今天把之前组团翻译的 Cookbook for R 也放到了 Gitee 上，国内访问和阅读的体验感会上升很多。...https://shixiangwang.gitee.io/cookbook-for-r-chinese/ ?...# Welch t-test t.test(extra ~ group, sleep) #> #> Welch Two Sample t-test #> #> data: extra by group...默认的不是Student t检验而是使用了Welch t检验。注意Welch t-test结果中df=17.776，这是因为对不同质方差进行了校正。...# Student t-test t.test(extra ~ group, sleep, var.equal=TRUE) #> #> Two Sample t-test #> #> data: extra
R语言提供t.test()函数可以进行各种各样的t检验。...在这里我将利用R里内置的鸢尾花数据集（iris）向大家展示如何进行t检验，这里iris数据集是由150朵鸢尾花的花瓣长度、花瓣宽度、花萼长度、花萼宽度以及鸢尾花种类组成。...# 配对t检验 t.test(y1,y2,paired=TRUE) # y1和y2均为数值型向量 # 单样本t检验 t.test(y,mu=3) # 原假设H0:mu=3(mu就是指总体的均值) # 这里就不赘述配对...t检验和单样本t检验，它们的使用方法和两独立样本t检验类似，只是分别多了参数paired=TRUE和mu=3。...好了，关于t检验的内容就分享到这里，大家先学会如何使用R进行t检验分析即可，后续我会介绍相关理论！
R语言基础知识： 样本大小：指实验设计中每种条件／组中观测的数目 显著性水平：由I型错误的概率来定义，可以说发现效应不发生的概率。 功效：通过I减去II型错误的概率，可以看作是真实效应发生的概率。...t检验，pwr.t.test（）函数提供许多有用的功效分析选项，格式为： pwr.t.test(n=,d=,sig.level=,power=,alternative=) 其中：n为样本大小...sig.level表示显著性水平（默认为0.05） power为功效水平 type指检验类型：双样本t检验（two.sample）、单样本t检验（one.sample...）或相依样本t检验（paired）。...手机与驾驶反应时间的实验，假定将使用双尾独立样本t检验来比较两种情况下 驾驶员的反应时间。
但实际上Java编译器不允许这个操作。会报错，“装苹果的盘子”无法转换成“装水果的盘子”。 ?...extends T>和的办法，来让”水果盘子“和”苹果盘子“之间发生正当关系。 二、上界 下面就是上界通配符（Upper Bounds Wildcards） ?...四、上下界通配符的副作用 边界让Java不同泛型之间的转换更容易了。但不要忘记，这样的转换也有一定的副作用。那就是容器的部分功能可能失效。 还是以刚才的Plate为例。...extends T>不能往里存，只能往外取 和类型参数的区别就在于，对编译器来说所有的T都代表同一种类型。 比如下面这个泛型方法里，三个T都指代同一个类型，要么都是String，要么都是Integer... ? 但通配符<?
这时候的统计检验方法就可以选择T检验。...本篇文章的内容参考https://www.datanovia.com/en/lessons/how-to-do-a-t-test-in-r-calculation-and-reporting/how-to-do-two-sample-t-test-in-r...如果要检验均值是否相等 t.test(women_weight,men_weight) 输出结果是 Welch Two Sample t-test data: women_weight and men_weight...这个做的是Welch Two Sample t-test，如果要做学生式T检验，可以在t.test()函数里加var.equal=T参数 > t.test(women_weight,men_weight...,var.equal=T) Two Sample t-test data: women_weight and men_weight t = -20.791, df = 38, p-value <
不知道大家平时在使用R的时候有没有见到过这样一些比较奇怪的操作符，%>%, %T>%, %$% 和 %%。今天小编就来跟大家掰次掰次。...这些操作符都是来自于一个叫做magrittr的R包，所以我们先来安装一下。...二、%T>%（向左操作符，tee operator) 我们把上面的需求稍微调整一下，在最后增加一个要求。 1.取10000个符合正态分布的随机数。 2.求这个10000个数的绝对值，然后乘以50。...对于这种情况，我们就可以用到 %T>% 了，%T>%（向左操作符，tee operator)，其实功能和 %>% 基本是一样的，只不过它是把左边的值做为传递的值，而不是这一步计算得到的值。...% hist %>% sum 这个时候我们可以正常的得到柱形图和最后的和 %T>%现实原理如下图所示，使用%T>%把左侧的程序的数据集A传递右侧程序的B函数，B函数的结果数据集不再向右侧传递，而是把
第一个 定义当前我有一个泛型变量类型，类型名使用T来表示 第二个 T 表示show3方法返回值类型为T，其中的只是为了在函数声明前，定义一种范型；因此下面的函数也是合法的： 上面的方法的也是为了定义一种范型...相反的，在使用自定义的范型T之前，如果不首先使用来声明范型变量的存在的话，编译器会有错误提示： 没有声明范型变量类型T 没有声明范型变量类型T ?
extends T ：表示上界是T， ? 都是继承自T的，都是T的子类； ? super T ：表示下界是T，？...extends T； 第二、 经常往里插入的，适合用 ?...super T； （阿里JAVA开发手册强制这样使用，见集合处理的第6条） 这个用法的典型用法可以在java的集合类Collections源码中找到： public static void...super T> dest, List di=dest.listIterator(); ListIterator<?
https://www.cnblogs.com/chyu/p/4630798.html 关于Java泛型,这里我不想总结它是什么,这个百度一下一大堆解释,各种java的书籍中也有明确的定义,只要稍微看一下就能很快清楚...是java泛型中的通配符,它代表java中的某一个类,那么就代表类型T的某个子类,就代表类型T的某个父类.....那么我们马上就发现实际上是有下限T的类型....因为对于有上限T,故我们如果list.get(0)一定返回的是T或是T的子类,这个是确定的,得出: List<?....因为是T的某个父类,将子类T赋值给父类没任何问题: List<?
☞统计学知识大梳理 ☞100个统计学 & R语言学习资源网站 R语言里面也有专门做t检验的函数，t.test。...☞R入门教程——cookbook for R ☞R语言入门-工欲善其事必先利其器 t检验的应用场景也很多，比如我们经常做的差异表达分析就可以使用t检验来做。...当我们手上有很多基因的时候，该如何做t检验会更有效率呢？今天小编就给大家介绍三个批量做t检验的方法。...☞统计学知识大梳理 ☞100个统计学 & R语言学习资源网站 ☞R入门教程——cookbook for R ☞R语言入门-工欲善其事必先利其器 ☞m6a甲基化相关基因boxplot并显示p值 ☞【...R语言】P值转换成***
今天给大家介绍一个做免疫组库数据分析很实用的数据库IMGT，以及如何使用R从IMGT批量下载B细胞和T细胞受体VDJ序列文件。...一、IMGT简介 IMGT （http://www.imgt.org/）是免疫遗传学（ImMunoGeneTics）的缩写，专注于所有脊椎动物物种的免疫球蛋白、T细胞受体（T-cell Receptors...从R如何提取，合并pdf文件这里你就可以看出来。 我们先观察一下这10个文件的链接有没有什么规律，目测应该只有文件名字不一样，前面的网址应该都是一样的。查看网页源代码，果然是这样的。...也很容易，前面我们讲过通过剪贴板在R和Excel之间移动数据，那么我们可以先把这个网页上的内容贴到Excel表中，选取B列，copy，然后在通过scan函数读到R中备用。...其实前面我也简单介绍过怎么用R来获取RNA相互作用神器——ENCORI数据库中，miRNA的靶基因预测结果文件。 B细胞受体VDJ序列文件的下载链接如下，留给大家自己练习吧！
因为最近重新看了泛型，又看了些反射，导致我对Object、T（以下代指泛型）、?产生了疑惑。...我们先来试着理解一下Object类，学习Java的应该都知道Object是所有类的父类，注意：那么这就意味着它的范围非常广！首先记住这点，如果你的参数类型时Object，那么的参数类型将非常广！...《Thinking in Java》中说很多原因促成了泛型的出现，最引人注目的一个原因就是为了创造容器类。这个要怎么来理解呢？...所以我们现在能小结一下Object和T很重要的两点区别就是： Object范围非常广，而T从一开始就会限定这个类型（包括它可以限定类型为Object）。...以上就是Object、T、?的区别。多写几行代码，多做试验，多讨论，就知道在何时何地恰当的使用了。
❝本节来介绍如何使用R语言来做数据统计分析，通过「rstati」包进行t-test，完全使用tidyverse体系进行数据清洗及可视化 ❞ 安装并加载R包 package.list=c("tidyverse...require(package,character.only=T, quietly=T)) { install.packages(package) library(package, character.only...=T) } } 数据清洗 ❝自定义计算sd,se;以「0.5」为对照进行t_test,通过dplyr整理绘图数据，去掉NA,ns ❞ df % mutate(...axis.title = element_text(size = 12, hjust = 1), axis.title.y = element_text(margin = margin(r...= 12)), axis.text.y = element_text(margin = margin(r = 5)), axis.text.x = element_text
但实际上Java编译器不允许这个操作。会报错，“装苹果的盘子”无法转换成“装水果的盘子”。 ?...四、上下界通配符的副作用 边界让Java不同泛型之间的转换更容易了。但不要忘记，这样的转换也有一定的副作用。那就是容器的部分功能可能失效。 还是以刚才的Plate为例。...extends T>不能往里存，只能往外取 <?...所以通配符和类型参数的区别就在于，对编译器来说所有的T都代表同一种类型。 比如下面这个泛型方法里，三个T都指代同一个类型，要么都是String，要么都是Integer... ?...super T>不影响往里存，但往外取只能放在Object对象里 使用下界会使从盘子里取东西的get( )方法部分失效，只能存放到Object对象里。
extends T> 表示类型的上界，表示参数化类型的可能是T 或是 T的子类; 表示类型下界（Java Core中叫超类型限定），表示参数化类型是此类型的超类型（父类型），直至Object; 上界首先你很容易误解它为继承于T的所有类的集合，你可能认为，你定义的这个List可以用来put任何T的子类，那么我们看下面的代码： import java.util.LinkedList...; import java.util.List; public class test { public static void main(String[] args) { List...而当我们读取的时候，编译器在不知道是什么类型的情况下只能返回Object对象，因为Object是任何Java类的最终祖先类。但这样的话，元素的类型信息就全部丢失了。
泛型是Java SE 1.5的新特性，泛型的本质是参数化类型，也就是说所操作的数据类型被指定为一个参数。这种参数类型可以用在类、接口和方法的创建中，分别称为泛型类、泛型接口、泛型方法。...Java语言引入泛型的好处是安全简单。...表示不确定的java类型 T (type) 表示具体的一个java类型 K V (key value) 分别代表java键值中的Key Value E (element) 代表Element 举个栗子：...下面举个栗子比较下这三种： package com.lyang.demo.fanxing;import java.util.Arrays;import java.util.List;public class...如果T是一个Java类型，那么T.class就代表了匹配的类对象。 Class clazz = List.class; ** 那么问题来了？
p=6261 t检验是统计学中最常用的检验之一。双样本t检验允许我们基于来自两组中的每一组的样本来测试两组的总体平均值相等的零假设。 这在实践中意味着什么？...现在让我们用R来检验样本均值分布（在重复样本中）收敛到正态分布的速度。我们将模拟来自对数正态分布的数据 - 即log（X）遵循正态分布。我们可以通过从正态分布中取幂随机抽取来从此分布中生成随机样本。...从表面上看，我们会担心对这些数据使用t检验，假设X是正态分布的。 ?...这表明对于这个特定的X分布，t检验应该是正确的，n = 100 。检查这种情况的更直接的方法是进行模拟研究，其中我们凭经验估计t检验的1型错误率，在给定的n选择下应用于该分布。...当然，如果X不是正态分布的，即使假设正态性的t检验的类型1错误率接近5％，测试也不会是最佳的。也就是说，将存在零假设的替代测试，其具有检测替代假设的更大功率。
进行转置 t(data) ? 数值型数据全部变成了字符型，怎么回事？其实是因为cluster那一列数据并不是数值型，而是字符型。因为这一列代表某一群细胞，如cluster0.所以才会出现这个情况。
如: a> 当某个数据不可能为负数时我们一定要考虑用以下类型: unsigned char, unsigned int, uint32_t, size_t, uint64_t, unsigned long...int, b> 当有些数据你不知道是正负时一定不要用”a>”中的类型, 不然他永远也不可能为负. c> 数据的边界值要多注意, 如: uint32_t a, b, c; uint64_t...m; m = a * b + c; 在该运算中可能出现错误, “a*b”的类型可能超过uint32_t的最大值,这时一定不要忘了类型转换. m = ((uint64_t)a) * b + c; 2>....我们都知道linux C开发中的常见扩展数据类型的定义有:uint8_t, uint16_t, uint32_t, uint64_t, size_t, ssize_t, off_t …....他之所以要自己定义出数据类型是有道理的, 如: typdef unsigned int uint32_t; 表示uint32_t为32位无符号类型数据, 其实size_t也是32位无符号数据类型,为什么不直接写
高维数据可视化之t-SNE算法 t-SNE算法是最近开发的一种降维的非线性算法，也是一种机器学习算法。...与PCA一样是非常适合将高维度数据降低至二维或三维的一种方法，不同之处是PCA属于线性降维，不能解释复杂多项式之间的关系，而t-SNE是根据t分布随机领域的嵌入找到数据之间的结构特点。...> tsne_out<-Rtsne(iris1) #c++实现Barnes-Hut t-分布式随机邻居嵌入的封装器， 通过设置theta=0.0可以计算出t-SNE的准确值， 降维全靠Rtsne()函数...t-SNE的局限性：若原始数据本身具有很高的维度，是不可能完整映射到二或三维空间，而且在t-SNE图中，距离本身是没有意义的，涉及概率分布问题。
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