如果你已经安装了vim/vi的话，这个教程其实已经在你的电脑里了，你只需要在终端输入vimtutor即可（对于windows用户，你需要设置vim的路径到环境变量的path中）。...昨天晚上看了看这个教程，很不错，花个半小时看完，能让你进入vim世界的大门。
看了文字还在这里BB，自己又高尚到哪里去了 最详细的Vuex教程 什么是Vuex？ vuex是一个专门为vue.js设计的集中式状态管理架构。状态？
初次使用或没有保存设置的大多需要重新设置使用默认设置，如果想偷懒可以右下角跳过设置
上周的教程中，我们讲解了使用omicverse进行单细胞测序数据的预处理的一些思想。...关于omicverse的使用文档与安装教程可以参考我们的readthedocs(https://omicverse.readthedocs.io/)....统一流形逼近和投影（UMAP）显示出最高的稳定性，并且最好地分离了原始细胞群体。在这种情况下，值得一提的另一种降维方法是主成分分析（PCA），它仍然被广泛使用。...思考 为了加深你对本章的理解，我们提出了以下思考题，如有兴趣作答者，可将答案发送至邮箱starlitnightly@163.com，邮件标题为姓名/昵称-单细胞最好教程（四）思考题 tsne与umap哪一个算法更好...往期回顾 单细胞最好的教程（三）：特征基因选择 单细胞最好的教程（二）：归一化 Python 单细胞分析教程（一）：质量控制 Seurat对象内部结构 胎儿视网膜和干细胞来源的视网膜类器官的scATAC-seq
Apache的配置由httpd.conf文件配置，因此下面的配置指令都是在httpd.conf文件中修改。
背景 在前面的教程中，我们从数据集中删除了低质量的细胞，包括计数较差以及双细胞，并将数据存放在 anndata文件中。...我们首先导入我们所需要的Python包，以及上一个教程分析所得到的anndata文件。...一键式归一化 我们在omicverse中提供了预处理函数pp.preprocess，该方法可直接计算移位对数或皮尔森残差，方法内同时包括了基于移位对数/皮尔森残差的高可变基因的选择方法，高可变基因会在下一节的教程中进行讲解
前言提到，在过去两天的教程中，我们讲解了使用omicverse进行单细胞测序数据的质控以及归一化的一些思想。...关于omicverse的使用文档与安装教程可以参考我们的【readthedocs】 就是，本系列教程是我带本科生所用到的，所以概念会尽可能地通俗，详细，但对于急于求成的人，可能不是一个很好的教程。...基于基因离散度的方法寻找高变基因有两个途径： 指定目的高变基因数 指定离散度，平均值过滤高变基因 在这里，我们分别尝试两种不同的方法，首先是基于指定高变基因数的方法： 2.1 指定高可变基因数 由于是教程演示...思考 为了加深你对本章的理解，我们提出了以下思考题，如有兴趣作答者，可将答案发送至邮箱starlitnightly@163.com，邮件标题为姓名/昵称-单细胞最好教程（三）思考题 我们为什么要选择高可变基因...往期回顾 单细胞最好的教程（二）：归一化 Python 单细胞分析教程（一）：质量控制 Seurat对象内部结构 胎儿视网膜和干细胞来源的视网膜类器官的scATAC-seq发现细胞命运改变过程中的染色质变化
我们前面四次教程，已经完成单细胞数据的预处理了，包括质控，归一化，高可变基因筛选，降维。现在，我们就要开始单细胞测序的正式分析了，细胞类型注释等，在开始介绍细胞类型注释前，我们先来了解一下聚类。...思考 为了加深你对本章的理解，我们提出了以下思考题，如有兴趣作答者，可将答案发送至邮箱starlitnightly@163.com，邮件标题为姓名/昵称-单细胞测序最好的教程（五）思考题 我们为什么要计算...往期回顾 单细胞分析工具||ShinyCell交互式展示单细胞数据 单细胞最好的教程（四）：降维 单细胞最好的教程（三）：特征基因选择 单细胞最好的教程（二）：归一化 Python 单细胞分析教程
你是否经常会有这样的感觉：大脑空白一片，思考速度太慢，思绪杂乱伍长。利用思维导图可以帮助我们从最几本的形象思考训练起，快速提升我们的思考速度、广度、深度。 ...
我们前面四次教程，已经完成单细胞数据的预处理了，包括质控，归一化，高可变基因筛选，降维。现在，我们就要开始单细胞测序的正式分析了，细胞类型注释等，在开始介绍细胞类型注释前，我们先来了解一下聚类。...思考 为了加深你对本章的理解，我们提出了以下思考题，如有兴趣作答者，可将答案发送至邮箱starlitnightly@163.com，邮件标题为姓名/昵称-单细胞测序最好的教程（五）思考题 我们为什么要计算
背景 在前面的教程中，我们从数据集中删除了低质量的细胞，包括计数较差以及双细胞，并将数据存放在 anndata文件中。...我们首先导入我们所需要的Python包，以及上一个教程分析所得到的anndata文件。...一键式归一化 我们在omicverse中提供了预处理函数pp.preprocess，该方法可直接计算移位对数或皮尔森残差，方法内同时包括了基于移位对数/皮尔森残差的高可变基因的选择方法，高可变基因会在下一节的教程中进行讲解...思考 为了加深你对本章的理解，我们提出了以下思考题，如有兴趣作答者，可将答案发送至邮箱starlitnightly@163.com，邮件标题为姓名/昵称-单细胞最好教程（二）思考题 我们在进行移位对数分析的时候...往期回顾 Python 单细胞分析教程（一）：质量控制 Seurat对象内部结构 胎儿视网膜和干细胞来源的视网膜类器官的scATAC-seq发现细胞命运改变过程中的染色质变化 初探单细胞下游 duplicated
NumPy是Python中用于数据分析、机器学习、科学计算的重要软件包。它极大地简化了向量和矩阵的操作及处理。python的不少数据处理软件包依赖于NumPy作...
为了保证可读性，本文采用意译而非直译。另外，本文版权归原作者所有，翻译仅用于学习。
前言提到，在过去两天的教程中，我们讲解了使用omicverse进行单细胞测序数据的质控以及归一化的一些思想。...关于omicverse的使用文档与安装教程可以参考我们的【readthedocs】(https://omicverse.readthedocs.io/)....就是，本系列教程是我带本科生所用到的，所以概念会尽可能地通俗，详细，但对于急于求成的人，可能不是一个很好的教程。 1....基于基因离散度的方法寻找高变基因有两个途径： 指定目的高变基因数 指定离散度，平均值过滤高变基因 在这里，我们分别尝试两种不同的方法，首先是基于指定高变基因数的方法： 2.1 指定高可变基因数 由于是教程演示
本系列教程首发于“[单细胞最好的中文教程](single_cell_tutorial Readthedocs[1])”，未经授权许可，禁止转载。...为了加深你对本章的理解，我们提出了以下思考题，如有兴趣作答者，可将答案发送至邮箱starlitnightly@163.com，邮件标题为姓名/昵称-单细胞最好教程（六）思考题 基于marker字典的注释...adata.obs['major_celltype'] = adata.obs['leiden'].map(cluster2annotation).astype('category') 参考资料 [1] 单细胞最好的中文教程...doi/abs/10.1002/eji.202249797 [22] TOX: https://www.nature.com/articles/s41586-019-1325-x 往期回顾 单细胞测序最好的教程...（五）：聚类 单细胞最好的教程（四）：降维 单细胞最好的教程（三）：特征基因选择 单细胞最好的教程（二）：归一化 Seurat对象内部结构 Bulk和scRNA-seq的综合分析揭示与心力衰竭相关的细胞类型
作者按 本教程将是本系列教程中最重要的一章，我们后续所有的单细胞分析，都要基于准确的细胞类型注释。...本系列教程首发于“[单细胞最好的中文教程](single_cell_tutorial Readthedocs[1])”，未经授权许可，禁止转载。...为了加深你对本章的理解，我们提出了以下思考题，如有兴趣作答者，可将答案发送至邮箱starlitnightly@163.com，邮件标题为姓名/昵称-单细胞最好教程（六）思考题 基于marker字典的注释
docker不是一个值得投入的领域，它解决的问题是Unix系统最初设计的一个疏忽。从一个不会用docker的小白，自己一步一步的摸索，中间也踩过许多坑。但任然，...
富 Web 时代，应用变得越来越强大，与此同时也越来越复杂。集群部署、隔离环境、灰度发布以及动态扩容缺一不可，而容器化则成为中间的必要桥梁。
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