AWK是一个强大的文本分析工具,相对于grep的查找,sed的编辑,awk在其对数据分析并生成报告时,显得尤为强大。简单来说awk就是把文件逐行的读入,以空格为默认分隔符将每行切片,切开的部分再进行各种分析处理。
awk是一种编程语言,用于在linux/unix下对文本和数据进行处理。数据可以来自标准输入、一个或多个文件,或其它命令的输出。它支持用户自定义函数和动态正则表达式等先进功能,是linux/unix下的一个强大编程工具。它在命令行中使用,但更多是作为脚本来使用。awk的处理文本和数据的方式是这样的,它逐行扫描文件,从第一行到最后一行,寻找匹配的特定模式的行,并在这些行上进行你想要的操作。如果没有指定处理动作,则把匹配的行显示到标准输出(屏幕),如果没有指定模式,则所有被操作所指定的行都被处理。awk分别代表其作者姓氏的第一个字母。因为它的作者是三个人,分别是Alfred Aho、Brian Kernighan、Peter Weinberger。gawk是awk的GNU版本,它提供了Bell实验室和GNU的一些扩展。下面介绍的awk是以GUN的gawk为例的,在linux系统中已把awk链接到gawk,所以下面全部以awk进行介绍。
awk是专门为文本处理设计的编程语言,是一门数据驱动的编程语言,与sed类似都是以数据驱动的行处理软件,主要用于数据扫描、过滤、统计汇总工作,数据可以来自标准输入、管道或者文件。
在学习awk之前我们应该都学过sed,grep,tr,cut等等命令,这些命令都是为了方便我们对Linux下文本和数据的处理,但是我们会发现很多时候这些命令并不能一下子就完全解决我们的需求,很多时候我们都需要使用管道符结合这些命令来使用,今天我就给大家介绍一个命令awk,他就能很好的解决我们对文本和数据处理的需求,使我们一条命令就解决很多问题。
http://blog.csdn.net/richerg85/article/details/44001501
Lua并不使用POSIX规范的正则表达式[4](也写作regexp)来进行模式匹配。主要的原因出于程序大小方面的考虑:实现一个典型的符合POSIX标准的regexp大概需要4000行代码,这比整个Lua标准库加在一起都大。
awk是一个处理文本的编程语言工具,能用简短的程序处理标准输入或文件、数据排序、计算以及生成报表等等。 在Linux系统下默认awk是gawk,它是awk的GNU版本。可以通过命令查看应用的版本:ls -l /bin/awk 基本的命令语法:awk option 'pattern {action}' file 其中pattern表示AWK在数据中查找的内容,而action是在找到匹配内容时所执行的一系列命令。花括号用于根据特定的模式对一系列指令进行分组。 awk处理的工作方式与数据库类似,支持对记录和字段处理,这也是grep和sed不能实现的。 在awk中,缺省的情况下将文本文件中的一行视为一个记录,逐行放到内存中处理,而将一行中的某一部分作为记录中的一个字段。用1,2,3...数字的方式顺序的表示行(记录)中的不同字段。用$后跟数字,引用对应的字段,以逗号分隔,0表示整个行。
这里我使用 Schizosaccharomyces pombe 这个物种的蛋白数据做例子,搜了一下拉丁名好像是裂殖酵母。
原文链接:http://tecdat.cn/?p=5124 包含关键词“生物信息学”的推文示例 第1步:加载所需的软件包 # 加载所需的软件包 library(igraph) 第2步:收
与其他几种脚本语言不通,Lua语言既没有使用POSIX正则表达式,也没有使用Perl正则表达式来进行模式匹配。之所以这样做的主要原因在于大小问题:一个典型的POSIX正则表达式实现需要超过4000行代码,这比所有Lua语言标准库总大小的一半还大。相比之下,Lua语言模式匹配的实现代码只有不到600行。尽管Lua语言的欧式匹配做不到完整POSIX实现的所有功能,但是Lua语言的模式匹配仍然非常强大,同时还具有一些与标准POSIX不同但又可与之媲美的功能。
目录 Awk是什么 命令行语法 脚本(Script)组成 模式(Pattern) 正则表达式(Regular Expression) 表达式(Expressions) 数组 内置变量 删除ARGV元素
作业参考的文献:Integrated analysis reveals five potential ceRNA biomarkers in human lung adenocarcinoma
GitHub - Precancer/SCC: Immune evasion before tumor invasion in early squamous lung cell carcinogenesis[1]
四、循环结构1-while循环 假如要你在屏幕上重复输出10次Hello World,你会怎么做?简单,把下面的代码拷贝10份就行了。 1 printf("Hello World\n"); 没错,把上次代码写10遍,确实能实现功能。但是这样的代码太垃圾了,有很多的重复的代码,这样会使得代码非常地臃肿,复用率低。因此,不建议这么做。 下次遇到像上面那样重复执行某个操作时,首先要想到的应该是循环结构。所谓循环,就是重复执行某一个操作,C语言中有多种方式可以实现循环结构。先来看看while循环。 1.形式 1 while ( 条件 )
awk的工作过程是这样的:按行读取输入(标准输入或文件),对于符合模式pattern的行,执行action。当pattern省略时表示匹配任何字符串;当action省略时表示执行'{print}';它们不可以同时省略。 每一行输入,对awk来说都是一条记录(record),awk使用$0来引用当前记录:
Awk、sed与grep,俗称Linux下的三剑客,它们之前有很多相似点,但是同样也各有各的特色,相似的地方是它们都可以匹配文本,其中sed和awk还可以用于文本编辑,而grep则不具备这个功用。sed是一种非交互式且面向字符流的编辑器(a “non-” stream- editor),而awk则是一门模式匹配的编程语言,因为它的主要功能是用于匹配文本并处理,同时它有一些编程语言才有的语法,例如函数、分支循环语句、变量等等,当然比起我们常见的编程语言,Awk相对比较简单。
现有如下文本,格式如下:即左边是随机字母,右边是随机数字, 即将相同的字母后面的数字加在一起,按字母的顺序输出
本文介绍了如何利用awk命令对日志文件进行统计分析。主要包括三个方面的内容:1.利用awk命令统计日志中IP地址出现次数;2.利用awk命令统计日志中访问来源;3.利用awk命令统计日志中访问站点。
while语句,提供了编写通用循环的一种方法,而for语句是用来遍历序列对象内的元素,并对每个元素运行一个代码块。break,continue用在循环内,跳出整个循环或者跳出一次循环。 一、while循环 1、一般格式 格式:首行以及测试表达式,有一列或多列缩进语句的主体以及一个选用的else部分(控制权离开循环时而没有碰到break语句时会执行) python会一直计算开投的测试,然后执行循环主体内的语句,直到测试返回假值为止。 while <test>: <statements1> else: <statements2> 2、例子 >>> while True: ... print "Type Ctrl+C to stop!" >>> while x: ... print x, ... x=x[1:] ... diege iege ege ge e 注意 print末尾的逗号,会使所有输出都出现在同一行。 >>> a,b=0,10 >>> while a<b: ... print a, ... a+=1 ... 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Python并没有其他语言中所谓的"do until”循环语句,不过我们可以在循环主体底部以一个测试和break来实现类似的功能。 while True: do something if exitTest():break 3、对比shell的while语句 while 命令 do 命令1 命令2 done 在系统管理时常用与逐行读取一个文件并处理。 while read line do echo $line done < /etc/rc.conf shell中还有一个类似while的循环until until 条件 do 命令1 命令2 done EG: IS_ROOT=`who |grep root` until [ "$IS_ROOT" ] do echo 'root online' sleep 2 done 二、 break continue pass和循环的else break 跳出最近所在的循环(跳出整个循环语句) continue 跳到最近所在循环的开头处(来到循环的首行,跳过本次循环) pass 什么事也不做,只是空占位语句 循环else块 只有当循环正常离开时才会执行(也就是没有碰到break语句) 1、一般循环格式 加入break和continue语句后,while循环的一般格式如下: while <test>: <statements1> if <test2>:break if <test3>:continue if <test4>:pass else: <statements2> break和continue可以出现在while(或for)循环主体的任何地方,但通常会进一步嵌套在if语句中,根据某些条件来采取对应的操作。 2、列子 pass >>> while 1:pass ... pass可用于空类,有时有指的是"以后会填上”,只是暂时用于填充函数主体而已: >>> def func1(): ... pass continue continue语句会立即跳到循环的顶端,开始下一次循环。 >>> while x: ... x=x-1 ... if x%2!=0:continue ... print x, ... 8 6 4 2 0 这个例子中,如果是奇数就返回循环顶部,不会打印.是偶数就打印。 这个下面这个结果一样 >>> while x: ... x=x-1 ... if x%2==0: ... print x, ... 8 6 4 2 0 注意这两个例子的print位置,第一个print是属于while块的,测试不通过下执行,测试通过就回到循环顶端,第二个是属于if块的,只有测试通过才打印 >>> while x: ... x=x-1 ... if x%2==0: ... print x, ...break break语句会
由于时间较紧,且人手不够,不能采用分类方法,主要是没有时间人工分类一部分生成训练集……所以只能用聚类方法,聚类最简单的方法无外乎:K-means与层次聚类。 尝试过使用K-means方法,但结果并不好,所以最终采用的是层次聚类,也幸亏结果还不错……⊙﹏⊙ ---- 分词(Rwordseg包): 分词采用的是Rwordseg包,具体安装和一些细节请参考作者首页 http://jliblog.com/app/rwordseg。请仔细阅读该页提供的使用说明pdf文档,真是有很大帮助。 安装: P.S. 由于我是6
判断条件,1位true,0是flesh,成立时true,不成立flesh,not取反
在程序中,一组被重复执行的语句被称为循环体,能否继续重复执行,取决于循环的终止条件.由循环体及循环的终止条件组成的语句,被称为循环语句.
5)有两个命令能帮助我调试脚本:set -e 遇到执行非0时退出脚本,set-x 打印执行过程。
awk不仅仅是linux系统中的一个命令,而且是一种编程语言;它可以用来处理数据和生成报告(excel);处理的数据可以是一个或多个文件;可以是直接来自标准输入,也可以通过管道获取标准输入;awk可以在命令行上直接编辑命令进行操作,也可以编写成awk程序来进行更为复杂的运用。
执行printf("%d ",x[i][3-i]),打印出x[i][3-i],即x[1][2]的值
解释:i从1到100,每次增加一个,该共循环100次 注意:分号的位置;不能使用“+=”符号;每写一层循环,必须以end结尾
在C语言中,for语句和数组密切相关。为了帮助读者理解稍后for语句要用到的数组,这里先简要地介绍什么是数组。
八皇后问题描述:在一个8✖️8的棋盘上,任意摆放8个棋子,要求任意两个棋子不能在同一行,同一列,同一斜线上,问有多少种解法。
Lyric Analysis with NLP & Machine Learning with R
笔者寄语:情感分析中对文本处理的数据的小技巧要求比较高,笔者在学习时候会为一些小技巧感到头疼不已。
掌握了 Python 的数据类型、语句和函数,基本上就可以编写出很多有用的程序了。
这部分内容摘自百度百科。超几何分布是统计学上一种离散概率分布。它描述了从有限N个物件(其中包含M个指定种类的物件)中抽出n个物件,成功抽出该指定种类的物件的次数(不放回)。超几何分布中的参数是N,n,M,上述超几何分布记作X~H(N,n,M)
原文链接:https://blog.csdn.net/fightsyj/article/details/83615498
与定义基本数据类型变量不同,引用数据类型的变量定义及赋值有一个相对固定的步骤或格式。
截止到目前为止,python基础内容已经学习了50%左右,在学习编程过程中,我们不仅要学习python语法,同时也需要学习如何把自己代码写的更美观,效率更高。
其中pattern是要替换的字符,replacement是替换成的字符,x是对应的string或string vector。
如果你打算记录2014年的营业开支,并将开支按月归档,那么需要为每个月的开支都准备不同的文件夹,但是如果使用一个带12个隔层的文件夹会更方便。
当我们需要从文档中查找某个关键词时,就用到了子字符串查找技术。比如在某个数据库导出文档中想要查找所有用户的密码,想在一个学长给的word题库中查找你正在做的检测题的答案。就像上边这个表格,我们想要在字符串文本中查找模式所在位置,并返回这个位置给用户。这个功能是怎么实现的呢? 我们可以简单暴力的来实现,从头开始一个字符一个字符的比较字符串文本和模式,如果匹配失败,再从字符串文本的下一个位置开始跟模式从头比较,重复这个过程,如果成功,则返回模式在字符串中的起始位置。
前段时间看了一下awk的使用选项,字段变量,标准变量,操作运算符,正则表达式,数组和控制流,并且也附带着一些相关的案例,总的来说,在深入了解和使用AWK之后,还是带来了很多的便利,在处理文本的文件的时候提供了更多的思路和便捷,比如按需自定义打印文本显示格式,进行一些简单的数据处理,同时awk还有和shell,python,go一些编程语言类似的循环,条件,逻辑处理,以及一些内置的函数更方便的帮助在命令行完成一些文本处理工作。今天完成了awk剩余的一些知识点学习。
for file in $(ls html); do mv file bbs_{file#} # mv file(echo $file |sed -r ‘s/.*(.*)/bbs\1/’) # mv file(echo file |echo bbs_(cut -d_ -f2) done
给定一个仅包含数字 2-9 的字符串,返回所有它能表示的字母组合。答案可以按任意顺序返回。给出数字到字母的映射如下(与电话按键相同)。注意 1 不对应任何字母。
注意事项 1)开头加解释器:#!/bin/bash 2)语法缩进,使用四个空格;多加注释说明。 3)命名建议规则:变量名大写、局部变量小写,函数名小写,名字体现出实际作用。 4)默认变量是全局的,在函数中变量local指定为局部变量,避免污染其他作用域。 5)有两个命令能帮助我调试脚本:set -e 遇到执行非0时退出脚本,set-x 打印执行过程。 6)写脚本一定先测试再到生产上。
Python中的分支结构和循环结构是编写程序时常用的控制结构。在Python中,分支结构通过if、elif和else关键字来实现条件判断。在使用if语句时,程序会根据条件表达式的真假执行相应的代码块。
大家好,很高兴又能和你们见面。在上一篇的内容中我们探讨了while语句以及break和continue在while语句中的用法,今天的内容咱们将继续探讨第二个循环语句——for语句。
awk复习 awk 中使用外部shell变量 awk 中使用外部shell变量 A=44echo "ABCD" | awk -v GET_A=$A ’{print GET_A}’ 说明:-v选项用于定义参数,这里表示将变量A的值赋予GET_A。 有多少个变量需要赋值,就需要多少个-v选项。与之等价的:应用于脚本中: #! /bin/bash sort -n filename |awk -F ':' '{print $1}'|uniq >id.txt for id in `cat id.txt`; do
近日浏览LeetCode,发现了一道很有意思的小题目。当我尝试用Python解答的时候,居然动用了集合、map函数、zip函数、lambda函数、sorted函数,调试过程还涉及到了迭代器、生成器、列表推导式的概念。一个看似极为简单的题目,尽管最终的代码可以合并成一行,却几乎把Python的编程技巧用了一遍,真可谓“细微之处见精神”!通过这个题目,也许会让你从此真正理解了Python编程。
4种流程控制语句结构: if if -- else if -- elif --else if多条件
Python 支持for循环,它的语法与其他语言(如JavaScript 或Java)稍有不同。下面的代码块演示如何在Python 中使用for循环来遍历列表中的元素:
看到这个问题,我首先想到的是R和python。基础的爬虫无非是:构建URL、根据页面结构解析爬取关键信息、整理数据格式输出结果。
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