在R语言的ggplot2包中，读者可以借助于geom_bar函数轻松地绘制条形图。对于条形图大家对其的印象是什么呢？又见过哪些种类的条形图呢？在本篇文章我将带着各位网友说道说道有关条形图的哪些品种。...ggplot2的语法讲解 ---- 如果读者对R语言比较熟悉，一定听过或使用过ggplot2的绘图体系了。...，有两点需要说明，一方面，在ggplot2绘图过程中均采用图层思想，将多个图形进行叠加和设置；另一方面，图层思想是通过代码中的加号（+）表现出来的。...，默认为'stack'，表示绘制堆叠条形图；如果指定为'dodge'，表示绘制水平交错条形图；如果为'fill'，表示绘制百分比堆叠条形图； ......然而，在实际的企业环境中，这样的图形出现的频次并不是很高，因为绝对数量的堆叠条形图并不能够达到刺激效果。读者不妨使用下面介绍的百分比堆叠条形图。
linetype线型、size点的大小或线的宽度和 shape形状） 位置 （x, y, xmin, xmax, ymin, ymax, xend, yend） 指定数据分组和顺序的映射group和order，另一类是字符串映射...✦ 几何对象（Geometric objects, geoms）代表在图中实际看到的点、线、多边形等。...「position：」 位置调整，有效值是stack、dodge和fill，默认值是stack（堆叠），是指两个条形图堆叠摆放，dodge是指两个条形图并行摆放，fill是指按照比例来堆叠条形图，每个条形图的高度都相等...「width：」 条形图的宽度，是个比值，默认值是0.9 「color：」 条形图的线条颜色 「fill：」 条形图的填充色 基本演示 读取ImagJ数据及转换 #读取ImageJ dat=read.csv...image.png 数据调整及误差线增加 在ggplot2中可以直接结合stat_summary函数快速进行数据统计->链接 所以stat可以设置为summary,将柱状图的高度设置为各组的均值并联合stat_summary
，在刚开始上手的时候可能稍有难度（而且官网的帮助内容比较不友好），而本文也是我在日常使用和与别人交流中摸索和总结出来的，将对ggplot2的绘图语法和绘图部件进行介绍，并附以常用的一些图形示例； 下面我们就来探索... 设置geom='bar'可以绘制条形图，当传入单个离散类别型数据时，可以自动绘制每个类别的频数统计条形图： qplot(color, data=data, geom='bar',...中绘制的通常为2D图像，即图像的位置信息由(x,y)决定，且通常为笛卡尔坐标系，用得较少的是极坐标系和各种地图坐标系； 坐标系最大的特点是，它可以同时影响所有的位置变量，譬如说，条形图在笛卡尔坐标系中是规规矩矩的条形...plot.title = element_text(hjust = 0.5)) *这里labs用于修改标题，theme(plot.title=element_text(hjust=0.5))用于决定标题居中...将图形元素堆叠起来 而上述这些位置参数通常是应用在条形图中，下面一一进行展示： p <- ggplot(data,aes(am,fill=factor(cyl)))+ geom_bar(position
此外，图形中还可能包含数据的统计变换（statistical transformation，缩写stats），最后绘制在某个特定的坐标系（coordinate system，缩写coord）中，而分面（...接下来开启ggplot2基础学习系列。第一步从复现文章开始。...除此之外，ggplot2提供了众多几何对象geom_xyz()供大家选择，完整的几何对象可以下载RStudio公司总结的ggplot2 cheetsheet。...geom_text(aes(label = value), position = position_stack(vjust = 0.5),size=5) #vjust=0.5在堆叠柱子的中间位置添加文字...geom_text(aes(label = value), position = position_stack(vjust = 0.5),size=5) #vjust=0.5在堆叠柱子的中间位置添加文字
比较类图表 2. 组成类图表 3. 分布类图表 4. 关系类图表 为了选择最适合分析手中数据的图表类型，首先考虑以下几个问题： 1. 单个图表里，需要几个变量？ 2....柱状图和条形图 使用场景：柱状图一般用于表现分类的变量或者是连续的分类变量的组合。 在超市数据的例子中，如果我们需要知道在每一年新开的超市的门店数量，那么柱状图就是一个很好的图形分析的方式。...堆叠条形图是柱状图的一个高级版本，可以将分类变量组合进行分析。...超市数据的例子中，如果我们想要知道不同分类商品的折扣店数量，包含折扣店种类和折扣店区域，堆叠条形图就是做这种分析最为有效的图表分析方法。...下面是一个简单的画堆叠条形图的例子，使用的是R中的ggplot()函数。
对于折线图而言，折线的颜色或条形图的颜色，并不是从bbc_style（）函数中直接实现的，而是需要在其他标准ggplot（ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)）图表函数中明确设置...它能按照BBC图形的标准将标题和副标题左对齐，在绘图的右下角添加页脚，也可以在左下角添加来源。它还可以将图表保存到指定的位置。...在标准工作流程中使用finalise_plot（）的示例： finalise_plot(plot_name = my_line_plot, source = "Source:...title="Reunion is highest", subtitle = "Highest African life expectancy, 2007") R语言 - 柱状图 制作堆叠条形图...legend.position = "top", legend.justification = "left") + guides(fill = guide_legend(reverse = TRUE)) 堆叠柱状图各成分连线画法
一、前言二、初阶图形2.1 基本条形图2.2 水平柱状图2.3 带图例的堆叠柱状图2.4 带图例的分组柱状图2.5 ggplot作图2.6 plotly作图三、进阶图形3.1 水平柱状图3.2 显著性柱状图...3.3 堆积百分比柱状图3.4 分组柱状图四、讨论一、前言柱状图又称条形图，在统计分析中的使用频率最高，也是众多小白入门R最早绘制的可视化图形。...") #可自行更换颜色图片2.2 水平柱状图barplot(values,horiz = TRUE) #翻转图片2.3 带图例的堆叠柱状图#构建数据data <- as.matrix(data.frame...legend = c("Group 1", "Group 2"),fill = c("#1b98e0", "#353436"))图片2.5 ggplot作图#下载和加载包install.packages("ggplot2...") library("ggplot2") #构建数据框group <- LETTERS[1:5] data_ggp <- data.frame(group, values) #绘图ggplot
ggplot2 初探 在ggplot2中，图是采用串联起来（+）号函数创建的。每个函数修改属于自己的部分。...ggplot2包提供了分组和小面化的方法。分组指的是在一个图形中显示两组或多组观察结果。小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。需要注意，ggplot2包在定义组或面时使用因子。...对条形图来说，'dodge'将分组条形图并排，'stacked'堆叠分组条形图，'fill'垂直地堆叠分组条形图并规范其高度相等。对于点来说，'jitter'减少点重叠。...分面 如果组在图中并排出现而不是重叠为单一的图形，关系就是清晰的。我们可以使用facet_wrap()函数和facet_grid()函数创建网格图形（在ggplot2中也称为刻面图）。...在ggplot2中标尺的概念很普遍，可以通过查看以scale_开头的函数来了解更多信息。 主题 主题可以让我们控制这些图的整体外观。
abline()、hline()与vline() 在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条，在ggplot2中当然也有类似的方法： geom_abline()： ...我们主要使用两个参数控制线条的位置，slope控制斜率，intercept控制截距，下面是一个简单的例子，我们在散点图层上叠加截距为20，斜率为2的直线： library(ggplot2) p <-...mpg)) + geom_point() + geom_hline(yintercept = 15:25) p 2.2 area() 面积图也是一种很常用的图，多用于表现某些水平或比例类指标随时间的变化情况...stat = 'identity')+ labs(title='消费水平')+ theme(plot.title=element_text(hjust=0.5)) p 可以看出这时我们的堆叠条形图便而可以看作离散的堆积面积图...top-left", "top-right", "center") ) ggplot(df, aes(x, y)) + geom_text(aes(label = text)) 可以看出，落入四角的标签因为其中心对应坐标点
偶尔逛朋友圈发现一年前跟着我们生信技能树学生信的研究生开发了自己的单细胞数据分析相关R包，4（热图，气泡图，upset图，堆叠条形图）+4（密度散点图，半小提琴，山峦图，密度热图）美图吸引了我的注意力...最后，为了方便用户将可视化结果与其他的ggplot2对象进行拼图操作，我们也通过ggplotify包把输出结果转换为ggplot2对象。...格子中的星号越多，格子的P值越小；左边的聚类树代表不同基因集在不同细胞亚群中表达模式的相似性；上方的条形图分别代表不同的细胞亚群，以及差异基因集在细胞亚群中是呈现上调还是下调趋势；你还可以把method...点越大，P值越小；左边的聚类树代表不同基因集在不同细胞亚群中表达模式的相似性；上方的条形图分别代表不同的细胞亚群，以及差异基因集在目标细胞亚群中是呈现上调还是下调趋势；你还可以把method从'RRA"...the #> condition has length > 1 and only the first element will be used irGSEA.upset.plot upset图 ④.堆叠条形图
那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装：install.packages("ggplot2")。...2. ggplot2的绘图原理: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离，数据相关的绘图与数据无关的绘图分离，并按图层作图。...按变量组图（facet_等） 真正的绘图命令（stat_，geom_，annotate），这三类就是实现一个函数一个图层的核心函数。...微调图型：严格意义上说，这一类函数不是再实现图层，而是在做局部调整。...描述 position_dodge 并列 position_fill 填充 position_identity 不对位置进行处理 position_jitter 扰动处理 position_stack 堆叠处理
条形图的离散数据是分类数据，针对的是单一类别中的数量多少，而不会显示数值在某时间段内的持续发展。...13、堆叠式条形图 跟多组条形图不同，堆叠式条形图 (Stacked Bar Graph) 将多个数据集的条形彼此重迭显示，适合用来显示大型类别如何细分为较小的类别，以及每部分与总量有什么关系。...堆叠式条形图共分成两种： 简单堆叠式条形图。将分段数值一个接一个地放置，条形的总值就是所有段值加在一起，适合用来比较每个分组/分段的总量。 100% 堆叠式条形图。...两种较常用的面积图是分组式面积图和堆叠式面积图。分组式面积图在相同的零轴开始，而堆叠式面积图则从先前数据系列的最后数据点开始。...18、量化波形图 这种图表是堆叠式面积图的一种变体，但其数值并非沿着固定直线轴来绘制，而是围绕着不断变化的中心基线。
#ggplot2学习笔记##第一节：尝试ggplot library(ggplot2) #使用的是R内置数据（mpg） qplot(displ,hwy,data=mpg,colour=factor(cyl...(fill="steelblue"),stat ="bin",stat_params=list(binwidth=2)) #geom参数：point 基础散点 point(size) 气泡图 bar 条形图...#用新的数据暂时取代P里面的数据 #修改参数 p+geom_point(aes(colour=factor(cyl))) summary(p) #作业题百分比排列方式使用position #题目一：堆叠型...，则为count，fill填充颜色为cut x + geom_bar(position="stack") +scale_y_continuous(breaks=seq(0,12000,2000)) #堆叠型...height<-predict(model,preds)#通过混合线性模型预测排列组合的身高 oplot+geom_line(data=preds,colour="#3366FF",size=0.4)#在原来黑色图层上增加蓝色预测数据
不可否认的是里面的优秀资源确实不少，比如；https://rpubs.com/Mentors_Ubiqum/geom_col_1 一步步带你绘制各种各样条形图： ggplot: How to stack...其实中文领域，公众号才是最好的资源，类似的绘图细节有《老俊俊的生信笔记》： 环形热图进阶 ggplot 绘制环形堆叠条形图 精彩目录， 值得细读： 其实它的底层仍然是ggplot系列 但是如果你要从ggplot2...✦ 几何对象（Geometric objects, geoms）代表在图中实际看到的点、线、多边形等。
4.6 ggplot2程序包 ggplot2是R中用于绘图的高级程序包，它将绘图视为一种映射—数学空问到图形元索空间的映射，例如将不同的数值映射为不同的颜色或其他图形属性。...ggplot2在画图时就是采用了类似photoshop的图层设计方式，允许用户一步步构建图形，并且便于图层的修改。...，在图中绘制图形元素其他类型的图形，如直方图、箱线图等。...na.rm=FALSE,…) 参数mapping用于构建映射，data指定数据集，如果在第一图层己经指定，则可以省略:stat用于这一层数据的统计变换:position用于这一层图形的位置调整，常用于条形图...(bar)和直方图，取值为“identity”时表示直接显示，" dodge”为按分类变量并列放置，" stack”为堆叠放置，"fill”显示相对比例;" jitter”为增加扰动，常用于散点图，防止图形过分重叠
总结 这里我用了两个个小技巧，（1）首先明确ggplot2绘制堆叠条形图时，对number这一列相加，所以我将number设置为1，刚好代表每一行就是一个样本/患者（2）在计算百分比时，用了ddply函数
在BBC数据团队开发了一个R包，以ggplot2内部风格创建可发布出版物的图形，并且使新手更容易到R创建图形。 例如： ? 加载所有所需的R语言包 通常在R中创建图表需要安装和加载某些软件包。...绘制堆叠柱状图 #prepare data stacked_df % filter(year == 2007) %>% mutate(lifeExpGrouped...将左对齐标签添加到条形图 如果您想为条形图添加左对齐标签，只需根据数据设置x参数，而是直接使用数字值指定y参数。y的确切值将取决于数据范围。...例如，如果要创建带有很多条形图的条形图，并要确保每个条形图和标签之间有一定的呼吸空间，则可能是这种情况。 如果您确实保留了较大高度图的边距，那么轴和标签之间的间隙可能会更大。...这是我们在处理条形图的边距和高度时应用的指南（已应用coord_flip） size t b 550px 5 10 650px 7 10 750px 10 10 850px 14 10 因此，您需要做的就是将此代码添加到图表中
包中的ggplot函数（需先加载ggplot2工具包支持） ?...其实严格来讲，在R预言的作图函数中，是并不严格区分柱形图与条形图，因为二者无论是形式上还是功能上都表达着同样的数据类型和信息。他们有一个通用的名称——Barplot。...geom_bar是在ggplot坐标系系统之上添加的柱形图图层，stat是对其中的数值型变量所做的统计变换（默认为count），fill是颜色填充设定，可以是某一分类变量，也可以直接映射为颜色。...当然我们也可以设置两个序列堆叠。...通过设定分面参数：facet_grid，我们可以将某一分类变量做成每一个分类项的分面组图。
按照绘图方式，R 语言可以分为四大绘图系统，分别是：1、R 基础绘图系统，2、Grid 绘图系统，3、lattice 绘图，4、ggplot2 绘图。...1.1 成竹在胸 苏轼有云，“故画竹，必先得成竹於胸中”。这句话对于 R 语言绘图也同样适用。也就是我们在进行画图之前，心里应该清楚我们要画的图大概是什么样子。...比如描述数据分布的，可以用散点图，直方图，热图，表现数据各部分百分比，可以用条形图，饼图，韦恩图，展示变化趋势可以用折线图等。...，雷达图，星云图，玫瑰风向图等 4、整体部分：堆叠（分组）条形图，饼图，树形图等 5、进化：折线图，面积图，时间序列图等； R 绘图导图 1.2 数据维度...按是否能够自动创建新的图形，R 的绘图函数可以分为两类——高级绘图函数和低级绘图函数。高级绘图函数可以创建一个新的图形，低级绘图函数是在现有的图形上添加元素。
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