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基因注释:区间范围匹配

今天,有老师问我一个问题,如果从一个区间匹配到另一个的区间范围,并找出来。我觉得比较有代表性,就写篇博客总结一下。...「换到基因注释的领域,看一下相关需求:」 1,显著性的SNP位点,取上下游50k的位点,作为候选的区间 2,将候选区间有基因的,匹配到SNP的右边 「处理注意:」 1,显著SNP在上下游区间时,可能会有交叉...,所以要先合并(merge) 2,匹配基因时,一个SNP区间可能会有多个基因 1....上面的信息中,有些SNP匹配到了多个基因,也就是基因是有重复的。 如果我们想看每个SNP匹配的基因情况,可以用上面的结果 如果我们想看一下共有多少无重复的基因匹配,就需要对SNP区间先合并 4....基因注释的不同玩法 把上面SNP的区间,作为显著性SNP上下游的信息,把基因的信息作为gff基因文件,就可以进行基因注释了! 上面的玩法都可以做。

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GWAS分析后的基因注释:区间范围匹配

「换到基因注释的领域,看一下相关需求:」 1,显著性的SNP位点,取上下游50k的位点,作为候选的区间 2,将候选区间有基因的,匹配到SNP的右边 「处理注意:」 1,显著SNP在上下游区间时,可能会有交叉...,所以要先合并(merge) 2,匹配基因时,一个SNP区间可能会有多个基因 1....上面的信息中,有些SNP匹配到了多个基因,也就是基因是有重复的。 如果我们想看每个SNP匹配的基因情况,可以用上面的结果 如果我们想看一下共有多少无重复的基因匹配,就需要对SNP区间先合并 4....合并SNP区间再匹配 合并命令: bedtools merge -i snp_infor.ped >snp_infor_merge.ped 原始数据: $ cat snp_infor.ped chr1...基因注释的不同玩法 把上面SNP的区间,作为显著性SNP上下游的信息,把基因的信息作为gff基因文件,就可以进行基因注释了! 上面的玩法都可以做。

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js】如何正确的写代码注释

错误注释 你的注释是不是这样的? //时间戳日期格式化函数 function formTime(time,isyear){ } 亦或者是这样的?...、易维护、易理解,起到提示的作用的,上面的两个注释都是正确的,但是它起到的作用太低了,在正式工作中我们往往会协同开发,这种注释是万万不可的。...正确注释 正确的注释 就是文档注释,先来看看是什么样子。...优点 方法提示 time是个字符串 我们要截取字符串 普通注释 文档注释 内容提示 鼠标移动到函数以及参数上所给的提示。...npm install jsdoc -g 基本使用 jsdoc 文件名 其他的使用方式可以去官网查看 jsdoc 33.js 执行完此命令,会生成一个out文件夹,查看里面的index页面即可,右边侧边栏会显示函数的使用

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Java正则匹配空格_js正则表达式匹配空格

解决方案 利用正则表达式来匹配空格 \\s+ 首先利用split(“\\s+”);方法来对字符串切割,尽可能的匹配空格,这里也挺有意思,因为空格数目不一样,可以动态变换匹配的空格数量,这个实现原理可以看看底层原理...() 是为了提取匹配的字符串。表达式中有几个()就有几个相应的匹配字符串。(\s*)表示连续空格的字符串。 []是定义匹配的字符范围。...{}一般用来表示匹配的长度,比如 \s{3} 表示匹配三个空格,\s{1,3}表示匹配一到三个空格。 (0-9) 匹配 '0-9′ 本身。...[0-9]* 匹配数字(注意后面有 *,可以为空)[0-9]+ 匹配数字(注意后面有 +,不可以为空){1-9} 写法错误。...另外,括号在匹配模式中也很重要。这个就不延伸了,LZ有兴趣可以自己查查 []表示匹配的字符在[]中,并且只能出现一次,并且特殊字符写在[]会被当成普通字符来匹配

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括号匹配算法的JS简单实现

完整示例 See the Pen 括号匹配算法演示 by 戴兜 (@DaiDR) on CodePen....括号匹配算法 (1)(2)(3)(4)(5) 观察上面这组括号,不难发现当 ) 的左侧不存在另一个 ) 时(即未发生嵌套时),最靠近它的 ( 便是和它所对应的括号。...既然最内层的括号依然能够被匹配,似乎也不是无药可救。既然数字能够被跳过,内部嵌套的括号也应该可以被跳过才对。我们通过递归来匹配内部嵌套的括号并将其跳过。...有效性判定 我们没有办法保证每次匹配的字串都是有效的,像 )()((()()( 这种情况可能就会抛出错误。所以在匹配前对字符串进行简单的校验是必要的。 如何校验?...逻辑相似,我们只需要校验每对括号是否都被匹配就行了。从左向右遍历字串,如果当前位置是 ( 时,将其压入数组。

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P3375 【模板】KMP字符串匹配(全程注释,简单易懂)

所以两个匹配位置为1和3,输出1、3 裸KMP 思路来源http://www.cnblogs.com/c-cloud/p/3224788.html 1 #include 2 #include...=b[i])//当出现不匹配的情况的的话,就让j从p数组中取一个能继续匹配的元素 16 j=p[j-1];// 因为对j的最后一次处理是j++,而p是从0开始,故j=p[j-1] 17...p[i]=j;// 将每一个元素的最长公共前后缀的长度记录下来,方便以后处理 20 } 21 } 22 void KMP() 23 { 24 int j=0;// 已经匹配的最长的长度...=a[i])// 当将要匹配的元素不想同且找到相同的匹配元素的时候 28 j=p[j-1];// j==0的时候p[-1]不存在,所以j>0 29 if(b[j]==...a[i])// 同理,当将要匹配的元素相同的时候,j++ 30 j++; 31 if(j==lb)// 找到一个匹配 32 printf("%

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Annotorious.js 入门教程:图片注释工具

使用 Fabric.js 或者 Konva.js 等库确实可以实现,但多少觉得有点大炮打蚊的感觉,好奇有没有专门做图片标注的工具呢? 在网上搜了一下发现 Annotorious 可以实现这个功能。...Annotorious 提供了图片注释和标注功能,而且用法很简单。 本文分为 【快速入门】和【API讲解】两部分。 【快速入门】部分包含 Annotorious 的安装、使用、导入导出的讲解。...-- 引入js --> <script src="https://cdn.jsdelivr.net/npm/@recogito/annotorious@2.7.10/dist/annotorious.min.<em>js</em>...因为如果你不允许<em>注释</em>为空的话,当你点击空白处时选框就会消失。 禁止选中选框 disableSelect 将 disableSelect 设置为 true 后,画布上的选框就无法再次选中了。...、清空所有<em>注释</em>等。

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【Python】Python 注释 ( 单行注释 | 多行注释 | 代码示例 )

文章目录 一、Python 注释 1、单行注释 2、多行注释 3、代码示例 单行注释 : # 单行注释 多行注释 : """ 多行注释 多行注释 多行注释 """ 一、Python 注释 ---- Python...注释 可以 对 代码 进行解释说明 , 代码中的 注释 不会被执行 , 可以 增加代码的可读性 ; 1、单行注释 单行注释 : Python 中的 单行注释 以 # 开头 , # 右边是注释内容 ;...单行注释 中 , # 与 注释内容 建议使用 空格隔开 , 这是 Python 官方的建议 , 建议大家都遵守该规范 ; 单行注释 可以 独立占一行 , 也可以 写在代码右侧 ; 在 C / C++ /...之间添加空格 , 警告信息消失 ; 代码示例 : 下面的代码中 , 第一行中的 单行注释 独占一行 , 第二行中的 单行注释 在代码的右侧 ; # 单行注释 print(123) #...单行注释 2、多行注释 Python 多行注释 使用三个双引号 引起来 ; 三个双引号 即可以进行单行注释 , 又可以多行注释 , 代码如下 : """ 多行注释 """ """ 多行注释

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