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R for data science (第一章) ②

使用ggplot2进行数据可视化② 添加其他变量的一种方法是aesthetics。 另一种对分类变量特别有用的方法是将绘图分割为多个子图,每个子图显示一个数据子集。...facet_wrap()的第一个参数应该是一个公式,你用〜后跟一个变量名创建(这里“formula”是R中数据结构的名称,而不是“equation”的同义词)。...要在两个变量的组合上构建绘图,请将facet_grid()添加到绘图调用中facet_grid()的第一个参数也是一个公式。 这次公式应该包含两个用〜分隔的变量名。 ?...而不是变量名,例如facet_grid(.〜cyl)。 Genometric Objects 两个图包含相同的x变量,相同的y变量,并且都描述相同的数据。 但情节并不完全相同。...您可以通过将一组映射传递给ggplot()来避免这种类型的重复。 ggplot2会将这些映射视为适用于图中每个geom的全局映射。

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ggplot2--R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

data 用于构造一个具体的图形,由变量组成,这些变量作为列存储在数据框中。...stat可以向数据集添加新变量。将几何映射到这些新变量是可能的 几何体:是指绘制来表示数据的几何对象;每个geom控制我们创建的打印类型。...尺度函数既可用于连续变量,也可用于分类变量。例如,在连续情况下,用刻度填充直方图或密度图;在离散情况下,比例用于填充直方图或条形图,或者在映射颜色、大小或形状时用于散点图。...4.3.3.4 添加标签图层以更改标题和轴标签 默认情况下,由ggplot2创建的绘图没有任何标题,并且带有与绘图中使用的变量名相对应的轴标签。...,它用于按行分割绘图;实现facet_grid(x~.)。函数按行拆分具有方向的绘图。公式也可以是.~y,用于按列拆分绘图;实现facet_grid(.~y)函数可以按列拆分具有方向的绘图。

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    生信技能树七天学习小组 Day4笔记——R语言基础

    1.1准备工作ggplot2是tidyverse的一个核心R包,首先需要加载tidyverselibrary(tidyverse)此处用到内置数据mpg(mpg是一个数据框)复习数据框的概念:变量(列)...geom_point向图中添加一个点层mapping参数定义如何将数据集中的变量映射为图形属性,mapping参数总是与aes()函数成对出现注意:geom_point是函数,而mapping是它的参数...(1)此时颜色不会传达关于变量的信息,仅仅改变图的外观(2)手动设置图形属性时,是将其作为几何对象函数的一个参数,位置在aes()函数的外面(3)图形属性要是有意义的值,例如颜色名称是一个字符串color...facet_grid()只会是单列或者单行,不需要nrow和ncol这两个参数。(6)在使用函数facet_grid()时,一般应该将具有更多唯一值的变量放在列上。为什么这么做呢?...stat_summary()函数的默认几何对象:pointrangegeom_pointrange用于绘制数据点的范围(2)geom_col()函数的功能是什么?它和geom_bar()函数有何不同?

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    ggplot2多维分面多图层对应规则

    ggplot2的多维分面系统非常完美,可以让我们非常方便的将一个多维度的复杂图形按照某个维度的类别进行矩阵化,使得单个类别的信息更加清晰明了,数据呈现直观易懂。...然而问题来了,以上图形仅仅基于同一个图层进行维度分面,倘若我有如下需求,不仅要对地图进行分面,而且要在单个区域地图上呈现一些点信息、线条的信息,这就意味着我们需要在保持分面的基础上,叠加图层,那么我们给分面函数指定的分面规则是否能够作用于第二个图层呢...但是分面函数只能在以上两个数据框中找到第一个图层数据源中含有NAME_1变量,而第二个图层的数据源中尽管有同性质的变量,但是名称不同,分面函数是无法识别的,因为忽略了对图层二的分面操作。...接下来我将图层二中的省份名称变量更改为更图层一中名称相同,再看下结果: mydata%rename(NAME_1=Province) ggplot() + geom_polygon(...这个知识点相对难理解,属于ggplot2高阶用法中比较深奥的部分,与此相同的还有分面参数的控制权限范围问题,即分面参数的控制权限范围到底有多高,是否可以控制ggplot父函数内设定的同名参数,关于这一点儿

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    55-R可视化-4-ggplot2基石三部曲之基础一

    开篇语 这一个部分一共三篇,学会了基本上你的ggplot 就达到ggplot 界小学二年级的水平了吧~ 开始前 主要为ggplot2 中的前三个部分的内容。...ggplot2 可视化使得数据科学从业者更好地分析并解释数据 常用的ggplot 模版 ggplot2 的图形可以按照七种参数来对其进行调整 简单模版 ggplot(data = ) + 的优势在于,它可以自定义输出的分面的行与列数。 易错点 对于color, shape 等不连续的变量区分参数,不适于映射连续变量。...(其一无法体现连续变量的变化趋势,其二这些不连续的参数其数量有限,无法有效区分连续变量)对于连续变量可以选择size, alpha等。...练习题 6-1 #练习6-1 # 示例数据:ggplot2中数据集mpg # 1.分别以mpg的displ和hwy两列作为横纵坐标,画点图。

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    R语言从入门到精通:Day17 (ggplot2绘图)

    图2与图1最大的区别在于添加了一条“平滑”曲线,这里用到了函数geom_smooth()。对于图3,ggplot2包提供了分组和小面化(faceting)的方法。...小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。ggplot2包在定义组或面时使用因子(factor)(主要涉及函数facet_grid())。 ggplot2很强大,能够创建各种各样的信息图。...最后,将研究如何调整ggplot2图形的外观,包括修改坐标轴和图例、改变配色方案以及添加注释。...在R中,组通常用分类变量的水平(因子)来定义。分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如形状、颜色、填充、尺寸和线类型的视觉特征的分组变量来完成的。...在基础图形中可以实现的图形“组合”在ggplot2中自然也不是难事,可以使用函数facet_wrap()和函数facet_grid()创建。

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    「R」ggplot2数据可视化

    最常见的元素是坐标轴上的刻度线和标签(还有图例)。 接下来以三个数据集解释ggplot2的使用。第一个是lattice包中的singer数据集,它包括纽约合唱团歌手的高度和语音变量。...labs()函数是可选的,可以添加注释、轴标签、标题等。 ggplot2中有很多函数,并且大多数包含可选的参数。下面我们来看一下相应扩展。...分组 在R中,组通常用分类变量的水平(因子)来定义。 分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如颜色、形状、填充、尺寸和线条类型的视觉特征的分组变量来完成的。...分面 如果组在图中并排出现而不是重叠为单一的图形,关系就是清晰的。我们可以使用facet_wrap()函数和facet_grid()函数创建网格图形(在ggplot2中也称为刻面图)。...~sex) 添加光滑曲线 这一部分我们着重分析一下添加平滑曲线到散点图的方法。 我们可以使用geom_smooth()函数来添加一系列的平滑曲线和置信区域。

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    R可视乎|分面一页多图

    library(ggplot2) head(mpg) ? 2.使用图形属性 比如说:散点图点的形状/透明度/颜色用第三个属性表示。...ggplot2的分面有两种方式,分别使用 facet_wrap 或 facet_grid 函数。...3.1.facet_wrap() 当想通过单个变量进行分面,则可以使用函数`facet_wrap()`其第一个参数是一个公式,创建公式的方式是在~符号后面加一个变量名,并且该变量应该是离散的。...3.2.facet_grid() 如果想通过两个变量对图进行分面,则使用`facet_grid()`。这个函数第一个参数也是公式,但该公式包含由~隔开的两个变量。...它是指用于分面的包含每个变量元素所有数据的数据组。很好用的参数! 具体例子如下: 用drv与cyl变量进行分面,x轴方向是cyl,y轴方向是drv的值。注意的是俩都是分类型变量。

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    ggplot2优雅的给图像添加阴影

    ❝本周「VIP群」有个朋友询问下面这张图的绘制方法,需要对两组数据做统计分析并且只给差异显著的添加阴影背景,那么肯定是要全部通过代码来自动实现这些需求;即然观众老爷有需求那小编就来详细拆解一下这张图的代码...rstatix) library(ggpubr) library(GGally) library(ggsci) 导入数据 df <- read_csv("easy_input.csv") ❝由于要根据显著性来添加阴影...,因此就不能使用那些自动添加p值的函数,在此我们使用「rstatix」来进行统计分析得到p值结果 ❞ 统计分析 test % group_by(tissue) %>% t_test...「显著」的添加阴影,因此我们将p值的结果分为两类,并将p值结果与原始数据进行整合 ❞ 构建阴影填充分组 df2 % left_join(....TRUE ~"A")),by="tissue") %>% select(-p.adj.signif) ❝完成上面两步骤后我们就得到了添加阴影部分所需要的数据集

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    R语言学习笔记——柱形图

    今天分享R语言中的柱形图,所有图表语法都基于ggplot2包中的ggplot函数完成 。...其实严格来讲,在R预言的作图函数中,是并不严格区分柱形图与条形图,因为二者无论是形式上还是功能上都表达着同样的数据类型和信息。他们有一个通用的名称——Barplot。...二者之间的转换往往只需要添加一个额外的参数而已。 coord_flip() 今天先介绍柱形图: 这里就暂且使用ggplot2包中内置的数据集mpg。...geom_bar是在ggplot坐标系系统之上添加的柱形图图层,stat是对其中的数值型变量所做的统计变换(默认为count),fill是颜色填充设定,可以是某一分类变量,也可以直接映射为颜色。...通过设定分面参数:facet_grid,我们可以将某一分类变量做成每一个分类项的分面组图。

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    【学习】ggplot2绘图入门系列之二:图层控制与直方图

    如前文所述,ggplot2使用图层将各种图形元素逐步添加组合,从而形成最终结果。第一层必须是原始数据层,其中data参数控制数据来源,注意数据形式只能是数据框格式。...aes参数控制了对哪些变量进行图形映射,以及映射方式,aes是Aesthetic的缩写。 下面我们来绘制一个直方图作为示例。数据集仍采取mpg,对hwy变量绘制直方图。..., model, displ, year, cyl, trans, drv, cty, hwy, fl, class [234x11] mapping: x = hwy faceting: facet_grid...下面我们尝试两种更为复杂的直方图,首先将数据按照year这个变量划分为两组,用不同的颜色绘制直方图,而且用频率而非计数来刻画Y轴,并添加密度曲线。...如果想将两个直方图分开绘制,也可以使用facet_grid参数,结果如下图所示。 ?

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    R for Data Science - 2.4 Facets

    这节开始学习ggplot2图形语法中另外两个重要元素:分面。...分面在美学映射那一节中,当我们需要把大于两个变量映射到图形中时,x轴和y轴就已经不够用了,需要通过形状和颜色等可区分的形式来代表新增的变量,但是一味的在一张图中增加多种映射会导致图上的信息密度过高,可读性差...单变量分面对于单个变量的分面,可以用函数facet_wrap(),它的第一个参数是一个表达式,用~ variable来表示,就是在~后加上变量名,注意这里的变量需要是离散的:library(ggplot2...)图片直接用连续变量分面,可以看到因为连续变量的数值较多,导致分面的图形拥挤完全无法观看。...,如上图车型(class)用颜色映射时就很难分清各车型的发动机排量(displ)和每加仑高速里程(hwy)的关系;而要分面的变量所含的种类较多时,就会导致分面出的图形太多,就如上面用连续变量分面一样。

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    【数据分析 R语言实战】学习笔记 第四章 数据的图形描述 (下)

    4.6 ggplot2程序包 ggplot2是R中用于绘图的高级程序包,它将绘图视为一种映射—数学空问到图形元索空间的映射,例如将不同的数值映射为不同的颜色或其他图形属性。...;第三图层对Y轴作log10变换;第四图层添加平滑的统计变换 (5)分面 当我们想要观察某一分类变量对数据的影响情况时,仅通过shape, color区分是不够的,需要根据变量的不同取值进行分组、分别绘图...也可以用facet_grid(x~.)替代。...”) 生成文件后,默认在后台扫一开,所以查看图形文件前需要用dev.off()关闭文件 此外,程序包ggplot2中的函数ggsave()也用于保存图形,并且可以指定为不同的文件类型。...、名称及扩展名,文件路径也可以通过path设置;plot填写图形对象,默认为最后显示的图形:device指定要使用的设备,自动提取文件扩展名;scale为比例因子。

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    高维分面应用——ggplot2分面气泡图饼图

    今天仍然是一篇介绍关于ggplot2高维分面的教程,为什么要单独把这一块内容写这么多篇呢,因为很重要,而且很难搞定呀,高维分面是否能够熟练掌握将决定着你对ggplot2的理解甚至对于整个高维数据可视化的理解是否能够进阶...其实ggplot2系统内的分面函数只有简单的一个facet_grid(),但是恰恰就是这么一个不很起眼,甚至看起来有些特立独行的分面函数,却给高维数据可视化带来了革命性的变化,有了它,所有基于ggplot2...还是再强调一下facet_grid()在ggplot2各个几何图层中的地位和控制范围,分面函数作为一个特殊的,具有美学映射属性,却被设计在了与几何图层近乎独立地位(表现在从写法上来看,它并没有被设计在几何图层内...它的控制权限是很高的,倘若你在facet_grid()函数内部指定了一个分面参数,那么剩余的所有几何图层都可以自动适用这个分面(当然前提是各几何图层的美学映射中都好含有与分面参数相同的变量)。...所以想要分面参数同事控制多个图层,必须保证每一个图层内都含有该分面参数同名的变量。

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