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    新冠病毒测序

    病毒属于无细胞生物,无法独立生存,都是营寄生生活,寄生在宿主细胞内。新冠病毒感染之后,病毒寄生在人体细胞内。目前的技术条件下无法对病毒进行分离培养。由于新冠病毒为单链 RNA 病毒,在提取过程中得到是 RNA 产物,最终得到的 RNA 样本其实属于一个混合样本,是宿主与病毒的混合样本。由于人基因组大小约为 30 亿个碱基对,而新冠病毒基因组大小约为 3 万个碱基,二者长度相差 10 万倍,因此,提取到的染色体中人基因组占据绝大部分。因此对于新冠病毒染色体提取过程中最重要的步骤就是如何对病毒进行富集,目前只能通过 PCR 扩增富集的方法,或者是宏基因组的方法将混合物直接进行测序,在 NCBI 下载新冠病毒测序数据的时候描述部分会有 metagenomics 或者 Amplicon ,分别表示利用宏基因组测序还是 PCR 扩增。下面我们分别进行介绍。

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    天津大学研究团队提出基于源混叠矩阵估计的稳态视觉诱发电位扩增方法

    针对稳态视觉诱发电位(steady-state visual evoked potential, SSVEP)识别面临的校准数据不足的问题,天津大学神经工程团队提出了一种源混叠矩阵估计方法(source aliasing matrix estimation, SAME)来扩增SSVEP信号的校准数据。在Benchmark和BETA公开数据集上的结果表明,当与SAME方法结合后,两种先进的空间滤波方法(eTRCA, TDCA)在校准数据不足的情况下均有显著的性能提高。SAME可以有效扩增基于稳态视觉诱发电位的脑机接口系统的校准数据,从而减少系统的校准负担,相关研究成果在实用型脑机接口方面具有潜在的应用价值,已在线发表至《IEEE Transactions on Biomedical Engineering》期刊。

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