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bam文件读入R,并且转为grange对象

有成熟的R包可以bam文件读入R,比如Rsamtools,很简单的代码: library(Rsamtools) bamFile="alignResults.BAM" quickBamFlagSummary...genbioconductor/html/Rsamtools.html bam <- scanBam(bamFile) bam 值得注意的是,这里我虽然不再演示了,但是作为初学者的你,应该是知道 但是读入的数据变成...grange对象就需要一点点技巧,下面演示如何创建grange对象samtools等命令行工具有多复杂的功能和技巧, 那么这个R包就可以多复杂,如果你学习足够努力,那就发一个你比较Rsamtools和samtools...关于 grange对象 三年前我在生信菜鸟团博客就多次强调过这个重点了,在R里面处理生物信息学数据是躲不过这个定义的,有点类似于各式各样的生物信息学文件格式,是一个标准。...对这个grange对象也会有很多很多的方法,假设有一个grange对象命名为exon_txdb,来自于代码 library("TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene") txdb

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jquery.ajax()怎么获取来的内容转为JSON,并使用。

现在越来越多的接口调用返回的数据类型为json数据类型,所以我们在写网页的时候通过AJAX调用数据的话可以通过设置JQ的属性 dataType : "json", 来设置返回数据的格式。...设置了这个属性之后我们就可以按JSON格式使用AJAX返回的内容。...实际代码如下: $.ajax({ type: 'GET', url: 'url.php', dataType : "json",...最后在啰嗦几句: 以上代码需要注意的一点是:在写JSON格式数据内容的时候一定要注意格式的准确性,数组的标题一定要用双引号引起来,字符型的数据也一定要用双引号引起来,数值型的可以不用符号引入。...这是我自已已经踩过的坑,因为格式没写好折腾大半夜才找出问题,所以我的经验分享出来警示大家。良好的代码习惯真的会给你节省大量的开发时间,切记。

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js数组、jsonjs对象的区别与联系

最近在敲代码时,遇上了一个关于JS数组的问题,由此引发了关于对象json的联想,曾经觉得很畅顺的知识点突然模糊了。于是,为了理清这些东西,有了如下这篇文章。...(2)自定义js对象,这里我构造一个和json相似的对象来找到区别,这里写了两种构造方法 var person = {key:“value”} var person = new object();...字符串) ==》 转化成json对象 JSON.stringify(json对象) ==》转化为json字符串 二、js对象json对象 js对象, var person = {key:“...记得上面概念里,js所有事物都是对象,那么我们完全可以json对象当做js对象的子集,string只是js对象的key的数据类型中的一个选项 额外说一点,js里面是没有键值对数组这一说的,现有的这种键值对数组...,即map json格式常用于数据传输方面,其他情况遇到类似json对象的形式,可以它当成是特殊的js对象来处理,例子如下 var a = { “star”:{“img”:require

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js如何将json字符串转成json对象_前端json字符串转json对象

”: “man” }’; JSON对象: var str2 = { “name”: “cxh”, “sex”: “man” }; 一、JSON字符串转换为JSON对象 要使用上面的str1,必须使用下面的方法先转化为...JSON对象: //由JSON字符串转换为JSON对象 var obj = eval(‘(‘ + str + ‘)’); 或者 var obj = str.parseJSON(); //由JSON字符串转换为...JSON对象 或者 var obj = JSON.parse(str); //由JSON字符串转换为JSON对象 然后,就可以这样读取: Alert(obj.name); Alert(obj.sex);...特别注意:如果obj本来就是一个JSON对象,那么使用eval()函数转换后(哪怕是多次转换)还是JSON对象,但是使用parseJSON()函数处理后会有问题(抛出语法异常)。...例如: var last=obj.toJSONString(); //将JSON对象转化为JSON字符 或者 var last=JSON.stringify(obj); //将JSON对象转化为JSON

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