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    详解GO的层级关系在富集分析的应用

    所有GO的层次结构关系如下图所示 ?...这样的结构我们称之为有向无环图DAG, 虽然在图这种数据结构,节点并没有严格的层级关系,但是由于在GO这张图中,存在了祖先节点,即最上层的3个节点,其他的节点都可以看做是其子节点,从而引用了树状结构的...how-can-i-calculate-level-go-term 传统的费舍尔精确检验也好,GSEA也罢,这些富集分析的算法都只是为单个GO term进行分析,不会考虑该GO term在整个网状结果层级关系...对于这些分析的结果,采用上述的GO level 进行过滤时,只能是采用较小的level, 在一下R包,比如goprofiler, 推荐的最小层级是level为2。...根据所有富集到的GO terms, 从整个GO Graph取出一个子图subgraph, 图中有颜色的节点为富集到的GO, 颜色的深浅有P值决定, 节点的大小由degree决定。

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    Kafka的消息操作的层级调用关系Kafka源码分析-汇总

    Kafka里有关log操作的类比较类, 但是层次关系还是很清晰的,实际上就是上次会把操作代理给下一层; 是时候放出这张图了 Log层级.png 相关的一些类我们在前面的章节中都有介绍过 Kafka的日志管理模块...--LogManager KafkaMessage存储相关类大揭密 Kafka消息的磁盘存储 目前看起来我们只剩下上图中的Log类没有介绍, 所以这章基本上就是过一下这个Log类 Log 所在文件:...messages: ByteBufferMessageSet, assignOffsets: Boolean = true) : 追加新的msg到Log文件 3.1 对`messages`的每条..."Error in validating messages while appending to log '%s'".format(name), e) 3.2 验证每条`Record`的...appendInfo.lastOffset + 1) def read(startOffset: Long, maxLength: Int, maxOffset: Option[Long] = None): 从log文件读取

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    ODOO优化层级关系查询效率的方法

    《Odoo10 Development Essentials》Chapter5(p106)中介绍了Odoo中分层关系的建立。 代码如下 在上面的代码。 使用字段来关联上层记录。...使用和字段来进行记录所属层级,当时看书的时候对这些代码不是很理解,只是知道这样做能够提高层级关系数据模型查询数据记录的效率。...(如递归查询文件夹文件) Odoo为了提高层次结构(树状结构)查询效率,每一条层级数据记录添加跟字段. 假设A是B的上级对象。那么存在这样的逻辑关系。...画个图来理解下 可以看到,图中的B属于A的,清楚的表示了A,B的层级从属关系。...因为这个优化对查询层级结构效率有良好效果。 凡事皆有两面,这种存储特性会在数据库添加多余的字段。其实是以空间换时间。

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    Elasticsearch父子文档的关联:利用Join类型赋予文档的层级关系

    父子join关联解决的问题 数据层级关系的表示:在实际应用,很多数据天然具有层级或关联关系。例如,一个博客系统可能包含博客文章和对应的评论,其中博客文章是父级数据,而评论是与文章相关联的子级数据。...父子索引类型允许在Elasticsearch明确地表示这种数据之间的层级关系。 关联查询的优化:当数据之间存在关联关系时,我们经常需要进行跨层级的查询。...数据聚合和分析:在数据分析场景下,我们可能需要对具有层级关系的数据进行聚合操作。父子索引类型使得这类聚合更加直观和高效。...通过将相关联的数据组织在同一个索引,并明确它们的层级关系,可以减少数据冗余和提高数据的一致性。 虽然父子索引类型提供了解决上述问题的有效手段,但它也带来了一些额外的复杂性和性能考虑。...结语 Elasticsearch的父子索引类型join是一个强大的工具,它允许我们在同一索引创建具有层级关系的文档。

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    【设计模式】第九篇:组合模式解决层级关系结构问题

    说明:此文章两个示例,公司结构的示例思路来自于《大话设计模式》,内容以及代码经过了一定修改,尊重且维护作者版权所有,特此声明。...一 引言 在生活中常常会见到一些具有层级关系的结构,例如学生时代的【大学-学院-专业】之间的关系就是这样,同样还有例如【总公司-分公司/部门】、【书包-书】,软件开发也是啊,【文件夹-文件】、【容器-...(一) 分析 首先捋一下总公司,分公司,办事处,以及各自所属几个部门的关系 根据图可以看出,北京公司总部是最高级别的,其拥有两个最直接的部门,即:人力资源部和财务部,而分公司其实和这几个部门是属于同一级的...int depth); // 履行职责 public abstract void lineOfDuty(); } 具体公司类,相当于 Composite ,为了在控制台输出时能看出其层级结构...我们分别创建了 root、comp、comp1 等多个 ConcreteCompany,通过 add 方法先给每部分都添加了这几个职能部门,在通过像 root.add(comp); 这样的代码表示了其层级

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    数据库关系代数关系运算

    这里通过一个实例来说明除法运算的求解过程: 设有关系R、S 如图所示,求R÷S 的结果: ? 求解步骤过程: 第一步:找出关系R和关系S相同的属性,即Y属性。...在关系S对Y做投影(即将Y列取出);所得结果如下: ?...第二步:被除关系R与S不相同的属性列是X,关系R在属性(X)上做取消重复值的投影为{X1,X2}; 第三步:求关系RX属性对应的像集Y 根据关系R的记录,可以得到与X1值有关的记录,如图3...第四步:判断包含关系 R÷S其实就是判断关系RX各个值的像集Y是否包含关系S属性Y的所有值。...对比即可发现: X1的像集只有Y1,不能包含关系S属性Y的所有值,所以排除掉X1; 而X2的像集包含了关系S属性Y的所有值,所以R÷S的最终结果就是X2 , ?

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    K8s:通过 kubectl 插件 kubectl-tree 查看API对象层级关系

    写在前面 ---- 分享一个开源小工具 kubectl-tree,用于查看 k8s API 对象层级关系 比如对于无状态应用来讲,可以看到Deployment --> ReplicaSet --> Pod...的构成关系 博文内容涉及:tree 插件的安装以及使用。...——《陈风·衡门》 ---- 有时候我们希望可以看到,k8s 有状态应用、无状态应用和 pod 的所有关系,但是往往需要多条命令才可以实现,其实通过 kubectl-tree 插件,可以很轻松的做到...kubectl-tree 一个 kubectl 插件,它用于探索 Kubernetes 对象之间的所有权利关系。...无状态应用关系查看 ┌──[root@vms81.liruilongs.github.io]-[~/ansible/krew] └─$kubectl get deployments.apps -n

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    HTML5设计原理(

    因而在HTML5,你可以随意使用下列任何语法。... 在HTML5,我只要简单地把所有内容都包装在一个链接元素中就行了。...在HTML5,这些元素都可以换掉。说起新增的语义元素,它们价值的一方面可以这样来体现:“嘿,看啊,这样多好,用HTML5新增的元素可以把这些div都替换掉。” ......这几个元素,header、footer、aside、nav,最重要的是它们的语义;跟位置没有关系。一想到footer这个词,我们总会不由自主地想,“噢,应该放在下面。”...不要紧,但我可以告诉你,我认为这才是HTML5这些新语义标记的真正价值所在。换句话说,我们现在有了独立的元素了,这些元素的标题级别可以重新定义。

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    工作递归返回多层级josn数据

    APIPropVO>(); for (APIPropEO prop : onePropEOList) { //把每一个遍历的APIPropEO对象放到APIPropVO对象...apiPropVO); } return sonVOList; } 集合转数组的toArray()和toArray(T[] a)方法 下面代码是jdk ArrayList的源码...[]) list.toArray(new String[0]); 这段代码是没问题的,但我们看到String[] tt =(String[]) list.toArray(new String[0]) 的参数很奇怪...该容器的元素已经用泛型限制了,那里面的元素就应该被当作泛型类型的来看了,然而在目前的java却不是的,当直接String[] tt =(String[]) list.toArray()时,运行报错。...回想一下,应该是java的强制类型转换只是针对单个对象的,想要偷懒将整个数组转换成另外一种类型的数组是不行的,,这和数组初始化时需要一个个来也是类似的。

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