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R语言ggplot2使用geom_label()函数添加文本标签一些细节调节

首先是构造一份数据集 library(ggplot2) df<-data.frame(x=c(1,1), y=c(1,2), label=c(...image.png 文本框四周默认是带有圆角,如果不想要圆角可以使用参label.r ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_label(aes(label=label...image.png 调整带颜色背景大小,可以使用label.padding参数 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_label(aes(label=label,...这里遇到一个问题是两个文本不一样,背景颜色大小就不一样,如和把他们改成大小一样呢?...公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己学习笔记!

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如何通过R语言制作BBC风格精美图片

在BBC数据团队开发了一个R包,以ggplot2内部风格创建可发布出版物图形,并且使新手更容易到R创建图形。 例如: ? 加载所有所需R语言包 通常在R创建图表需要安装和加载某些软件包。...为了不必一一安装和加载它们,可以使用pacman软件包``p_load''函数通过以下代码一次加载它们。...请注意,对于折线图而言,折线颜色或对于条形图而言是条形颜色,并不是从bbc_style()函数中直接获得,而是需要在其他标准ggplot图表函数明确设置 。...image.png 这就是bbc_style()函数实际上是在做什么。 它本质上修改了ggplot2主题功能某些参数。例如,第一个参数是设置绘图标题元素字体,大小,字体和颜色。...左对齐/右对齐文本 参数'hjust'和'vjust'指示水平和垂直文本对齐方式。 它们值可以在0到1之间,其中0左对齐,而1右对齐(或垂直对齐底部和顶部对齐)。

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R tips:ggtextgeom_richtext图层格式调整和使用

ggtextgeom_richtext可以使用Markdown或者html语法来拓展ggplot2文字图层geom_label用法。...fill、color还可以映射变量,和普通ggplot2geom_label类似,如果需要可以在aes函数定义它。但是如果是映射常量,则需要在aes函数外定义。...这里上标使用^字符,也可以htmlsup标签。 至于上面的例子特地提到换行和空格,是因为他们配合R无穷量Inf,可以实现一个相对优雅固定排版布局。...比如我们想实现一个label在右上角布局,那么就可以设置x和y均是Inf,则label会出现在x和y最大值处,在图中也就是右上角位置,再通过hjust和vjust控制此label中心点,即可实现注释文本永远在右上角对齐效果...,这种稳健写法非常适合自己需要写工具函数时候。

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跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2画流程图

Figure2B,论文里没有提供这个图代码,可以尝试用ggplot2模仿一下 image.png 当然这个图用ppt很容易实现。...用ggplot2来做会稍微繁琐一点,但是后续多图组合会方便很多 流程图就是文本和箭头组合,可以借助geom_text()函数和geom_segment()函数来做 首先是文本标签 library(ggplot2...bold", fill="#547e34", size=5, label.size = 0) image.png 这里有个问题是背景颜色条和文本宽度是一致...这个链接里重新自己定义了一个函数,关于自己写ggplot2绘图函数我还看不明白 添加箭头 ggplot()+ geom_label(aes(x=0,y=0),label=" VE ",.../web/packages/ggarchery/readme/README.html 添加箭头有一个专门R包 这样一个一个添加太麻烦,可以把数据整理好 new.dat.01<-data.frame(

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Rggplot2R包开发使用

尤其是在R编程改变了从ggplot2引用函数方式,以及在aes()和vars()中使用ggplot2非标准求值方式。...引用ggplot2函数 与引用其他包类似,你需要在DESCRIPTION文件下Imports条目下列出ggplot2,并使用::访问ggplot2提供函数。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包通常用于可视化对象(例如,在一个plot()-风格函数)。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R需要类都有plot()方法,但想要依赖一个单一plot()为你每个用户都提供他们所需要可视化需求是不现实...如果没有,则会将主题对象存储在编译后字节码,而该字节码可能与安装ggplot2不一致!

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R语言ggplot2画图一套好看配色以及调整字体简单小例子

昨天看到一份资料,介绍ggplot2画柱形图并且使用指定字体,我感觉最终成图配色还挺好看,记录在这里。...这个R包,通过这个包font_import()函数将将操作系统中所有的字体导入,第一次使用时间可能会有点长。...导入结束后就可以使用fonts()函数查看导入字体名称。font_import()函数还可以导入指定路径下字体 ? image.png 我R语言里目前可以使用字体如下 ?...image.png R语言ggplot2画图如果要更改图片整体字体可以使用theme()函数设置text参数 library(ggplot2) library(Cairo) p<-ggplot(df,...image.png 这里我遇到一个问题是 从系统里导入字体可以使用,但是从指定目录导入字体还不能使用,暂时不知道是什么原因 欢迎大家关注我公众号 小明数据分析笔记本 小明数据分析笔记本 公众号

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Rsweep函数

函数用途 base包sweep函数是处理统计量工具,一般可以结合apply()函数来使用。...函数参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理原数据集 MARGIN:对行或列,或者数列其他维度进行操作...,与apply用法一样 STATS:需要对原数据集操作用到统计量 FUN:操作需要用到四则运算,默认为减法"-",当然也可以修改成"+","*","/",即加、乘、除 check.margin:是否需要检查维度是否适宜问题...…… 下面我们结合几个具体例子来看 #创建一个4行3列矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行均值 #方法一,通过rowMeans函数来计算每一行均值...#方法一,通过colMeans函数来计算每一列均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一列均值,MARGIN=2,对列做操作 sweep(M,2,

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CC++内存对齐问题讲解

内存对齐规则在C/C++结构体或类,存在内存对齐问题。内存对齐是为了方便计算机进行寻址,优化寻址速度一个措施,其代价是消耗不必要内存空间。...(不同编译器其默认对齐数不同,64位系统VS默认对齐数是8,在Linux没有默认对齐数)- 可以在程序开端声明`#pragma pack(数字)`来设置默认对齐值结构体总大小为最大对齐数(...如果嵌套了结构体情况,嵌套结构体对齐到自己最大对齐整数倍处,结构体整体大小就是所有最大对齐数(含嵌套结构体对齐数)整数倍。...根据数据类型在内存对齐规则,int类型占用4个字节,在内存占用0,1,2,3地址处,而double类型占用8个字节,需要放在地址偏移量为8位置上。因此,test2大小为16个字节。...struct默认是public继承因此,对于struct对齐规则同样是class对齐规则,在c++,还必须注意在存在虚函数时类有一个虚表指针情况:(在64位指针大小为8字节,32为4字节) class

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ggplot2-annotation|画图点“精”,让图自己“解释”

可视化展示方式可以使数据更易读,且容易看出一些数据下隐藏“结果”,而添加注释则可以进一步聚焦到想重点展示“信息”。...更多参数ggplot2|详解八大基本绘图要素,主题ggplot2|theme主题设置,详解绘图优化-“精雕细琢”,图例ggplot2 |legend参数设置,图形精雕细琢 可参考。...B:geom_label方式添加 p + geom_label(data=annotation, aes( x=x, y=y, label=label),...如果待注释text太多,可使用ggrepel包解决标签太多导致重叠问题 ggplot2-plotly|让你火山图“活”过来 2.2 点注释 1)添加点 p + annotate(geom = "...2)更改原有点 对齐数据集中数据坐标即可 p + annotate(geom = "point", x = 2.620, y = 21.0, colour = "red", size = 5) ?

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R语言可视化及作图7--ggplot2之标签、图例和标题绘制

---- R语言绘图系列: R语言可视化及作图1--基础绘图(par函数,散点图,盒形图,条形图,直方图) R语言可视化及作图2--低级绘图函数 R语言可视化及作图3--图形颜色选取 R语言可视化及作图...4--qplot和ggplot2美学函数 R语言可视化及作图5--ggplot2基本要素和几何对象汇总 R语言可视化及作图6--ggplot2之点图、条形图、盒形图、直方图、线图 * 1....图例绘制 2.1 guide_legend函数(主要参数:color, shape, size) 图例调整函数也属于标度函数一类,但不可以直接使用加号来连接,必须放在函数,作为一个参数。...在theme函数,与图例有关主要参数有: 参数 用法 功能 legend.background 接受函数element_rect() 定义图例背景 legend.margin 接受数值 定义图例边缘范围...,0表示左边,1表示右边 定义图例标签对齐方式 legend.title 接受函数element_text() 定义图例标题样式,但是无法定义标题是什么 legend.position 接受字符串:“none

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R替换函数gsub

Rgsub替换函数参数如下 gsub(pattern, replacement, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE,...vector举例如下: > x <- c("R Tutorial","PHP Tutorial", "HTML Tutorial") > gsub("Tutorial","Examples",x) #将...Tutorial替换成Examplers [1] "R Examples" "PHP Examples" "HTML Examples" 还有其他一些例子来灵活使用这个函数,结合正则表达式。...,我们知道组织病理分期分成stage I,stage II,stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组,并转换成因子 我们使用gsub函数...,并转换成因子 我们还是使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾A,B或者C等字母,例如Stage IIIA,Stage IIIB stage=gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage

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跟着Nature Genetics 学画图:R语言ggplot2一次性画好多个饼状图

image.png 今天试着重复图片对应着是论文附件Figure8b,很多个饼状图放到一起 ?...通过 help(package="scatterpie")函数查看帮助文档,得知需要准备数据格式如下 ?...(data=df1,aes(x=x-0.1,y=y,label=label), fill="#5b9bd5")+ geom_label(data=df2,aes(x=x+0.1...image.png 模仿还差不多 这里遇到一个问题是:ggplot2添加文本时候默认是以坐标轴位置居中分布,有没有办法让文本以坐标的位置居左或者居右来呢?...暂时还不知道如何设置 欢迎大家关注我公众号 小明数据分析笔记本 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学

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R语言ggplot2作图如何去掉图例NA

遇到这个问题是在使用ggtree可视化展示进化树时候,我想给进化树枝分组映射颜色,对应推文是跟着Nature Genetics学画图:R语言ggtree给进化树枝分组映射颜色 第一步是准备进化树文件...image.png 加载需要用到R包 library(treeio) library(ggtree) library(ggplot2) 读取树文件和分组信息 tree<-read.tree("practice.tree...image.png 这个结果右侧图例最下方式有一个NA,如果不想要那个NA加一行代码 scale_color_discrete(na.translate=FALSE) 参考链接是 https://stackoverflow.com...image.png 欢迎大家关注我公众号 小明数据分析笔记本 需要示例数据和代码 点赞 点击在看 然后在后台留言 20210605 就可以了 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python...做数据分析和数据可视化简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己学习笔记!

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R问题|如何查看函数源代码

简介 最近有读者问我,如何查看R语言某包函数源代码呢?我第一时间给出了自己比较常用方法(见方法一),今天打算做个这方面的推文,于是又查了些资料,才发现原来水好深!...还有更好方法(见方法二),并且和不同面向对象系统有关。 方法一 打开查R相关网站,比如:https://rdrr.io/ ?...查R相关网站 输入你R包名称或者相应函数,这里以nlme包lme()为例。 ? 找到对应位置 进入会出现这样界面,界面相应介绍可以下图: ?...界面介绍 打开左上角源代码(Source code)即可找到该包内部所有函数了。 ? 源代码 找到你对应函数,进入即可,任务完成。 ?...nlme源代码 方法二 Stack overflow[1]给出了一些更加高效方式,在R控制台输入相应函数,即可得到对应函数源代码了。 这里小编做个知识点整理,自己也学一波。

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Rstack和unstack函数

我们用R做数据处理时候,经常要对数据格式进行变换。例如将数据框(dataframe)转换成列表(list),或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样功能。 这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠,就像下面这张图展示这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样功能呢?下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框第二列分组信息,将第一列数据划分到各个组,是一个去堆叠过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体例子 例如现在我们手上有一个数据框,里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 内容,第一列是重量,第二列是不同处理方式...,后面小编会使用这两个函数来给大家举个真实应用案例,敬请期待。

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