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生存分析时间点问题

datasets) 2016-04-27 前者数据是 IlluminaHiSeq TCGA hub表达矩阵,基因SYMBOL的表达矩阵,基因的表达信息,通常是用来把病人进行分组,然后还是需要下载临床信息,才能做生存分析...分分钟对TCGA数据库的任意癌症种类做生存分析,并校验 发现TCGA数据库记录病人的生存事件的时候,区分Alive和Dead,但是呢,不同的事件本来是应该对应不同的时间记录字段,但是突然就发现了一个特例...构建生存分析需要的时间 我这里使用的代码好像很复杂: table(phe$vital_status) phe=phe[phe$vital_status %in% c('Alive' , 'Dead'),...但是也有情况出现就是他们不一致,所以就出现了bugs 生存分析代码是 有了上面的数据, 就可以做生存分析并且绘制代码了。...但是,其实是有些癌症的性别生存差异是显著的,大家猜猜看是哪一个呢?

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Redis 键的生存时间和过期时间

Redis的键可以设置生存时间和过期时间,这个过期时间是如何设置的呢,可以简单看下: 通过 EXPIRE 命令或者 PEXPIRE 命令,客户端可以以秒或者毫秒精度为数据库中的某个键设置生存时间(TTL...),在经过制定的秒数或者毫秒数之后,服务器就会自动删除生存时间为0的键。...这个问题有三种可能的答案,分别代表了三种不同的删除策略: 定时删除:在设置键的过期时间的同时,创建一个定时器,让定时器在键的过期时间来临时,立即执行对键的删除操作。...对CPU时间是不友好的,在过期键很多的情况下,删除过期键往往耗费了不少的CPU资源; 惰性删除:放任键过期不管,但每次获取键时,查询是否过期,如果过期就删除该键,否则就返回该键。...这种策略对CPU时间是友好的,因为只有访问的时候才判断是否删除,基本不占用CPU资源。

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如何合并ESTIMATEScore和生存时间

记录肿瘤组织中基质的存在) 2)ImmuneScore 免疫评分(代表免疫细胞在肿瘤组织中的浸润) 3)ESTIMATEScore 估计分数(推断出肿瘤的纯度) 一、我们可以从TCGA下载到特定肿瘤样本的生存时间...生存时间的数据如下 StromalScore,ImmuneScore和ESTIMATEScore文件如下 你会发现ESTIMATEScore文件中样本的ID号比较长,而生存时间文件中样本ID比较短...那么我们就提取ESTIMATEScore文件中样本的前12位,然后跟生存时间里面的样本ID做比较,找到一样的ID就把免疫分值和生存时间合并起来。...,header=T,sep="\t") #提取样本ID的前12位最为新的样本ID id=substr(score$ID,1,12) #将新ID号作为行名 rownames(score)=id #读入生存时间文件...read.table("Overall_Survival_month.txt",header=T,sep="\t") #将样本ID号作为行名 rownames(os)=os$Patient.ID #删掉生存状态中

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Flink 状态生存时间(State TTL)设置

为什么状态需要被清理 状态不需要一次存储 状态有效期有时间限制,超过时间需要重置状态(业务上) 开启状态清理: StateTtlConfig ttlConfig = StateTtlConfig...OnCreateAndWrite but also updated on read. */ OnReadAndWrite } 有三种 如果设置为 Disabled,则表明不更新时间戳...,永远有效 如果设置为 OnCreateAndWrite,则表明当状态创建或每次写入时都会更新时间戳 如果设置为 OnReadAndWrite,在状态创建、写入、读取均会更新状态的时间戳 失效时间=上次访问的时间戳...+ TTL > 超过了当前时间 2.状态可见性 /** This option configures whether expired user value can be returned or not...expired user value. */ NeverReturnExpired } 如果设置为 ReturnExpiredIfNotCleanedUp,那么即使这个状态的时间戳表明它已经过期了

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只在视图 Body 中生存变量

但很少有人会在 body 中去使用 var 来定义变量,因为实在找不到使用 var 的理由和意义。本文将探讨在 SwiftUI 的视图 body 中用 var 来创建变量的意义和可能的场景。...意义 严格来说,本文接下来介绍的两个场景,都有其他的替代方案( 无需在 body 中创建变量 )。...在此种情况下,在 body 中使用 var 来声明一个变量,或许会有意想不到的效果。...,让我们可以直接在结果生成器中使用惰性变量。...如果计算时间真的较长( 会导致视图停滞 ),通过在 task 中使用异步方法才是更好的选择。 总结 我也是一时兴起写了本文,写完后我也不知道是否能给读者带来什么有价值的东西。

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html js 全局 变量,JS定义全局变量

【实例名称】 定义全局变量 【实例描述】 在高级开发语言(如c#、Java)中可以很方便地使用“public”等关键字,定义应用程序中的全局变量,但JaVascript的变量只能存在于当前的方法中。...本例通过一个简单的方法实现全局变量的定义。...”;’); //设置全局变量的值 alert(varText); //显示全局变量的值 【运行效果】 【难点剖析】 本例的重点是“window.execscript”方法,execscript所执行的脚本是针对整个全局域的...将“varText”变量设置为window对象的属性,则在全局中都可以调用此变量。...【源码下载】 为了JS代码的准确性,请点击:定义全局变量 进行本实例源码下载 发布者:全栈程序员栈长,转载请注明出处:https://javaforall.cn/134413.html原文链接:https

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局部变量的作用域和生存周期

变量定义的三种情况 (1)在函数开头定义 (2)在函数的内部定义 (3)在复合语句块内部定义 局部变量 定义在函数内部的变量只能在函数内部引用,同样定义在复合语句块中的变量只是在复合语句块内有效...将这种变量称为“局部变量”,顾名思义,这些变量的作用域仅仅是在函数内部或复合语句块内。...变量i只在复合语句块内有效,离开该复合语句块变量就失效,系统会把它占用的内存释放掉。...但在主函数中,我想输出定义在func()函数内部局部变量i的值。同样是不可行的,编译器在编译的的时候就会报错。但是在不同的函数中可以定义同名的变量,因为他们代表不同的对象,互不干扰。...上述例子虽然简单,但是也直白直观的感受到局部变量的作用域和生命周期。我们在实际写代码的过程中,一定要注意局部变量的引用。

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JS 变量提升

问到 JS 一些细节问题的时候发挥比较糟糕,有些是知道反应得太慢,有些是压根没接触过,还是积累的太少了。这篇的 JS 变量提升问题就是从没有接触过的,网上一搜一大把,实在是不应该。...) { a = 10; return; function a() {} } b(); alert(a); 运行结果为:1 ---- 此前有在资料上扫到过一眼,所以听到答案后第一时间反应过来是变量提升...,但对变量提升的具体行为则不了解了。...在蝴蝶书里有一笔带过提了一句“通常编写代码提倡把变量声明尽量贴近变量使用的位置,以提供上下文参考,但 Javascript 没有块级作用域,所以反而推荐在函数的顶部给出所有用到变量的声明。”...而后又被赋值 10 ,至于全局变量 foo 完全没参与进来。 虽然考点是变量提升,但个人认为,答出变量提升顶多合格分,这道题还有更实用的现实意义。 ---- 由于 !

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7.5 变量的存储方式和生存

02 局部变量的存储类别 1、自动变量(auto变量) 函数中的局部变量,如果不专门声明static存储类别,都是动态地分配存储空间的,数据存储在动态存储区中。...2、静态局部变量(static局部变量) 函数中的局部变量的值在函数调用结束后不消失而继续保留原值,即其占用的存储单元不释放,在下一次再调用该函数时,该变量已有值。...3、寄存器变量(register变量) 为提高执行效率,允许将局部变量的值放在CPU中的寄存器中,需要用时直接从寄存器取出参加运算,不必再到内存中去存取。...03 全局变量的存储类别 1、在一个文件内扩展外部变量的作用域 如果由于某种考虑,在定义点之前的函数需要引用该外部变量,则应该在引用之前用关键字extern对该变量作“外部变量声明”,表示把该外部变量的作用域扩展到此位置...2、将外部变量的作用域扩展到其他文件。 3、将外部变量的作用域限制在本文件中。 4、注意,用auto、register和static声明变量时,是在定义变量的基础上加上这些关键字,而不能单独使用。

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6.7 变量的存储方式和生存

一、动态存储方式与静态存储方式 C语言中,每一个变量和函数都有两个属性:数据类型和数据的存储类别 从变量值存在的时间来观察,变量的存储有两种方式静态存储方式和动态存储方式 ?...二、局部变量的存储类别 (1)自动变量(auto变量) 函数中的局部变量,如果不专门声明为static(静态)存储类别,都是动态地分配存储空间 的。...” (2)静态局部变量(static局部变量) 作用:局部变量的值在函数调用结束后不消失而继续保留原值 (3)寄存器变量(register) 为了提高执行效率,允许将局部变量的值放在CPU...三、全局变量的存储类别 (1)在一个文件内扩展外部变量的作用域 如果由于某种考虑,在定义点之前的函数需要引用该外部变量,则应该在引用之前用关键 字extern对该变量作“外部变量声明...”,表示把该外部变量的作用域扩展到此位置 (2)将外部变量的作用域扩展到其他文件 (3)将外部变量的作用域限制在本文件中 原创不易,未经本公众号允许禁止转载,否则追究法律责任

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Js中的变量

Js中的变量:  1:如果在var中没有初始化变量的值,则默认为undefined.  2:可以不用var来申明一个变量,但是在过程级中申明一个变量时,就必须用var.   ...总之用var就对了.  3:当要声明一个变量并进行初始化,但又不想指定任何特殊值,可以赋值为 JScript 值 null。下面给出示例。   ...var bestAge = null;  4:如果声明了一个变量但没有对其赋值,该变量存在,其值为Jscript 值 undefined。下面给出示例。    ...js中的数据类型  1:Jscript 有三种主要数据类型、两种复合数据类型和两种特殊数据类型    主要(基本)数据类型是: 字符串 数值 布尔    复合(引用)数据类型是: 对象 数组    特殊数据类型是...: Null Undefined  2:测试是否已经声明变量 x :    if (typeof(x) == "undefined")      // 作某些操作 js中的内置对象  1:Jscript

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JS全局变量

❝你从互联网上学东西、掌握新的技能,或者互联网帮助你实现自我,那么互联网就是你的工具;如果你只是在互联网上玩乐,花了自己的时间和金钱,却只得到了精神的满足,那你是互联网的工具。...我们在前期的文章中,描述了,V8执行JS代码核心流程 1. 先编译 2. 后执行。在这个编译的过程就是「静态」的。所以我们可以这么说,作用域是「不随代码的运行而改变」的变量查找机制。...❝JS的作用域是静态的 ❞ 同时,作用域还可以被嵌套。...声明环境记录(declarative environment record): 拥有属于自己的存储空间来存放binding 5.1 Script 作用域 和Module 作用域 在JS中,只有在script...所有ECMAScript内置的全局变量 宿主环境的所有内置全局变量(浏览器、Node.js等) 使用const/let定义的全局变量可以保证不受ECMAScript和宿主环境的内置全局变量影响。

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JS–JavaScript变量详解(全局变量、局部变量)

JavaScript变量 JavaScript使用var关键字声明变量。声明变量的5种常规用法如下: var a; //声明单个变量。...var关键字与变量名之间以空格分隔 var b, c; //声明多个变量变量之间以逗号分隔 var d = 1; //声明并初始化变量。...以逗号分隔多个变量 var e = f = 3; //声明并初始化多个变量,且定义变量的值相同 JavaScript也支持不使用var命令,直接使用未声明的变量。...根据可见性,变量可以分为全局变量和局部变量(或称私有变量) 全局变量在整个页面中可见,并在页面任何位置被允许访问。 局部变量只能在指定函数内可见,函数外面是不可见的,也不允许访问。...在函数内部使用var关键字声明的变量就是私有变量,该变量的作用域仅限于当前函数体内。 但是如果不使用var关键字定义的变量都是全局变量,不管是在函数内或者函数外,在整个页面脚本中都是可见的。

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JS全局变量和局部变量

全局变量和局部变量 在看了一个博主写的关于js全局变量的的介绍后,自己也跟着做了一下,并且记录在这里。 原博客地址:谈谈JS的全局变量跟局部变量。 博主说的比较详细,也比我的表达好。...不过我的内容多了点东西,关于定义变量时不加var的影响,在文章的最后面。...而在方法内重新var a;相当于重新定义了一个局部变量a,会在这个方法内把全局变量的作用域掩盖,而js在执行之前的扫描检测机制会使得function内部的全局变量作用能力提前失效。...还有,在定义变量时不加var 定义变量不加var,相当于在定义全局变量 i = 2; function...在控制台可以看到出现了错误: 说n没有被定义,因为在内部加上了var,就相当于在当前域定义变量,而当前域是function 那么你再猜一猜下面的结果是什么?

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「R」怎么对连续变量分组并进行生存分析

在探究基因表达、基因拷贝数等连续变量对癌症病人的预后情况的影响时,我不得不面对和处理的主要问题是如何对这种连续型的变量进行分组,然后进行相应的生存分析。...生存分析最最关键的两个变量生存事件和存活时间,前者是指一位病患是死了还是不知道是死是活了,前者一般用1表示,后者用0,其中后者常被称为截尾事件,要么就是研究周期到了,病人还没死;要么是找不到人了。...所以生存分析第三个必不可少的变量是组别变量,用来对比和探寻差异。 有的时候组别不明自显,比如我们要分析某个癌症组织和正常组织的差异,那么划分组别的方式自然就很明显了,而且在实验或分析设计之时就能确定。...这里画图函数涉及一些参数的设定,可以参考《怎么画出好看的生存曲线》这篇文章。 如果我们想要将连续型变量进行生存对比分析,显然我们要在构建生存模型之前将组别划分好。...设置一个时间阈值: plot_surv(res$data, cutoff = 3000) ?

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R语言使用限制平均生存时间RMST比较两条生存曲线分析肝硬化患者

下面是每个实验组的死亡时间的卡普兰-梅尔(KM)估计。 3 限制平均生存时间(RMST)和限制平均损失时间(RMTL RMST被定义为生存函数曲线下的面积,直到一个时间τ(< ∞)。...其中S(t)是所关注的时间-事件变量生存函数。对RMST的解释是:"当我们对患者进行τ的随访时,患者平均会存活μτ",这是对删减的生存数据的相当直接和有临床意义的总结。...第二个参数(status)也是一个向量变量,其长度与时间相同,每个元素取1(如果有事件)或0(如果没有事件)。...设Y为限制性平均生存时间,设Z为治疗指标。同时,让X表示一个q维的基准协变量向量。...受限的平均生存时间是一个稳健的、临床上可解释的生存时间分布的总结方法。与中位生存时间不同,即使在严重的删减情况下,它也是可以估计的。关于限制性平均生存时间,有相当多的方法学研究可以替代风险比方法。

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