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dplyr突变、替换和列长度

dplyr是一个在R语言中用于数据处理和数据操作的包。它提供了一组简洁且一致的函数，可以帮助我们对数据进行筛选、排序、汇总、变换等操作。

突变（Mutate）：在dplyr中，突变操作指的是添加新的列或修改已有列的值。我们可以使用mutate()函数来实现突变操作。该函数接受一个数据框（data frame）作为输入，并返回一个包含突变后结果的新数据框。
替换（Replace）：在dplyr中，替换操作指的是修改数据框中某一列的值。我们可以使用mutate()函数结合ifelse()函数来实现替换操作。ifelse()函数接受一个条件表达式，如果条件为真，则返回第一个参数的值，否则返回第二个参数的值。
列长度（Column Length）：在dplyr中，列长度指的是数据框中某一列的元素个数。我们可以使用n()函数来获取某一列的长度。n()函数接受一个数据框作为输入，并返回该数据框中某一列的元素个数。

dplyr的优势在于其简洁而一致的语法，使得数据处理和操作变得更加直观和高效。它适用于各种数据分析和数据处理任务，包括数据清洗、特征工程、数据聚合等。同时，dplyr还提供了一些高级功能，如分组操作、连接操作等，可以满足更复杂的数据处理需求。

腾讯云相关产品中，与数据处理和分析相关的产品有腾讯云数据仓库（Tencent Cloud Data Warehouse）和腾讯云数据湖（Tencent Cloud Data Lake）。数据仓库提供了高性能的数据存储和查询服务，适用于大规模数据分析和数据挖掘；数据湖则提供了海量数据存储和分析能力，支持多种数据类型和数据格式的处理。

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相关搜索:dplyr mutate将单个列值替换为ifelse dplyr分组和使用多列中的条件 dplyr将新列中的NAs替换为good值的函数 dplyr根据筛选、分组和汇总计算新列 python列替换和填充and R& dplyr -分组和添加新列使用dplyr:: mutate ()和ifelse()基于R中排名顺序的条件突变语句使用dplyr中的组长度创建新列使用dplyr和mutate计算符合条件的列数使用dplyr进行数据帧分组和列转换

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生信入门马拉松之R语言基础-脚本项目管理、条件循环、表达矩阵和一丢丢数据挖掘(Day 7)

复习R包stringr字符串操作的几个函数-长度、拆分、提取、字符检测、替换和删除。...代码2实现结果和代码1相同2.6 练习library(dplyr)x = c(-1,-1,4,5,2,0)case_when(x>0 ~ "A", x==0 ~ "0",...加载test1.Rdata，将两个数据框按照probe_id列连接在一起，按共同列取交集load("test1.Rdata")library(dplyr)merge1 <- merge(dat,ids,...基因表达芯片转录组单细胞突变、甲基化、拷贝数变异。。。7.4 怎么筛选基因？...分组信息：是一个有重复值的离散型的向量，分组向量的元素和表达矩阵的列是一一对应的。

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Day07 生信马拉松-数据整理中的R

.玩转字符串--stringr包 1.1 字符串长度-引号内的单个字母/数字/符号数量 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x str_length...1.2 字符串拆分 str_split(x," ") #直接拆分后会变成list的子集 class(str_split(x," ")) x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 #向量长度仅为...1.3 按位置提取字符串 #提取x中第5和第9位的字符串 str_sub(x,5,9) 1.4 字符检测 str_detect(x2,"h") # 第一个参数为向量名，第二个是检测的关键词 str_starts..."A") #每个元素里面只替换第一次出现的目标字符 str_replace_all(x2,"o","A") #替换元素中所有目标字符 1.6 字符删除 x str_remove(x," ") #只删除第一次出现的目标字符...str_remove_all(x," ") #删除全部目标字符 2.玩转data.frame--dplyr包 2.1 arrange，数据框按照某一列排序,实际参数不能加" " library(dplyr

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#安装运行dplyr包图片图片图片#新建test，新增列用mutate，mutate单词是突变、变异的意思图片#select和mutate都是筛选的意思，前者是筛选列，后者是筛选行图片#arrange是排序...summarise汇总，group_by是先分好组，再分别计算图片#count是分别计算某一类有多少个图片#连接用join，依据左边的表用left，右边用right，inner则是交集，完全一样的有谁#这三个是三列都要写上...，哪怕没有数也要写NA，不能不写图片图片#全连就不用说明了#semi是半连，依据第二组数，写能与之匹配的第一组数，这里就不写第三列了，anti是写匹配不上的。...图片#这个bind也是连接，_后面是根据什么连，row是行，col是列，要一样数的行列才能连图片

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bcftools csq分析基因突变对蛋白水平的影响

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R07-R语言的综合应用

str_length(x) # 1.检测字符串长度str_split(x," ") # 2.字符串拆分（以空格隔开的字符串拆分）拆分后以列表格式呈现str_sub(x,5,9)...，x2中的o替换为A（有重复的只替换了第一个）str_replace_all(x2,"o","A") # 5.字符串替换，x2中的o全部替换为Astr_remove(x," ") # 6.字符删除...（只删除了第一个空格）str_remove_all(x," ") # 6.字符删除（删除全部空格）2.玩转数据框（dplyr)#arrange，数据框按照某一列排序arrange(test, Sepal.Length...iris,-5)),50))3.管道符号传递，简洁明了iris %>%select(-5) %>%as.matrix() %>%head(50) %>% pheatmap::pheatmap()3.条件和循环一...:4中的每个元素进行循环输出批量画图par(mfrow = c(2,2))for(i in 1:4){ plot(iris,i,col = iris,5)}批量装包pks = c("tidyr","dplyr

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新TCGA+文献复现里的几种算法

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十二、R语言的综合应用

birch canoe slid on the smooth planks." x [1] "The birch canoe slid on the smooth planks." 1.1.检测字符串长度...1.4.字符检测 str_detect(x2,"h") ### 看x2这个长度为8的向量中的每个元素是否含有h这个关键词，生成的与x2长度相等且一一对应的逻辑值向量 str_starts(x2,"...select(filter(iris,Sepal.Width>3), Sepal.Length,Sepal.Width), Sepal.Length) 三、条件和循环...“tumor”，是FALSE就替换成“normal”， ####如果samples这个向量中的每个元素含有tumor就是TRUE，就会被替换成“tumor” k2 = str_detect(samples...= T) z[,4] # 2.如何把上一题结果中的Control和Vemurafenib改成全部小写？

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生信马拉松 Day7

;x 1.1 检测字符串长度 str_length(x) #注意包括空格，空格也算一个 #[1] 42 length(x) #算的是向量有多少个元素 #[1] 1 1.2 字符串拆分 str_split...FALSE FALSE FALSE FALSE str_ends(x2,"e") #[1] TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE 1.5 字符串替换...canoe" "slid" "on" "the" "smooth" "planks." str_replace(x2,"o","A") #此时只有每个字符串的第一个"o"被替换了...条件和循环，if，for 碎碎念：这个东西每次好久不用就想不起格式要重新查，脑子是个好东西，就是漏的厉害 rm(list=ls()) #if的格式 if (){ #if后面的括号里只能是一个逻辑值...不可以是多个逻辑值组成的向量 } #if+else的格式 if (){ }else{ } #ifelse的格式 ifelse( , ,) #第一个逗号前是逻辑值 #for的格式 for(){ } 条件和循环的应用

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R语言小专题

一、字符串专题（stringr包）1）str_length() 统计字符串长度str_length("hello world")10 #这个字符串的长度，包括空格和一些符号在内2）str_split()...FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE[8] FALSE根据搜索的内容会返回true or false的值5）str_replace() / str_replace_all() 字符替换...birch" "canoe" "slid" [5] "on" "the" "smooth" "planks." str_replace(x2,"o","A") #同一个字符串只替换了一次...str_replace_all(x2,"o","A") #全部替换 [1] "The" "birch" "canAe" "slid" [5] "An" "the"...列输出——从小到大排序三、条件语句和循环语句专题1）if 条件语句基本格式：if (i>1) {print("+")else{print( "-")}2)‼️重点函数：ifelse（）ifelse(x,

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生信技能树- R语言-day7

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跟小洁老师学习R语言的第七天

专题一：玩转字符串1.检测字符串长度x 3), Sepal.Length,Sepal.Width), Sepal.Length)专题三：条件和循环一

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图片专题1 玩转字符串图片检测字符串长度代码1 str_length(x) if(!...smooth planks." x [1] "The birch canoe slid on the smooth planks." str_length(x) [1] 42 ### 1.检测字符串长度...> library(dplyr) > arrange(test, Sepal.Length) #arrange() 以“Sepal.Length”这一列从小到大（默认）排序列名大多数不需要加“”...T替换成tumor输出，F替换成normal输出 [1] "tumor" "tumor" "tumor" "normal" "normal" "normal" #换一种写法，检测normal >...（向量长度得是相同的）长脚本管理方式 if(T){} #运行{}中的代码;可折叠 if(F){} #跳过{}中的代码专题四表达矩阵画箱线图表达矩阵 set.seed(10086) #设置随机种子

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tidyverse：R语言中相当于python中pandas+matplotlib的存在

从文件中读取数据 purrr：(提供好用的编程函数 tibble：data.frame升级款 stringr：处理字符，查找、替换等 forcats：处理因子问题 ?...02 — tibble：高级数据框（data.frame升级版） ——数据（列）类型一目了然 tibble是R语言中一个用来替换data.frame类型的扩展的数据框，tibble继承了data.frame...tibble，不关心输入类型，可存储任意类型，包括list类型 tibble，没有行名设置 row.names tibble，支持任意的列名 tibble，会自动添加列名 tibble，类型只能回收长度为...4.6 分组: group_by # install.packages("dplyr") library(dplyr) 4.1 筛选: filter() #按给定的逻辑判断筛选出符合要求的子数据集...这些函数允许在长数据格式（long data）和宽数据格式（wide data）之间进行转换（功能类似于reshape包，但是比reshape更好用，并且可以用于管道%>%连接）。

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TCGA|根据somatic mutation绘制突变景观图（oncoplot）和基因词云

使用 XENA下载的TCGA-LAML.mutect2_snv.tsv文件绘制基因词云和突变景观图。...首先根据maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总，分析和可视化得到了laml数据，那么可以用以下方式获得基因云图 library(wordcloud2) data2 <- as.data.frame...转成绘制热图的数据形式（宽型数据） library(reshape2) mut3_dcast % dcast(Sample_ID ~ gene,value.var='effect') %>% dplyr...col <- c( "missense_variant" = "blue" , "inframe_insertion" = "green") #指定变异的样子，x,y,w,h代表变异的位置(x,y)和宽度...alter_fun, col = col, column_title = column_title, remove_empty_columns = TRUE, #去掉空列

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从零开始的异世界生信学习 R语言部分 06 R应用专题

一、玩转字符串 stringr包图片 1.str_length() 检测字符串长度 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x ### 1....检测字符串长度 str_length(x) #计算字符串中有多少字符 length(x) #计算向量中元素的个数图片图片 2. str_split 字符串拆分 x <- "The birch...x2 str_replace(x2,"o","A") ##在" "中只替换一个函数 str_replace_all(x2,"o","A") ##替换所有图片 6. str_remove 字符串替换...新增一列是两列数值的乘积 mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) 图片图片 select和filter 筛选出来的结果是数据框 3.连续操作，优秀的管道符号...select(filter(iris,Sepal.Width>3), Sepal.Length,Sepal.Width), Sepal.Length) 三、条件和循环

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「R」一个函数获取 TCGACCLE 单基因分子数据

第 2 个是数据的类型，包括基因表达（gene），转录本表达（transcript）、突变（mutation）、拷贝数变异（cnv）和甲基化（methylation），默认是基因表达。...第 3 个是数据库，包括 toil（包括上面提到的 TCGA 等几个个体水平数据）和 ccle。使用了解函数参数后，使用就根据自己所需就行了。如果还不懂，可以不断试错。...我们再看下它的 CNV 和突变情况。...TCGA-EK-A2RE-01 #> 0 0 0 -1 0 # 突变...::filter() masks stats::filter() #> x dplyr::lag() masks stats::lag() expr <- dplyr::tibble( sample

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