首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

(数据科学学习手札55)利用ggthemr来美化ggplot2图像

一、简介   R中ggplot2一个非常强大灵活数据可视化包,熟悉其绘图规则后便可以自由地生成各种可视化图像,但其默认色彩和样式很多时候难免有些过于朴素,本文将要介绍ggthemr包专门针对原生...二、基础内容 2.1 安装   不同于常规R包,ggthemr并没有CRAN上发布,因此我们需要使用devtools中install_github()直接从github上安装它,参照github...实际上我们通过上述语句已经将ggthemr压缩包下载到本地如上图所示,所以我们可以很容易地使用手动安装本地压缩包形式来完成ggthemr安装(注意要吧.tar格式改为.tar.gz格式,我想这可能...这个语句,便可傻瓜式地载入各种精美的自适应绘图主题,ggthemr中也有类似的功能,我们利用ggplot2创建图像语句之前,加上ggthemr('主题名称'),便可简单套用多种内建主题,下面几个简单例子...可以看到,密度图中色彩预设红色与绿色之间过渡; 3.2 ggthemr()其他关键参数   前文中我们使用函数ggthemr()来挂载主题,而除了最关键主题参数之外,ggthemr()还有若干控制其他图像样式参数

93530

R:色盲友好配色方案viridis

之前投文章时候,审稿人意见有一条说图颜色对色盲读者不太好。 我确实还从来没有考虑过这个问题,给审稿人点个赞~ 之后又用ggsci()重新调了一下颜色返回了。...举个例子,这是一些正常人眼中配色: ? 绿色色盲眼中会变成这样,ggplot配色看起来就差不多完全一样了: ? 蓝色色盲眼中会变成这样: ?...viridis能和ggplot完美结合使用: 离散颜色可用scale_color_viridis() ;连续颜色可用scale_fill_viridis()。...# link: https://cran.r-project.org/web/packages/viridis/vignettes/intro-to-viridis.html # 安装 install.packages...("viridis") library(viridis) # 连续颜色可用scale_fill_viridis(): library(ggplot2) ggplot(data.frame(x =

6.1K30
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

R 语言绘制热图 10 种方法

R 语言里面可以用来绘制热图主要包括: 今天将按照这个顺序依次为大家分享它们绘图方法。 一、基础安装 heatmap 函数 所谓基础安装,即下载安装 R 语言后即可使用包。...就可以查看变化;(3)热图绘制一般输入矩阵,而 R 默认输入格式数据框,因此需要转化。...要使用非基础安装里面的包,就需要安装并加载这个包,代码如下: 要查看一个包或者一个包里面函数详细介绍,代码为: 与 heatmap 类似的,pheatmap 也可以同时绘制热图和系统树图,同样需要矩阵格式原始输入...但是 pheatmap 完美地解决了这一问题,看图 3 右上角,我们可以看到一个颜色和相对数值对应关系。与这一呈现相关参数:legend = TRUE, 默认设置保留 legend。...,这幅图看起来普普通通,但是神奇之处当你鼠标落到任一色块,可以显示当前色块数值。

24K402

绘制让人眼前一亮美图--你需要这个!

背景介绍 我们日常科研绘图中,经常会使用ggplot2绘图,这也给我们带来很大方便,但是设置主题时候,要想得到一个完美的颜色,还是需要大量代码去实现,要想实现自由搭配还是比较麻烦,这时候小编要给大家介绍一个主题配置神器...ggthemr发布github上开源ggplot插件包,可以方便快捷配置各种风格主题,并且改变字体类型、大小,图例、坐标轴、背景等各种元素。...R包安装 与常规R包不同,ggthemr没有发布CRAN上,因此我们需要使用devtools中install_github()从github上安装: devtools::install_github...我们可以使用如下命令清除主题并返回到ggplot2默认设置: ##清除主题 ggthemr_reset() 由于ggplot2函数会存在一些bug,绘图时候可能会返回错误(如:颜色名称未知),我们可以通过调用...做了一个初始化函数,初始化主题时候,该主题就已经替换掉了ggplot使用主题方案,而不需要我们去设置scale_()或者theme_()这些参数,这极大方便了我们使用ggplot2,作图效率立马提升好几个层次

1.3K20

体验R和python不同绘制风格

下面ggplot2绘图体系一些关键概念: 数据:ggplot2使用数据框作为数据输入基本单位。数据框一个二维表格,其中每一列代表一个变量,每一行代表一个观察值。...映射(Mapping):映射将数据变量与图形属性进行关联过程。例如,将数据x轴映射到图形横坐标,将数据颜色映射到图形填充颜色。...它提供了许多用于绘制统计图表高级函数,如散点图、直方图、小提琴图和回归图等。 美观默认样式:Seaborn具有吸引人默认绘图样式和颜色主题,使图表在外观上更具吸引力。...定制化能力:虽然Seaborn提供了美观默认样式,但用户仍然可以轻松地自定义图表各个方面,包括颜色、线型、标记、标题等,以满足特定需求。...那我们接下来体验一下使用Rggplot2和Pythonmatplotlib绘制一张饼图吧!

14910

填满Github绿色格子用我做VSCode插件-Auto Commit

功能特性 选择多个日期范围:一次操作即可提交不同日期 commit 控制每个日期commit次数: 可以用它来控制绿色格子颜色,了解commit次数与颜色 随机commit次数:随机commit次数让我们提交看起来更加逼真...如下图,你甚至可以规划一下 commit次数,然后画出图形, 天空才是你极限。 ? 自动commit演示: ? 安装 Vscode 扩展商店中搜索 AutoCommit,点击安装即可。...需要提交到* master*分支上 如果提交到其他分支,提交记录不会显示绿色格子里面,合并分支之后 才会显示绿色格子里面。...如下图所示配置(日期覆盖情况),最后结果: 12/01~12/06 使用默认commit次数,每天将会提交一次 12/07~12/08 每天提交三次 12/09~12/19 每天提交四次 ?...插件提供了一个配置项让你可以修改commit信息将要存储文件。 commit信息 每次提交需要有一个commit信息,插件默认 autoCommit, 你可以界面修改它。

1.3K20

『Ant Design』主题定制

在上一篇文章中介绍使用时,我们使用 Button 与 Switch 默认主色调都是蓝色,但是企业开发中,自己公司项目,往往都有自己主题色,这时候我们就需要对『Ant Design』主题进行定制...这包括全局样式,比如主题颜色、圆角和边框样式,还有特定组件外观定制。简而言之,你可以轻松地让 Ant Design 看起来符合你品牌和业务独特需求。...菜单中,刚好我们项目通过这种方式创建,在这个菜单中告诉我们有一个高级配置: 高级配置中介绍到对 create-react-app 默认配置进行自定义,这里我们使用 craco,那么 craco...我这里创建了一个全新 React 项目,可以基于上篇文章创建方式创建,并且自行安装 Ant Design, 其实可以直接将上篇文章项目拷贝一份改个名字即可: 之前我们 App 组件中,我们引入了一个...再来一个,我将 Link Button 也改为绿色,这个好像是文字颜色,再去官方文档找找有没有更改文字颜色 Token 名称,然后我文档中搜索了一下没有找到,我利用猜想加编辑工具提示找到了我想要

37050

教你如何填满过去一年Github绿色格子-Auto Commit

次数:随机commit次数让我们提交看起来更加逼真。...仓库地址: autoCommit 自动commit演示: [autoCommit.gif] 安装 Vscode 扩展商店中搜索Auto Commit,点击安装即可。...需要提交到master分支上 如果提交到其他分支,提交记录不会显示绿色格子里面,合并分支之后 才会显示绿色格子里面。...[commit颜色] 插件运行机制相关 随机commit次数 默认开启,默认为1~10随机,时间范围内默认每个日期随机commit几次,如果单个时间段设置了commit次数将使用设置次数。...commit信息 每次提交需要有一个commit信息,插件默认autoCommit, 你可以界面修改它。 运行日志 插件运行日志,倒序展示,如果提交量比较大,支持在运行期间清空日志。

3.3K31

Learn R 画图1-3

require(patchwork))install.packages("patchwork",update = F,ask = F) #加载以检查是否安装成功 >library(ggplot2) >library...参数,具体颜色···手动设置 Q2 区分color和fill两个属性 Q2-1 空心形状和实心形状都用color设置颜色 > ggplot(data = iris)+ + geom_point...2.尝试修改点颜色为暗绿色(darkgreen)、灰色、红色 ggplot(data = test)+geom_point(mapping = aes(x=a,...replace = T) #sample(letters[1:5],150,replace = T) #sample()函数意思随机抽样,默认replace = F即不放回取样,无重复值 ggplot...,stat开头统计变换函数 #x=cut将cut作为横坐标,默认统计数为纵坐标,不用写y= 统计变换使用场景 #5.1.不统计,用表里数据直接做图 fre = as.data.frame(table

71200

SCI写作:色盲友好色板

这些色盲患者和我们一样工作各种领域,论文送审中也可能会遇到色盲审稿人。假如论文送给三位白人男性审稿人,其中至少一人色盲概率高达22%。...因此,为论文图片选取一种对色盲友好配色方案很重要,能确保准确展示我们研究成果,同时体现了人性关怀。...相对于普通人群,红绿色盲患者对红色和绿色分辨能力很差,但对黄、蓝色辨别则没有问题。...因此,配色应尽量避免红绿对比,更多使用黄蓝对比为好,绿色可以作为过渡色。...R语言中,有一些配置好色盲友好色板,例如在ggplot2中常用viridis色板,其使用方法如下所示: library(ggplot2) library(gcookbook) ggplot(uspopage

1.5K20

R语言ggplot2科研数据作图配色一些小技巧

以下正文内容 大家好,在这里给大家介绍一下使用ggplot2绘图调色几种小方法。正所谓绘图十分钟,调色一小。图片配色直接决定了图片质量好坏。下面讲一下我平时绘图用到调色工具。...首先是创建一份数据集 data <- data.frame( name=letters[1:9], value=sample(seq(10,20),9)) data 使用ggplot2默认配色做一个简单柱形图...image.png 1 对应应该是sequential 2 对应 qualitative 3 对应diverging 生成颜色值我们需要使用brewer.pal()函数,这个函数又两个参数,第一个参数调色板左侧名字...image.png 很喜欢这张柳白大战昊天照片,喜欢柳白一往无前大河剑气(视频截图,原视频颜色看起来很纯净),现在我想把剑气颜色放到我绘图中,该怎么办呢?...image.png 颜色提取完了,不过我最想要白色没提取成功,可能和图片太糊有关。图片里颜色不能直接复制,我就不试效果了。大家如果知道怎么把这些颜色代码导出来可以评论区里说一下,谢谢。

8.7K22

相关矩阵可视化-神颜R包!

导语 GUIDE ╲ ggcorr一个可视化函数,可以用于将矩阵绘制为ggplot2图片 背景介绍 进行生物信息学分析过程中,经常需要通过计算得到一些连续变量相关性矩阵,这种相关系数可以通过...今天小编就将给大家分享一个精美的R语言绘制相关系数矩阵软件包:ggcorr。ggcorr函数主要用于绘制相关矩阵图,它主要依赖包ggplot2。...ggcorr安装 ggcorr可以通过安装GGally包来获得 ###下载安装### install.packages("GGally") library(GGally) library(ggplot2...相关系数中断处显示位数,默认为2 name = "",##图例名称 low = "#3B9AB2",##低相关系数颜色 mid = "#EEEEEE",##中相关系数颜色 high...## head(data) 首先使用ggcorr函数对每一列之间绘制相关性图 ggcorr(data) ##在这里我没有定义第二个参数,函数默认使用pearson计算 默认情况下,出图色标渐变色,

1.5K30

R语言之可视化⑤R图形系统目录

R base graphs R带有简单函数来创建许多类型图形。 例如: ? 大多数情况下,您可以使用以下参数来自定义绘图: pch:改变点形状。 允许值包括1到25之间数字。...安装软件包后,使用R命令install.packages(“lattice”)。格子包中主要功能: ? 创建y乘以x基本散点图。 语法:y~x。...ggplot2图形 GGPlot2一个功能强大且灵活R软件包,由Hadley Wickham实现,用于逐件生成优雅图形。...对于初学者来说,ggplot2语法可能看起来不透明,但是一旦理解了基础知识,就可以创建和自定义任何类型图表。 ?...ggplot2包中主要功能ggplot(),它可用于使用数据和x / y变量初始化绘图系统。

1.7K50

2023.4生信马拉松day6-绘图

require(patchwork))install.packages("patchwork",update = F,ask = F)#加载以检查是否安装成功library(ggplot2)library...(不常用)手动设置可以指定属性包括:颜色color——可指定参数字符串型颜色名称,“blue”,“red”;填充颜色fill,跟color可选范围相同;大小size——单位mm;透明度alpha...参数,输入不带引号列名;手动设置 colorgeom_point参数,要求是带引号颜色名称;手动设置设置多个颜色非常出力不讨好,跟数据关联起来了再指定颜色就好;映射也可以手动修改映射到颜色而不必使用默认分配颜色...,具体操作为用scale_color_manual(values = c("blue","grey","red"))来指定;注:其中颜色不仅可以用“blue”这样名字来指定,还可以使用十六进制颜色代码来指定...library(ggpubr)ggscatter(iris,x="Sepal.Length", y="Petal.Length", color="Species")#ggplot2

1K30

Jelys Note之生信入门class4

用plot()函数画图,对于x如何生成,如何赋值无关!!】plot(iris[,1],col = iris[,5])iris按第一列数据来画图、iris第五列来分配颜色、col颜色!...画图很多东西都是默认3.函数自定义【!...多个函数打包存放:包含函数、数据、帮助文件、描述文件(2)为什么要装R包【不断更新】具有特定分析功能5.R包使用规律(1)R包在哪?及安装代码【怎么安装,就按什么网站来】· CRAN网站!...下载方法· 方法1【代码脚本里】· 方法2【每次使用都要运行,一次性】options("repos"=c(CRAN=""))options(BioC_mirror="xxxx")(4)R包安装使用逻辑函数存在于...(5)R包使用逻辑包名::函数名可以快速调用里面的函数(6)R包使用场景某流程代码中用到某些包学绘图,用到ggplot2别人代码套自己数据,报错不会改

18320

(数据科学学习手札37)ggplot2基本绘图语法介绍

刚开始上手时候可能稍有难度(而且官网帮助内容比较不友好),而本文也是我日常使用和与别人交流中摸索和总结出来,将对ggplot2绘图语法和绘图部件进行介绍,并附以常用一些图形示例;   下面我们就来探索...更多几何图像   上述散点图只是qplot中参数geom默认参数point(当x与y都有传入值默认值,只有x传入时hist图),这个参数用来控制图形类型,值得一提,他几乎涵盖了所有的图像类型...xlab,ylab:设置x轴与y轴名称 三、ggplot2图形图层语法   图形图层语法ggplot2语法基础,它使得图形重复更新变得更简单灵活,遇到新问题也许只需要照搬之前堆砌成一个优美图形全部代码再稍加修改即可直接使用...中绘图,有两种方式:一qplot中一步到位配置好所有的参数以产出所需图像;另一种利用ggplot逐层定义绘图部件,并用加号连接,保存到一个对象里,再使用print这个对象方法将其呈现在屏幕上...,该函数有两个主要参数,对应了数据和图形属性映射,这两个参数将作为接下来绘图默认参数,直到新加图层中设定了新参数,默认值才会被修改‘;其中,数据指定绘图所使用默认数据框且必须数据框;映射设定则与

6.8K50

Capture One最新中文版下载Capture One软件安装

无广无毒绿色安装包 首先,这些软件都是自己慢慢一点点收集过来,当然有的也是花了价钱去买,我自己也是从你们现在情况走过来,到处找免费安装包下载,下载完了,要么没用,要么使用不了,要么各种捆绑软件,...安装包 无广告 无套路 绿色无捆绑 换杯奶茶钱 ,白嫖党请绕道,需要一件三连 留言! 安装包自取:(下方图片保存放大即可) Capture One特色 1、再次提升用户体验。...用户可以更快浏览、缩放、移动镜头,即使 100% 视图中也能快速切换图像。此外,全新默认工作空间为新用户打造更直观体验,并且提供入门示范; 2、三步图像锐化流程带来更强大控制能力。...全新镜头工具选项可以修正衍射造成清晰度降低问题; 用户定义创意锐化功能(利用全新光环抑制滑块和混合算法)让摄影师可以选择锐化整张图片或只是图片中多个元素; Capture One中文版可以独有工具中进行用户定义输出锐化...这种全面集成面板为图像编辑提供真正意义上全新界面,让用户可以进行细化颜色和图像调整,允许同时快速输入多条命令,还能让用户在编辑器“感受到”应用程序输入信号查看主显示屏。

1.1K00
领券