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    Nat. Methods | MARS: 跨异构单细胞实验发现新型细胞类型

    今天给大家介绍由美国斯坦福大学计算机科学系Jure Leskoveck课题组在《Nature methods》上发表了一篇名为“MARS: discovering novel cell types across heterogeneous single-cell experiments”的文章。文中提出了用于识别和注释已知的以及新的细胞类型的元学习方法MARS,MARS通过跨多个数据集传输潜在细胞表示,克服了细胞类型的异质性。使用深度学习来学习细胞嵌入功能以及细胞嵌入空间中的一组地标。该方法具有发现以前从未见过的细胞类型并注释尚未注释的实验的独特能力。将MARS应用于大型小鼠细胞图集,并展示了其准确识别以前从未见过的细胞类型的能力。此外,MARS通过概率性地在嵌入空间中定义细胞类型,自动为新的细胞类型生成可解释的名称。

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