DOCK是经典的分子对接软件,很多对接软件的思路都是它的基础上发展起来的,但是无奈操作太复杂,上手的或者用来做科研的论文上少见。...http://ringo.ams.sunysb.edu/index.php/DOCK_Tutorials
---- DOCK教程 ---- 简介: DOCK是基于Unix的科学计算软件。 遵循通用的安装方法:下载,解压缩,配置,构建和测试。DOCK的简单配置方案基于纯文本文件。...DOCK的安装是如此简单和透明,以使用户有机会自己解决问题。 DOCK是经典的分子对接程序,用于识别潜在的结合构象以及分子与靶标的相互作用。...DOCK能做的 预测小分子-蛋白质复合物的结合模式 搜索配体的数据库,以模拟经过实验验证的抑制剂的抑制性结合相互作用的化合物 在配体数据库中搜索与特定蛋白质的特定位点结合的化合物 搜索与核酸靶标结合的化合物的配体数据库...---- 对接步骤: (1)下载蛋白结构文件: 1ABE.pdb (2)准备受体文件 删除配体分子文件 使用chimera的dock prep功能对受体文件进行准备(删除) 删除水分子,加氢,加电荷 保存为...或者说对接口袋) 需要程序/指令:showsphere sphere_selector (5)生成Grid 围绕着活性位点建立一个box 生成Grid (6)Docking 进行对接(半柔性): 需要程序/指令:dock6
Dock从初级到高级全套教程 dock是iMac中很常见的一个功能,而且非常实用,那么dock到底是什么意思呢?...1.经常使用苹果电脑的小伙伴,和大家讨论时总会听到有人在说dock栏,不过还是有很多小伙伴不知道dock到底是什么意思,接下来小编就给大家普及一下。...2.dock一般指的就是苹果操作系统中的停靠栏,也就是苹果电脑桌面中最下方,类似于Windows系统下方的任务栏,不过要比Windows任务栏更加有趣味性。...3.dock的主要作用就是启动、切换运行中的应用程序,是一种很实用的功能界面,适用于Mac OS X操作系统。不过如今不同的操作系统中,都有很多不同的dock程序。...4.如今dock已经不仅仅是用在苹果电脑中了,苹果的所有产品都有这个功能了,比如说iPad中最下方,类似于毛玻璃的那一栏,就是dock系统。同理iPhone下方那一栏也是。
要安装最新的 Docker 版本,首先需要安装 apt-transport-https 支持,之后通过添加源来安装。要安装最新的 Docker 版本,首先需要安...
对接 直接进行半柔性对接,刚性对接不感兴趣 使用指令: dock6 -i dock.in 创建文件dock.in 参数详解: http://dock.compbio.ucsf.edu/DOCK_6/tutorials.../ligand_sampling_dock/ligand_sampling_dock.html 格式为: conformer_search_type...../3_grid/grid multigrid_score_secondary no dock3.5...20 rank_ligands yes 输入指令,进行运算: dock6...-i dock.in -o dock.out 输出文件: dock.out为总结的参数文件 anchor_and_grow_ranked.mol2为输出文件,里面有20个排名较高的mol 使用chimera
FF/ UUUUUUU/ CC/ CC\ SSSSSS/ FFFFFFFFF/ University of California at San Francisco, DOCK...-1 working_directory /Users/sujiaqi/Desktop/PyDrug.0.4/PyDrug_going/PyDrug_DOCK...0.75 ____________________File_Input____________________ receptor_file rec-1htp-dock-prep.mol2...box_file rec_box.pdb vdw_definition_file /Users/sujiaqi/Program/dock6
此外,HyperDock还支持对Dock中的文件夹、文档和网站进行快速预览和访问。它还允许用户自定义所需的快捷键和手势,以进一步提高工作效率。
DockView for Mac(Dock窗口预览工具)以下是DockView的一些特点:预览窗口:DockView允许用户在Dock中预览不同应用程序的打开窗口,无需切换到该应用程序即可通过鼠标悬停在...Dock图标上进行查看。
生成Spheres 官方教程链接: http://dock.compbio.ucsf.edu/DOCK_6/tutorials/sphere_generation/generating_spheres.htm...步骤 接上文,已经完成了蛋白受体以及配体的准备,加氢加电荷 现在开始准备生成Spheres 生成Sphgen是DOCK的必须 Sphgen生成多组重叠的球体,以描述分子或分子表面的形状。...生成Sphgen (1)使用chimera的工具生成dms File -> Open -> rec-1htp-dock-prep.mol2.
如何在没有 Ubuntu Dock 的情况下访问活动概览 如果没有 Ubuntu Dock,你可能无法访问活动的或已安装的应用程序列表(可以通过单击 Dock 底部的“显示应用程序”按钮从 Ubuntu...Dock 访问)。...方法 1: 移除 Gnome Shell Ubuntu Dock 包 摆脱 Ubuntu Dock 的最简单方法就是删除包。...Ubuntu Dock 只对你的桌面隐藏,当你进入叠加模式(活动)时,你仍然可以看到并从那里使用 Ubuntu Dock。...to Dock 的一个很好的替代品(Ubuntu Dock 是从 Dash to Dock 分叉而来的)。
如果用户启用 Space 模式,只需把鼠标移到 Dock 正在运行的程序上,即可显示该应用程序属于第几个 Space。...HyperDock for Mac(Dock优化工具)
HyperDock for Mac(Dock优化工具) 图片
DockView for Mac(Dock窗口预览工具)
readonly double ORIGNSIZE = 60; //宿主容器,即容纳SilverDock元素的父控件 internal SilverDock Dock..., Dock.MaxDistance, distance); item.Width = zoom * Dock.Size; item.Height...= zoom * Dock.Size; } } /// /// Handles the MouseLeave...) { totalWidth += item.Width; } Dock.ContentPanel.Width...SilverDockItem子元素 public void AddItem(SilverDockItem item) { item.Dock
当在C#项目开发中,在窗体界面的设置经常用到Dock属性值。这里一panel面板的Dock属性值为例描述其作用。...当容器中的控件的Dock属性设置为Fill时,可能会覆盖其他Dock属性为Top,Bottom,Right,Left的控件。...应用Dock时,越是底层的控件,其优先级越高。 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。
今天说一说dock是什么意思?「建议收藏」,希望能够帮助大家进步!!! Dock从初级到高级全套教程 dock是iMac中很常见的一个功能,而且非常实用,那么dock到底是什么意思呢?...1.经常使用苹果电脑的小伙伴,和大家讨论时总会听到有人在说dock栏,不过还是有很多小伙伴不知道dock到底是什么意思,接下来小编就给大家普及一下。...image.png 3.dock的主要作用就是启动、切换运行中的应用程序,是一种很实用的功能界面,适用于Mac OS X操作系统。不过如今不同的操作系统中,都有很多不同的dock程序。...3.dock的主要作用就是启动、切换运行中的应用程序,是一种很实用的功能界面,适用于Mac OS X操作系统。不过如今不同的操作系统中,都有很多不同的dock程序。...image.png 4.如今dock已经不仅仅是用在苹果电脑中了,苹果的所有产品都有这个功能了,比如说iPad中最下方,类似于毛玻璃的那一栏,就是dock系统。同理iPhone下方那一栏也是。
0 前言 前面有一篇文章是介绍用 TranslucentTB 让任务栏变透明,要是有个类似 Mac 的 Dock(程序坞)就更好了。...安装好之后就能在屏幕顶部看到 Dock 栏了。 ? 3 配置/使用 点击程序设置进入 RocketDock 的设置页,把语言改成中文,勾选启动时自动运行。 ? 位置可以修改成在屏幕的别的地方。
Mac电脑Dock是什么意思,Dock怎么用?个人总感觉,不能原谅我们自己的惰性!遇到问题自己想办法独立解决,解决不了,可以想办法求助搜索引擎。如果连这也做不到,那实在是无可救药了!...一、Mac电脑Dock是什么意思 Dock的汉语意思是码头港口。在苹果Mac OS X操作系统(还有它的前辈们)中,是操作系统图形界面中,对应用程序进行相关操作的一种功能界面。...二、Dock怎么用 我们这里提供两种常见操作:设置显示位置和删除添加应用程序图标 1、设置Dock显示位置 第一步、点击桌面Dock上面的“系统偏好设置”图标,也可以点击左上角苹果图标,菜单中点击选择“...系统偏好设置” 第二步、在出现的“系统偏好设置”界面,点击个人项目下的Dock 第三步、在Dock界面,,您就可以设置Dock大小、放大比例、Dock在屏幕上的位置[屏幕左边、屏幕底部(默认)以及屏幕右边...2、删除添加应用程序图标 Mac电脑Dock是什么意思,Dock怎么用的内容,完全在于一个使用经验! 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。
,注销进入的时候选择dock就OK了 ubuntu安装 apple的Glx-Dock / Cairo-Dock界面 点击打开链接 苹果的MAC OS里的dock任务栏让人印象深刻。...Dock是苹果公司Mac OS X操作系统,及其始祖NeXTSTEP和OPENSTEP操作系统中重要组成部分。在 Newton OS中也有dock概念的一些早期例子。...现在在不同操作系统中有很多不同的dock程序。 在ubuntu等linux系统中,现在已经可以非常方便的安装使用dock任务栏了,因为很多仿dock的程序都已经进入到ubuntu官方源中。...现在就推荐两款dock程序。 推荐一: Docky,一个号称花钱也买不到的最棒的docky。这个dock工具占资源小,比较稳定,也是我现在一直在使用的。...以后,Cario-Dock默认开机启动。这个时候,ubuntu自带的底部任务栏也可以删除了。 2,在Cario-Dock上右键点击设置,可以进行相关设置,这个dock可以进行更多的设置。
Dock栏就是Mac电脑屏幕下方的那一排快捷键,我们可以把自己常用的程序放到Dock上面,这样可以帮助我们快速的打开自己想要打开的文件和程序,默认情况下,OS X 的 Dock 置于屏幕的底部。...其实,我们不仅可以自定义 Dock 中显示的内容,而且你还可以调整 Dock 的大小、位置等等,下面给大家介绍几个关于Dock栏使用技巧,让大家使用Mac电脑更加得心应手。...3.点击按住该应用程序图标并将其拖到 Dock 中(当移动图标到 Dock 时,Dock 中的已有应用程序图标将向两侧移动来腾出空间)。 4.松手即可将应用程序将留在 Dock。...二、从 Dock 移除应用程序,文件夹和文件 在你尝试从 Dock 中移除应用程序之前,请先退出该应用程序,因为打开的应用程序图标将始终显示在 Dock 上。...三、 改变 Dock 的大小和位置 你可以调整 Dock 大小,调整图标的缩放效果(当你鼠标指针移到 Dock 的时候),调整 Dock 的位置(左边,屏幕下方或右边),调整最小化窗口的动画效果等。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云