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UseGalaxy.cn生信云|零代码使用Tiverse优雅地处理数据集

Dplyr Count the observations count 函数用于统计数据框中各个组的频数,可以对指定变量进行计数,得到每个类别的观测数目,支持根据需要对结果进行排序。...Dplyr Distinct keep unique rows distinct 函数用于去除数据框中的重复观测,仅保留唯一的观测。它可以基于指定的列对数据框进行去重操作,确保每个观测都是唯一的。...Dplyr Select keep or drop columns select 函数用于选择数据框中的特定列,可以保留感兴趣的变量,并且能够根据列名、位置或条件表达式进行灵活的变量选择操作。...Dplyr Slice select rows by position slice 函数用于按行数进行切片,能够从数据框中提取特定的行,支持根据行数或行号选择需要的行,也支持使用负数表示从末尾开始计算的行数...Tidyr Pivot Longer from wide pivot_longer 函数用于将宽格式数据转换为长格式数据,能够根据用户指定的列将数据框中的多个列整理成一对 “名-” 对,便于进一步的分析和处理

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R&Python Data Science 系列:数据处理(1)

Python from dfply import * import numpy as np import pandas as pd ##筛选cutIdeal记录的4行 diamonds >> filter_by...R语言 library(ggplot2) library(tidyverse) library(tidyr) library(dplyr) ##筛选cutIdeal记录的4行 diamonds %...4 筛选函数 4.1 select函数 select函数用于选择数据集中某(几)列: Python实现 ##选择cut和price列,取3行 diamonds >> select(X.cut...注意:python中按比例抽样和抽样指定的几列,是通过参数限制的;R语言按比例抽样使用sample_frac()函数,抽样几列使用sample_n()函数 4.4 distinct函数 选择唯一...,这里需要注意的是,查看某列有几个唯一,python中需要先select()函数选择这一列,然后再使用distinct,或者先distinct,再使用select;若直接使用distinct,则所有列全部输出

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RFM模型及R语言实现

可以进行不同块的对比分析:均值分析、块类别分析等等 ? 接下来,我们继续采用挖掘工具对R、F、M三个字段进行聚类分析。...这时候我们要考虑是直接用R(Recency)、F(Frequency)、M (Monetary)三个变量还是要进行变换,因为R、F、M三个字段的测量尺度不同最好对三个变量进行标准化,例如:Z得分(实际情况可以选择线性插法...(rnorm(10000,28,13)))) # rnorm(n, mean = 0, sd = 1),以上产生均值28,方差13的1万个数,用来模拟用户的消费情况. # sample(1000...:1999,replace=T,size=10000), 从1000到1999这些数字中,有放回抽样进行取样,一共取1万个样本,平均每个样本取10次。...salesR,"CustomerId") salesRFM=merge(salesM,test1,"CustomerId") ##Creating R,F,M levels #切分成100份,实际只用5

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R语言之 dplyr

dplyr 包里处理数据框的所有函数的第一个参数都是数据框名。 下面以 MASS 包里的 birthwt 数据集例,介绍 dplyr 包里常用函数的用法。...其中结果变量 bwt 是新生儿的体重(单位:g),变量 low 是将 bwt 的取值以 2500g 分点转换成的一个二分类变量。...使用下面的命令将会选择选择年龄大于 35 岁,并且出生体重小于 2500g 或者大于 4000g 的所有记录,因为记录较多,这里只显示了 10 行。...最本质的差别是多了一个分组属性(Groups),即上面的结果包含了 3 个数据框,分别对应于变量 race 的 3 个类别。...使用传递符 %>% 组合多个操作 我们经常需要对一个数据框做一系列的操作,后面一个操作的输入需要用一个操作的输出结果。

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R语言入门(一)之数据处理

KNO3", "NaNO3", "H2O"), each=5) #seq() 产生一个向量序列;rep() 重复一个对象 #rep(x,times):x是要重复的对象(例如向量c(1,2,3)),times对象中每个元素重复的次数...read.csv(file=file.choose(),header=T) #跳出选择文件的对话框,选择文件后自动打开 head(a1) #显示数据6行 tail(a1) #显示数据后6行 dim(a1...table(a1$chemical) table(a1$chemical, useNA = "ifany") #求因子出现的频数;table()函数默认忽略缺失(NA),要在频数统计中将NA视为一个有效的类别...#数据特定列的选择 a2.2[, c("Species", "Sepal.Length", "Sepal.Width")] a2.2[,c(5,1,2)] dplyr::select(a2.2, 5,...#数据列的选择 dplyr::select(a2.2, Species, contains("Sepal")) #筛选a2.2数据中标题包括"Sepal"、标题为"Species"的列 ?

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【R语言】基础知识|dplyr管道函数处理表格

01 select()变形函数 dplyr包的安装就不展示了,dplyr包是内含多函数且功能强大的数据处理包。...select(data, "销售城市", "产品类别", "销售员", "金额") ? 02 filter( ) filter( ) 函数 筛选数据框内容,选择产品类型是纯棉口罩的数据。 ?...03 mutate( ) mutate( )函数用来创建新的数据框,创建新的1列销售额。 ?...summarize()用来汇总数据,汇总产品类别和销售城市,同时增加平均数量和均价。 ?...06 %>%管道操作符 %>%管道操作符,这个是我在dplyr包中最喜欢的一个操作符了,它运用起来特别方便,能够连接前后两个步骤,实现嵌套使用简化代码的同时还能避免存储多余的中间而节省内存空间。

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机器学习| 一个简单的入门实例-员工离职预测

因此首先对离职与否(left)这个类别变量通过factor()函数,指定水平参数的取值1和0后将其转变为因子型。...dplyr包和forcats包(install.packages(“dplyr”)、install.packages(“forcats”)),第一次使用还需要进行加载(library(dplyr)、library...2.模型建立 首先在R中安装和加载e1071包,然后利用e1071包中的svm( )函数,通过给定自变量与因变量,同时给出训练数据,并将参数type设置”C”以表示进行分类,由此建立起可用于处理二分类问题的支持向量机模型...4.选择调和参数 在用带RBF核(Radial Basis Function)的SVM拟合样本时,gamma和cost这两个参数的取值可能会影响最终的结果。...因此,基于初始的gamma和cost,我们gamma和cost参数设置一个候选范围,一共尝试了5个不同的gamma(0.001,0.01,0.1,1,10)以及5个成本参数(0.01,0.1,1

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「R」数据操作(五):dplyr 介绍与数据过滤

你可能已经注意到每个列名下面有三到四个字母的缩写。...,只含TRUE和FALSE fctr代表因子,R用它来代表含固定可能的分类变量 date代表日期 dplyr基础 这部分我们学习5个关键的dplyr函数,它可以让我们解决遇到的大部分数据操作问题:...根据选择观察(记录),filter() 对行重新排序,arrange() 根据名字选择变量,select() 根据已知的变量创建新的变量,mutate() 将许多值塌缩单个描述性汇总,summarize...dbl>, distance , hour , minute ## # , time_hour 比较 想要有效地过滤,你必须知道怎么利用比较操作符来选择观测...解决这种问题的一种有用简写x %in% y。这将选择符合x属于y的行(x是y中的一个)。

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【R语言】dplyr对数据分组取各组几行

然后取每一个组的10个条目或者5个条目来绘制柱形图或者气泡图。 那么问题来了,如何分组取几行。今天小编就跟大家分享一个专业处理数据框的函数dplyr。...top_n #使用top_n r2=GO_result %>% group_by(ONTOLOGY) %>% top_n(n=-5,wt=p.adjust) r2 这里可以使用top_n这个函数来输出每个组的五行...,wt是排序的依据,根据校正之后的p来排序,n=-5是按从小到大排序。...GO富集分析的结果,默认是会根据校正之后的p(p.adjust)来由小到大排序,所以基于这个结果,直接取每组的五行就是最显著的5个条目。...如果GO富集结果默认没有按p.adjust排过序,那么就需要选择带有排序的方法,如top_n和slice_min。

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数据处理第3部分:选择行的基本和高级的方法

原文地址:https://suzan.rbind.io/2018/02/dplyr-tutorial-3/ 作者:Suzan Baert 这是系列dplyr系列教程中的第三篇博客文章。...Basic row filters 在许多情况下,您不希望在分析中包括所有行,而只包括选择的行。 仅使用特定行的函数在dplyr中称为“filter()”。...在这种情况下,我们需要一个函数来评估字符串上的正则表达式并返回布尔。 每当语句“TRUE”时,该行将被过滤。...以一个财务数据框例,你想要选择带有'food'的所有行,是否在主类别栏,子类别栏,评论栏或你花费的地方提到了食物。 您可以在OR语句中包含4个不同条件的长过滤器语句。...但是几组专栏只包含动物信息。 Vesper Mouse的遗体缺失,但这是我仍然可以挖掘并添加到数据框的信息,如果我想要的话。 所以想象一下,我想找出几列中我们NA的所有数据行。

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R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

包 #dplyr中基本函数 filter——数据筛选(筛选观测,行) filter(Hdma_dat,pclass == 1) ###################################...## #dplyr中基本函数 select——子集选取(筛选变量,列) select(Hdma_dat,pclass,survived) ##选择pclass变量 ?...– apply – combine模式——分组处理模式 对数据的转换,可以采用split – apply – combine模式来进行处理: split:把要处理的数据分割成小片断; apply:对每个小片断独立进行操作...##按照已有的类别数据,分类 g<-split(Cars93,Cars93$Origin) #按照cars93数据集,按照origin进行分组 ##例2:对矩阵分组(按列) m<-cbind...##对于数据框 x是对象,subset是保留元素或者行列的逻辑表达式,对于缺失用NA代替。 Select 是选取的范围,应小于x。

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手把手教你R语言随机森林使用

随机森林用于分类器的算法过程,随机切分样本,然后选择2/3用于建模,剩余1/3用于验证袋外误差;随机选择特征构建决策树,每个叶子节点分成二类;根据GINI系数判断分类内部纯度程度,进行裁剪树枝;1/3数据预测...,根据每个决策树的结果投票确定标签;输出标签结果,并给出OOB rate随机的含义在于样本和特征是随机选择去构建决策树,这可以有效避免偏差,另外弱分类器组成强分类器也即是多棵决策树组成森林能提升模型效果...另外,在这一步也有教程对特征进行选择,筛选组间差异大的特征用于建模。这里使用caret::createDataPartition函数进行划分数据集,它能够根据组间比例合理分割数据。...) 结果:在选择Pr(>|z|) |z|) < 0.2,最终5个特征符合要求。...该处没有对自变量进行标准化,本来是要做的,但考虑到每个指标所含有的临床学意义,就使用了原始

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ggstatsplot:R统计绘图的颜天花板

今天小编为大家介绍一个可以让科研论文统计绘图颜提升好几个level的R包:ggstatsplot。 ggstatsplot是ggplot2的扩展,用于绘制带有统计检验信息的图形。...ggstatsplot提供了多种类别的统计绘图。用户可以在图形上添加统计建模(假设检验和回归分析)的结果,可以进行复杂的图形拼接,并且可以在多种背景和调色板中进行选择,使图形更美观。...# for reproducibility set.seed(123) # plot ggstatsplot::grouped_ggbetweenstats( data = dplyr::filter...仅仅遵循默认本身就可以生成可以发布的相关矩阵。 如果所选变量中存在NA,图例将显示用于相关性测试的最小、中位数和最大对数。...如果只输入一个类别变量,单样本比例检验(即卡方拟合优度检验)的结果将显示为副标题。

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R数据科学|5.5.2内容介绍及课后习题解答

使用内置的geom_count() 函数: ggplot(data = diamonds) + geom_count(mapping = aes(x = cut, y = color)) 【注】图中每个圆点的大小表示每个变量组合中的观测数量...相关变动就表示特定 x 轴变量值与特定 y 轴变量值之间的强相关关系。 ?...问题二 使用geom_tile()函数结合 dplyr 来探索平均航班延误数量是如何随着目的地和月份的变化而变化的。为什么这张图难以阅读?如何改进?...从上图可以发现存在缺失,因此可以通过删除缺失来改进: flights %>% group_by(month, dest) %>%...解答 更好的做法是使用带有更多类别的分类变量,或者在y轴上较长的标签。如果可能的话,标签应该是水平的,因为这样更容易阅读。并且,切换顺序不会导致标签重叠。

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