gg.gap诞生记 “站长,小站工具qPCR在线分析功能非常好,但有些基因的表达量太高了,图做出来值非常大,能否想prism那样把y轴做个截断呢?”...面对的疑问,站长最开始并没有想到去开发一个R包解决。 ggplot2以及依赖它开发的包已经丰富,原以为在网络搜索一下肯定有解决方案,但谁曾想这样的需求真的没有找到完美的解决方案。...不管三七二一,画个草图先: 思路很简单,就是先按照y轴切,然后用cowplot去拼接。...小站VIP群中的树神(微信ID:一棵树)精通R包制作,为了让野路子出来的代码更完善,拉上树神一起干,不仅实现截取多个截断,还可以对任意ggplot2对象进行截断,再不断测试修补bug之后,gg.gap终于在今天这个有意义的日子正式上线...install.packages("gg.gap") 都能切什么图,切几段 理论上,ggplot2的图都能切,想切几段切几段。
但是最近有好几个小伙伴儿跟我咨询关于ggplot2的次坐标轴问题,平时的一些业务分析中,有些场景出于数据呈现的需要,或者阅读习惯等,往往需要在一幅图中呈现两个量级不等的坐标。...所以我觉得这一篇推送很有必要,确实在最新版的ggplot2(ggplot 2.2.0以上版本)中,已经加入了次坐标轴参数,通过这个次坐标轴的转换,我们可以模拟出不同数量级的次坐标轴效果。...这段代码与我们经常用的有两点不同: 第一次自定义映射——折线度量数据的映射转换: geom_line(geom_point,因为点图是附属于折线图,仅做修饰之用,这里只重点说折线图层)中的y参数指定的对象使用了一个统计变换函数...因为在ggplot2标度系统中,不容许在一个图形中出现两个量级不等的标度(一山不容二虎),但是想要提供度量不等的次坐标轴,折中的方法就是,将次坐标轴的所有量级按照主坐标轴的量级进行缩放(如果次坐标轴量级大于主坐标轴...第二次自定义映射——次坐标轴刻度标签转换: 仅仅做以上步骤还不够,因为这只能保障次坐标轴的数据点位置相对于整个坐标系统而言,不会出现太大的视觉误差,但是现在的问题是这个图形对象中有两套不同的度量,所以必须声明不同的
❝今天来主要介绍如何在不引入外部几何对象的前提下在图形的原有的基础上「自定义修改轴文本颜色」,也许恰好您正好有此特殊需求,希望对各位观众老爷有所帮助;下面来看具体案例; ❞ 加载R包 library(tidyverse...0.5,color="grey", arrow = arrow(length = unit(0, "npc"),type="closed")) ❝可以看到此处我们使用的「...geom_text」在图形内部添加文本并定义颜色,那如果我们要在图形外部修改轴文本颜色该如何操作,当然有更加简单的方法请往下看 ❞ 构建数据 df % arrange(id) %>...,下面我们就在此基础上修改Y轴文本颜色 统一个数 x_cols <- rep(c("#EDB749","#3CB2EC","#9C8D58","#4A452A"),each=11) p + theme...当然上述操作ggplot2会显示如下警告信息,是不是发现了什么;感觉挺有趣的 ❝Warning message: Vectorized input to element_text() is not
Laya 缩放功能的实现 在 laya 中实现滚轮对选中对象的缩放,涉及到以下两个模块: 事件 容器坐标 1. 事件 在 Laya 中, Event 是事件类型的集合。...这样可以避免同一个对象多次绑定的问题, 在 laya 中,事件管理器是允许同一个对象的同一个方法事件进行多次绑定的,这样容易造成许多意向不到的 bug, 所以务必 只在使用时进行绑定,用完立马解除绑定...向右为 x 轴正向,向下为 Y 轴正向。所有容器创建时坐标原点默认为 (0,0), 此处需要注意: 所有容器的原点坐标都是相对于其父容器原点的坐标,是局部坐标,而非全局坐标。...因此,对象在容器中的坐标为局部坐标,转换为全局需要逐层向父容器变换,知道跟容器 Stage 为止。 同时要注意: 在移动、缩放对象时不要改变对象坐标,改变容器坐标,实现对象的改变。...// 对容器对象进行缩放 ///-------------- Scale Drawing Sprite -------------------------- public static MouseWheel
image.png 今天用ggplot2作图y轴的标题想实现上图红框里的形式,查了一下如何实现 记录一下代码 首先是构造一份数据集 df<-data.frame(x=1,y=1) R语言ggplot2...散点图并添加文本 library(extrafont) fonts() library(ggplot2) ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_text(label=...stackoverflow.com/questions/34892262/subscripts-and-superscripts-or-with-ggplot2-axis-labels-ionic-chemical 欢迎大家关注我的公众号...小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记
由于dotplot绘图的图像是一个ggplot2对象,其实使用scale系列函数就可以达到目的。...有的时候,ggplot2图是经过坐标轴变换的,如使用coord_flip进行x、y轴反转。此时竖直的坐标轴实际上是x轴,需要使用scale_x系列函数控制。...,有些时候过长的labels是出现在legend中,而且str_wrap只在有空格的地方才会折叠,那么一个很长的没有空格的字符串需要如何处理才能折叠?...首先在legend中也是同样的处理,只不过根据此legend映射的美学不同而选择不同scale函数:如scale_color、scale_fill、scale_size等等。...= TRUE) 这个图直接使用scale_color_discrete进行修改是不会有任何改变的,因为这个图的color映射并不是ggplot2的默认情况,而是使用ggraph的geom_edge
经过一番努力,我们找到一篇2017年预印2019年见刊NCB的文章: ? 文章摘要: 在脊椎动物中,位于咽部中胚层心肌细胞和鳃状头部肌肉的多能祖细胞,心肺多能和头部肌肉的命运选择仍然不清楚。...在第二种心脏谱系中,Tbx1/10-Dach通路积极地抑制第一种心脏谱系程序,调节以后跳动心脏中的细胞多样性。最后,Ciona和小鼠的跨物种比较揭示了脊索动物的心咽网络的深层进化起源。...PC轴的基因,并判断出每个PC轴潜在的生物学意义,如PC5 作者写道:Another batch effect。...然后,有batch的PCs用RegressOut回归掉(这个函数在V3中放到了 ScaleData的参数vars.to.regress 中,在R中?Seurat::ScaleData)。...下面我们用Seurat V3+ 来做一个发现PC轴秘密的演示,首先我们还是清出我们的R包和老朋友pbmc3k的数据集。
需要注意的是只有二维数组(矩阵)以及更高维度的数组才能够进行转置操作,对Numpy中的一维数组进行转置操作是没有用的。...在Numpy中既可以使用一维数组表示向量,也可以使用二维数组矩阵的形式表示向量。...对比一下会发现,第一个元素位置和最后一个元素的位置发生了改变。 d swapaxes函数 Numpy中还有一个swapaxes函数,它需要接受一对轴编号。...0,2)) ▲输出结果 这里为了方便都将第一个轴和最后一个轴进行转置,三种转置方式得到的结果是一样的,不过可以看出swapaxes是以轴为单位的,并且只能传入两个轴参数。...▲二维数组的轴 对于三维数组来说,三个轴分别为axis 0,axis 1,axis 2,这些轴就这些转置操作所变换的对象。 ?
在ggplot2中很容易出现一个修改坐标轴范围的问题,喜欢用ggplot2画图的需要注意一下。...ylim和coord_cartesian都是调整坐标轴范围,但是它们的结果是有可能不一样的,看下面的一个例子: data(diamonds) p <- ggplot(data = diamonds, aes...image 截取0到60的部分: ? image 可以看到第二张图跟原图是不一样的,比如Fair的第一个box原数据最高是超过60的,但是截取之后不到60了。这是一个不太容易注意到的坑。...这里是因为ylim是直接处理的数据导致的,比如例子中不在范围的数据就直接被移除。同等操作应该用coord_cartesian来实现。...coord_cartesian指定参数控制图形特定区域放大显示,只影响图形展示,不影响内部数据的值。即使用原数据作图,再对图形进行变动。
ggplot 中 scale 的使用 ggplot画图是画图中的战斗机,但是往往在我们用ggplot2画图时候,需要根据需求更改坐标,图例等,最常见的就是更改x,y坐标系的名称。...在ggplot2中,坐标系与比例尺和参考线是自动生成的,并且生成得很好。...我们会使用scale_color_和scale_fill_来更改调色板,今天我们就来介绍如何在ggplot中调整比例尺,调整中断和标签,修改轴和图例等。...强大的 Scale包,可以实现在ggplot基础上,对图形进行微调及更改。...1.基础底图 Scale包为ggplot底图提供了四种样式的比例尺: demo_continuous() and demo_log10() for numerical axes demo_discrete
geom_segment()函数实现的 library(ggplot2) library(lubridate) 作图 ggplot() + theme_bw() + geom_segment(...yend = -30), size = 8, colour = gray(0.5)) 对x轴操作的代码...这里涉及到时间格式的数据如何操作 ggplot() + theme_bw() + geom_segment(data = df_normal, aes(x =...limits = (c(as_date("2020-01-01"), as_date("2020-12-31")))) 接下来就是对Y轴操作...,添加双坐标轴的代码 ggplot() + theme_bw() + geom_segment(data = df_normal, aes(x = date,
x、y、hjust、vjust:分别设置所画图片的坐标x和y,以及与x轴、y轴的相对关系,hjust>0,表示在y轴左边,yjust>0,表示在x轴上边。...scale:图片等比例缩放,默认为1,表示图片不缩放 width和height:设置图片的宽度和高度 下面详细介绍一下plot参数。...plot参数可以是一个ggplot2图片,也可以是一个align_plots后的list,但是两者有区别的:ggplot2图片是可以和其它ggplot2参数合用的,但是align_plots产生的list...图A是ggplot2图片,放大y轴标题 ggdraw()+ draw_plot(A+ theme(axis.title.y = element_text(size = rel(...read_image读取图片,然后使用ggplotify包中as.ggplot命令将图片转成ggplot2图片,最后连续使用draw_plot画出 #读取本地图片 library(magick) logo
代码 library(ggplot2) ggplot()+ geom_point(aes(x=1,y=1))+ theme(axis.title.x = element_text...(margin = margin(2,1,0,1,'cm'))) image.png 欢迎大家关注我的公众号...小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记
rw=RandomWalk() rw.fill_walk() points_numbers=list(range(rw.num_points)) # 设置图表标题,并给坐标轴加上标签...plt.scatter(rw.x_values,rw.y_values,c=points_numbers,cmap=plt.cm.Blues,edgecolors='none',s=15) # 隐藏坐标轴...False) #plt.show() plt.savefig('sjmb.png',bbox_inches='tight') keep_running=input("是否要再模拟一次随机漫步
客户需要在OA中实现每日动态功能,能够记录每一位员工的每天的工作动态,我很快想到了时间轴,因为时间轴能很直观的现实员工每一刻的动态。就像Facebook的Timeline效果(点击查看)。...成果演示 最终的效果如下所示: 点击每个员工的姓名,即可进入他当天的工作动态(只能看),若点击自己的名字(既能看又能发送/编辑/删除动态),如下所示: ? 动态的详细页,如下所示: ?...点击时间轴,即可新增动态,如下所示: ? 编辑效果,鼠标移至内容区域,现实黄色提醒,如下所示: ? 单击即可显示编辑界面,如下所示: ? 移开鼠标,即可自动保存。...实现原理 关于效果的实现原理可以参考这篇文章。 了解了上面提到的这篇文章之后(Masonry.js),接下来就是Sharepoint 客户端对象模型的实现了,比如Ecmascript。 ...List中,对于List,他能负担的item的个数和一次从数据库里获取的item都是有限制,对于数据量很大的情况下,是有风险的。
在使用ggplot2初步绘制(ggplot2|详解八大基本绘图要素)出需要展示的图形后,还需要对标题,坐标轴(ggplot2|theme主题设置,详解绘图优化-“精雕细琢”)和legend(ggplot2...本文针对性的介绍下如何对标题,坐标轴和legend进行修改和设置,算是之前几篇推文的一些补充。...注意theme中对应的更改plot.title ,plot.caption 和 plot.subtitle p1 <- p + labs(title="学习<em>ggplot2</em>可视化",...3.1 设置坐标轴 使用labs函数 ,其中x y 即为对应的坐标名字; p2 <- p1 + labs(x="X<em>轴</em>",y = "这是Y<em>轴</em>",title = "生信补给站") p2 3.2 设置坐标大小...ggplot2的scale系列函数有很多,命名和用法是有一定规律的。
❝本节来回答一个老爷的问题,介绍常见绘图案例中几个基本参数的设置问题,主要用在柱状图与箱线图中。下面小编通过两个案例来进行展示,图形仅供展示用过程仅参考,希望各位观众老爷能够喜欢。...position_dodge2(preserve = "single"))+ labs(x=NULL,y=NULL)+ theme(legend.position ="non") p1+p2+p3 ❝在上方代码中可以看到...但它们之间有一些细微的差别: ❞ 1. position = "dodge" 这是position_dodge()的简写形式,它会自动计算需要的dodge宽度。不能设置preserve参数。...3. position_dodge2() 这是position_dodge()的一个扩展,提供了更多的控制,preserve= "single":保持每个单独的柱子的宽度不变,而不是整个组。...使用position_dodge2(preserve="single"),如果A=1和A=2的柱子高度不同,那么A=1的两个柱子会比A=2的两个柱子更接近,因为它们的宽度被保留了。
在本教程中,我们将建立一个可缩放、可平移的图像视图来实现这一功能。 计划 他们说,一张图片胜过千言万语--但它不一定要花上一千行代码!对于我们的可缩放图像视图,我们要做的是让它成为一个可缩放的视图。...对于我们的可缩放图像视图,我们将利用UIScrollView的缩放和平移功能。...基本上,我们将在UIScrollView中嵌套一个包含图片的UIImageView,它将处理所有我们扔给它的缩放、平移(和点击!)手势。...设置滚动视图 我们需要实际设置我们的滚动视图,使其可缩放和可平移。这包括设置最小和最大的缩放级别,以及指定用户放大时使用的UIView(在我们的例子中,它将是图像视图)。...添加这种额外的功能可以真正帮助人们参与到你的应用程序中显示的图片中,而且通常是用户所期望和要求的功能。
特征工程又是数据预处理的一个重要组成, 最常见的特征工程有以下一些方法: 编码 缩放 转换 离散化 分离 等等 在本文中主要介绍特征缩放和特征编码的主要方法。...特征缩放 特征缩放是一种在固定范围内对数据中存在的独立特征进行标准化的技术。...在规范化中只更改数据的范围,而在标准化中会更改数据分布的形状。...而在标准化中,数据被缩放到平均值(μ)为0,标准差(σ)为1(单位方差)。 规范化在0到1之间缩放数据,所有数据都为正。标准化后的数据以零为中心的正负值。 如何选择使用哪种缩放方法呢?...虽然是这么说,但是使用那种缩放来处理数据还需要实际的验证,在实践中可以用原始数据拟合模型,然后进行标准化和规范化并进行比较,那个表现好就是用那个,下图是需要使用特征缩放的算法列表: 特征编码 上面我们已经介绍了针对数值变量的特征缩放
在神经网络学习之Ndarray对象和CNN入门 中,主要介绍了Ndarray维度的概念和CNN的大体流程图,本文基于此介绍Ndarray中比较重要的一个函数stack函数的使用以及numpy中的广播,...@在python中是函数装饰器,和Java中的注解是不一样的。...轴的概念 我在图中标注出了哪些是外边的轴,哪些是第二个轴,哪些是最里边的轴,有一个比较简单的方法来判断这些轴,就是观察一下方括号,方括号数量越多的轴,越是在外层的轴,在这个例子中,最外侧的轴有两层方括号...,从外边数第二个轴有一层方括号,这里还好一点,最难理解的是最里边的轴,最后来看一下最内侧的轴。...numpy中的广播 广播(Broadcast)是 numpy 对不同形状(shape)的数组进行数值计算的方式。 下面的图片展示了数组 b 如何通过广播来与数组 a 兼容。
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