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jQuery胸腺叶中的每个收集组

jQuery是一款流行的JavaScript库,用于简化HTML文档遍历、事件处理、动画效果和AJAX交互等操作。它提供了一系列易于使用的API,使开发人员能够更高效地操作DOM元素、处理事件、执行动画和发送异步请求。

胸腺叶是人体内的一个器官,位于胸腺中。胸腺叶中的每个收集组是指胸腺叶内的细胞聚集区域,这些细胞在胸腺发育和免疫功能中起着重要作用。

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人-胸腺肿瘤组织细胞悬液制备流程

分享是一种态度 注 | 以上操作指南中涉及消化酶以及实验方法仅供参考,实际应用过程请根据具体情况进行细节上调整。 背景介绍 胸腺属于中枢淋巴器官,分左右两,表面有薄层结缔组织被膜。...被膜结缔组织呈片状伸入胸腺内部形成小叶间隔,将实质分割成许多不完全分离胸腺小叶。每个小叶都有皮质和髓质两部分,皮质内胸腺细胞密集,髓质则含较多胸腺上皮细胞。...胸腺瘤起源于胸腺上皮细胞,是最常见前上纵隔原发性肿瘤。 对于胸腺瘤组织单细胞悬液一般使用美天旎公司肿瘤组织试剂盒制备。...胸腺组织示意图 实验仪器及耗材 实验步骤 准备肿瘤解离试剂盒酶混合液,将100µLH酶、500 µLR酶和25 µLA酶加入到4.4mL RPMI 1640培养基。...去上清后使用RPMI重悬细胞沉淀,使用置于50 mL离心管上70 μm滤膜过滤。 用20 mL RPMI 1640培养基冲洗滤膜,收集滤液后300g离心7 min,尽可能去上清液。

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人类胸腺发育细胞图谱揭示了T细胞形成

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胸腺基质单细胞转录谱揭示胸腺髓质中新细胞异质性

最近证据表明,胸腺基质由功能上不同亚群组成,但人类胸腺这种细胞异质性程度尚不清楚。文章使用单细胞转录测序来全面分析跨生命多个阶段的人类胸腺基质。...鉴定了三种上皮细胞(EPCAM和KRT8作为一般上皮标记物和FOXN1、PSMB11、LY75、CLDN4、AIRE、IVL, NEUROD1 , MYOD1作为特定亚群标志物), 一种间细胞 (...神经嵴、间充质和内皮细胞对于通过产生可溶性因子和细胞间相互作用来支持胸腺生成胸腺微环境建立很重要。但是这些可溶性因子在人类胸腺发育功能和细胞类型特异性尚不清楚。...人类胸腺上皮细胞在不同阶段分析 将上图d3群上皮细胞继续细分亚群,得到9个亚群,基于已知 TEC biomarker和差异基因注释得到: 两个亚群表达了 cTECs 特征基因(PSMB11、PRSS16...、 SIX1)但缺乏 cTECs 或 mTECs 功能基因 神经内分泌(BEX1、NEUROD1) 肌肉样肌样(MYOD1、DES) 髓鞘+上皮细胞(SOX10、MPZ) 在成人胸腺检测到 cTEC

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NATURE|人类突变特征

因此,为了系统地描述导致癌症突变过程,曾使用数学方法从体细胞突变目录解释突变特征,并用每个特征产生概率注释每个肿瘤每个突变类。...context,第二步(SigProfilerAttribution)关注准确估算体细胞突变数量与每个样本每个提取突变特征关联。...NMF作为突变谱输入矩阵因数分解一部分,确定了特征轮廓和每个特征对每个癌症基因贡献。...因此,在每个基因识别出了聚集突变,并分别进行分析,识别到四个主要聚类突变特征(图2),与之前有过报道一致。...ID13主要特征是胸腺嘧啶-胸腺嘧啶二核苷酸胸腺嘧啶缺失,并在皮肤恶性黑色素瘤中表现出大量突变(图2,3)。

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再谈T细胞:起源、分化和分群

DNA整合进基因。...记忆细胞识别相应蛋白抗原,快速分化为效应B细胞,产生具有强大杀伤力IgG型抗体,从而防御病原体感染。 T细胞发育 T细胞来源于骨髓淋巴样祖细胞,在胸腺中分化、发育、成熟。...在胸腺皮质,该类细胞与胸腺上皮细胞表达抗原肽-MHC复合物以适当亲和力进行特异结合,则可继续分化为CD4+或CD8+单阳性(SP)细胞。...e) 走出去——在外周淋巴结发育 从胸腺髓质迁移至血液、然后进入外周淋巴组织、尚未接触过抗原T细胞称为初始(naïve)T细胞,主要定居于外周淋巴器官胸腺依赖区。...由T细胞抗原识别受体TCR和一CD3分子以非共价键结合而成。TCR识别特异性抗原,CD3向细胞内传递信号,共同完成信号传导功能。 每个T细胞表面约有3000~30000个TCR分子。

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20种小鼠器官单细胞转录学研究构建了一个Tabula Muris

(10-15周)20个器官中分离100,605个细胞单细胞转录学数据 将取自同一只小鼠主动脉、膀胱、骨髓、脑(小脑、皮质、海马体、纹状体)、横隔膜、脂肪(棕色、性腺、肠系膜、皮下)、心脏、肾脏...所有的器官都用流式细胞仪将单个细胞分选到平板,许多器官也被装载到微流控液滴。...发现来自不同器官细胞经常混合在一起,54个簇中有25个包含(至少5个)来自不同器官细胞。例如,簇3和48每个包含来自5个或更多器官内皮细胞。...第4簇包含主要增殖胸腺T细胞,这可能代表VDJ重组后前T细胞扩张。簇1-3主要包含单个阳性T细胞(CD4+或CD8a+)。...,可用于后续发现新假定细胞类型,发现已知细胞类型新基因表达,以及比较不同器官细胞类型研究。

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多年来,尽管在每个脊椎动物类IgM有其独特而耐人寻味特征,IgM一直被认为是原始抗体类。在哺乳动物,IgM是一种与连接(J)链相关五聚体。...尽管如此,每个B细胞都表现出抗原受体排斥,即每个细胞仅表达1条H链。...Fig 4 14 The thymus 胸腺存在于所有的有颚类,通常有典型皮质和髓质组织。它可以从一个小叶到一个多甚至不连续结构,取决于所观察物种或发育阶段。...在无颚类这一结构被命名为胸腺样体,并被认为是胸腺等价物。...为什么胸腺会进化?如果无颚类胸腺样体是一种模型,也许有颚类胸腺出现不是为了胸腺正向或负向选择,而是为了使发育T细胞远离B细胞发育微环境(就像骨髓)。

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Nature: 泛癌突变特征,错过了TCGA但别错过它!

.内外因素一直驱动着肿瘤基因发生体细胞突变,在这一过程形成了具有特征性突变标签集。...通过估计每个突变特征对癌症基因突变影响,该研究发现了突变特征与外源或内源性暴露以及有缺陷DNA维持过程关联,为了解人类癌症发展突变过程提供了系统性分析观点。...每个颜色代表肿瘤显示某个突变特征位突变负荷。 ? 图3:PCAWG肿瘤每个突变特征突变数量 图4:示例两种不同肿瘤SBSs、DBSs、indels突变特征。 ?...图4.单个癌症样品突变谱说明性例子 ? 图S1:SigProfiler和SignatureAnalyzer分析在2780个PCAWG样本每个样本归属签名数量直方图 ?...在(≥5bp)胸腺嘧啶单核苷酸重复序列,indels签名1(ID1)主要由胸腺嘧啶插入组成,而ID2主要是胸腺嘧啶缺失(图2)。

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Nat Biotechnol 恭喜胡鹏、邱琪丨吴昊团队开发同时检测DNA 5hmC5mC修饰单细胞测序技术

DNA胞嘧啶甲基化(5mC)是一种重要表观遗传修饰,参与了细胞特异基因表达调控、基因稳定性维持等重要过程。...哺乳动物细胞,DNA胞嘧啶甲基化可以被TET家族蛋白氧化,进而去甲基化,从而动态调控基因胞嘧啶修饰( 图1a, b)【1】。...胞嘧啶羟甲基化修饰(5hmC)是基因丰度最高去甲基化中间产物(尤其在神经细胞),可能发挥着重要功能【2】。...这项技术核心是通过化学脱氨和APOBEC3A (A3A) 酶促脱氨两个步骤(图2a),将未修饰胞嘧啶 (C) 和甲基化修饰胞嘧啶(5mC)分别转化为尿嘧啶(U)或胸腺嘧啶(T),并在最终测序结果中转化为胸腺嘧啶...)和兴奋性神经元(NeuN+ & Neurod6+),再对收集细胞核进行Joint-snhmC-seq分析。

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生物学机器学习:使用K-Means和PCA进行基因序列分析 COVID-19接下来如何突变?

在本文中,我将…… 提供RNA序列简单解释 使用K-Means创建基因信息集群 使用PCA可视化集群 …并对我们执行每个程序进行分析来获取经验。 什么是基因序列?...如果您对RNA序列有基本了解,请跳过此部分。 与“解码”相比,基因测序通常是分析从样品中提取脱氧核糖核酸(DNA)过程。在每个正常细胞内有23对染色体,这些染色体容纳着DNA。 ?...DNA卷曲双螺旋结构使其可以展开为梯形。该梯形由成对化学字母(称为碱基)制成。DNA只有四种:腺嘌呤,胸腺嘧啶,鸟嘌呤和胞嘧啶。腺嘌呤仅与胸腺嘧啶结合,而鸟嘌呤仅与胞嘧啶结合。...因为这些点是按比例缩放,所以图中标注数值在数量上没有任何意义。但是,可以比较每列标注值。您可以从视觉上了解每个突变簇相对属性。如果科学家要开发疫苗,它应针对这些主要病毒突变簇。...结论 使用K-Means和PCA,能够识别冠状病毒五个主要突变簇。研发冠状病毒疫苗科学家可以利用聚类中心信息获得有关每个聚类特征知识。

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单细胞文章专列——细胞图谱

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Immunity:菌群研究里程碑,可有效筛选供者菌群

Treg细胞可以限制抗感染效应细胞过度应答,即常说抑炎细胞。 Britton等收集了健康人与两IBD患病人群粪便标本/菌群。...因此,微生物定植所诱导Foxp3+ Treg细胞数目并不能预测该微生物菌群是“健康”还是“失调”。 ? ? Foxp3+ Treg可来源于胸腺或自组织naïve T细胞原位分化。...这些发现表明,微生物诱导RORγt+ Treg细胞在结肠炎起保护作用,还可以在菌群失调时提高胸腺来源Treg细胞比例(Foxp3+ Treg),这就解释了为什么不同菌群移植总Foxp3+ Treg...此研究进一步强化了RORγt+ Treg在微生物耐受重要性,同时为筛选粪便移植手术潜在人类微生物供者提供了可能。对理想微生物供者鉴定是当前实现IBD患者粪便移植手术主要瓶颈之一。...从健康和IBD供体收集微生物群用一种相似的方式导致体外无菌小鼠肠道Foxp3+Treg细胞总数增加。

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北大课题改进ECC测序法,利用信息冗余大幅增加测序精度 | 黑科技

近日,北京大学黄岩谊教授课题在DNA测序方法研究上取得重要突破,该团队在此前荧光发生测序技术基础上发展了一种全新概念测序方法——纠错编码(简称ECC)测序法。...其中,DNA测序是指分析特定DNA片段碱基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤(G)排列方式。...A、C、T、G4种碱基,抽象成图中4个不同颜色不同结构镂空立方体,可以通过3种正交方式解构为两两组合。在ECC测序每个碱基均通过3次“投影”进行了测量,再通过3个投影重构出原来序列。...在ECC测序法,序列信息冗余来自“对偶碱基荧光发生”SBS测序流程,该流程通过对测序试剂按对偶碱基分为两两匹配,并对待测DNA序列进行三轮独立测序,继而产生三条互相正交简并序列编码。...此次黄岩谊团队在测序技术首次引入冗余编码概念,将进一步推动通信和存储技术发展。据了解,相关研究成果已经公布在《自然》杂志上。

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常见面试算法:朴素贝

这个假设正是朴素贝叶斯分类器 朴素(naive) 一词含义。朴素贝叶斯分类器另一个假设是,每个特征同等重要。...我们可以观察文档中出现词,并把每个词作为一个特征,而每个出现或者不出现作为该特征值,这样得到特征数目就会跟词汇表数目一样多。...朴素贝斯 原理 提取所有文档词条并进行去重 获取文档所有类别 计算每个类别文档数目 对每篇训练文档: 对每个类别: 如果词条出现在文档-->增加该词条计数值(for...(P(类别|文档所有词条)) 朴素贝斯 开发流程 收集数据: 可以使用任何方法。...测试算法: 使用朴素贝斯进行交叉验证 使用算法: 构建一个完整程序对一文档进行分类,将错分文档输出到屏幕上 收集数据: 提供文本文件 文本文件内容如下: ?

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Nature Neuroscience:经颅交流电刺激(tACS)有助于老年人工作记忆恢复

实验2,实验程序与实验1相同,但只收集行为数据。...一老年被试分五天完成实验: 第一天测量工作记忆基线水平; 第二天进行额颞同相θ波调谐并完成实验; 第三天只对前额进行θ波调谐刺激并完成实验(如图a); 第四天只对颞进行θ波调谐刺激并完成实验...实验4收集被试额颞同步调谐θ波HD-tACS刺激前,刺激中和刺激后10个block数据。...将记忆block按4分钟划分为9个bin,每个bin也表现出了与a相同数据结果,说明该结果在整个实验过程中都非常稳定(如下图b和c)。 ? ?...而左侧颞与相邻脑区(如外侧枕叶)γ锁相值在年龄之间并没有表现出显著差异,且对老年被试施加HD-tACS刺激也并不影响这一结果(如下图b)。 ?

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BRAIN:额颞痴呆患者情绪加工任务态功能磁共振研究

但是,task-fMRI实验也存在着相当多噪声影响,除去静息态也会面对头动噪声和机器噪声外,情绪识别类任务对被试心理生理状况(如心跳)和眼动状况(如瞳孔大小变化)会产生额外噪声影响,因此,对这部分信息进行收集并将其考虑进统计模型...方法是将每个视频分成400个相等矩形(20×20),然后随机化每个视频矩形位置。...每个被试EPI序列被重新对齐到第一张图像,并与B0失真信息合并,以矫正场不均匀性(这里作者使用了spm提供场图矫正方法,在spmunwrap功能)。...考虑到被试在情绪识别能力和自主反应方面差异神经基础,将每个被试总情绪识别评分或平均生理反应参数作为第二阶协变量,来估计每个被试T检验,这样能更有力解释每个疾病内产生血液动力学差异来自特定症状预测因子...事后比较发现,所有疾病情绪识别能力均比健康控制差,疾病svPPA(伴有语义变异原发性失语症患者)比bvFTD(变异型额颞痴呆患者)差。

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移动通信设备射频电磁场暴露量与青春期前儿童大脑脑容量发育之间关系

此外,作者估计了来自三不同RF-EMF源全脑和脑特定RF-EMF暴露量,这三RF-EMF源会导致不同RF-EMF 暴露模型: 来自手机和DECT电话脑RF-EMF暴露量,这是RF-EMF...对于每个设备和活动,我们从可用不同可能使用位置对SAR值进行平均,以获得每个活动SAR值,该值可以插入公式(1)和(2)。...统计分析 在确认了模型所有假设都得到满足后,使用线性回归模型来评估全脑和脑特定RF-EMF暴露量与全脑和皮质下脑容量之间关系,以及每个特定脑和皮质体积全脑和特定源RF-EMF暴露量之间关系...表3在9-12岁青春期前儿童估计全脑和特定源RF-EMF暴露量与每个和皮质体积(mm3)之间关系。 ?...以前大多数研究都是单独评估不同RF-EMF源与大脑发育之间关系,但本文综合方法可以更全面地评估几个RF-EMF源全脑暴露量,以及导致不同模式RF-EMF暴露RF-EMF源特定脑暴露量

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