ggplot Sankey图，冲积层？_Sankey图R不显示_数据帧到Sankey图 - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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ggalluvial绘制桑基图

导语 GUIDE ╲ 桑基图（Sankey diagram），即桑基能量分流图，也叫桑基能量平衡图。背景介绍桑基图（Sankey diagram），即桑基能量分流图，也叫桑基能量平衡图。...因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名，此后便以其名字命名为“桑基图”。...直线冲积图 ggplot(as.data.frame(Titanic), aes(y = Freq, axis1 = Class, axis2 = Sex, axis3...fill = Admit), width = 1/12) + geom_stratum(width = 1/12, fill = "black", color = "grey") + #fillc冲积层的填充颜色...,color冲积层边框颜色 geom_label(stat = "stratum", aes(label = after_stat(stratum))) + #冲积层添加标签 scale_x_discrete

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前端用JavaScript实现桑基图（Sankey图）

前端用JavaScript实现桑基图（Sankey图）桑基图（Sankey图），是流图的一种，常用来展示事物的数量、发展方向、数据量大小等，在可视化分析中经常使用。...本文，演示如何在前端用JavaScript绘制桑基图。注：本例使用JShaman数据展示JS代码混淆加密流程。先看效果：因为已有成熟的库可用，比如，可以使用d3引擎，所以sankey的实现较为简单。...最后，附上完整代码，如果您也需要绘制桑基图，可以参考此代码：<script src="....= {}<em>sankey</em>_data.nodes = label;<em>sankey</em>_data.links = [];for(i=0;i<source.length;i++){<em>sankey</em>_data.links.push

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流量结构分布图——桑基图（Sankey）

桑基图用于表达流量分布于结构对比，最初的发明者使用它来呈现能量的流动与分布。百度百科给了桑基图相对完善的解释：桑基图（Sankey diagram），即桑基能量分流图，也叫桑基能量平衡图。...因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名，此后便以其名字命名为“桑基图”。...因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名，此后便以其名字命名为“桑基图”。...： d3Sankey(Links=Sankeydata,Nodes=Sankeyname,Source="Source",Target="Target",Value="Value",NodeID="name...最后好像再强调一遍，Sankey是特定场景下呈现流量关系与结构对比所使用的，不要觉得这种图表很炫酷就各种乱用，数据可视化的要义很重要的一条就是，不可乱用图表，适当的场景使用合适的图表。

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ggsankey绘制精美的sankey流程图

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝之前介绍了如何使用「networkD3」包来绘制交互式桑基图，本节再来介绍如何使用「ggsankey」绘制有多个分类变量的桑基图。...Water, Type, Structure, Substrate, value = "Subsite2") # 使用make_long()函数对数据进行重塑，结果保存到dt2变量中数据可视化 ggplot...= x, next_x = next_x, node = node, next_node = next_node)) + # 创建一个ggplot...对象，并指定数据和映射关系 geom_sankey(flow.alpha = 0.5,node.fill = "#f5ccae", # 添加sankey流程图层，设置外观参数...(aes(label = node), size = 3) + # 添加sankey流程图文本标签层 facet_wrap(vars(value), scales

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ggsankey绘制精美的sankey流程图

之前介绍了如何使用networkD3包来绘制交互式桑基图，本节再来介绍如何使用ggsankey绘制有多个分类变量的桑基图。...Water, Type, Structure, Substrate, value = "Subsite2") # 使用make_long()函数对数据进行重塑，结果保存到dt2变量中数据可视化 ggplot...= x, next_x = next_x, node = node, next_node = next_node)) + # 创建一个ggplot...对象，并指定数据和映射关系 geom_sankey(flow.alpha = 0.5,node.fill = "#f5ccae", # 添加sankey流程图层，设置外观参数...(aes(label = node), size = 3) + # 添加sankey流程图文本标签层 facet_wrap(vars(value), scales

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使用R语言创建自定义桑基图Sankey图

p=9101 本文将描述如何在R中创建自定义Sankey图。我将首先解释Sankey图的基础，然后提供自动创建和手动控制的布局的示例。 Sankey图的元素 Sankey图是一种可视化数据流的方式。...Sankey图由三组元素组成：节点，链接和确定其位置的指令。首先，有节点。在下面的示例中，方框表示四个节点。这些链接具有与之关联的值，该值由链接的厚度表示。...使用自动布局的Sankey图

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实现绘制Sankey桑基图（河流图、分流图）流程数据可视化

现在，本文仅说明如何构建多级图。构造数据此示例的计划是在六层中的每一层具有四个节点，并且层之间具有流。数据很好地说明了该过程，并且产生的结果与我所追求的最终图一致。我们必须为节点和边创建数据结构。...> pate = paste0 > stes = lapply(y, function(n) { + list + }) > names= ID 构造桑基图河流图对象现在我们可以构造河流图对象了。...> plot 结论通过仔细观察，可以得到不少信息，桑基图绘制目的就是让各类别间的区别和联系更加直观展现出来。今天的分享到此结束，下次再见！...---- 本文摘选《R语言实现绘制Sankey桑基图（河流图、分流图）流程数据可视化》

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ggplot绘制火山图

火山（Volcano Plot）图在一张图中显示了两个重要的指标（Fold change/pvalue），可以非常直观且合理地筛选出在两样本间发生差异表达的基因。...检验分析出两样本间显著差异表达的基因后，以log2（fold change）为横坐标，以T检验显著性检验P值的负对数-log10（pvalue）为纵坐标，即可得火山图（Volcano Plot）。...> install.packages("ggplot2") > library(ggplot2) > R0_vs_R3_isoforms_fitter <- read_excel("~/Downloads.../R0-vs-R3.isoforms.fitter.xlsx") > data <- R0_vs_R3_isoforms_fitter > r03 <-ggplot(data,aes(log2FC,-1

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ggplot做蝴蝶图

蝴蝶图是一种形似蝴蝶双向柱状图。做GO term 的时候常常同时展现上调和下调的数据，因此，这里用ggplot2绘制GO term双向柱状图。...##ggplot2 作图 library(ggplot2) library(stringr) #up updata<-goBP.up@result[1:5,c("Description","pvalue...decreasing = T),] updata$Description<-factor(updata$Description,levels = updata$Description) #上调 GO GO_up <- ggplot...Description,levels = downdata$Description) term.down<- levels(downdata$Description) #下调 GO GO_down <- ggplot

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ggalluvial|炫酷桑基图（Sankey），你也可以秀

桑基图（Sankey diagram），是一种特定类型的流程图，图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小，通常应用于能源、材料成分、金融等数据的可视化分析。...因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名，此后便以其名字命名为“桑基图”。...也可后台回复“R-桑基图”获得示例数据以及R代码。...#install.packages("ggalluvial") library(ggalluvial) library(ggplot2) library(dplyr) #读入LIHC临床数据 LIHC...ggplot(as.data.frame(LIHCData), aes(axis1 = AJCC_PATHOLOGIC_TUMOR_STAGE, axis2 = SEX, axis3 =

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ggplot2-点图

p <- ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) p + geom_point() # Add aesthetic mappings p + geom_point(aes(colour...size = I(3)) # You can create interesting shapes by layering multiple points of # different sizes p <- ggplot...geom_point(colour="pink", size = 4, show_guide = TRUE) + geom_point(aes(shape = factor(cyl))) 参考书籍：021-ggplot2

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pyecharts实现多节点、长路径的sankey桑基图

1 画桑基图一个容易出错的细节 pyecharts︱交互式pyecharts的相关使用教程简单的用pyecharts实现超多节点、较长路径的桑基图，一个样图：起先拿网络教程里的数据跑的时候没有任何问题...，然后用自己的数据，就一直显示空白，内有内容显示，找了很久问题，发现了一个很多网上教程都没有说的点，需要用pyecharts划超多节点的话，一定需要留意：举例来说，这个简单的桑基图，如果你的数据里面出现了...='20%'##图距离容器上端的距离 ,pos_right='20%' #图距离容器右侧的距离 ,pos_bottom...指定需要的标准格式最后还有非常多可调节的参数，可以参考以下文献： pyecharts 学习篇☞桑基图实用示例（文末附完整代码）「Python数据可视化」使用 Pyecharts 制作 Sankey（...桑基图）详解桑基图（Echarts）——自定义风格

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全球植物病原真菌分布图

,Global,Continent,LandCoverType,Habitat) %>% ggplot(....(flow.alpha = .6,node.fill="#87CEEB", flow.fill="grey80",width=0.2) + geom_sankey_text...(size = 3,color="black") + scale_fill_manual(values="grey80")+ theme_sankey(base_size =15) + labs...position = "top")+ theme(legend.position = "none", axis.text=element_text(color="black")) 绘制桑基图...❝桑吉图节点的顺序可根据出现的频率通过定义因子的方式来调整顺序 ❞ p2 % ggplot()+ geom_polygon(aes(x=long,y=lat

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ggplot2绘制玫瑰图

1绘制 ggplot(mydata) + + geom_bar(aes(x=a, y=b),width = 1,stat="identity", + colour = "black...0.25), + axis.text.x=element_text(size = 13,colour="black",angle = myAngle)) 4.png 2绘制不带空心的玫瑰图...ggplot(diamonds,aes(x=clarity,fill=color))+ + geom_bar(width=1.0,colour...+ axis.text.x=element_text(size = 13,colour="black",angle = myAngle)) image.png 3绘制带空心的玫瑰图...> ggplot(diamonds,aes(x=clarity,fill=color))+ + geom_bar(width=1.0,colour="black",size=0.25)+ + coord_polar

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ggplot_QQ图和ECDF

QQ图和ECDF sunqi 2020/8/3 QQ图用来描述数据正态性的问题，配合正态性检验进行分析主要的函数和参数 stat_qq() color, shape and size：和之前一样代码...(aes(sample = weight)) + # QQ图，根据颜色分组 stat_qq(aes(color = sex)) + # 配色方案 scale_color_manual(values...= c("#00AFBB", "#E7B800")) + # 添加lab labs(y = "Weight") # 除了ggplot2，ggpbur也可以进行qq图的绘制 # 使用ggpbur...ECDF图 ECDF：Empirical cumulative distribution function，用于描述数据的分布，横坐标为指标，纵坐标为累计概率从图中可以看出数据的分布比例代码 # 绘图...结束语此次为ggplot2系列的最后一次内容，基本的图形已经介绍完毕，总体来说，ggplot语法结构大同小异，用的时候查函数就行。

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ggplot2 图层

流图：geom_stream() # 安装 # remotes::install_github("davidsjoberg/ggstream") library(ggstream) # 示例数据 blockbusters...geom_density_ridges() # 安装 # install.packages("ggridges") library(ggridges) ggplot(blockbusters, aes(...geom_density_ridges(scale = 4) + scale_fill_manual(values = wes_palette("Darjeeling2", n = 5)) 桑基图：...geom_sankey() # 安装 # devtools::install_github("davidsjoberg/ggsankey") library(ggsankey) # 准备示例数据： mtcars...node = node, next_node = next_node, fill = factor(node))) + geom_sankey

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ggplot画鸡冠花图

鸡冠花图，又称为玫瑰图，可以通过极坐标coord_polar()改变barplot来获得。...首先画一个简单的bar图 library(ggplot2) bar <- ggplot(data = diamonds) + geom_bar( mapping = aes(x = cut, fill...通过coord_polar() 函数使用极坐标系将barplot改为鸡冠花图。 bar + coord_polar() ?...还可以通过调整width来调整距离,如将width改成0.5 library(ggplot2) bar <- ggplot(data = diamonds) + geom_bar( mapping =

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ggplot2循环出图

在用ggplot画图的过程中，我们常常希望能够循环某个变量同时画很多图。如我们的数据是testdata ?...如果我们按stage来画某个基因的表达： ggplot(testdata,aes(x = stage,y = Myh6,fill = stage))+geom_boxplot() ?...如果我们想不断遍历所有的基因，aes里面填写是参数，而我们通常填入的列名是character，这个时候用到字符向量的循环，将aes改成aes_string，它可以将字符变量映射为ggplot所需的输入参数...ggplot里面的其他变量也要改成字符串的形式，即可以很容易的实现循环出图。即 ? 写成一个function，适用于下次直接进行基因表达查询 ?

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ggplot2实现哑铃图

哑铃图（Dumbbell Chart），也叫DNA图。当我们想要比较不同指标不同组的情况可用多个“哑铃”表示。另外，如果想表示某一组在不同条件下的变化情况也可以用这种方法。哑铃图如下图所示： ?...在R中实现可以考虑用ggalt这个包（基于ggplot2）。...selva86/datasets/master/health.csv") health$Area <- factor(health$Area, levels=as.character(health$Area)) ggplot...进行一些小小的修饰： ggplot(health, aes(x=pct_2013, xend=pct_2014, y=Area)) + # 以下geom_segment是自己添加了x到...最后加上 coord_flip() 可以将图片翻转为竖着的哑铃图。

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TidyFriday R 语言中桑基图的一些画法。。。

df_count sankeywheel( from = df_count$prov, to = df_count$gender, weight = df_count$n, type = "sankey...to", "n")) ) sankeywheel( from = df_count$from, to = df_count$to, weight = df_count$n, type = "sankey...用过 sankeywheel 包的同学都知道这个包还有另外一个功能，就是它也可以绘制和弦图。...是绘制桑基图还是和弦图是有 type 参数决定的，type 参数的默认值是 "dependencywheel"，也就是说默认绘制的就是和弦图，之所以这样设置，是因为我觉得这个单词不好写： sankeywheel...的桑基图了： ggplot(pg, aes( axis1 = prov, axis2 = gender, axis3 = city, y = n ), size = 0.001) + geom_stratum

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