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    Nat. Mach. Intell. | MolCLR:一个用于分子表征学习的自监督框架

    今天介绍的是卡内基梅隆大学化学工程系的Amir Barati Farimani 教授最新发表在 Nature Machine Intelligence上的文章 ”Molecular contrastive learning of representations via graph neural networks”. 该文提出一种自监督的图神经网络框架MolCLR,利用大量无监督的标签进行自监督学习,有效缓解了因为数据标记有限而阻碍将分子机器学习推广到巨大的化学空间的难题。同时,本文提出了三种全新的分子图的增强方法:原子屏蔽、键删除以及子图删除,所提的分子图增强方法保证了增强时同一分子的一致性最大化以及不同分子一致性的最小化。实验表明,MolCLR 大大改善了 GNN 在各种分子特性基准上的表现。

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