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R语言ggplot2作图如何去掉图例NA

image.png 加载需要用到R包 library(treeio) library(ggtree) library(ggplot2) 读取树文件和分组信息 tree<-read.tree("practice.tree...image.png 这个结果右侧图例最下方式有一个NA,如果不想要那个NA加一行代码 scale_color_discrete(na.translate=FALSE) 参考链接是 https://stackoverflow.com...geom_tiplab(offset = 0.1)+ scale_color_manual(values=colors, na.translate=FALSE) 将图例线更改粗一点...image.png 欢迎大家关注我公众号 小明数据分析笔记本 需要示例数据和代码 点赞 点击在看 然后在后台留言 20210605 就可以了 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python...做数据分析和数据可视化简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己学习笔记!

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6种 数据库隔离级别SNAPSHOT隔离级别

实际上之前一段时间,我认知也是4种隔离级别,这是通过我们ANSI SQL 表定义 isolation level。...ISOLATION定义一直与数据库系统性能有关,隔离级别越低,那么性能就会越好。..., 读取数据事务第一次对数据读取都是不被限制,在这个snapshot lsolation 是不会阻止任何对数据读取行为。...而当其他事务修改了这批数据,则会影响SNAPSHOT LEVEL事务对数据第二次读取,同时对于还未读取这批数据其他事务来说,刚才我们start-timestarmp 将失效与还未读取数据事务...总结: SNAPSHOT LEVEL 解决了锁解决了事务隔离级别和性能之间矛盾问题,有效提高了数据库并发性能问题。

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msyql查询数据不存在记录

背景 有时候,需要往数据库里插入数据,这些数据,有些已经在MySQL。但这种导入工作,只是临时性,又想专门写一个脚本去判断是否存在数据库,不存在就插入。...这里提供一个骚操作,可以直接用MySQL查看哪些不在数据,然后再插入。...你可以使用以下查询语句来判断 "zhangsan" 和 "lisi" 是否在数据.如果 "zhangsan" 和 "lisi" 存在于数据,那么可以查询将返回它们名字。...'lisi'); +----------+ | name | +----------+ | zhangsan | +----------+ 1 row in set (0.00 sec) 查找不存在数据...如果你想知道哪个名字不在数据,可以稍作修改,使用 NOT IN 来找出不在数据名字 SELECT 'zhangsan' AS name WHERE 'zhangsan' NOT IN (SELECT

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R for data science (第一章)①Chapter1 使用ggplot2进行数据可视化

这是积极吗? 负?线性?非线性? mpg数据框 您可以使用ggplot2(又名ggplot2 :: mpg)mpg数据框测试您答案。 数据框是变量(列)和观察(行)矩形集合。...要将aesthetic映射到变量,请将aesthetic名称与aes()变量名称相关联。 ggplot2将自动为变量每个唯一值分配唯一级别(这里是一种独特颜色),这个过程称为缩放。...ggplot2还将添加一个图例,说明哪些级别对应于哪些值。 颜色显示许多不寻常点是双座汽车。这些车似乎不像混合动力车,实际上是跑车!...语法强调了对x和y有用见解:点x和y位置本身就是aesthetic,可以映射到变量以显示有关数据信息可视属性。 绘制美学图后,ggplot2会处理其余部分。...它选择了一个合理尺度来与美学一起使用,它构建了一个解释水平和价值之间映射图例。对于x和y美学,ggplot2不会创建图例,但会创建带有刻度线和标签轴线。

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92-R可视化24-与ggplot图例较劲

Date : [[2022-01-06_Thu]] Tags : #R/index/02 #R/R可视化 #R/R数据科学 #其他/答粉丝问题 前言 感觉ggplot 绘图中图例/legend,完全可以作为一个单独内容讲很久...2-移除图例标题 theme(legend.title = element_blank()),我们也可以在labs ,按照aes 定义对应内容,直接创建空白名称: ggplot(chic, aes...,可以指定图例背景为透明,好看一些: 4.3-调整图例方向 默认下,图例显示是竖直(自上而下),我们可以将其改变为水平horizontal : ggplot(chic, aes(x = date,...其实不只是图例,aes 设定属性都可以进行排序。...默认下,如果是多个图都指定了某个分组: 图例标记也会非常智能显示

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动态地理信息可视化——leaflet在线地图简介

: #该句加载地图数据,也可以说是对地图初始化操作,相当于ggplot2作图系统ggplot()函数,会建立一个没有内容空白图层面板。...m<-leaflet(data=province_city) #该句设定所要展示图层中心位置,参数为带有数据地图图层、经纬度信息以及呈现缩放级别(3~9级不等)。...以上四局代码会制作出一个以province_city为数据源、以(116.38,39.9)为视觉中心,缩放级别为3级,点标识对象为city中国行政地图出来。...颜色映射对于数据地图而言是最复杂也最为重要视觉对象,毕竟你目光要有很大一部分数据墨水比是由色彩来呈现,但是小魔方再在前讲解ggplot数据地图系列时候已经讲解过非常详细颜色映射规则。...colorFactor:这个就是单纯分类变量(因子或者有序)映射颜色设置方式。 图例对象: addLegend:是添加图例图层对象,相当于ggplotguilde函数。

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ggplot2学习笔记——图例系统及其调整函数

自己都感觉过分了哈哈~ 今天赶紧找空写一篇~ 学过ggplot2小伙伴儿们大概都了解过,ggplot2语法系统将数据层和美化层分开,这种理念给了学习更多选择,你可以只学习数据层,这样大可保证做出正确图来...(虽然质量不敢恭维),也可以同时学习数据层和美化层(当然你要耗费双倍精力,因为ggplot2理念几个美化函数模块那是出了名繁杂)。...所以我喜欢写在单独调整图例函数guides函数,它在语法层次上是与scale_xxx类标度调整函数平行。...而其他图例都是有小方块 构成一组数据条(小方格称之为key)。...以上函数,着重说一下order参数,order参数用于表明图例在图表上显示顺序(因为在图表如果有多个美学映射,那么会形成多个图例【如果这些美学映射不是映射在同一个变量上的话】,如果不对图例显示顺序加以限制

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ggplot2自定义离散型热图图例

本节来介绍ggplot2绘制图例设置方面的问题,通过一个热图案例进行阐述。整个过程仅参考,希望对各位观众老爷能有所帮助。...ggplot2图例体系 ❝在ggplot2针对图例自定义设置可通过guide与guides函数来完成,二者虽只有一字之差具体参数上也基本一致,但是使用时却也有些许不同。...「guides函数中常使用主要有 guide_legend 和 guide_colourba」两类 guide_legend:用于定义离散型数据图例 guide_colourba:用于定义连续型数据图例...❝因此在使用前需针对图例所对应几何对象来选择正确函数,同时在实际绘图过程图例绘制还存在一种情况,即数据为连续型但是在绘制图例将其定义为离散型。...针对这种情况上方所列两个函数就无法实现。这时就可使用「guide_colorsteps」函数来实现,该函数可将区域显示为单一恒定颜色,而不是从颜色条对应项已知渐变。

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matplotlib可视化-什么是matplotlib?

使用过python做数据分析小伙伴都知道,matplotlib是一款命令式、较底层、可定制性强、图表资源丰富、简单易用、出版质量级别的python 2D绘图库。...很多其它python绘图库是基于matplotlib开发,比如seaborn、ggplot、plotnine、holoviews、basemap等。...在命令行输入: pip install matplotlib 对于新手,疲于安装各种包。可以直接下载安装Anaconda,包含了python及数百个数据科学第三方库,一劳永逸。...1、打开jupyter notebook,新建python3笔记本,以下界面: 2、导入pyplot模块,使用magic图像函数用来在notebook显示图表 import matplotlib.pyplot...,用于调整图例位置等 plt.xlabel('X') # x轴标签 plt.ylabel('Y') # y轴标签 plt.show() # 显示图表 4、结果 这里pyplot模块方法函数都是做什么

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ggplot2作图共享图例方法一:ggpubr包ggarrange()函数以及调整图例布局

当使用ggplot2作图时候如果多个图拼接到一起,图例互相之间有一样时候,比如如下情况(我们用R语言内置鸢尾花数据集做三个散点图) ?...) ggarrange(p1,p2,p3,ncol = 3) 因为三个图图例是一样,我们完全可以只显示一个图例就够了。...image.png 图例放到顶部,默认布局是3行3列,如果要改成1行6列呢?ggplot2里应该有对应参数可以修改吧?...如果将ggplot2图例设置为顶部,默认结果如下 p4<-ggplot(df,aes(x=V1,y=V2))+ geom_point(aes(color=V6))+ theme_bw()+...image.png 欢迎大家关注我公众号 小明数据分析笔记本 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、

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数据科学学习手札57)用ggplotly()美化ggplot2图像

一、简介   经常利用Python进行数据可视化朋友一定用过或听说过plotly这样神器,我在(数据科学学习手札43)Plotly基础内容介绍也曾做过非常详细介绍,其渲染出图像以浏览器为载体,...非常精美,且绘制图像自由程度堪比ggplot2,其为R也提供了接口,在plotly包,但对于已经习惯用ggplot2进行可视化朋友而言,自然是不太乐意转向plotly学习,有趣是plotly...式交互操作,注意上图中我们鼠标放置点位对应显示悬浮标签,其中内容是默认格式,即在这张ggplot2图像中所涉及到所有信息,在上图中即为横纵轴对应数据,以及在定义形状和颜色时使用到分类属性信息...style(pp, text=mytext, hoverinfo = "text", traces = c(1, 2, 3))   这里我们先定义mytext向量来保存每一个点我们希望其悬浮标签显示信息...可以看到悬浮标签内信息如我们所愿,但ggplot2某些部件在plotly是相冲突,例如图例: p_changed <- ggplot(iris, aes(x=Sepal.Length, y=Sepal.Width

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如何通过R语言制作BBC风格精美图片

在BBC数据团队开发了一个R包,以ggplot2内部风格创建可发布出版物图形,并且使新手更容易到R创建图形。 例如: ? 加载所有所需R语言包 通常在R创建图表需要安装和加载某些软件包。...以下代码显示了在标准图表制作工作流程应如何使用bbc_style()。 这是一个非常简单折线图示例,使用了来自gapminder包数据。...因为文本和其他元素位置在RStudio“plot”面板无法准确呈现(这取决于显示绘图大小和纵横比), 因此将其保存并打开文件可以准确地表示图形外观。...添加到guide来更改图例符号默认外观,例如下面将增加图例符号大小: + guides(fill = guide_legend(override.aes = list(size = 4)))) 在图例标签之间添加空格...默认ggplot图例在各个图例项目之间几乎没有空格。

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24式R入门作图必学之barplot条形图(一)

一、前言二、初阶图形2.1 基本条形图2.2 水平柱状图2.3 带图例堆叠柱状图2.4 带图例分组柱状图2.5 ggplot作图2.6 plotly作图三、进阶图形3.1 水平柱状图3.2 显著性柱状图...3.3 堆积百分比柱状图3.4 分组柱状图四、讨论一、前言柱状图又称条形图,在统计分析使用频率最高,也是众多小白入门R最早绘制可视化图形。..., 0.5) barplot(values,col = "#1b98e0") #可自行更换颜色图片2.2 水平柱状图barplot(values,horiz = TRUE) #翻转图片2.3 带图例堆叠柱状图...#构建数据框group <- LETTERS[1:5] data_ggp <- data.frame(group, values) #绘图ggplot(data_ggp, aes(...图片还有很多刚入门或者准备入门生信同学,特出此系列巩固和提供一些入门帮助。关注公众号「生信初学者」回复【barplot】领取示例数据和代码

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day4 呦呦鹿鸣——R for data science阅读笔记之ggplot()

::penguinglimpse(penguins)View(penguins)开始可视化使用ggplot()第一个参数:在图形中使用数据集第二个参数:mapping:如何将数据集中变量映射到绘图视觉属性...,在aes()定义使用geom_形状()定义一个几何图形,表示数据几何对象形状:bar-条形图;line-折线图;boxplot-箱线图;point-点对于有缺失值数据,散点图内没有显示,但有报错...默认值为FALSE,即表示warning;更改为TRUE,即静默warning加一个变量将物种 species作为图例,用不同颜色和形状标识(兼顾色盲群体需求)geom_point(aes(color...fct_infreq() :按每个级别的观测值数(最大在前)fct_inseq():按级别的数值。数值变量数值变量可以是连续,也可以是离散。...ggplot(penguins, aes(x = island, fill = species)) + geom_bar()第二个图是通过在几何设置 position = "fill" 创建相对频率图

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R语言可视化及作图7--ggplot2之标签、图例和标题绘制

(x=4,y=40),label='y==1.2+x^2',parse = TRUE,size=7) #如果parse=FAKSE,图形上显示就直接是y == 1.2 + x^2,而不是图上公式。...图例绘制 2.1 guide_legend函数(主要参数:color, shape, size) 图例调整函数也属于标度函数一类,但不可以直接使用加号来连接,必须放在函数,作为一个参数。...在theme函数,与图例有关主要参数有: 参数 用法 功能 legend.background 接受函数element_rect() 定义图例背景 legend.margin 接受数值 定义图例边缘范围.../width 接受unit() 定义图例每一个小图标的背景大小 legend.text 接受函数element_text() 定义图例每一个图标的标签 legend.text.align 取值0-1...”, “left”, “right”, “bottom”, “top”;或者接受一个表示坐标的数值向量 定义图例出现位置 legend.direction 接受字符串 定义图例图标的排列方式 legend.box

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