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R语言可视化及作图7--ggplot2之标签、图例和标题绘制

x <- 1:8 df <- data.frame(x=1:8,y=1.2+x^2) ggplot(df,aes(x,y))+geom_point()+geom_smooth()+geom_text(aes...图例绘制 2.1 guide_legend函数(主要参数:color, shape, size) 图例调整函数也属于标度函数一类,但不可以直接使用加号来连接,必须放在函数中,作为一个参数。...() #画出散点图,在不对图例进行任何调整情况下,图形有测也会出现三个图例,分别是color,size,shape pp+guides(color='colorbar',size='none',shape...和guide_legend设置是不同图例,guide_colorbar定义色条图例,guide_legend定义普通图例。...=factor(cyl)))+geom_point() pt+scale_color_discrete(name='cyl')+ #由于theme()函数无法定义图例标题,因此事先用scale函数定义

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R-ggplot2 学术散点图绘制

这种效果是万万不能进行学术发表,当然,你可以通过ggthemes 包 选择合适主题进行修饰。而推文目的在于熟悉和理解绘图函数,再说了,一些统计指标还是需要自己另行添加。...代码如下: #导入需要包 library(ggpubr) plot <- ggplot(scatter_data,aes(x = true_data,y = model01_estimated))...+ geom_point(shape=15) + geom_smooth(method = 'lm',se = F,color='red',size=1) + #绘制对角线:最佳拟合线...axis.line = element_line(size = .8), axis.ticks = element_line(size = .8), #去除图例标题...到这里,一幅符合学术出版相关性散点图就绘制完成了,我想需要绘制图表元素应该都体现出来了 ? ? 03. 总结 R-ggplot2 绘制相关性学术散点图还是很方便(毕竟有好多优秀第三方包

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用R在地图上绘制网络图三种方法

首先准备需要R包,当需要一次性加载多个R包时,我们可以利用pacman,它整合了library包中一些相关函数,利用pacman包中p_load函数可以自动加载需要R包,如果没有找到则会自动安装缺失...(LON和LAT)和国家名字,这些就是之后要在地图中展现节点,下面我们需要在这些节点之间随机创建一些连结,方便之后将不同国家连起来。...)) 方法一:ggplot2 除了需要世界地图(country_shape)中国家边界外,我们还需要三个几何对象: geom_point:绘制节点; geom_text:添加节点标签名字; geom_curve...然后是绘制第二个需要叠加图层——节点(nodes) (p_nodes <- ggplot(nodes) + geom_point(aes(x = lon, y = lat, size = weight...最后需要用annotation_custom(ggplotGrob)把p_edges和p_nodes添加到p_base上,三个图形就叠加在一起了。

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了解绘制条形图和折线图细节

所以我们一再强调系统性掌握编程知识重要性,在这个打基础方面我让实习生“身先士卒”,起码每个人在每个编程语言上面都需要看至少五本书而且每本书都需要看五遍以上,并且详细记录笔记。...(position = 'identity') #然而,我们经常需要负值为蓝色,正值为红色,且图例显得比较多余 #通过scale_fill_manual()进行颜色调整,参数guide='none'删除图例...()进行调整并指定图例对应需要调整图形属性 ggplot(cabbage_exp,aes(x=Date,y=Weight,fill=Cultivar))+geom_col()+ guides(fill...=guide_legend(reverse = T)) #3.如果想要反转条形堆积顺序,可以使用position_stack(reverse=T)来实现,同时需要反转图例顺序保持一致 #当然也可以通过调整数据框顺序实现上述操作...A:在绘图命令中使用geom_text()函数即可添加数据标签,此时需要分别指定一个变量给x,y和标签本身。

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ggplot2绘制散点图配合拟合曲线和边际分布直方图

❞ 1.拟合曲线添加 ❝拟合曲线添加在R中常用大概有两个函数geom_smooth与ggmpisc::stat_poly_line。两者均可用于在R图形中添加平滑线或拟合线,需要选择正确模型。...它们有一些相似之处,但也有一些关键区别。 ❞ stat_poly_line 是一个在 ggplot2 图形中添加多项式回归线函数。这个函数直接计算多项式回归模型,并将拟合线添加到图形上。...=species)) + geom_point(aes(size = body_mass_g), alpha = 0.5) + # 添加散点图层,点大小表示体重 stat_poly_line...length (mm)\n", y = "Bill length (mm)") + # 设置坐标轴标签 guides(colour = FALSE, size = FALSE) + # 不显示颜色和大小图例...ggMarginal(p, type = "densigram", groupColour = TRUE, groupFill = TRUE, alpha = 0.4) ❝本节内容介绍到此结束,过程仅供参考;有需要学习时间可视化朋友

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ggplot2-plotly|让你火山图“活”过来

二 ggplot2绘制火山图 2.1 绘制简单火山图--点图 ggplot(data = data, aes(x = logFC, y = -log10(adj.P.Val))) + geom_point...3) 标示重点显著差异基因 上图是不是有点像了,新增sign列,利用ifelse函数添加重点显著差异基因,然后使用geom_text参数添加到图上, data$sign <- ifelse(data$adj.P.Val...library(ggrepel) ggplot(data = data, aes(x = logFC, y = -log10(adj.P.Val), color = change)) + geom_point...5) 标示感兴趣基因表达情况 将我们感兴趣基因添加到数据LABEL列中,假设以下几个基因是我们重点关注基因,单独查看以下基因表达情况 ?...ggplot(data = data, aes(x = logFC, y = -log10(adj.P.Val), color = change)) + geom_point(alpha=0.8,

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生信绘图与配色

画布:ggplot()函数,mtcars为画图数据 2.横纵坐标:mpg,qsec两个变量 3.散点- 几何对象: geom_point()函数,size,alpha为控制点属性参数 4.散点颜色-...变量映射:color = factor(cyl):把cyl这个变量因子化,不同颜色表示变量分类水平 5.图例- 变量映射产物 6.背景网路:theme_bw()完成,主题函数 7.坐标:横纵坐标,...最基本四要素: 1)绘图数据:mtcars 2)画布:由geom_point()函数完成 3)映射:由aes()函数完成 4)几何对象:由 geom_point()函数完成 ggplot2基本结构:...C'),each = 15), incidence = sample(10:100,45)) #16-rank(incidence)显示肿瘤在不同regions从大到小排列,需要根据自己数据更改...theme(legend.position = c(.15,.85))图例位置 5.3多面板图facet_wrap(~clarity,ncol = 3)分三列 面板 5.4元素大小 散点图geom_point

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