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如何获取染色体长度

我们在做基因组或者转录组数据分析时候,经常需要用到染色体长度。今天我们就来聊聊如何获取染色体长度。...我们以人为例,给大家介绍两种不同方法,都要用到著名公共数据库UCSC(https://www.genome.ucsc.edu/) 方法一 1.在UCSC主页上,点击Genomics, 2....然后点击human图标,当然如果需要获取其他物种染色体长度,这里就点击其他物种图标 3.点击View sequences,你就会看到下面这张表 这张表拖到最底下,你会发现有Download as...file,可以把这张表下载到本地 用文本编辑器打开如下,第一列是染色体号,第二列是每一条染色体长度。...下载hg38.chrom.sizes这个文件即可,跟上面一种方法得到结果是一样

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如何在Bash中获取数组长度

在Bash脚本中,数组是一种常用数据结构,用于存储多个值。在处理数组时,经常需要知道数组长度,即数组中元素个数。本文将详细介绍如何在Bash中获取数组长度方法,以帮助您更好地处理数组操作。...图片声明和初始化数组在讨论如何获取数组长度之前,让我们先了解如何声明和初始化数组。...方法一:使用${#array_name[@]}获取数组长度在Bash中,可以使用${#array_name[@]}形式来获取数组长度。这个表达式会返回数组元素个数。...方法二:使用${#array_name[*]}获取数组长度除了${#array_name[@]}之外,还可以使用${#array_name[*]}来获取数组长度。...总结在Bash脚本中,获取数组长度是一项常见操作。本文介绍了四种方法来获取数组长度:使用${#array_name[@]}:展开数组为元素列表,并返回列表长度

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js如何获取select选中

我想获取select选中value,或者text,或者…… 比如这个: <option value=”A” url=”http://www.baidu.com...; // selectedIndex代表是你所选中项index 3:拿到选中项optionsvalue: myselect.options[index].value; 4:拿到选中项options...text: myselect.options[index].text; 5:拿到选中项其他值,比如这里url: myselect.options[index].getAttribute(‘url’...); 二:jQuery方法 1:var options=$(“#select option:selected”); //获取选中项 2:alert(options.val()); //拿到选中项值...3:alert(options.text()); //拿到选中项文本 4:alert(options.attr(‘url’)); //拿到选中项url值 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人

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如何js获取当前月份天数

获取每月天数时候,一般都是存储到一个数组中进行获取,但是如果是二月份的话就需要首先判断是否闰年,再确定是28还是29了。...js可以通过Date对象很方便获取到每月天数,在初始化Date对象时,我们可以通过这种方式: var d = new Date(2017,2,0); console.log(d.getDate())..., month, 0); return d.getDate(); } 在使用时传入想要获取年份和月份即可,如下: var totalDay = mGetDate(2004,2);...如果要获取当前月份天数: function mGetDate(){ var date = new Date(); var year = date.getFullYear();...JavaScript中day范围为1~31中值,我们获取第N-1个月第0天,就是N-1个月最后一天,这样就获得了第N个月有多少天。

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获取基因有效长度N种方法

参见生信技能树文章: 基因长度之多少 | 生信菜鸟团 (bio-info-trainee.com) 那么问题来了,在计算FPKM/RPKM时,每个基因基因有效长度数据该如何获取呢?...我总结了几种获取基因有效长度(或非冗余总外显子长度、总转录本长度方法,现整理如下: 一、从上游输出文件结果中获取基因有效长度 一般而言,RNA-seq得到原始counts表达矩阵最常用到上游软件就是...首先看看从gtf文件中获取基因有效长度两种方法是否有差异。...gtf中获取efflen比较 总结: 获取基因有效长度最简便方法是直接从featureCounts或salmon输出文件中提取。...在没有上游原始输出文件情况下,也可以采取直接从gtf文件中计算方法,获取每个基因非冗余外显子总长度得到基因有效长度

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四种获取fasta序列长度方法

在处理fasta序列时候,我们经常需要获取每一条fasta序列长度。今天小编就跟大家来分享四种获取fasta序列长度方法。 一、awk awk '/^>/{if (l!...fai文件如下,前两列正好就是fasta序列名字和长度。....fai文件每一列具体含义 第一列 NAME : 序列名称,只保留“>”后,第一个空白之前内容; 第二列 LENGTH: 序列长度, 单位为bp; 第三列 OFFSET :...第一个碱基偏移量, 从0开始计数,换行符也统计进行; 第四列 LINEBASES : 除了最后一行外, 其他代表序列碱基数, 单位为bp; 第五列 LINEWIDTH : 行宽, 除了最后一行外..., 其他代表序列长度, 包括换行符, 三、seqkit conda install seqkit seqkit fx2tab --length --name --header-line test.fasta

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