首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

Science | ProteinMPNN : 基于深度学习的蛋白序列设计

本文介绍华盛顿大学的蛋白质设计科学家D. Baker在2022年9月15发表在Science研究工作Robust deep learning–based protein sequence design using ProteinMPNN。研究团队开发了一种基于深度学习的蛋白质序列设计方法 ProteinMPNN,它在计算机和实验测试中均具有出色的性能。天然蛋白质骨架上,ProteinMPNN 的序列恢复率为 52.4%,而 Rosetta 为 32.9%。不同位置的氨基酸序列可以在单链或多链之间偶联,从而能够应用于当前广泛的蛋白质设计任务。研究团队使用 X-ray晶体学、cryoEM 和功能研究通过挽救以前失败的蛋白质单体设计(使用 Rosetta 或 AlphaFold设计的蛋白质单体、环状同源寡聚体、四面体纳米颗粒和靶结合蛋白)证明了 ProteinMPNN 的广泛实用性和高精度,

01

《利用Python进行数据分析·第2版》第13章 Python建模库介绍13.1 pandas与模型代码的接口13.2 用Patsy创建模型描述13.3 statsmodels介绍13.4 sciki

本书中,我已经介绍了Python数据分析的编程基础。因为数据分析师和科学家总是在数据规整和准备上花费大量时间,这本书的重点在于掌握这些功能。 开发模型选用什么库取决于应用本身。许多统计问题可以用简单方法解决,比如普通的最小二乘回归,其它问题可能需要复杂的机器学习方法。幸运的是,Python已经成为了运用这些分析方法的语言之一,因此读完此书,你可以探索许多工具。 本章中,我会回顾一些pandas的特点,在你胶着于pandas数据规整和模型拟合和评分时,它们可能派上用场。然后我会简短介绍两个流行的建模工具,st

06
领券