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如何随意截断ggplot2图像y

gg.gap诞生记 “站长,小站工具qPCR在线分析功能非常好,但有些基因表达量太高了,图做出来值非常大,能否想prism那样把y做个截断呢?”...面对疑问,站长最开始并没有想到去开发一个R包解决。 ggplot2以及依赖它开发包已经丰富,原以为在网络搜索一下肯定有解决方案,但谁曾想这样需求真的没有找到完美的解决方案。...不管三七二一,画个草图先: 思路很简单,就是先按照y切,然后用cowplot去拼接。...小站VIP群树神(微信ID:一棵树)精通R包制作,为了让野路子出来代码更完善,拉上树神一起干,不仅实现截取多个截断,还可以对任意ggplot2对象进行截断,再不断测试修补bug之后,gg.gap终于在今天这个有意义日子正式上线...install.packages("gg.gap") 都能切什么图,切几段 理论上,ggplot2图都能切,想切几段切几段。

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ggplot2双坐标解决方案

但是最近有好几个小伙伴儿跟我咨询关于ggplot2坐标问题,平时一些业务分析,有些场景出于数据呈现需要,或者阅读习惯等,往往需要在一幅图中呈现两个量级不等坐标。...所以我觉得这一篇推送很有必要,确实在最新版ggplot2(ggplot 2.2.0以上版本),已经加入了坐标参数,通过这个坐标转换,我们可以模拟出不同数量级坐标效果。...这段代码与我们经常用有两点不同: 第一自定义映射——折线度量数据映射转换: geom_line(geom_point,因为点图是附属于折线图,仅做修饰之用,这里只重点说折线图层)y参数指定对象使用了一个统计变换函数...因为在ggplot2标度系统,不容许在一个图形中出现两个量级不等标度(一山不容二虎),但是想要提供度量不等坐标,折中方法就是,将次坐标所有量级按照主坐标量级进行缩放(如果坐标量级大于主坐标...第二自定义映射——坐标刻度标签转换: 仅仅做以上步骤还不够,因为这只能保障坐标数据点位置相对于整个坐标系统而言,不会出现太大视觉误差,但是现在问题是这个图形对象中有两套不同度量,所以必须声明不同

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ggplot2优雅自定义文本颜色

❝今天来主要介绍如何在不引入外部几何对象前提下在图形原有的基础上「自定义修改文本颜色」,也许恰好您正好有此特殊需求,希望对各位观众老爷有所帮助;下面来看具体案例; ❞ 加载R包 library(tidyverse...0.5,color="grey", arrow = arrow(length = unit(0, "npc"),type="closed")) ❝可以看到此处我们使用「...geom_text」在图形内部添加文本并定义颜色,那如果我们要在图形外部修改文本颜色该如何操作,当然有更加简单方法请往下看 ❞ 构建数据 df % arrange(id) %>...,下面我们就在此基础上修改Y文本颜色 统一个数 x_cols <- rep(c("#EDB749","#3CB2EC","#9C8D58","#4A452A"),each=11) p + theme...当然上述操作ggplot2会显示如下警告信息,是不是发现了什么;感觉挺有趣 ❝Warning message: Vectorized input to element_text() is not

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Laya 缩放实现

Laya 缩放功能实现 在 laya 实现滚轮对选中对象缩放,涉及到以下两个模块: 事件 容器坐标 1. 事件 在 Laya , Event 是事件类型集合。...这样可以避免同一个对象多次绑定问题, 在 laya ,事件管理器是允许同一个对象同一个方法事件进行多次绑定,这样容易造成许多意向不到 bug, 所以务必 只在使用时进行绑定,用完立马解除绑定...向右为 x 正向,向下为 Y 正向。所有容器创建时坐标原点默认为 (0,0), 此处需要注意: 所有容器原点坐标都是相对于其父容器原点坐标,是局部坐标,而非全局坐标。...因此,对象在容器坐标为局部坐标,转换为全局需要逐层向父容器变换,知道跟容器 Stage 为止。 同时要注意: 在移动、缩放对象时不要改变对象坐标,改变容器坐标,实现对象改变。...// 对容器对象进行缩放 ///-------------- Scale Drawing Sprite -------------------------- public static MouseWheel

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R语言ggplot2作图时候给坐标添加文本π

image.png 今天用ggplot2作图y标题想实现上图红框里形式,查了一下如何实现 记录一下代码 首先是构造一份数据集 df<-data.frame(x=1,y=1) R语言ggplot2...散点图并添加文本 library(extrafont) fonts() library(ggplot2) ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_text(label=...stackoverflow.com/questions/34892262/subscripts-and-superscripts-or-with-ggplot2-axis-labels-ionic-chemical 欢迎大家关注我公众号...小明数据分析笔记本 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己学习笔记

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R tips:调整ggplot2坐标或legendlabel长度

由于dotplot绘图图像是一个ggplot2对象,其实使用scale系列函数就可以达到目的。...有的时候,ggplot2图是经过坐标变换,如使用coord_flip进行x、y反转。此时竖直坐标实际上是x,需要使用scale_x系列函数控制。...,有些时候过长labels是出现在legend,而且str_wrap只在有空格地方才会折叠,那么一个很长没有空格字符串需要如何处理才能折叠?...首先在legend也是同样处理,只不过根据此legend映射美学不同而选择不同scale函数:如scale_color、scale_fill、scale_size等等。...= TRUE) 这个图直接使用scale_color_discrete进行修改是不会有任何改变,因为这个图color映射并不是ggplot2默认情况,而是使用ggraphgeom_edge

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隐藏在PC秘密

经过一番努力,我们找到一篇2017年预印2019年见刊NCB文章: ? 文章摘要: 在脊椎动物,位于咽部中胚层心肌细胞和鳃状头部肌肉多能祖细胞,心肺多能和头部肌肉命运选择仍然不清楚。...在第二种心脏谱系,Tbx1/10-Dach通路积极地抑制第一种心脏谱系程序,调节以后跳动心脏细胞多样性。最后,Ciona和小鼠跨物种比较揭示了脊索动物心咽网络深层进化起源。...PC基因,并判断出每个PC潜在生物学意义,如PC5 作者写道:Another batch effect。...然后,有batchPCs用RegressOut回归掉(这个函数在V3放到了 ScaleData参数vars.to.regress ,在R?Seurat::ScaleData)。...下面我们用Seurat V3+ 来做一个发现PC秘密演示,首先我们还是清出我们R包和老朋友pbmc3k数据集。

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Numpy转置对换

需要注意是只有二维数组(矩阵)以及更高维度数组才能够进行转置操作,对Numpy一维数组进行转置操作是没有用。...在Numpy既可以使用一维数组表示向量,也可以使用二维数组矩阵形式表示向量。...对比一下会发现,第一个元素位置和最后一个元素位置发生了改变。 d swapaxes函数 Numpy还有一个swapaxes函数,它需要接受一对编号。...0,2)) ▲输出结果 这里为了方便都将第一个和最后一个进行转置,三种转置方式得到结果是一样,不过可以看出swapaxes是以为单位,并且只能传入两个参数。...▲二维数组 对于三维数组来说,三个分别为axis 0,axis 1,axis 2,这些就这些转置操作所变换对象。 ?

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ggplot2ylim

​在ggplot2很容易出现一个修改坐标范围问题,喜欢用ggplot2画图需要注意一下。...ylim和coord_cartesian都是调整坐标范围,但是它们结果是有可能不一样,看下面的一个例子: data(diamonds) p <- ggplot(data = diamonds, aes...image 截取0到60部分: ? image 可以看到第二张图跟原图是不一样,比如Fair第一个box原数据最高是超过60,但是截取之后不到60了。这是一个不太容易注意到坑。...这里是因为ylim是直接处理数据导致,比如例子不在范围数据就直接被移除。同等操作应该用coord_cartesian来实现。...coord_cartesian指定参数控制图形特定区域放大显示,只影响图形展示,不影响内部数据值。即使用原数据作图,再对图形进行变动。

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R高级|cowplot包拼图(4):ggdraw和draw_*

x、y、hjust、vjust:分别设置所画图片坐标x和y,以及与x、y相对关系,hjust>0,表示在y左边,yjust>0,表示在x上边。...scale:图片等比例缩放,默认为1,表示图片不缩放 width和height:设置图片宽度和高度 下面详细介绍一下plot参数。...plot参数可以是一个ggplot2图片,也可以是一个align_plots后list,但是两者有区别的:ggplot2图片是可以和其它ggplot2参数合用,但是align_plots产生list...图A是ggplot2图片,放大y标题 ggdraw()+ draw_plot(A+ theme(axis.title.y = element_text(size = rel(...read_image读取图片,然后使用ggplotify包as.ggplot命令将图片转成ggplot2图片,最后连续使用draw_plot画出 #读取本地图片 library(magick) logo

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SharePoint 时间 Timeline实现

客户需要在OA实现每日动态功能,能够记录每一位员工每天工作动态,我很快想到了时间,因为时间能很直观现实员工每一刻动态。就像FacebookTimeline效果(点击查看)。...成果演示 最终效果如下所示: 点击每个员工姓名,即可进入他当天工作动态(只能看),若点击自己名字(既能看又能发送/编辑/删除动态),如下所示: ? 动态详细页,如下所示: ?...点击时间,即可新增动态,如下所示: ? 编辑效果,鼠标移至内容区域,现实黄色提醒,如下所示: ? 单击即可显示编辑界面,如下所示: ? 移开鼠标,即可自动保存。...实现原理 关于效果实现原理可以参考这篇文章。 了解了上面提到这篇文章之后(Masonry.js),接下来就是Sharepoint 客户端对象模型实现了,比如Ecmascript。 ...List,对于List,他能负担item个数和一从数据库里获取item都是有限制,对于数据量很大情况下,是有风险

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ggplot2 | 关于标题,坐标和图例细节修改,你可能想了解

在使用ggplot2初步绘制(ggplot2|详解八大基本绘图要素)出需要展示图形后,还需要对标题,坐标ggplot2|theme主题设置,详解绘图优化-“精雕细琢”)和legend(ggplot2...本文针对性介绍下如何对标题,坐标和legend进行修改和设置,算是之前几篇推文一些补充。...注意theme对应更改plot.title ,plot.caption 和 plot.subtitle p1 <- p + labs(title="学习<em>ggplot2</em>可视化",...3.1 设置坐标 使用labs函数 ,其中x y 即为对应坐标名字; p2 <- p1 + labs(x="X<em>轴</em>",y = "这是Y<em>轴</em>",title = "生信补给站") p2 3.2 设置坐标大小...ggplot2scale系列函数有很多,命名和用法是有一定规律

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ggplot2position参数解析

❝本节来回答一个老爷问题,介绍常见绘图案例几个基本参数设置问题,主要用在柱状图与箱线图中。下面小编通过两个案例来进行展示,图形仅供展示用过程仅参考,希望各位观众老爷能够喜欢。...position_dodge2(preserve = "single"))+ labs(x=NULL,y=NULL)+ theme(legend.position ="non") p1+p2+p3 ❝在上方代码可以看到...但它们之间有一些细微差别: ❞ 1. position = "dodge" 这是position_dodge()简写形式,它会自动计算需要dodge宽度。不能设置preserve参数。...3. position_dodge2() 这是position_dodge()一个扩展,提供了更多控制,preserve= "single":保持每个单独柱子宽度不变,而不是整个组。...使用position_dodge2(preserve="single"),如果A=1和A=2柱子高度不同,那么A=1两个柱子会比A=2两个柱子更接近,因为它们宽度被保留了。

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在Swift创建可缩放图像视图

在本教程,我们将建立一个可缩放、可平移图像视图来实现这一功能。 计划 他们说,一张图片胜过千言万语--但它不一定要花上一千行代码!对于我们缩放图像视图,我们要做是让它成为一个可缩放视图。...对于我们缩放图像视图,我们将利用UIScrollView缩放和平移功能。...基本上,我们将在UIScrollView嵌套一个包含图片UIImageView,它将处理所有我们扔给它缩放、平移(和点击!)手势。...设置滚动视图 我们需要实际设置我们滚动视图,使其可缩放和可平移。这包括设置最小和最大缩放级别,以及指定用户放大时使用UIView(在我们例子,它将是图像视图)。...添加这种额外功能可以真正帮助人们参与到你应用程序显示图片中,而且通常是用户所期望和要求功能。

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特征工程缩放和编码方法总结

特征工程又是数据预处理一个重要组成, 最常见特征工程有以下一些方法: 编码 缩放 转换 离散化 分离 等等 在本文中主要介绍特征缩放和特征编码主要方法。...特征缩放 特征缩放是一种在固定范围内对数据存在独立特征进行标准化技术。...在规范化只更改数据范围,而在标准化中会更改数据分布形状。...而在标准化,数据被缩放到平均值(μ)为0,标准差(σ)为1(单位方差)。 规范化在0到1之间缩放数据,所有数据都为正。标准化后数据以零为中心正负值。 如何选择使用哪种缩放方法呢?...虽然是这么说,但是使用那种缩放来处理数据还需要实际验证,在实践可以用原始数据拟合模型,然后进行标准化和规范化并进行比较,那个表现好就是用那个,下图是需要使用特征缩放算法列表: 特征编码 上面我们已经介绍了针对数值变量特征缩放

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Numpystack,,广播以及CNN介绍

在神经网络学习之Ndarray对象和CNN入门 ,主要介绍了Ndarray维度概念和CNN大体流程图,本文基于此介绍Ndarray中比较重要一个函数stack函数使用以及numpy广播,...@在python是函数装饰器,和Java注解是不一样。...概念 我在图中标注出了哪些是外边,哪些是第二个,哪些是最里边,有一个比较简单方法来判断这些,就是观察一下方括号,方括号数量越多,越是在外层,在这个例子,最外侧有两层方括号...,从外边数第二个有一层方括号,这里还好一点,最难理解是最里边,最后来看一下最内侧。...numpy广播 广播(Broadcast)是 numpy 对不同形状(shape)数组进行数值计算方式。 下面的图片展示了数组 b 如何通过广播来与数组 a 兼容。

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