今天给大家介绍一个ggplot2连续颜色映射函数中一组非常好用的预设函数,它可以很容易的帮我们实现特定离散颜色间的均匀连续化。...,仍然是三大类别,palette指定色盘代号或者名称,direction指定方向,na.value指定缺失值颜色,guide指定最终图例的样式。...以上两个配对函数即是我今天要讲解的主要内容,这两个函数是用于线条颜色(含字体)、填充颜色的的标度函数,其将RcolorBrewer色盘中的所有离散颜色组合通过均匀差值连续化,给我们在提供连续性变量的颜搭配了提供了很大的便利...library(ggplot2) ggplot(faithfuld) +geom_tile(aes(waiting,eruptions,fill=density)) ?...当你使用一个默认的连续性映射时,ggplot2会给你的图表设定一个默认的连续性颜色渐变。
https://kieranhealy.org/blog/archives/2018/12/09/canada-map/ 完整代码 library(raster) library(sf) library(ggplot2
需求: 需要将QImage加载的图片里指定的颜色值替换成另一种指定的颜色。...=0;j<w;j++) { QRgb rgb=image.pixel(j,i); if(rgb==0) //如果是透明色(全透明的颜色...就填充成黑色 { image.setPixel(j,i,0xFF000000); } } }
#所需的包 library(reshape2) #数据处理相关 library(ggplot2) # 绘图相关 library(grDevices) #绘图颜色相关 library(RColorBrewer...包中的geom_tile()或者geom_raster()绘制热 力分布图。...这里使用geom_tile()进行演示,将三维数据(x,y,z)中(x,y)表示位置信息,z映射到颜色。这里的scale_fill_gradientn()将颜色填充呈n个梯度。...ggplot(map,aes(x=Var1,y=Var2,z=value))+ geom_tile(aes(fill=value))+#根据高度填充 scale_fill_gradientn(colours...(aes(fill=value))+#根据高度填充 scale_fill_gradientn(colours=colormap)+ geom_contour(breaks=breaks_lines,
那就按照这个思路试一下看能不能实现。 首先画热图 这个热图和常规的还稍微有点不太一样,可以简单的理解为带有缺失值的热图,缺失值是空白格,其他值分别填充颜色。...example_data/ggplot2_heatmap.csv",header=T) 以上数据是宽格式,借助reshape2这个包中的melt函数将宽格式转变为长格式 df1<-reshape2::melt(df) ggplot2...画热图 library(ggplot2) ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+ geom_tile(aes(fill=value),color="black")+ theme...(panel.background = element_blank()) 这个地方遇到一个问题是缺失值如何给他填充为白色,我想到的办法是给缺失值赋值为0,然后将0,1,2,3离散化处理,然后分别分配颜色...接下来是美化 调整一下y轴的的顺序 df1$A<-factor(df1$A,levels = rev(df$A)) ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+ geom_tile
之前发过一篇推文 ggplot2画散点图拼接密度图 模仿下面这幅图片。但是遇到一个问题是如何给密度图某一个部分填充不同的颜色,就像下面的图片被红色方框圈住的部分。 ?...参考链接是 ggplot2 area plot : Quick start guide - R software and data visualization - Easy Guides - Wiki...image.png 填充颜色用fill参数,更改线条颜色用color参数 ggplot(df,aes(x))+ geom_density(fill="#e72a8a",...image.png 上面的图如果想要给x小于-2和大于2的填充另外一种颜色改如何实现呢?
R语言ggplot2作图的时候配色如果不知道如何选择,可以参考如下链接https://r-charts.com/color-palettes/ image.png image.png image.png...提供了一些色盲患者也能够分辨的安全配色 通过函数help(package="colorBlindness")查看帮助文档,发现还有好多提供色盲患者也能识别的配色的R包 image.png 推文开头提到的链接中的颜色如果在...expand.grid(X=x, Y=y) data$Z <- runif(400, 0, 5) # Heatmap ggplot(data, aes(X, Y, fill= Z)) + geom_tile...() image.png 这里用到的fill填充颜色,连续型数值映射颜色,所以自定义的配色是用函数scale_fill_paletteer_c() library(ggplot2) library(...expand.grid(X=x, Y=y) data$Z <- runif(400, 0, 5) # Heatmap ggplot(data, aes(X, Y, fill= Z)) + geom_tile
read_excel("example_data/06-lineplot/dat08.xlsx") 这里需要注意的 一个点是热图数据通常需要把第一列的基因名作为整个数据的行名,但是读取excel的函数好像没有指定列为行名的函数...也有直接做热图的函数 geom_tile(),ggplot2做热图可能代码稍微繁琐,但是优点是细节调整方便,基本上所有的细节都可以用代码来调整 ggplot2做热图还需要掌握的一个知识点是 长格式数据...(aes(fill=expr_value),color="red") 更改热图色块填充的颜色 更改热图填充颜色有很多种方式,这里我介绍我自己最常用的一种方式 参考链接 https://r-charts.com...= 20, ticks = FALSE, label = TRUE)) 以上介绍的用来填充颜色的数据是连续型的...气泡热图图 如果x 和 y都是离散的,把热图函数geom_tile()换成geom_point()函数,然后用表达量的值映射点的大小 同时映射颜色 也可以归为热图的一种 比如 library(readxl
引言 由于最近开始使用R-ggplot2绘制一些可视化作品,也慢慢发现ggplot2绘图的方便之处,但毕竟开始于Python绘图,我们也不能落下 ? 。所以尽量实现两种语言绘制同一幅可视化作品。...首先,我们还是对各个地区(region) 进行颜色设置,使用我们常用的字典形式,如下: region_color = { 'Africa': '#EA7480', 'Oceania'...参数: xy: 2元组 矩形左下角xy坐标 width:矩形的宽度 height:矩形的高度 angle: float, 可选,矩形相对于x轴逆时针旋转角度,默认0 fill: bool, 可选,是否填充矩形...R-ggplot2 绘制 数据为同样数据(格式符合ggplot2 绘制要求),这里主要使用 geom_tile()和geom_text() 函数。这里我们主要解释下 geom_tile() 函数。...matplotlib 中颜色设置就是来源于此。
ggplot(small)+geom_histogram(aes(x=price)) #同样可以根据另外的变量给它填充颜色,比如按不同的切工: ggplot(small)+geom_histogram(...我们可以用前面直方图的参数来画side-by-side的柱状图,填充颜色或者按比例画图,它们是高度一致的。...geom_density(aes(x=price, colour=cut)) ggplot(small)+geom_density(aes(x=price,fill=clarity)) #####colour参数指定的是曲线的颜色...,而fill是往曲线下面填充颜色。...y=price,fill=color)) #geom_boxplot将数据映射到箱式图上,上面的代码,我们应该很熟悉了,按切工(cut)分类,对价格(price)变量画箱式图,再分开按照color变量填充颜色
这幅图和ggplot2做的热图有点像。试着用ggplot2来实现这张图。...通常用ggplot2做热图会用geom_tile()函数 首先是geom_tile()函数的一个例子 参考 https://www.r-bloggers.com/how-to-make-a-simple-heatmap-in-ggplot2...]), metrics=paste0("Metric",1:4)) df$performance<-rnorm(nrow(df)) head(df) library(ggplot2...image.png 这里遇到的问题是:如何实现Metric4,3,2,1添加不同的颜色,比如Metric4是红蓝渐变色,Metric3我想填充黄绿渐变色。...想到一个解决办法是将Metric4,3,2,1 分成四份数据集,分别使用geom_tile()函数作图,然后在将图拼接起来。
下面,小编就给大家介绍一个好用的文本处理工具-「ggfittext」,该工具可以让你在使用ggplot2绘图中绘制一些文本自动调整文字大小后在区域内显示。...ggfittext绘图案例 这一部分,我们介绍一下ggfittext包中的geom_fit_text() 函数的各种绘图案例,如下: 将文本置于方框内 library(ggplot2) library(...自动调整文本颜色 geom_fit_text()函数中的contrast(对比度)参数,可以用来自动反转文字的颜色,使其与背景填充(fill)形成对比: ggplot(animals, aes(x =...type, y = flies, fill = mass, label = animal)) + geom_tile() + geom_fit_text(reflow = TRUE, grow...不是,这个地理数据工具这么强的吗?数据处理、可视化它都行.. 这种环形图太难画?!带你一行代码搞定.. 不是,这封面图这么多人问的吗?
那就按照这个思路试一下看能不能实现。...最初的想法是左侧的颜色条用堆积柱形图来实现,又看了一遍Y叔公众号关于aplot这个包的推文,发现他是用geom_tile()函数实现的,仔细想想还是geom_tile()函数实现起来比较方便。...首先解决昨天的遗留问题:ggplot2画图添加文字内容的时候如何添加下划线 非常感谢下面这位的留言 文本添加下划线的小例子 df<-data.frame(A=1:10, B...=1:10) library(ggplot2) ggplot(df,aes(A,B))+ geom_point(size=5)+ theme_minimal()+ ggtitle(expression...画带有空白格的热图简单小例子 接下来是准备分组颜色条的数据 下面是画这个颜色条 df2<-read.csv("example_data/ggplot2_heatmap_color_bar.csv",
# ncol: 指定列数 # byrow: 先按行填充数据 # ?...# 在最开始读入数据时,一般只指定x和y,其它后续指定 p <- ggplot(data_m, aes(x=variable,y=ID)) # 热图就是一堆方块根据其值赋予不同的颜色,所以这里使用...fill=value, 用数值做填充色。...p geom_tile(aes(fill=value)) # ggplot2为图层绘制,一层层添加,存储在p中,在输出p的内容时才会出图。...# 连续的数字,指定最小数值代表的颜色和最大数值赋予的颜色 # 注意fill和color的区别,fill是填充,color只针对边缘 p <- p + scale_fill_gradient(low =
❝本节来介绍如何使用「ggplot2」来绘制热图并添加双向箭头添加注释,下面小编通过一个案例来进行展示,图形仅供展示用,希望各位观众老爷能够喜欢。。...c("ID","name","value")) 数据可视化 p % ggplot(aes(name,ID,fill=value))+ # 设置ggplot的aes参数 geom_tile...()+ # 使用geom_tile()添加瓦片 coord_cartesian(clip = "off") + # 关闭坐标轴裁剪 labs(x=NULL,y=NULL)+ # 移除x和y...scale_x_discrete(expand=c(0,0))+ # 设置x轴 scale_fill_gradient2(mid="#FBFEF9",low="#0C6291",high="#A63446") + # 设置填充颜色...0.2,0.9), # 设置图例位置 legend.spacing.x = unit(0.01,"in"), # 设置图例内部的水平间距 plot.margin = ggplot2
) dat %>% pull(x) %>% unique() -> x.levels dat %>% pull(y) %>% unique() -> y.levels 组图代码 library(ggplot2...factor(x,levels = x.levels), y=factor(y,levels = rev(y.levels))) %>% ggplot(aes(x=x,y=y))+ geom_tile...这里用来填充颜色的数据,基因不存在统一填充为0,基因存在填充为不同的群体值。
library(tidyverse) fig1a<-read_delim("data/20230521/Figure1a.txt", delim = " ") library(ggplot2...shape=21, fill="#f1f1f1", color="black")+ theme_bw() image.png 给指定的点映射颜色...这里我的处理方式是把想要映射颜色的点单独挑出来,然后再叠加一层 geneSelected<-c("ZBP1","IFNB1","CGAS","IFNAR1","STING","IFNAR2") match
那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装:install.packages("ggplot2")。...2. ggplot2的绘图原理: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离,并按图层作图。...aes : 同样适用于修改geom_XXX() aes参数控制了对哪些变量进行图形映射,以及映射方式 图形属性(aes)横纵坐标、点的大小、颜色,填充色等 几何对象函数 描述 geom_abline 线图...值上表示y的范围,例如Tufte著名的拿破仑远征图) geom_rug 触须 geom_segment 线段 geom_smooth 平滑的条件均值 geom_step 阶梯图 geom_text 文本 geom_tile...3中颜色构建的渐变色 scale_gradientn n种颜色构建的渐变色 scale_grey 灰度颜色 scale_hue 均匀色调 scale_identity 直接使用指定的取值,不进行标度转换
混淆矩阵大家应该都不陌生,但是3d版的混淆矩阵你见过吗?...猜他不是肿瘤 非肿瘤 15 2 猜他不是肿瘤 肿瘤 1 3 猜他是肿瘤 非肿瘤 5 4 猜他是肿瘤 肿瘤 9 2d混淆矩阵可视化 如果要可视化混淆矩阵,简单的2维非常简单,比如用ggplot2...即可: library(tidyverse) ggplot(df1, aes(pred, outcome))+ geom_tile(aes(fill=ca125))+ geom_label(data...# 把混淆矩阵结果放到1个向量里 inputdata <- c(15,5,1,9) # 定义4个颜色 mycolors 填充色 xlabels = c("pred.No","pred.Yes"), ylabels
#ggplot2学习笔记##第一节:尝试ggplot library(ggplot2) #使用的是R内置数据(mpg) qplot(displ,hwy,data=mpg,colour=factor(cyl...stat指定统计变化,bin为频数。...作业题百分比排列方式使用position #题目一:堆叠型bar x 填充颜色为...geom_area()+ggtitle("geom_area")#填黑线图 p+geom_path()+ggtitle("geom_path")#路径图 p+geom_tile()+ggtitle("geom_tile...")#瓦片图 p+geom_polygon()+ggtitle("geom_polygon")#多边形填充图 #画分布的技巧(1)画密度 depth_dist<- ggplot(diamonds,aes
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