首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

高分辨率系统发育微生物群落剖析

摘要:在过去十年中,在微生物群落分析方面,短读长高通量16S rRNA基因扩增子测序,已经使克隆依赖性长读长Sanger测序黯然失色。过渡到新技术提供了更多的定量信息,牺牲了分类分辨率,其具有推测各种生态系统中的代谢特征的意义。我们应用单分子实时测序进行微生物群落分析,获得全长16S rRNA基因序列的高通量,我们建议命名为PhyloTags。我们进行了基准测试,并通过应用到特定的微生物群落验证了这种方法。当进一步应用于来自Sakinaw湖的水柱样本时,我们发现,尽管门水平上,PhyloTag和Illumina V4 16S rRNA基因序列(iTags)群落结构的分析结果之间是可比较的,方差随着种群复杂性和水深的变化而增加。但是PhyloTag还允许较少的模糊分类。最后,关于平台的比较,PhyloTags和silicon产生的部分16S rRNA基因序列显示出群落的结构和系统发育分辨率跨多个分类级别的显著差异,包括严重的低估涉及氮和甲烷的特定微生物属的丰度,在湖泊的水柱。因此,PhyloTag提供了可靠的具有成本效益iTags的补充(adjuction)或替代方案,可实现更准确地对系统发育微生物群落的分解代谢潜力进行预测。

05

Kali Linux 网络扫描秘籍 第三章 端口扫描(一)

由于 TCP 是更加常用的传输层协议,使用 UDP 的服务常常被人遗忘。虽然 UDP 服务本质上拥有被忽视的趋势,这些服务可以枚举,用来完全理解任何给定目标的工具面,这相当关键。UDP 扫描通常由挑战性,麻烦,并且消耗时间。这一章的前三个秘籍会涉及如何在 Kali 中使用不同工具执行 UDP 扫描。理解 UDP 扫描可以用两种不同的方式执行相当重要。一种技巧会在第一个秘籍中强调,它仅仅依赖于 ICMP 端口不可达响应。这类型的扫描依赖于任何没有绑定某个服务的 UDP 端口都会返回 ICP 端口不可达响应的假设。所以不返回这种响应就代表拥有服务。虽然这种方法在某些情况下十分高效,在主机不生成端口不可达响应,或者端口不可达响应存在速率限制或被防火墙过滤的情况下,它也会返回不精确的结果。一种替代方式会在第二个和第三个秘籍中讲解,是使用服务特定的探针来尝试请求响应,以表明所预期的服务运行在目标端口上。这个方法非常高效,也非常消耗时间。

03
领券