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    Nat. Biotechnol. | 利用深度学习进行蛋白质同源性检测和结构比对

    今天为大家介绍的是来自Kyunghyun Cho和Richard Bonneau团队的一篇论文。在生物技术领域,挖掘序列(sequence)、结构(structure)和功能(function)之间的关系,需要更好的方法来比对那些与已经标注的蛋白质序列相似度较低的蛋白质。作者开发了两种深度学习方法来解决这一难题,即TM-Vec和DeepBLAST。TM-Vec允许在大型序列数据库中搜索结构-结构的相似性。它经过训练,能够直接从序列对预测TM分数,作为结构相似性的度量,无需中间计算或解析结构。一旦识别出结构相似的蛋白质,DeepBLAST就可以仅使用序列信息来结构性地比对蛋白质,识别蛋白质之间的结构同源区域。

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