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dbGaP加密数据权限申请和数据解密

其实这些数据库都是需要通过dbGaP申请下载权限的。 这里就以NCBI为例给大家介绍一下dbGaP数据权限申请过程,以及数据下载解密时要注意的地方。...Step1:获取账号 dbgap账号需要NCI/NIH认证资格,一般是实验室的PI、且申请过NIH或是NCI的资助,才可能有dbgap账号。...点击"get dbGaP repository key"下载解密要用的key,文件以“.ngc”结尾。 Step5. 文件解密 解密使用的软件是SRA-Toolkit,建议在linux端运行。...进入ncbi路径: cd /home/ncbi/dbGaP-xxxx 运行解密命令: vdb-decrypt xx.ncbi_enc (xx.ncbi_enc为下载的需要解密的文件) 注意,运行vdb-decrypt...以上就是dbGaP数据申请和下载解密的方法,希望大家都能顺利申请到权限,利用好公共数据库。

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数据分析:创建统一的公有基因组数据平台

基因组学的科研人员正越来越多地使用云计算服务,谷歌的云计算服务就是其中之一 今年三月基因组学领域的科研工作者们迎来了一件大喜事:美国国立卫生研究院NIH取消了不准将其dbGap数据库中的基因组信息上传到云端的规定...访问控制 科研人员想要从dbGAP等数据库中取得人类基因组数据,必须要经过数据访问委员会的批准。现在如果有不同的科研人员想要在云平台上使用同一数据集,他们各自必须得到相应的数据访问委员会批准。...比如现在囊性纤维变性研究人员完全不能通过软件在dbGap数据库中搜索病患的基因序列。通过系统性地进行数据标记,例如样本的来源将有助于解决这个问题。

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