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R语言ggtree画圆形树状展示聚类分析的结果

今天的主要内容是实现下面这幅 ?...image.png 做完聚类分析通常可以选择树形来展示聚类分析的结果,之前公众号也分享过一篇文章 R语言聚类树小例子 如果样本数不是很多,可以选择矩形的树状。...但是样本数如果比较多,比如今天一位公众号的读者留言说他有160多个样本,这样矩形的树状就会比较宽或者比较长。这个时候就可以选择用圆形的柱形来展示。 那么圆形树状如何实现呢?...Y叔开发的ggtree包时用来可视化进化树的,我隐约记得好像也可以用来画聚类分析的树状。...image.png 接下来我们用鸢尾花的数据集试一下 鸢尾花数据集是150个样本,用圆形看下效果 df<-iris[,1:4] rownames(df)<-paste(iris$Species,

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树状(Tree Map)

树状(treemap)是一种经常用来展示多层级数据的分析工具。主要是使用矩形的面积、颜色、来显示复杂的层级数据关系,能够直观体现同级数据之间的比较。...exce2010及以下版本的内置图表库中没有树状的样式,但是可以通过加载第三方插件的方式制作树形,excel2013则可以通过应用商店插件完成树形制作,而从office2016预览版开始,excel...已经内置有了树形的图表类型,可以一键插入。...今天我们将三种方式全部介绍: ●●●●● ——第三方插件 ——应用商插件(需联网) ——excel内置树形(office2016预览版)【低版本无法查看】 第一种:第三方插件(treemap插件) (...第一个是不包含类别名称的图表输出 第二个是包含类别、品牌、销量的图表输出 ●●●●● ‍ 第三种:excel内置树形(office2016预览版) 选中原数据区域: 然后选择插入——树形——

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你没见过的树状和旭日

在2016版的EXCEL里,有很多以前版本没有的图表,比如旭日树状,这两个我相信很多小伙伴几乎没有用过,今天我们来讲讲这两个。...首先旭日树状都是表示数据成分关系的图表,他们可以用视觉化的形式来表示一系列数据所占比例的成分,当然他和饼比起来更加的直观,饼相对来说能表达的数据有限,超过6个数据,用饼来表示就会感觉比较的复杂...,但是树状和旭日可以应用到大量的类别的数据成分里,通过不同的颜色和不同的形状进行表示,我们先来看一下树状。...我们客户尝试用树状。...这个里面我们有2个层级的数据,一个是门店,一个是每个门店卖的手机的型号和每个手机的销量,这个时候如果要去做分析,当然一种方法是用数据透视表和数据透视图,但是我们也可以尝试用旭日来表述,我们看下面的

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图解 | 怎么解读一个树状

但是不仅限于此,我们只要是可以衡量不同对象之间的相似度,都可以通过树状来进行可视化。 比如,在高通量测序的各个样本当中,利用层次聚类➕ 树状来比较各个样本之间的整体表达关系的远近。...例如:下面就展示了六个观测对象,在散点图上的距离关系()以及在树状的具体呈现()。 基本概念 在了解树状之前,对于树的一些基本概念就需要解释一下。...这里我们使用5样本的表达谱芯片的数据进行层次聚类然后构建了树状。来观察这个样本之间的表达的相似程度。 对于树状的解读是自下而上进行的。首先我们可以看到。...其他扩展图形 以上就是树状的基本图形解读,同样的其实我们在研究物种进化的时候使用的进化树其实也算是树状。解读起来也是一样的。...以上就是关于树状的基本内容了,至于做工具的话,还是看自己能掌握什么工具。如果也是用R语言进行做的话,推荐使用ggtree呀。一个专门绘制树的工具。这里附上ggtree大佬的公众号,欢迎关注。

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【D3.js - v5.x】(6)绘制树状 | 层级布局 | 附完整代码

树状 在d3 中,绘制树状,要用到层级布局这个概念: d3.hierarchy(data[, children]) 根据指定的层次结构数据构造一个根节点。...文档: https://www.d3js.org.cn/document/d3-hierarchy/#tree 其中, d3.tree(),创建一个树状生成器,使用默认的设置创建一个新的树布局 d3....创建一个树状 //创建一个树状 var tree = d3.tree() .size([width-400,height-200]) .separation(function(a,b){ return...初始化树状,也就是传入数据,并得到绘制树基本数据 var treeData = tree(hierarchyData); var nodes = treeData.descendants(); var...创建一个树状 var tree = d3.tree() .size([width-400,height-200]) .separation(function(a,b){ return

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终于等到你——ggplot2树状

2017年8月份的R语言更新包中,默默地加入了支持ggplot2树状的新几何对象,从此在R语言中制作树状,不用再求助于第三方包的辅助了。...实际上我曾经分享过一个树状图案例,但是是使用第三方辅助包制作,一直在等ggplot2出树状图层。...一个简单的树状: ggplot(G20, aes(area = gdp_mil_usd)) + geom_treemap() ?...添加标签: 包作者针对ggplot树状写了优化好的文本 标签函数geom_treemap_text(刚开始就说过树状超越了传统三大坐标系的范畴,没有显式声明的坐标系统,算法比较特殊因而无法使用常规的...treemapify包给ggplot2提供的geom_treemap(),填补了ggplot2原生几何对象在树状领域的空白,可谓是进一步扩展、丰富ggplot2生态系统。

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