书中绝大多数的绘图案例都是以强大、灵活制图而著称的R包ggplot2实现的，充分展现了ggplot2生动、翔实的一面。...---- 目 录 4 坐标轴 4.1 交换x轴和y轴 4.2 坐标轴显示直线 4.3 设置连续型坐标轴范围 4.4 坐标轴顺序 4.5 设置坐标轴缩放比例 4.6 刻度线和刻度标签 4.7 坐标轴标签...调整参数limits可以设定x轴范围 scale_y_continuous(limits=c(0, 10)) # 设定范围0-10，x轴同理 注意：ggplot2包有两种设置值域的方式，第一种是修改标度...当你修改x标度和y标度的范围时，任何在范围以外的数据都会被移除，换言之，超出范围的数据不仅不会被展示，而且会被完全移出考虑处理的数据范围，统计量的计算都会基于修剪后的数据。...() # 反转x轴，不设定值域范围 scale_x_reverse(limits=c(8, 0)) # 反转x轴并设定值域范围 以上y轴同理 4.4.2 离散型坐标轴 设定参数limits来修改坐标轴顺序
x轴标签 ylab：字符串设置x轴标签 ④大小样式 cex.axis：坐标轴刻度文字的缩放倍数 cex.lab：坐标轴标签(名称)的缩放倍数 cex.main：标题的缩放倍数 cex.sub：副标题的缩放倍数..."/yaxt="n"：禁用x/y轴的刻度线 xlim：xlim=c(a,b)将x轴刻度范围限定在a到b ylim：ylim=c(a,b)将y轴刻度范围限定在a到b xaxs：控制x轴显示范围，默认为“r...”，也即刻度范围扩大4%，设置为“i”则使用原始范围 yaxs：控制y轴显示范围，具体同上 也可以通过axis函数自定义axis(……) side：一个整数。...表示在图形的哪边绘制坐标轴（1=下，2=左，3=上，4=右） at：一个数值向量，表示需要绘制刻度线的位置 labels：一个字符型向量(也可以是数值型)，表示刻度线旁边的文字标签(刻度值)，如果整个不写...%') 其中scale_y_continuous为设置y轴范围，geom_abline()添加标准线并在其两边绘图，geom_text()添加文本内容，作图结果如下：
scale_y_continuous(breaks = (-3:3)*30)+ # 将Y轴的刻度限制为-90～90 scale_x_continuous(breaks = (-6:6)*30)+...# 将X轴的刻度限制为-180～180 labs(x="Longitude", y="Latitude", colour = "Subspecies" ) + # 修改X轴、Y轴及图例 theme_tufte...函数详解 map_data() map_data()[2]是ggplot2的一个函数，用于将map包中的数据转换为适合ggplot2绘图的框架。...New Zealand Basic Map 美化 我对代码进行了微调，包括地图背景颜色、字/点的大小、透明度，把图限制在了一定区间范围，同时修改了主题。...labs(x="Longitude", y="Latitude", color = "Species" ) + # 修改X轴、Y轴及图例 coord_cartesian(xlim = c(-120,150
例如，如果您希望x轴标题为“ I'm a axis”，而y轴标签为空白，则格式为： + labs(x = "I'm an axis", y = "") 添加轴刻度 可以通过在主题中添加axis.ticks.x...它们的值可以在0到1之间，其中0左对齐，而1右对齐（或垂直对齐的底部和顶部对齐）。 根据数据添加标签 上面的向图表添加注释的方法使您可以精确地指定x和y坐标。...将左对齐标签添加到条形图 如果您想为条形图添加左对齐标签，只需根据数据设置x参数，而是直接使用数字值指定y参数。y的确切值将取决于数据范围。...如果只想释放一个轴的刻度，则将参数设置为free_x或free_y。...Exporting your plot and x-axis margins 当您制作的绘图超出bbplot中的默认高度450px时，您确实需要考虑x轴边距的大小。
fixed 表示所有小图均使用统一坐标范围；free表示每个小图按照各自数据范围自由调整坐标刻度范围；free_x为自由调整x轴刻度范围；free_y为自由调整y轴刻度范围。...shrinks：也和坐标轴刻度有关，如果为TRUE（默认值）则按统计后的数据调整刻度范围，否则按统计前的数据设定坐标。 as.table：和小图排列顺序有关的选项。...drop：是否丢弃没有数据的分组，如果为TRUE（默认），则空数据组不绘图。...它是指用于分面的包含每个变量元素所有数据的数据组。很好用的参数！ 具体例子如下： 用drv与cyl变量进行分面，x轴方向是cyl，y轴方向是drv的值。注意的是俩都是分类型变量。...~cyl) 4.4.要在每个面板中重复相同的数据，只需构造一个不包含faceting变量的数据框架。
作为ggplot2的拓展包，ggtree可以充分利用ggplot2来进行系统发育树的注释和美化，做出更加丰富多彩的图形。...max(data$x)*1.2) #调节x轴范围，使得物种信息不超出边界 tregraph #查看图形 上面脚本中geom_tiplab和geom_tippoint控制显示物种及其标记，geom_nodepoint...和geom_text2控制显示节点及其节点支持率，theme_tree2控制显示x轴，xlim则调节x轴的范围，通过脚本可以看出ggplot2的语法特征，图片元素通过图层叠加的方法来进行调整。...graph #查看图形 上面图形仍十分粗操，接下来对图形进行调整美化，调节展示方式、颜色范围、图例位置等，完整脚本如下： library(ggplot2) library(ggtree) library...as.matrix(count[,-1]))) count2=count[,-1] size=numeric(50) for (i in 1:50) { size[i]=sum(count2[i,]) } #限定x轴范围
背景 ggplot2 包提供了一个基于全面而连贯的语法的绘图系统。它弥补了 R 中创建图形缺乏一致性的缺点，使得用户可以创建有创新性的、新颖的图形类型。...传统的 R 绘图称为“画家模式”，首先布局一块画布，然后在画布上添加点线面，而 ggplot2采用图层的方式，类似于“Photoshop”模式，通过累加不同的图层元素来绘图。...通过 mapping 选项添加，然后使用 aes()函数，aes 来自于 aesthetics（美学，美的哲学），数据可以分别映射到轴与 y 轴，同时可以添加更多属性，例如点的大小，形状，颜色，透明度等属性...，可以修改坐标轴范围，转换 xy 轴，笛卡尔坐标和极坐标转换。...ggplot2 默认的主题是其简单设置就可以生成高质量的图片，无需进行更多修改。
R有几种不同的系统用来产生图形，但ggplot2是最优雅而多变的那一种。ggplot2实现了图形语法，一种描述和构建图形的逻辑系统。通过ggplo2，我们能够快速学习，多处应用。...我们先了解下 ggplot2 的格式与术语。 格式与术语 数据格式 对ggplot2来说，数据的结构是一成不变的：它要求是“长”格式的数据框，而不是相反的“宽格式”。...aes()函数的功能是指定每个变量扮演的角色(aes代表aesthetics，即如何用视觉形式呈现信息)。在这里，变量wt的值映射到x轴，mpg的值映射到y轴。...最后，一个地毯图设置在左侧以指示薪水的一般扩散。 当几何函数组合形成新类型的图时，ggplot2包的真正力量就会得到展示，让我们利用singer数据集再来一探究竟。...Number by Rank3.png 值得注意的是，第三个图形中y轴的标签是错误的，它应该是比例而不是数量。我们可以通过添加y="proportion"参数到labs()函数来解决。
alpha表示透明度的设置，范围为0到1。...plain",size=15,hjust=0.5)) (3) 坐标轴标题及标签字体、大小及样式设置 I.坐标轴标题样式调整 #axis.title.x:对x轴标题进行调整 #axis.title.y:...对y轴标题进行调整 #axis.title: 对整体坐标轴标题统一调整 #vjust的设置是为了将x轴标题离绘图区远一点 windowsFonts(myFont = windowsFont("宋体"))...而普通设置画布的方式par(mfrow=c(n,m))，在ggplot中是不起作用的。以下，介绍两种多图呈现的方式。使用的数据集为鸢尾花 I....它们均需要指定为一个类别型变量，而实际中数据排列方式通常如左图所示，ggplot2需要的是右图排列样式。
header=TRUE参数是因为刚刚保存的数据中有表头，如果自己的数据没有表头，可以将参数设置为header=FALSE，这样表头就自动设置为了V1 加载ggplot2包 library(ggplot2...image.png df是你读入的数据 price是你数据中的变量名 binwidth设置的是柱子的宽窄，根据需要调大或者调小 以下是binwidth设置不同的参数的区别 p1<-ggplot(data...image.png fill设置的是柱子内部的填充颜色 color设置的是柱子边框的颜色 alpha设置的是柱子填充颜色的透明度，范围是0~1....image.png theme_bw()函数是去掉图片整体的灰色背景 感受一下加theme_bw()函数和不添加theme_bw()函数的区别 p1<-ggplot(data=df,aes(x=price...image.png labs()函数里的x和y参数分别设置的是x坐标轴和y坐标轴的标签 感受一下设置为不同值的区别 p1<-ggplot(data=df,aes(x=price)) + geom_histogram
，这是一种语法规则和参数设置介于常规plot与ggplot2之间的一种绘图函数； 与plot相似，qplot()的基本参数是x、y，分别代表所要绘制图像的x轴与y轴，并且为了和数据框高度契合（我也十分鼓励将变量都放进数据框中规整起来...，qplot中还有很多基本的参数，如： xlim,ylim：设置x轴与y轴的显示区间 log：传入字符型，用于控制将哪个轴转成对数轴，'x'和'y'分别代表x轴与y轴，'xy'代表两个轴都进行变化 main...：设置图形的主标题 xlab,ylab：设置x轴与y轴的名称 三、ggplot2的图形图层语法 图形图层语法是ggplot2的语法基础，它使得图形的重复更新变得更简单灵活，在遇到新问题时也许只需要照搬之前堆砌成的一个优美图形全部代码再稍加修改即可直接使用...，每一个属性都需要由标度x，y来驱动，才能实现从指定数据——指定图层的映射，对应的，colour，shape等参数，也是由标度进行控制，再映射到对应图层上的对应样式颜色的变换，而ggplot2有一个特性...，转换后的数据集中若涉及连续型与离散型间的转换，就需要注意一下，因为有些图在这种情况会因为不兼容的原因而绘图失败。
)) 注：ggplot2支持图层，可以把不同的图层中共用的映射提供给ggplot函数，而某一几何对象才需要的映射参数提供给geom_xxx函数。...等可更改的参数 第三个是具体的类型 此处仅介绍颜色设置和坐标轴设置函数的一些用法，其他类似。...ggplot2的图层设置函数对映射的数据类型是有较严格要求的，比如geom_point和geom_line函数要求x映射的数据类型为数值向量，而geom_bar函数要使用因子型数据。...#每个分面单独的坐标刻度，单独对x轴设置 #scales参数fixed表示固定坐标轴刻度，free表示反馈坐标轴刻度，也可以单独设置成free_x或free_y p+facet_wrap(~cyl,scales...#margins 通过TRUE或者FALSE表示否设置而一个总和的分面变量，默认情况为FALSE，即不设置 p+facet_grid(vs~cyl,margins=TRUE) ?
clusterProfiler包用于富集分析和可视化是非常好用的，语法简洁而统一。...由于dotplot绘图的图像是一个ggplot2对象，其实使用scale系列函数就可以达到目的。...对y轴标题进行操作，则使用scale_y系列函数，由于y是离散变量，因此使用scale_y_discrete函数，相应的如果y轴是连续变量，比如此时的x轴，就使用scale_x_continuous函数调整...有的时候，ggplot2图是经过坐标轴变换的，如使用coord_flip进行x、y轴反转。此时竖直的坐标轴实际上是x轴，需要使用scale_x系列函数控制。...dotplot(ego) + scale_y_discrete(labels = function(x) str_wrap(x, width = 40) ) scale函数处理legend 考虑一个相对复杂的情况
本次以散点图为例简略带领大家快速了解ggplot2的绘图逻辑，更详细内容后面我们会一一推送。 ❞ 1. 加载与安装包 安装并加载绘图所需的R包ggplot2。...绘图 3.1 创建画布 通过在ggplot函数内使用data=指定绘图数据，通过aes进行映射，指定x轴和y轴； theme_bw()函数用于设置主题。...cyl转换为因子后将其映射给fill； 最后使用scale_size设置点的大小范围，使用scale_fill_npg()设置点的内部填充色。...，我们分别可以通过scale_x_continuous和scale_y_continuous来控制x轴和y轴； 通过breaks=seq()控制刻度范围，labels=c()设置刻度内容。...通过在labs()内指定title=设置主标题，x=设置x轴名，y=设置y轴名，size=和fill=分别对应了geom_point中的aes(size = drat,fill = factor(cyl
数据框，并设置分组变量 Group 映射到 x 轴，指标 Index 映射到 y 轴，同时 Group 映射到颜色，用于区分不同组的颜色。...stroke = 1)：根据 plotOcc 数据框添加点，这些点表示出现率，映射 Group 到 x 轴，position 到 y 轴，occ 到点的大小，不显示图例，点的形状设置为 1（圆形），并且有...scale_size_continuous(range = c(10, 12))：设置点的大小比例尺，范围从 10 到 12。...coord_flip()：翻转坐标轴，使得 x 轴变为垂直，y 轴变为水平。guides(color = "none")：设置颜色图例为不显示。...，设置轴标题和文本的大小、颜色和字体加粗。
用 R 画图的时候，如果 y 轴存在个别非常大或非常小的值，或者当中的数值存在非常大差异的时候，画出的图很容易产生误导效果，使人忽略当中某一部分信息。...针对这种 y 轴范围太大、有一部分点与其他点差距非常大的情况，可以考虑压缩/压扁 y 轴。删除 y 轴中没有点的部分也是可以，但个人更倾向于直接对 y 轴进行缩放，把偏离比较大的区域压扁。...)) + geom_point() 得到的图是这样的，不同组别的值差别非常大，y 轴范围很大： 接下来构建一个 squash_axis 函数来实现坐标轴压缩功能，这个函数需要使用 scales 包：...比如要把 5 到 95 范围的 y 轴压缩 10倍： ggplot(shiyanhe, aes(x = group, y = value))+ geom_point()+ coord_trans...(y = squash_axis(5, 95, 10)) 这样画出的图，就能看清每个组别中各个点的分布： 把 1 到 99 范围的 y 轴压缩 30 倍： ggplot(shiyanhe,aes(x
这期我们就一起来使用一下这些参数，绘制更好看的小提琴图叭！ 分析数据简介 因为分析中需要用到分组信息，而pbmc3k的数据集是单个样品，没有包含分组信息。...直接可视化 VlnPlot(sce.all.int, features = g2[1:6]) 如果直接使用VlnPlot可视化，不设置参数，会得到每个基因单独展示的结果，不太易读。...美化VlnPlot结果 可以基于ggplot2的theme函数去调整坐标轴，设置文本颜色和大小、添加边框、调整间距等 p1 + theme_bw()+ theme( axis.text.x.bottom...= element_blank(), ) 旋转并对齐 x 轴标签，设置其样式； 取消 x 轴的次要网格线与 y 轴的刻度标签； 隐藏图例； 设置 x 轴标题和刻度线的颜色和大小； 完全取消 y 轴的刻度和网格线...= 'Expression') 通过theme_minimal()和theme()函数对图形的样式进行美化： 将 x 轴标签旋转 45 度并右对齐； 隐藏 y 轴的刻度标签； 设定轴标题的字体大小；
ggplot2的每个细节都是可以修改的，非常推荐大家系统学习一下，用到再学确实是一种不错的方式，但是如果要提高进阶，还是有必要系统学习的。 今天给大家介绍下如何自定义ggplot2坐标轴。...交换x轴和y轴 设置坐标轴范围 使图形从0开始 反转连续型坐标轴 修改类别型坐标轴的顺序 设置x轴和y轴的比例 设置刻度线位置 移除刻度线和标签 修改刻度标签 修改坐标轴标签 沿坐标轴显示直线 使用对数坐标轴...环状图形 日期坐标轴 交换x轴和y轴 在很久以前的版本中，还只能通过coord_flip()函数实现，现在支持直接换一下x轴和y轴的映射即可。...这个方法很好用，尤其是遇到画气泡图、散点图，发生图形显示不全的情况，只要增加下坐标轴范围就解决了！...-2 这种方法是把设定范围以外的数据完全去掉，而coord_cartesian()函数可以局部放大或者缩小图形。
常用参数： lab.pos标签位置： 可设置为"in"，'out'; lab.font标签字体颜色：可设置各种颜色，例如 "white" 简单例子： ggpie(df, "value",...接下来介绍圆环图的各种方式绘制（圆环图和饼图的意义其实差不多，都是给出各数据的比重，只不过，圆环图中间少了一块，变成环状）。主要有两个包：ggpubr包（推荐使用）与ggplot2包。...ggplot2包绘制圆环图 在[R可视乎|饼图]中ggplot2包绘制饼图的基础上，只要再加一条代码即可完成：xlim(c(0, 5))，即将x轴范围控制在0-5。...()) + ## 去掉左上角的坐标刻度线 theme(panel.border=element_blank()) + ## 去掉最外层的正方形边框 geom_text(aes(x = 3.5, y...可以看到：ggpubr包绘制圆环图十分方便，而ggplot2绘制则需要很多代码，这里不建议使用。 这是今天R可视化的学习笔记，我们下次再见。
那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装：install.packages("ggplot2")。...，由斜率和截距指定 geom_area 面积图（即连续的条形图） geom_bar 条形图 geom_bin2d 二维封箱的热图 geom_blank 空的几何对象，什么也不画 geom_boxplot...彩虹图（在连续的x值上表示y的范围，例如Tufte著名的拿破仑远征图） geom_rug 触须 geom_segment 线段 geom_smooth 平滑的条件均值 geom_step 阶梯图 geom_text...("text",x=23,y=200,parse=T,label ="x[1]==x[2]") labs : labs(x= "这是 X 轴", y = "这是 Y 轴", title = "这是标题"...使用xlim()和ylim()来设置连续型坐标轴的最小值和最大值 coord_cartesian(xlim=c(0,100),ylim=c(0,100)) guides：调整所有的text。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
腾讯会议
云直播
对象存储
