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Biological Psychiatry:CNNI|青少年抑郁症患者功能连通性的重测信度

大量文献探讨了健康个体的单变量和多变量可靠性,但相对较少的研究探讨了精神疾病人群的可靠性或其与年龄存在相互作用。方法:在此,我们对88名青少年有重度抑郁症(MDD)和无重度抑郁症(HV)展开了调研。...那些研究的重点是患有轻度认知障碍或精神分裂症的成年人群。评估精神病人群的可靠性是必要的,以确定临床生物标志物的发现是否受到效应大小减少的限制。...诊断为抑郁症的患者有资格参加门诊或住院治疗项目,由临床医生决定。健康志愿者(HVs)和最初诊断为重度抑郁症的患者均被纳入研究。参与者在评估后完成了功能磁共振成像扫描。...在该组中,有10名参与者由于数据收集、质量或处理方面的问题而被排除在所有报告的分析之外。...对于单变量和多变量可靠性指标,可靠性不因诊断或症状严重程度而变化。将临床测量作为可能的协变量,降低了这些结果是诊断截止值、疾病的偶发性波动或治疗的影响的可能性,这可能进一步增加生物标志物发现的难度。

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    Java加载ICC文件的方法总结

    引言: 在数字颜色管理中,ICC文件扮演着至关重要的角色,确保在不同的设备和应用之间实现颜色的一致性。但如何在Java中加载和使用这些文件呢?本文将为您提供答案。 1. 为什么要加载ICC文件?...使用Java加载ICC文件 Java提供了java.awt.color.ICC_Profile类来加载和处理ICC文件。以下是加载ICC文件的基本步骤: 2.1....); } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } return profile; } 这个函数接受ICC文件的路径作为参数...ICC文件,通常用于颜色管理,定义了如何将一个颜色空间转换为另一个颜色空间。在Java中,我们可能需要加载这些文件来进行颜色转换或管理。本文将为您提供加载ICC文件的方法和示例代码。...如果您有任何问题或建议,请在下面留言 原创声明 ======= · 原创作者: 猫头虎

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    一文搞懂 | Linux互连子系统

    这些设置可以是多个互连设备或功能块之间的吞吐量、延迟和优先级。这可以动态控制以节省功率或提供最大性能。 互连总线是具有可配置参数的硬件,可以根据从各种驱动程序接收到的请求在数据路径上设置这些参数。...互连总线的一个例子是芯片组中各种组件或功能块之间的互连。一个 SoC 上可以有多个互连,这些互连可以是多层的。 下面是 SoC 互连总线拓扑的简化图。...void icc_node_add(struct icc_node *node, struct icc_provider *provider); void icc_node_del(struct icc_node...*reverse; //遍历节点图时使用的标志 u8 is_traversed:1; //与此节点关联的...init_peak; //指向私有数据的指针 void *data; }; Interconnect endpoints 互连端点是路径的第一个或最后一个元素

    1.1K30

    Brief. Bioinform. | 基于肿瘤免疫微环境数学建模和强化学习的免疫检查点抑制剂(ICI)联合化疗决策优化

    一个可能的原因是化疗对免疫细胞有杀伤作用,于是同时减弱ICI的效果。...而处在两者之间的“冷”肿瘤有一部分处在ICI使用决策边界的左侧,DRL智能体推荐使用中等剂量的化疗让免疫微环境变得更“热”,当该环境变得更适合ICI起作用时,DRL智能体推荐使用ICI联合使用低剂量的化疗...有四个“冷”肿瘤病人得益于这样的ICC疗程, 深粉红色箭头向右下方指。但是,不是所有“冷”肿瘤病人的免疫微环境都被转化为适合ICI的状态,另有六个病人被推荐只使用化疗(深粉红色箭头向下指)。...而剩下7个“冷”肿瘤病人ICC疗程失效,原因是化疗耐药性细胞的自然增长速率过快,而使得最终CD8+T 细胞比癌细胞比例下降,深粉红色箭头在第三或第四个周期向左指。 图 6....(c) 化疗和ICI的使用应该以什么次序使用?ICI起作用偏好肿瘤里有更高的CD8+T细胞浸润。

    15910

    热点综述 | 空间多组学技术在肿瘤免疫微环境研究中的应用

    单细胞技术也被用于识别潜在的生物标志物。然而,这些方法丢失了有关肿瘤免疫微环境的空间信息,例如细胞位置和细胞间相互作用组。 早在空间组学发展之前,人们就知道肿瘤内的某些组织学模式与患者预后高度相关。...Stereo-seq技术对HCC和肝内胆管癌(ICC)肿瘤的研究中发现在侵袭性肿瘤前沿有一个独特的微环境,例如NK细胞、T细胞和巨噬细胞聚集在肿瘤和正常组织之间的边界附近等。...此外,肌上皮的 E-Cadherin表达及其在肿瘤周围的连续性与肿瘤恶性程度高度相关。 空间细胞分析识别肿瘤相关的三级淋巴结构 三级淋巴结构(TLS)是将肿瘤抗原呈递给 T 细胞的位置。...肿瘤组织拓扑扩展识别新的肿瘤生物标志物 与其他多组学方法一样,空间转录组学和scRNA-seq方法有可能导致发现新的肿瘤生物标志物。...肿瘤内细胞拓扑结构与患者预后相关 为了理解组织中的拓扑细胞相互作用模式,对高维多组学数据进行了计算分析,以确定特定类型细胞位置之间的相关性。某些细胞协调模式与各种癌症患者的生存或预后有关。

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    肿瘤多区域取样的进化分析四:肝癌肿瘤内基因组异质性变化

    这些结果提示,一些驱动因子和病毒整合可能发生于病变进展后期,并在肿瘤分支演化中发挥重要作用。...在系统发育树中,IMs与原发病变的距离在各个病人样本中是不同的(Figure 4),表明IMs可能发生在肿瘤进展的早期或晚期。8个TTs与原发匹配样本有90%以上的非同义突变。...PG和MG拷贝数变异的基因组区域差异较大(Figure 5D、E),表明它是独立起源的。 总的来说,每个肿瘤中心都可以独立进化。...08 肝细胞癌伴发肝内胆管癌有明显的表型病变 P5诊断cHCC-ICC、原发性HCC(P5P)和继发性ICC(P5IM)(Figure 6A)。...ICC(P5IM)与其他3个HCC病变(P5P,P5SN1,P5SN2)有102个突变(Figure 6B),包括TP53、CTNNB1和PIK3CB的潜在驱动突变。

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    BASE:大脑年龄的标准化评估

    引言 脑年龄是通过脑磁共振成像(MRI)对生物年龄的估计,它已成为神经健康和衰老的重要生物标志物。...接下来,我们使用niftyregg (Modat et al., 2014)进行了12个自由度的仿射配准,将去噪后的Tlw图像映射到第7代蒙特利尔神经学研究所(MNI)图谱空间(2009e版)(Fonov...结果表明模型结构对AE有显著影响。LMEM事后两两分析结果如图4所示。模型2的AE与模型1、3、4的AE差异有统计学意义。其他模型没有显著差异。...LMEM和ANOVA分析也以性别变量及其与其他变量的相互作用作为固定效应进行了检验。方差分析显示MAE在性别方面没有显著差异,性别与模型结构的相互作用也没有统计学意义。...有必要澄清的是,该标准差通常是根据不同权重初始化或交叉验证折叠的重复模型训练获得的MAE值计算的,而不是针对所有受试者。前者提供了对模型可重复性的洞察,而后者提供了预测离散度的信息。

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    innovus学习心得之一

    从icc过度到icc2,基本命令非常类似,只是更加的规范,命令以及图形界面设计的更加合理,尽管具体的命令和变量有很大的变化,但是,其规范基本相同。...而且命令也都非常的直白,很多直接看命令就可以知道这个命令的作用,并不一定需要查询在线手册。 而innovus,相对来说,各种命令比较杂乱。...例如,有很多让人很困惑的命令,check_design, 以及其“兄弟”, checkDesign。不知道为什么这样设计,我猜测可能这是两个团队,在不同的时间来做的两个功能类似的命令。...用好这个命令,相对于icc以及icc2,我认为会让代码非常简洁。图形界面目前还不是太适应,比如想看一条timing report中的timing path在GUI中如何显示,却发现,没有这个功能。...再就是熟悉图形界面,和有经验的同事多交流,可以事半功倍。 以上是我使用innovus的一点感想,并不涉及到QoR的比较。

    1.8K40

    空间解读 | 原发性肝癌的空间结构综合分析

    在局部,该研究发现在100mm宽的簇-簇边界上的双向配体-受体相互作用有助于维持肿瘤内结构,而PROM1+和CD47+肿瘤干细胞龛位与TME重塑和肿瘤转移有关。...(ICC-1)患者,利用10X Genomics空间技术进行了空间转录组测序。...在这里,该研究集中探讨了五种常用的肝癌干细胞相关标志物(CD47、EPCAM、KRT19、PROM1和SOX9)。...通过比较L/T/P部分CSC生态位的比例,该研究发现在HCC-2中,CD47-、SOX9-和PROM1阳性的比例逐渐增加,而EPCAM或KRT19基因并没有表现出这样的现象。...在这里,该研究注意到HCC-5的cluster 6具有高表达CXCL13、CCL19、CCL21、LTF、LTB、CD79A/B等的特征,这些都是TLS形成的必要分子。

    1.1K30

    这个项目熬走了多少届研究生

    WES:采用罗氏的NimbleGen SeqCap EZ V3外显子捕获试剂盒,在 HiSeq 或 Novaseq 平台 2 × 150 bp 的双端测序。...研究结果 ICC 基因组突变 图谱:在 204名患者中,共鉴定到的体细胞突变位点 21772 SNV 和 1302 Indel。通过Sanger 测序验证到的突变有1756个,95.9%。...生存分析发现,携带 TP53、KRAS、ELF3 和 SAV1突变的患者的预后更差(fig2E)。...SAV1 基因突变分析:研究人员对另外 468 个ICC患者的 SAV1基因进行 Sanger 测序,发现了 14个患者存在 SAV1体细胞突变。而 204 例WES患者有6例存在 SAV1 突变。...结合临床数据分析:SAV1 体细胞突变与肿瘤大小增加和肿瘤分化不良相关,具有 SAV1 体细胞突变或 SAV1 表达降低的患者表现出更短的 OS 和 RFS(fig4C)。

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    使用SAS,Stata,HLM,R,SPSS和Mplus的分层线性模型HLM

    该模型在教师的经验和学生水平的变量之间没有任何相互作用。...如果我们有理由相信Texp不会缓和Sex和Extrav对Popular的影响,那么我们将使用此模型,这意味着我们的学生水平变量的斜率是相同的,无论学生是否有新教师或新教师。一位拥有多年经验的人。...例如,如果我们想找出具有更多经验的教师是否比新教师对学生的外向性或性别与他们自我报告的知名度之间的关系有不同的影响,则可以使用此模型。...SAS结果  在固定效果表中,有两个交互作用项,其中一个()远不重要,p值> 0.5。  在随机方差分量表中,我们看到外向随机斜率的估计值和性别随机斜率的估计值与零没有显着差异。...另外,ICC与模型5几乎完全相同,这意味着交互作用项不会改变按类别说明的差异比例: 总结 进行比较的目的是调查来自六个不同统计软件程序的嵌套两级层次模型的过程和结果可能存在的差异。

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    SAS,Stata,HLM,R,SPSS和Mplus分层线性模型HLM分析学生受欢迎程度数据|附代码数据

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