧、并行数组扩展到流行接口(如pandasNumPy)的列表。...Dask数据帧非常适合用于缩放pandas工作流启用时间序列的应用程序。此外,Dask阵列还为生物医学应用机器学习算法提供多维数据分析。...此外,您可以在处理数据的同时并行运行此代码,这将简化为更少的执行时间等待时间! ? 该工具完全能够将复杂的计算计算调度、构建甚至优化为图形。...Dask还允许您为数据数组构建管道,稍后可以将其传输到相关的计算资源。

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数据可视化专题】22个免费的数据可视化分析工具推荐

本文总结推荐22个免费的数据可视化分析工具。列表如下: 数据清理(Data cleaning) 当你分析可视化数据前,常需要“清理”工作。...下面的两个工具被用来帮助使数据处于最佳的状态。 1、DataWrangler 斯坦福大学可视化组(SUVG)设计的基于web的服务,以你刚来清理重列数据。...可视化应用与服务(Visualization applications and services) 这些工具提供了不同的可视化选项,针对不同的应用场景。...还能够方便合作者在同一个服务器上分享备份,email上传数据,快速同步不同版本数据,Fusion Tables可以上传100MB的表格文件,同时支持CSVXLS格式,当然也可以把Google Docs...Google Fusion Tables的处理大数据量的强大能力,以及能够自由添加不同的空间视图的功能,也许会让Oracle,IBM, Microsoft传统数据库厂商感到担心,Google未来会强力介入数据库市场

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八个 Python 数据生态圈的前沿项目

Bokeh Bokeh 是一个不需要服务器就可以在网页浏览器中实现交互式可视化的 Python 程序库。...Bokeh 可以处理非常大的数据集甚至是大数据流(比如实时光谱图),同时它还具有运算速度快、可嵌入可视化新颖的特点。它对于想要快速便捷地创建交互式图表和数据应用的人来说非常有用。...Bokeh 真正表现出色的地方是大数据可视化过程。与这些数据打交道的人应该感谢 Bokeh 致力于提升自身的性能。...Dask 图表利用 Python 字典、元组函数来编码算法,而且它不依赖于 Dask 所提供的集合类型。 目前 Python 生态圈中的许多程序库功能相近。...但是Blaze, Dask Numba 这些程序库共同作用于数据处理过程的不同层面上。类似的,你可以把 Blaze 看成关系型数据库管理系统的查询优化器,而把 Dask 看成执行查询的引擎。

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豆瓣电影数据分析可视化

前一段时间出于个人兴趣做了个小demo,主要内容是以豆瓣电影上提供的电影数据为例,完整地展示网络数据从获取、处理到分析、可视化这一过程。纯当练手,也为感兴趣的小伙伴提供相关的技术介绍。...项目代码托管在我的Github上,可视化网站地址请参见文末。 数据获取 用python写爬虫,Scrapyurllib2都是比较好的选择,由于我对功能的要求比较简单,故选择后者即可。...数据清洗 这一步主要是为了提高数据质量配合后续的工作,对获取的数据进行一些清洗预处理工作。...我的主要分析字段是电影数量和平均评分,看它们电影分类、语言、上映国家、上映时间、时长等其他字段之间有何关联。 数据可视化 俗话说,“一图胜千言”,所以数据分析的结果以可视化网站的形式给出。...网络上可以获取的数据不计其数,只要脑洞开得够大,在数据源、分析技术、可视化方法上进一步提升,就一定可以创造出更有意义价值的成果。

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浅谈数据可视化那些可用的工具示例【可视化

什么是数据可视化?数据可视化主要旨在借助于图形化手段,清晰有效地传达与沟通信息。...这意味面对一大堆杂乱的数据你无法嗅觉其中的关系,但通过可视化数据呈现,你能很清晰的发觉其中价值。...在经过一阶段的数据分析平台搭建工作后,结合比赛,我开始了对数据可视化的研究,结合几篇对可视化技术与工具的描述,以下整理出一些数据可视化的资料与知识,以供参考。...9.Peity:jQuery 插件,可生成非常小的条形图、折线图饼图,只支持较新版本的浏览器。再强调一遍,它能生成非常小又非常精致的小型可视化图表。...Page: http://sigmajs.org/ 3.3 地图映射(包括地理位置数据或地理数据) 1.Kartograph: Gregor Aisch 开发的一个基于JavaScript Python

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Python处理大数据,推荐4款加速神器

Mars Mars 是numpy 、 pandas 、scikit-learn的并行分布式加速器,由阿里云高级软件工程师秦续业等人开发的一个基于张量的大规模数据计算的统一框架,目前它已在 GitHub...,能以一种更方便简洁的方式处理大数据量,与Spark这些大数据处理框架相比较,Dask更轻。...项目地址:https://github.com/dask/dask 官方文档:https://docs.dask.org/en/latest/ CuPy CuPy 是一个借助 CUDA GPU 库在英伟达...,它可以有效进行可视化、探索、分析乃至实践机器学习。...Vaex采用了内存映射、高效的外核算法延迟计算等概念来获得最佳性能(不浪费内存),一旦数据存为内存映射格式,即便它的磁盘大小超过 100GB,用 Vaex 也可以在瞬间打开它(0.052 秒)。

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用于ETL的Python数据转换工具详解

Pandas在Python中增加了DataFrame的概念,并在数据科学界广泛用于分析清理数据集。 它作为ETL转换工具非常有用,因为它使操作数据非常容易直观。...优点 广泛用于数据处理 简单直观的语法 与其他Python工具(包括可视化库)良好集成 支持常见的数据格式(从SQL数据库,CSV文件等读取) 缺点 由于它会将所有数据加载到内存中,因此无法扩展,并且对于非常大...(大于内存)的数据集来说可能是一个错误的选择 进一步阅读 10分钟Pandas Pandas机器学习的数据处理 Dask 网站:https://dask.org/ 总览 根据他们的网站,” Dask是用于...如果要处理的数据非常大,并且数据操作的速度大小很大,Spark是ETL的理想选择。...使用CSV等数据格式会限制延迟执行,需要将数据转换为Parquet等其他格式 缺少对数据可视化工具(如MatplotlibSeaborn)的直接支持,这两种方法都得到了Pandas的良好支持 进一步阅读

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基于Echarts实现可视化数据大屏大数据可视化的方法流程

随着大数据时代的到来,数据可视化成为一种重要的工具。它将庞大复杂的数据转化成直观、易懂的图形,便于用户快速理解分析数据。...而Echarts是一种优秀的数据可视化工具,能够帮助我们实现各种各样的数据可视化。本文将详细介绍基于Echarts实现可视化数据大屏大数据可视化的方法流程,并且给出一个实例进行演示。...同时,Echarts还提供了丰富的配置项交互功能,可以帮助我们轻松地实现各种各样的数据可视化可视化数据大屏设计思路在实现可视化数据大屏之前,我们需要先明确设计思路。...实现方法及流程下面将介绍基于Echarts实现可视化数据大屏大数据可视化的具体方法流程。1. 数据准备首先,我们需要准备数据数据可以来自数据库、API接口或其他数据源。...seriesIndex: 0 }); }); 结论以上便是基于Echarts实现可视化数据大屏大数据可视化的详细方法流程

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