harmony基本原理 harmony应用主成分分析,将转录组表达谱嵌入到低维空间中,然后应用迭代过程去除数据集特有的影响 我在跑单细胞前单独学习harmony算法时就有这样的感悟: 感觉这种方法默认需要批次效应不是很大...,大到让同一类型细胞PCA却分的很开 使用harmony等算法去除单细胞样品差异得谨慎 这篇推文评论区也有类似的声音 使用harmony算法与否对GZMA在细胞分群中表达量无影响 原推文已有代码略 这周的推文是对一篇文献...所以这篇推文就是要看看harmony与否对作者文章中的结果有无影响 样本名称: 导入数据 标准化和降维分群 特征需要跟生物背景一致 这里很明显看到C1D1与其他两种样本存在差异 harmony...前后相同分辨率下UMAP降维分组会发生变化 这两幅Dimplot中 第一张,区别于harmony前的UMAP图,reduction参数被设置为了"harmony" 绘制UMAP前要有基本降维 绘制UMAP...所以我们需要根据不同细胞类型和样本降维聚类分组图来判断需不需要去除批次效应 ②harmony后可能导致的问题 使用harmony等算法去除单细胞样品差异得谨慎 ...
说到ArkTS就得说一下DevEco Studio的演变过程,在我写一篇关于鸿蒙的文章时,DevEco Studio才刚推出不久,当时所支持的语言是Java...
Harmony OS这片轻舟,还在努力渡过万重山,尤其是在消费类终端的鸿蒙OS,需要等待应用生态飞轮效应的出现。 那HarmonyOS是什么到底是什么呢,接下来介绍一下。...HarmonyOS 4的取得的进展 更个性的Harmony OS (后续OTA升级实现) HarmonyOS 4升级了很多功能,包括艺术主角、海报标题、全新Emoji 表情、全景天气壁纸和趣味主题等。
前言 关于Android的低功耗蓝牙,我做了很多介绍了,那么对于Harmony来说这一块我没有做过介绍,而实际中我确实做过一个Harmony的BLE项目,所以这里分享一些内容出来。...正文 在Harmony中进行Ble的蓝牙开发实际上和Android中类似,但是又有一些不同,因为Harmony的SDK还在不断的完善。...二、工程配置 ① 权限配置 Harmony中同样有权限这个概念,也需要配置静态权限和动态权限,只不过配置静态权限的地方不一样。...Harmony是在config.json中,里面的代码如下: { "app": { "bundleName": "com.llw.ble", "vendor": "example",...this.device = device; } } 这个Bean没有什么好说的,下面要做的就是列表Item的渲染,在Android中我们使用的是适配器Adapter,而在Harmony
(A)Harmony概率性地将细胞分配给cluster,从而使每个cluster内数据集的多样性最大化。 (B)Harmony计算每个cluster的所有数据集的全局中心,以及特定数据集的中心。...(C)在每个cluster中,Harmony基于中心为每个数据集计算校正因子。 (D)最后,Harmony使用基于C的特定于细胞的因子校正每个细胞。...Run Harmony 运行Harmony的最简单方法是传递Seurat对象并指定要集成的变量。RunHarmony返回Seurat对象,并使用更正后的Harmony坐标。...1/10 Harmony 2/10 Harmony 3/10 Harmony 4/10 Harmony 5/10 Harmony 6/10 Harmony 7/10 Harmony 8/10 Harmony...harmony_embeddings <- Embeddings(pbmc, 'harmony') harmony_embeddings[1:5, 1:5] ?
Harmony 应用开发的知识储备 前言 这里先说明一点,如果你对Android应用开发很熟悉,那么做Harmony应用开发也可以驾轻就熟,只不过在此之前你需要知道一些关于Harmony应用开发的相关知识...一、DevEco Studio版本 首先要了解Harmony应用开发的开发工具DevEco Studio。 ...二、手机版本 做Harmony应用开发如果在真机上时,我们需要了解的是鸿蒙手机的版本,这里的版本不是鸿蒙几点零版本,而是指的是开发API版本,这一点就很重要了,至于为什么,后面我再细说,那么我们怎么查看鸿蒙手机的...2.0.0 4 JS、Java 通过上表我们可以了解到DevEco Studio的编译SDK版本,支持的API版本和开发语言,至于更早的API版本其实知不知道没有太大关系,因为现在基本上最低都是Harmony2.0...目前HarmonyOS属于高速发展的阶段,每一个版本的更新内容都很多,一些功能也会逐步开放,如果如果你有条件的话,弄一个高版本API的手机,会让你开发起来事半功倍,因为你现在看到的Harmony官网主推的是
Unity,作为全球领先的实时3D内容创作工具,一直以其强大的功能和广泛的应用领域在全球范围内享有盛誉。如今,Unity中国版——团结引擎(Unity Chin...
(2)开放开发者平台及开源OS,引导主流App迁移,打造Harmony生态;(3)兼容Android apk;平滑且几乎无差异的视觉交互;......(1)Harmony OS 的内核是 Linux + 微内核 + 鸿蒙内核(开发中),Android 是基于Linux内核的。 (2)Harmony是面向全场景,分布式的OS。...(3)Harmony OS 可以按需裁剪(到十几M),运行在手机,电视,手表及其他loT设备。...(4)视觉方面,Android 开发使用Java + xml,Harmony开发不仅支持Java + xml,也支持js + css。...在这里要阐明AOSP,Google Mobile Service(GMS),Harmony OS 2.0 之间的关系。
强烈建议这个时候使用harmony进行整合 代码如下所示; library(harmony) seuratObj <- RunHarmony(sce, "orig.ident") names(seuratObj...@reductions) seuratObj <- RunUMAP(seuratObj, dims = 1:15, reduction = "<em>harmony</em>...compare,filename="before_and_after_inter.pdf") sce=seuratObj sce <- FindNeighbors(sce, reduction = "<em>harmony</em>...0.1) table(sce@meta.data$seurat_clusters) DimPlot(sce,reduction = "umap",label=T) ggsave(filename = '<em>harmony</em>_umap_recluster_by...pdf') DimPlot(sce,reduction = "umap",label=T, group.by = 'orig.ident') ggsave(filename = '<em>harmony</em>_umap_sce_recluster_by_patients.pdf
这里简单的介绍 不考虑批次直接Merge 以及 使用harmony方法去批次 这2种方式,为了直观的对比一下区别。...2 harmony 去批次 去批次的方法有很多,本文对比展示使用harmony去批次分析。后续会介绍其他去批次的方法。...##############harmony 去批次################ library(harmony) #按照样本去批次,也可以选择根据group sce2 = sce %>% RunHarmony...("sample", plot_convergence = TRUE) sce2 #标准流程,参数不变 sce2 % RunUMAP(reduction = "harmony"..., dims = 1:30) %>% FindNeighbors(reduction = "harmony", dims = 1:30) %>% FindClusters(resolution
在上一篇中我们进行扫描设备的处理,本文中进行连接和发现服务的数据处理,运行效果图如下所示:
愿有朝一日用上国产的IDE、编译器、数据库系统、OS、光刻机、芯片等等,以形成闭环。
在上一篇中我们完成了连接和发现服务两个动作,那么再发现服务之后要做什么呢?发现服务只是让你知道设备有什么服务,可以做什么事情。
今天是1024,祝各位程序员们,钱多事少离家近,不秃也强bug黄。在上一篇文章中,我们了解了DevEco Studio的主推开发语言ArkTS,并写了一个简...
而Harmony OS作为一个分布式操作系统,对于开发语言的跨平台性、安全性和效率有着极高的要求。从这个角度看,C#与Harmony OS具有很高的契合度。...二、Harmony OS对C#的支持情况 截至目前,官方并没有明确表明Harmony OS直接支持C#语言进行应用开发。但是,这并不意味着C#无法在Harmony OS上发挥作用。...三、C#在Harmony OS应用开发的潜在挑战 虽然C#与Harmony OS具有一定的契合度,但在实际应用中,开发者仍然可能会面临一些挑战。...首先,可以通过创建一个C#到Harmony OS的桥接层,将C#代码转换为Harmony OS能够理解的语言或指令集,从而实现C#在Harmony OS上的应用开发。...从长远来看,随着Harmony OS的不断发展和普及,以及C#语言本身的不断进化,C#在Harmony OS应用开发中的可能性将会越来越大。
R包安装 install.packages("harmony") #如果需要更新 library(devtools) install_github("immunogenomics/harmony") library...02 在主成分分析(PCA)矩阵上运行 Harmony可以采用PCA嵌入矩阵作为输入 harmony_embeddings <- HarmonyMatrix(pca_matrix, meta_data,...$Y) dim(harmony_object$R) dim(harmony_object$Z_corr) ## 修正 PCA 嵌入 head(harmony_object$O) ##通过聚类共现矩阵进行批处理...Harmony将扩展这些计数,运行PCA,最后执行数据整合。...包进行Harmony分析需要有两步修改,首先使用RunHarmony()函数运行Harmony,然后在下游分析中,使用Harmony嵌入而不是先前的PCA嵌入。
往期专题 单细胞初级8讲和高级分析8讲 Harmony原理 Harmony需要输入低维空间的坐标值(embedding),一般使用PCA的降维结果。...Harmony整合样本 ##==harmony整合多样本==## library(harmony) scRNAlist <- readRDS("scRNAlist.rds") ##PCA降维 scRNA_harmony...系统 流逝 # 34.308 0.024 34.324 #降维聚类 scRNA_harmony <- RunUMAP(scRNA_harmony, reduction = "harmony",...dims = 1:30) scRNA_harmony % FindClusters...+plot2 ggsave("scRNA_harmony.png", plot = plotc, width = 10, height = 5) saveRDS(scRNA_harmony, 'scRNA_harmony.rds
一、Harmony NEXT地图SDK的推出背景 华为推出的鸿蒙系统(HarmonyOS)是近年来备受关注的操作系统之一。...二、Harmony NEXT地图SDK的特点与优势 1. 适配性强:Harmony NEXT地图SDK针对鸿蒙系统的特点进行了深度适配,确保了在不同设备和场景下的稳定性和兼容性。...易用性高:Harmony NEXT地图SDK采用了简洁明了的API设计和友好的开发文档,使得开发者能够轻松上手,快速集成到自己的应用中。...三、Harmony NEXT地图SDK的应用前景 随着鸿蒙系统的不断推广和应用场景的拓展,Harmony NEXT地图SDK的应用前景十分广阔。...Harmony NEXT地图SDK的推出将满足这些领域对高质量地图服务的需求,推动相关行业的创新和发展。
Logitech Harmony Hub是一款集成了软硬件的智能家居管理连接系统,攻击者可以通过漏洞控制Logitech Harmony Hub,对本地网络内的智能家居系统形成攻击威胁。...涉及漏洞 不当的证书验证方式 不安全的更新过程 开发者遗留在固件镜像中的调试信息 空密码的root用户 影响产品 Harmony Elite, Harmony Pro, Harmony Home Hub..., Harmony Ultimate Hub, Harmony Hub, Harmony Home Control, Harmony Smart Control, Harmony Companion,...Harmony Smart Keyboard, Harmony Ultimate and Ultimate Home。...一旦初始的蓝牙配对成功,Harmony APP应用就会搜索网络内的Harmony Hub设备,并通过基于API的http方式与设备通信。 ?
昨天我们分享了:《 细胞亚群细分的时候仍然是要选择harmony等算法去除样品差异 》,有粉丝留言提到这个使用harmony等算法去除样品差异,不应该是最开始就弄吗。...全部的样品的单细胞转录组数据整合后,如果不使用harmony等算法去除样品差异,默认的降维聚类分群,如下所示: ? 我们根据左边的标记基因以及生物学背景知识,可以进行如下所示的命名: ?...可以看到,效果还不错,很有意思, 给大家的感觉是 harmony等算法去除样品差异并不是必须的。但是如果我们具体到每个样品,有如下所示的现象: ?...有意思的事情就来了 如果我们在样品层面就开始使用harmony等算法去除样品差异,又会导致另外一个可怕的事情发生,如下所示: ? 就是本来是应该是具备病人特异性的上皮细胞,这个时候被抹除了样品差异。...这不是最可怕的,真正的问题是,这个上皮细胞被打散到了其它免疫细胞里面,因为这个harmony算法!
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