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基因ID转换工具比较

写在前面 昨天我们介绍了三个ID转换的工具: DAVID、g:Convert 以及 biomart,但是这个工具内置的数据怎么样并不清楚,所以今天就来评价一下这几个工具吧。...数据准备 由于我们使用最多的是TCGA的数据,所以我们就用TCGA的ID号来进行一下多个数据库的评估。 ? 首先由于TCGA比对的ID使用的是ENSG + 版本的的样式。...这样的ID号我们只能只能使用biomart来进行转换,同样的转换的结果也不是很理想。至于说TCGA的ID号怎么转换最好,这个我们可以明天再讲一下。...拆成了ENSG类别的ID号来进行多数据库评价。我们这里选择随机的999个基因ID来进行评价。 ? 多数据库评价结果 利用这999个ENSG ID号,我们在DAVID数据库当中进行了转换。...写到最后 以上就是我们对于三个数据库的比较以及对于biomart使用过程当中的一个对于基因类型注释的小技巧。

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