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R语言ggplot2科研数据数据可视化实用手册~第八章热图(heatmap)

TRUE, sep=",", row.names = 1)library(pheatmap)pheatmap(dat01) 如果要在色上添加文本...也有直接做热图的函数 geom_tile(),ggplot2做热图可能代码稍微繁琐,但是优点是细节调整方便,基本上所有的细节都可以用代码来调整 ggplot2做热图还需要掌握的一个知识点是 长格式数据... 宽格式 数据,ggplot2作图的输入数据都是长格式数据,长格式数据如下,一列x,一列y,还有一个数据 宽格式数据截图如下 这个长宽格式转化是ggplot2作图必须理解的一个概念 R语言里提供了长宽格式数据互相转化的函数...画热图展示相关系数的简单小例子 截断标签是在scale_fill函数里设置breakslabels 图例的位置是在主题里进行设置 其他一些细节在guides函数里设置 library(readxl)...气泡热图图 如果x y都是离散的,把热图函数geom_tile()换成geom_point()函数,然后用表达量的值映射点的大小 同时映射颜色 也可以归为热图的一种 比如 library(readxl

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R语言绘图之ggplot2

那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装:install.packages("ggplot2")。...2. ggplot2的绘图原理: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离,并按图层作图。...3. ggplot2的函数介绍: ggplot2里的所有函数可以分为以下几类: 用于运算(我们在此不讲,如fortify_,mean_等) 初始化、展示绘图等命令(ggplot,plot,print等)...值上表示y的范围,例如Tufte著名的拿破仑远征图) geom_rug 触须 geom_segment 线段 geom_smooth 平滑的条件均值 geom_step 阶梯图 geom_text 文本 geom_tile...theme函数采用了四个简单地函数来调整所有的主题特征:element_text调整字体,element_line调整主题内的所有线,element_rect调整所有的,element_blank清空

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R语言可视化—饼图

首先我们从基础的极坐标绘图开始,极坐标绘图一般是先画柱形图,再转化为极坐标,如下图: library(ggplot2) # 创建示例数据 data1 <- data.frame( category...接下来再对这张图进行修饰即可,观察Fig.1A,知道应该做如隐藏x,y轴、移除多余的图形元素、将value值标注在对应的色中并且居中排列、将图例放在图的下方按照两列排列并隐藏图例名称、图例外有黑边包边...) + coord_polar(theta = "y") + labs(x = NULL, y = NULL, fill = "Category") + theme_void() + # 移除多余的图形元素...vjust = 0.5:vjust是垂直对齐参数,取值范围是0到1: vjust = 0 表示标签对齐在每个堆叠部分的底部。 vjust = 1 表示标签对齐在每个堆叠部分的顶部。...可以将画图的代码包装成函数 #构建一个绘图函数,绘制饼图 drPiechart <- function(columnNames,Values,Colors,outputPdf){ library(ggplot2

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R语言cowplot包拼图系列教程~文末彩蛋

包拼接图片(1)基本操作 R高级|利用cowplot包拼接图片(2)巧用NULL调节距离、排版 R高级|cowplot包拼图(3):overlap R高级|cowplot包拼图(4):ggdrawdraw...0、构图 图A library(ggplot2) library(cowplot) mpg$year = as.character(mpg$year) A <- ggplot(mpg,aes(year...plot_grid(A,B,ncol = 1,align = 'hv') 我们可以看到左侧没有对齐 拼成1行 plot_grid(A,B,nrow = 1,align = 'hv') 我们看到底部没有对齐...axis参数是在align参数基础上使用的,也就是说axis参数align参数一起用。 axis参数有4个值:左侧对齐(l),右侧对齐(r),顶部对齐(t),底部对齐(b)。...画1行的时候,底部顶部对齐 plot_grid(A,B,nrow = 1,align = 'hv', axis = 'b') 画成1列的时候左右两侧对齐 plot_grid(A,

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如何通过R语言制作BBC风格的精美图片

它所做的通常是将文本大小,字体颜色,轴线,轴线文本,边距许多其他标准图表组件转换为BBC样式,这是根据设计团队的建议和反馈制定的。...它本质上修改了ggplot2的主题功能中的某些参数。例如,第一个参数是设置绘图标题元素的字体,大小,字体颜色。...修改图例legend 移除legend 仅仅移除特定legend multiple_line + guides(colour=FALSE) 移除所有legend multiple_line + theme...左对齐/右对齐文本 参数'hjust''vjust'指示水平和垂直文本对齐方式。 它们的值可以在0到1之间,其中0左对齐,而1右对齐(或垂直对齐的底部顶部对齐)。...这些数字分别指定顶部,右侧,底部左侧的边距-但您也可以直接指定要更改的边距。

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【CC++】2024春晚刘谦春晚魔术步骤模拟+暴力破解

cout << "将顶部卡牌移至底部: "; printDeck(deck); deck.erase(deck.begin()); // 移除现在的顶部牌...: 2 3 1 2 4 1 2 取出新的卡牌: 3 1 2 4 1 2 移除下一张顶牌(弃牌): 1 2 4 1 2 弃牌之前手里卡牌为: 1 2 4 1 2 将顶部卡牌移至底部: 1 2 4...1 2 1 取出新的卡牌: 2 4 1 2 1 移除下一张顶牌(弃牌): 4 1 2 1 弃牌之前手里卡牌为: 4 1 2 1 将顶部卡牌移至底部: 4 1 2 1 4 取出新的卡牌: 1 2...1 4 移除下一张顶牌(弃牌): 2 1 4 弃牌之前手里卡牌为: 2 1 4 将顶部卡牌移至底部: 2 1 4 2 取出新的卡牌: 1 4 2 移除下一张顶牌(弃牌): 4 2 弃牌之前手里卡牌为...: 4 2 将顶部卡牌移至底部: 4 2 4 取出新的卡牌: 2 4 移除下一张顶牌(弃牌): 4 最后一张牌为: 4 之前步骤3,藏在屁股后面的卡牌为: 4 魔术成功!

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R 可视化 | 华夫饼图

数据介绍 #相关包 library(ggplot2) library(RColorBrewer) library(reshape2) nrows <- 10 categ_table <- round(...ggplot 包绘制 块状华夫饼图 块状华夫饼图的小方格用不同颜色表示不同类别,适合用来快速检视数 据集中不同类别的分布比例,并与其他数据集的分布比例进行比较,让 人更容易找出当中模式。...代码看着很长,但是有一半都是主题的设置theme(). ggplot(df, aes(x = y, y = x, fill = category)) + geom_tile(color = "white...点状华夫饼图 点状华夫饼图(dot matrix chart)以点为单位显示离散数据,每种颜色 的点表示一个特定类别,并以矩阵形式组合在一起,适合用来快速检视数据 集中不同类别的分布比例,并与其他数据集的分布比例进行比较...pad = 0, use_glyph = FALSE, glyph_size = 12, legend_pos = "right") 主要参数含义: parts 用于图表的值的命名向量 rows 的行数

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iPhone X 适配手Q H5 页面通用解决方案

目前的H5页面可以分为通栏页面非通栏页面两种,每种页面都可能有底部操作栏,具体如下: 通栏页面 顶部通栏 某些业务的一级页面多数使用了顶部通栏banner的效果,由于iPhone X在状态栏增加了24px...解决方案:在页面底部增加一层高度34px的颜色,将操作栏上移34px,颜色可以自定义。 关于安全区域 这里可能有人会有疑问,为什么非通栏下的页面内容是通到底部的,而按钮却是在安全区域上方呢?...网页内容完全覆盖可视窗口 auto: The default value, 同contain的作用 通过给页面设置viewport-fit=cover,可以将页面的布局区域延伸到页面顶部底部。...底部适配层颜色在主资源加载完成后填充颜色 对于顶部通栏的页面,通过加URL参数来增加顶部黑色适配层。..._bid=278&_wvx=1 对于有底部操作栏(包括通栏非通栏),通过加URL参数来增加底部适配层以及设置颜色。

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cache 淘汰算法:LIRS 算法

4)当需要一个free block时,从队列Q移除一个HIR block,并将栈s中的这个block设置为non-resident。 5)确保栈S的底部为LIR。...6)当有HIR再次被访问,则将其升级为LIR放于栈顶,并将栈s底部的LIR降级为HIR,并将其放至队列Q顶部。同时进行栈剪枝(stack push)。...Ps 栈剪枝的概念如下: (1).栈底一定要是LIR (2).如果栈底的LIR移除上一个LIR之间的HIR也要被移除。...3.访问栈S non-resident HIR:队列Q的队首元素移除,并在cache中彻底删除它,并用于存储新数据,并将其置于栈S顶部。...1503282910177.png] 2.8 算法缺陷及解决方案 LIRS算法在空间使用上有一定缺陷,即为栈S的大小在极端情况下会变的无法预期的大,文中提供了一种简单的抑制方法,即超过大小限制之后移除栈最底部

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HarmonyOS学习路之开发篇—Java UI框架(六大布局开发)

/底部边缘与另一个子组件的左/右/顶部/底部/开始/结束边缘对齐 ohos:align_left/right/top/bottom/start/end="$id:component_id" align_parent_left.../right/top/bottom/start/end 将左/右/顶部/底部/开始/结束边与父组件的左/右/顶部/底部/开始/结束边对齐 ohos:align_parent_left/right/top...vertical_center 将子组件保持在父组件垂直方向的中心 ohos:vertical_center=“true” ③ StackLayout 对应 FrameLayout StackLayout直接在屏幕上开辟出一空白的区域...orientation=“horizontal” 表示水平方向布局ohos:orientation=“vertical” 表示垂直方向布局 注意事项:在设置子组件的行列属性时,TableLayout剩余的行数列数必须大于等于该子组件所设置的行数列数...clearAdaptiveRules() 移除所有自适应盒子布局规则。

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vue上拉加载更多组件

上拉加载原理简单来说就是判断内容是否到达底部。容器自身的高度加上距离顶部的距离就是现在整个页面的高度。整个页面的高度减去可视窗口的高度再减去滚动条移动的距离,当接近0的时候就是到达底部的时候。...data: windowHeight: '',contentOffSetHeight: '',downT: '' 因为可视窗口距离顶部的距离是不会变的,所以初始化的时候就赋值,downT是监听滚动防抖用的...Props: props: ['up', 'bottomDistance'], up对应的就是父组件传递的到达底部是触发的方法,'bottomDistance'是可以设置到达底部距离多少的时候触发加载更多的方法...,防止记住滚动条位置,亲测,要是没有设置history.scrollRestoration,vue生命周期会先移动到顶部然后再移动到记住的位置。...其实设置了这个移动到顶部也不需要,这边为了稳定就加上了。还有就是要移除监听滚动,我试了,跟定时间计时器一样,没有在组件销毁的时候移除,会一直存在。

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基因集富集分析(GSEA)及其可视化

GSEA首先将基因在样品中的差异倍数值(logFC)由大到小排序,然后判断来自功能注释等预定义的基因集或自定义的基因集中的基因是富集在这个排序列表的顶部还是底部,如果在富集顶部,则该基因集是上调趋势,反之...,如果富集在底部,则是下调趋势。...正值说明在顶部富集,峰值左边的基因为核心基因,负值则相反。...如果研究的功能注释基因集的成员显著聚集在表达数据集的顶部底部,则说明功能基因数据集中的基因在数据集中高表达或低表达,若随机分配,则说明表达数据集与该通路无关。...-log10(dat$pvalue)dat$pvalue=dat$pvalue*dat$group dat=dat[order(dat$pvalue,decreasing = F),]library(ggplot2

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ggplot2包图形参数(坐标轴、分面、配色)整理

R具有强大的统计计算功能便捷的数据可视化系统。目前R主要支持四套图形系统:基础图形(base)、网格图形(grid)、lattice图形ggplot2。...其中ggplot2凭借强大的语法特性优雅的图形外观,逐渐成为R中数据可视化的主流选择。...4.6.1 移除刻度线、刻度标签网格线 theme(axis.ticks=element_blank()) # 移除两坐标轴刻度线,无法仅隐藏单个坐标轴的刻度线 theme(axis.text.x...= element_blank()) # 仅移除x轴刻度标签,y轴同 scale_y_continuous(breaks=NULL) # 移除y轴刻度线、刻度标签y轴网格线,仅对连续型坐标轴有效...居中/右对齐)纵向对齐(顶部对齐/居中/底部对齐)。

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Source Insight快捷键大全

Ctrl+Shift+O 另存为 : Ctrl+Shift+S 显示文件状态 : Shift+F10 激活语法窗口 : Alt+L 回到该行的开始 : Home 回到选择的开始 : Ctrl+Alt+[ 到的下面...: Ctrl+Shift+] 到的上面 : Ctrl+Shift+[ 书签 : Ctrl+M 到文件底部 : Ctrl+End, Ctrl+(KeyPad) End 到窗口底部 : (KeyPad)...PgUp, Ctrl+(KeyPad) PgUp, (KeyPad) / 左滚 : Alt+Left 向上滚动一行 : Alt+Down 向下滚动一行 : Alt+Up 右滚 : Alt+Right 选择一...从当前位置选择到文件结束 : Ctrl+Shift+End 从当前位置选择到行结束 : Shift+End 从当前位置选择到行的开始 : Shift+Home 从当前位置选择到文件顶部 : Ctrl+Shift...1,2,3次) : Alt+F7 移除文件 : Alt+Shift+R 同步文件 : Alt+Shift+S 增量搜索(当用Ctrl + F 搜索,然后按F12就会转到下一个匹配) : F12 替换文件

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